Výskumník genomiky UChicago získal cenu NIH Directors New Innovator Award

Oni Basu, PhD., odborný asistent genetickej medicíny na Chicagskej univerzite, získal prestížnu cenu New Innovator Award riaditeľa Národného inštitútu zdravia (NIH).

Tieto ocenenia, súčasť Vysokého rizika NIH, Výskumný program s vysokou odmenou, sa udeľujú mimoriadne kreatívnym vedcom, ktorí navrhujú vysoko rizikové vysokoúčinný výskum vo všetkých fázach kariéry. Cena nového inovátora, financované zo spoločného fondu NIH, sa zameriava na podporu výskumných pracovníkov v ranej kariére, podpora neobvykle inovatívneho výskumu od vyšetrovateľov ranej kariéry, ktorí sú do 10 rokov od ukončenia záverečného štúdia. Tento rok, Ocenením bolo ocenených 53 vedcov.

Šírka inovatívnej vedy predložená kohortou ranej kariéry a skúsených vyšetrovateľov do roku 2020 je pôsobivá a inšpirujúca. Som presvedčený, že ich práca bude poháňať biomedicínsky a behaviorálny výskum a povedie k zlepšeniu zdravia ľudí. “

Francis S. Collins, M.D., Ph.D., Riaditeľ NIH

Od príchodu na UChicago v roku 2016 Basu pracoval na rôznych výskumných projektoch. Skúma komplexné biologické systémy pomocou jednobunkovej genomiky - izoluje jednotlivé bunky a sekvenuje ich genetické informácie, aby získala lepší obraz o bunkových rozdieloch vo vzorke tkaniva. Toto, zasa poskytuje pohľad na jedinečné podtypy buniek a ich funkcie v rámci daného tkaniva.

Basu vyškolený v laboratóriách Aviv Regev, PhD., a David Weitz, PhD., obaja priekopníci v oblasti jednobunkovej genomiky a mikrofluidiky. Samotná Basu je spoluzakladateľkou prvých vysokovýkonných jednobunkových a jednojadrových technológií RNA-seq, ktoré umožnili ich rozsiahle prijatie na celom svete.

Výskumné laboratórium Basu vyvíja a aplikuje nové technológie na vykonávanie vysoko výkonného jednobunkového epigenomického a transkriptomického profilovania až do 100, 000 buniek naraz. S týmto prístupom, jej tím pracuje na analýze a klasifikácii jedinečných typov buniek v rôznych tkanivách, vrátane myšieho a ľudského mozgu a populácií mikrobiálnych buniek.

Jej výskum tiež prispieva do Atlasu ľudských buniek, globálny projekt zahŕňajúci expertov na genomiku z celého sveta, ktorého cieľom je vytvoriť kompletný atlas všetkých bunkových typov v ľudskom tele v oblasti zdravia aj chorôb. Pracuje na identifikácii a charakterizácii typov buniek v ľudskom čreve, aby vytvorila bunkový atlas ilea - koncovej časti tenkého čreva. Použitím vzoriek črevnej biopsie od pacientov s Crohnovou chorobou a bez nej, snaží sa lepšie porozumieť výrazovým vzorcom špecifickým pre bunkový typ a chorobu spojeným s oslabujúcim stavom.

S podporou ceny New Innovator Award, Basu plánuje posunúť túto jednobunkovú technológiu do mikrobiálneho sveta. Rozmanitosť jedinečných typov buniek v mnohobunkových organizmoch, ako sú ľudia, viedla k potrebe študovať genóm na úrovni jednej bunky; podobnú úroveň diverzity je možné očakávať aj v mikrobiálnych komunitách. Lepšie pochopenie tejto heterogenity pomôže zodpovedať otázky na komplikované témy, ako je evolučná spôsobilosť a antimikrobiálna rezistencia.

Produkcia nástrojov schopných skúmať rozdiely medzi mikrobiálnymi bunkami pri rozlíšení jednej bunky zostáva náročná. Basu a jej tím pracujú na vývoji mikrofluidických a genomických nástrojov, ktoré umožnia vedcom rozlúštiť komplexné interakcie medzi mikrobiálnymi populáciami, interakcia hostiteľ-patogén a mikrobióm.

Vysoké riziko, Výskumný program s vysokou odmenou urýchľuje vedecké objavy podporou výskumných návrhov, ktoré:vzhľadom na ich inherentné riziko, môžu mať problémy v tradičnom procese partnerského hodnotenia napriek svojmu transformačnému potenciálu. Uchádzači o program sa vyzývajú, aby premýšľali „mimo rámca“ a usilovali sa o priekopnícke nápady v akejkoľvek oblasti výskumu, ktorá je dôležitá pre poslanie NIH rozvíjať znalosti a zlepšovať zdravie.

• Štúdia môže vysvetliť, prečo rastlina konope môže zmierniť symptómy rôznych črevných chorôb
• Tiopuríny by mohli pomôcť zastaviť replikáciu vírusov v ľudských koronavírusoch