Software de computador inovador lança nova luz sobre processos genéticos subjacentes a doenças mortais

Um software de computador inovador desenvolvido por cientistas da Universidade de Leicester está lançando uma nova luz sobre a composição genética de patógenos mortais responsáveis ​​pela meningite e gastroenterite.

p O software, chamado ' Phasome Isto ' , examina rapidamente grandes conjuntos de genomas e identifica seus genes de fase variável, ao mesmo tempo que compara todos esses genes uns contra os outros. Isso pode ajudar na nossa compreensão dos processos genéticos subjacentes a uma série de doenças mortais.

p Pesquisadores da Universidade de Leicester, liderado pelo Dr. Chris Bayliss do Departamento de Genética e Biologia Genômica, aplicaram este software a um grande número de sequências de genoma para duas famílias de bactérias - Neisseria meningitidis ( uma causa significativa de meningite) e Campylobacter jejuni ( a causa mais frequente de gastroenterite de origem alimentar) . Os estudos foram publicado no jornal PLOS One e Genômica Microbiana .

p O Dr. Bayliss explicou:"Nós e outros prevêem que uma análise aprofundada desses grandes conjuntos de genomas lançará luz sobre como esses patógenos se adaptam à vida em seus hospedeiros humanos e aviários e como as mudanças genéticas podem levar a infecções prejudiciais."

p As tecnologias modernas de sequenciamento de DNA agora produzem um enorme volume de "genômico" - todo o conteúdo genético de um organismo - informações para muitos organismos diferentes - de humanos a microorganismos.

p Em muitos casos, há até dados demais para serem analisados ​​com eficácia com o software de computador disponível atualmente.

p "Um mecanismo que ambas as bactérias usam para se adaptar às pressões ambientais e do hospedeiro é a ativação ou desativação reversível de genes que codificam moléculas responsáveis ​​pelas interações com o hospedeiro, "explica Joe Wanford, um aluno de doutorado trabalhando na pesquisa no Departamento de Genética e Biologia Genômica da Universidade de Leicester.

p "Em muitos casos, este processo é vantajoso porque o gene 'estado ON' permite uma interação estreita com as superfícies da célula hospedeira (como na garganta), enquanto o 'estado OFF' permite a evasão dos anticorpos do hospedeiro, o que pode resultar na morte da bactéria. Alguns desses chamados 'genes de fase variável' podem ser facilmente identificados por causa de características de identificação específicas de seu DNA, mas até agora não havia como analisar rapidamente a presença, e distribuição desses genes em vários genomas. "

p As análises da equipe indicaram que os genes de variáveis ​​de fase são amplamente compartilhados entre patogênicos (que causam doenças), e comensais (que vivem em seu corpo, sem causar danos) espécies de bactérias, mas essas pequenas diferenças na presença, ou a expressão desses genes pode desempenhar um papel na transição da colonização assintomática de nossos corpos, a doença desenvolvida.

p O trabalho agora está em andamento em seu laboratório para caracterizar os papéis específicos desses genes no processo da doença.

p O Dr. Bayliss acrescentou:"Acreditamos que nosso novo software será crítico na análise de um volume cada vez maior de sequências de genoma, e continuará a lançar descobertas importantes sobre os ciclos de vida de nossos simbiontes bacterianos. "

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