Az UChicago genomikai kutatója elnyeri az NIH Directors New Innovator Award díját

Az innovatív tudomány szélessége, amelyet a 2020 -as korai karrier és a tapasztalt nyomozók mutattak be, lenyűgöző és inspiráló. Bízom benne, hogy munkájuk elősegíti az orvosbiológiai és viselkedési kutatásokat, és javítja az emberi egészséget. "

Francis S. Collins, M.D., Ph.D., NIH igazgató

Amióta 2016 -ban megérkezett UChicagóba, Basu számos kutatási projekten dolgozott. Összetett biológiai rendszereket vizsgál egysejtes genomika segítségével - izolálja az egyes sejteket és szekvenálja azok genetikai információit, hogy jobb képet kapjon a szövetmintán belüli sejtkülönbségekről. Ez, viszont, betekintést nyújt a sejtek egyedi altípusaiba és funkcióikba egy adott szöveten belül.

Basu az aviv Regev laboratóriumaiban képzett, PhD, és David Weitz, PhD, mindkét úttörő az egysejtes genomika és a mikrofluidika területén. Basu maga is feltalálta az első nagy teljesítményű egysejtű és egymagos RNS-seq technológiákat, amelyek lehetővé tették azok széles körű alkalmazását világszerte.

A Basu kutatólaboratórium új technológiákat fejleszt és alkalmaz nagy teljesítményű egysejtes epigenómiai és transzkriptomikus profilozásra akár 100, 000 sejt egyszerre. Ezzel a megközelítéssel, csapata az egyedi sejttípusok elemzésén és osztályozásán dolgozik különböző szövetekben, beleértve az egér és az emberi agyat és a mikrobiális sejtpopulációkat.

Kutatásai hozzájárulnak az emberi sejtatlaszhoz is, világszerte genomikai szakértőket bevonó globális projekt, amelynek célja egy teljes atlasz létrehozása az emberi test összes sejttípusáról mind egészségben, mind betegségekben. Azon dolgozik, hogy azonosítsa és jellemezze az emberi bélben lévő sejttípusokat, hogy létrehozza az ileum sejtes atlaszát - a vékonybél végső részét. Crohn -betegségben és anélkül szenvedő betegek bélbiopsziás mintáinak felhasználásával, a gyengítő állapothoz kapcsolódó sejttípusú és betegségspecifikus kifejeződési mintákat igyekszik jobban megérteni.

Az Új Innovátor Díj támogatásával Basu azt tervezi, hogy ezt az egysejtű technológiát a mikrobák világába tolja. Az egyedi sejttípusok sokfélesége a többsejtű élőlényekben, például az emberekben, a genom egysejtes szinten történő tanulmányozásának szükségességét eredményezte; hasonló szintű sokszínűségre lehet számítani a mikrobiális közösségekben is. Ennek a heterogenitásnak a jobb megértése segít megválaszolni a kérdéseket olyan bonyolult témákban, mint az evolúciós fitnesz és az antimikrobiális rezisztencia.

Továbbra is kihívást jelent olyan eszközök előállítása, amelyek képesek vizsgálni a mikrobiális sejtek közötti különbségeket egysejtes felbontásban. Basu és csapata olyan mikrofluidikus és genomiális eszközök kifejlesztésén dolgozik, amelyek lehetővé teszik a kutatók számára, hogy megfejtsék a mikrobiális populációk közötti összetett kölcsönhatásokat, gazdaszervezet-kórokozó kölcsönhatás és a mikrobióma.

A magas kockázatú, A High-Reward Research Program katalizálja a tudományos felfedezéseket azáltal, hogy támogatja azokat a kutatási javaslatokat, bennük rejlő kockázat miatt, küzdhetnek a hagyományos szakértői felülvizsgálati folyamatban átalakító potenciáljuk ellenére. A programra jelentkezőket arra ösztönzik, hogy "a dobozon kívül" gondolkodjanak, és úttörő ötleteket kövessenek az NIH tudásfejlesztési és egészségfejlesztési küldetése szempontjából releváns kutatási területeken.

• A tanulmány megmagyarázhatja, hogy a kannabisznövény miért csökkentheti a különböző bélbetegségek tüneteit
• A tiopurinok segíthetnek megállítani a vírusok replikációját az emberi koronavírusokban