Verëffentlecht am Journal PLOS Biologie a representéiert fënnef Joer Aarbecht, Fuerscher um Institut fir Integrativ Biologie hunn ee vun de gréisste bakterielle vergläichende Genausdrockstudien bis elo ofgeschloss.
Invasiv nontyphoidal Salmonellose (iNTS) tritt op wann Salmonella Bakterien, déi normalerweis gastrointestinal Krankheet verursaachen, gitt an de Bluttkrees a verbreet sech duerch de mënschleche Kierper. Déi afrikanesch iNTS Epidemie gëtt verursaacht duerch eng Variant vun Salmonella Typhimurium (ST313) dat resistent géint Antibiotike ass an allgemeng Leit betrëfft mat Immunsystem geschwächt duerch Malaria oder HIV.
"Och wann d'Genome vun afrikanescher a globaler S. Typhimurium sinn 95% identesch, déi reschtlech 5% ass ganz anescht, "erkläert de Studie Autor Dr Rocío Canals Alvarez." Déi meescht vun dësen Differenzen verursaache keng Verännerungen am Genausdrock, awer mir musse d'genetesch Verännerungen identifizéieren déi den Genausdrock beaflossen an d'Resultat vun enger bakterieller Infektioun bei Mënschen beaflosse kënnen. "
Fir dës Schlëssel genetesch Differenzen z'entdecken, d'Fuerscher hunn eng grouss-Skala vergläichend transkriptomesch Approche tëscht dem fatalen Afrikaner duerchgefouert Salmonella an déi allgemeng 'global' Versioun déi Gastroenteritis verursaacht.
D'Fuerscher wuesse jiddereng vun den Salmonella Stämme op 16 verschidde Weeër déi verschidde Stadien vum mënschleche Infektiounsprozess duerstellt. Si isoléieren och Salmonella vu Mausmakrofagen - Immunzellen, déi vun de Bakterien benotzt gi fir den Host wärend der Infektioun ze kapéieren.
Duerch Ënnersichung vum Transkriptom vun afrikanescher a globaler S. Typhimurium ënner dëse verschiddene Bedéngungen, si hunn entdeckt datt 677 Genen a kleng RNAs anescht ausgedréckt waren tëscht den zwou Stämme.
Eng parallel proteomesch Approche identifizéiert d'Genexpressioun Differenzen déi zu Verännerungen um Proteinniveau gefouert hunn. Zwee Beweis-vu-Prinzip Experimenter hunn déi genetesch Basis vun engem afrikanesche Salmonella metabolesche Defekt opgedeckt an entdeckt e neie bakterielle Plasmid Ënnerhalt System.
Fir Fuerscher op der ganzer Welt mat den neien Informatiounen ze schaffen, déi nei Daten ginn an engem userfrëndlechen Online Tool presentéiert deen den
"Dës Studie hëlt d'Kraaft vun Transkriptomik op en neien Niveau fir eng Bakterie. Eis 'funktionell transkriptomesch' Approche ass relevant fir e breede Publikum a ka fir vill aner Organismen ugewannt ginn. Déi analytesch Pipeline an d'Gemeinschaftsdatenressource Aspekter si generesch a kënne anerer inspiréiere fir eng ähnlech Approche ze benotzen fir hir Fuerschungsfroen ze beäntweren, "füügt de Professer Jay Hinton derbäi, deen d'Etude gefouert huet.