Publikované v časopise Biológia PLOS a predstavuje päť rokov práce, vedci z Ústavu integratívnej biológie dokončili jednu z doposiaľ najväčších štúdií bakteriálnej porovnávacej génovej expresie.
K invazívnej netyfoidnej salmonelóze (iNTS) dochádza vtedy, keď Salmonela baktérie, ktoré zvyčajne spôsobujú gastrointestinálne ochorenia, vstúpiť do krvného obehu a šíriť sa ľudským telom. Africká epidémia iNTS je spôsobená variantom Salmonella Typhimurium (ST313), ktorý je odolný voči antibiotikám a vo všeobecnosti postihuje jedincov s imunitným systémom oslabeným maláriou alebo HIV.
„Hoci ide o genómy afrických a globálnych S. Typhimurium sú na 95% identické, zvyšných 5% je veľmi rozdielnych, "vysvetľuje autor štúdie Dr Rocío Canals Alvarez." Väčšina týchto rozdielov nespôsobuje zmeny v génovej expresii, ale musíme identifikovať genetické zmeny, ktoré ovplyvňujú génovú expresiu a mohli by ovplyvniť výsledok bakteriálnej infekcie u ľudí. "
Ak chcete objaviť tieto kľúčové genetické rozdiely, vedci vykonali rozsiahly porovnávací transkriptomický prístup medzi smrtiacim Afričanom Salmonela a bežná „globálna“ verzia, ktorá spôsobuje gastroenteritídu.
Vedci vypestovali každý z Salmonela kmene 16 rôznymi spôsobmi, ktoré predstavovali rôzne fázy procesu ľudskej infekcie. Izolovali tiež salmonely z myších makrofágov - imunitných buniek, ktoré baktérie používali pri infekcii hostiteľa.
Skúmaním transkriptómu Afriky a sveta S. Typhimurium za týchto rôznych podmienok, zistili, že 677 génov a malých RNA bolo medzi týmito dvoma kmeňmi exprimovaných odlišne.
Paralelný proteomický prístup identifikoval rozdiely v génovej expresii, ktoré viedli k zmenám na úrovni proteínu. Dva experimenty na princípe princípu odhalili genetický základ metabolického defektu africkej salmonely a objavili nový udržiavací systém bakteriálnych plazmidov.
Aby vedci z celého sveta mohli pracovať s novými informáciami, nové údaje sú prezentované v užívateľsky príjemnom online nástroji s názvom
"Táto štúdia posúva silu transkriptomiky na novú úroveň pre baktériu. Náš 'funkčný transkriptomický' prístup je relevantný pre široké publikum a môže byť aplikovaný na mnoho ďalších organizmov. Analytický zoznam a aspekty zdrojov údajov komunity sú generické a mohli by inšpirovať ostatných, aby podobným spôsobom odpovedali na svoje výskumné otázky, “dodáva profesor Jay Hinton, ktorý štúdiu viedol.
Za zistenie zmien metabolizmu môžu zodpovedať črevné imunitné bunky
Niektoré druhy baktérií môžu zvýšiť riziko HIV u žien,
Črevný bakteriálny profil môže predpovedať poškodenie čreva po rádioterapii
Reakcie na potraviny sa riadia črevným mikrobiómom,
Štúdia naznačuje súvislosť medzi používaním probiotík a „zahmlievaním mozgu“
Vedci našli v modeli MS nový spôsob ochrany pred chorobami
Horná endoskopia
Ak máte chronické pálenie záhy, bolesť brucha alebo hrudníka, nevoľnosť, a vracanie, alebo iné problémy, ktoré zrejme pochádzajú z horného tráviaceho systému, môžeme odporučiť hornú endoskopiu. Tiež z
Črevné baktérie spojené so silnejšími svalmi u starších ľudí
Odvážna nová štúdia naznačuje, že svalová sila u starších dospelých môže byť vyššia kvôli, čiastočne, mechanizmy zahŕňajúce črevné baktérie. Črevné baktérie súvisia so svalovou hmotou a fyzickými fu
Netesné črevo a vesmírny let - mechanizmus odhalený
Nová štúdia o účinkoch simulovanej mikrogravitácie, podmienka, s ktorou sa astronauti stretávajú vo vesmíre, zasahuje do epiteliálnej bariéry čreva, a efekt pretrváva aj potom, čo sa astronaut vráti d