Innovativ Computersoftware werft neit Liicht op genetesch Prozesser ënner déidlecher Krankheeten

Innovativ Computersoftware entwéckelt vun der University of Leicester Wëssenschaftler werft neit Liicht op d'genetesch Make -up vun déidleche Pathogenen verantwortlech fir Meningitis a Gastroenteritis.

D'Software, genannt ' Phasome Et ' , scannt séier duerch grouss Sätz vu Genome an identifizéiert hir Phasvariabel Genen, wärend och all dës Genen matenee vergläichen. Dëst kann bei eisem Verständnis vun de genetesche Prozesser hëllefen, déi eng Rei vun déidleche Krankheeten ënnerläit.

Fuerscher vun der University of Leicester, gefouert vum Dr Chris Bayliss vum Department of Genetics and Genome Biology, hunn dës Software op eng grouss Zuel vu Genom Sequenzen fir zwou Famillen vu Bakterien applizéiert - Neisseria meningitidis eng bedeitend Ursaach vun Meningitis) an Campylobacter jejuni ( déi heefegst Ursaach vun der Liewensmëttelborne Gastroenteritis) . D'Studien goufen am Journal publizéiert PLOS One an Mikrobiell Genomik .

Den Dr Bayliss huet erkläert:"Mir an anerer viraussoen datt eng detailléiert Analyse vun dëse grousse Sätz vu Genome Liicht werft op wéi dës Pathogenen sech un d'Liewen an hire Mënsch- a Gefligelhären adaptéieren a wéi genetesch Verännerungen zu schiedlechen Infektiounen féieren."

Modern DNA Sequencing Technologien produzéieren elo en enorme Volumen "genomesch" - de ganzen geneteschen Inhalt vun engem Organismus - Informatioun fir vill verschidden Organismen - vu Mënschen bis zu Mikroorganismen.

A ville Fäll ginn et souguer ze vill Daten fir effektiv mat aktuell verfügbare Computersoftware ze analyséieren.

"Ee Mechanismus dee béid vun dëse Bakterien benotze fir sech un d'Ëmwelt- an den Hostdrock unzepassen ass den reversibelen Uschalten ON oder OFF vun Genen, déi Moleküle codéieren, verantwortlech fir d'Interaktiounen mam Host, "erkläert de Joe Wanford, e PhD Student deen un der Fuerschung an der University of Leicester Department of Genetics and Genome Biology schafft.

"A ville Fäll ass dëse Prozess avantagéis well den 'ON State' Gen erlaabt eng enk Interaktioun mat Hostzelloberflächen (sou wéi am Hals), wärend den 'OFF Staat' d'Evasion vu Host Antikörper erlaabt, déi schlussendlech zum Doud vun de Bakterien féiere kënnen. E puer vun dëse sougenannte 'Phas variabelen Genen' kënne ganz einfach identifizéiert ginn wéinst spezifesche identifizéierende Funktiounen vun hirer DNA, awer bis elo war et kee Wee fir d'Präsenz séier ze analyséieren, a Verdeelung vun dësen Genen iwwer verschidde Genome. "

D'Analysen vum Team hunn uginn datt Phas variabel Genen gréisstendeels tëscht pathogenen (déi Krankheet verursaachen) gedeelt ginn, a commensal (déi an Ärem Kierper liewen, ouni Schued ze verursaachen) Aarte vu Bakterien, awer datt kleng Differenzen an entweder d'Präsenz, oder Ausdrock vun dëse Genen kann eng Roll am Iwwergank vun der asymptomatescher Kolonisatioun vun eise Kierper spillen, zu enger vollstänneger Krankheet.

D'Aarbecht leeft elo an hirem Labo fir déi spezifesch Rollen vun dësen Genen am Krankheetsprozess ze charakteriséieren.

Den Dr Bayliss huet bäigefüügt:"Mir gleewen datt eis nei Software kritesch wäert sinn an der Analyse vun engem ëmmer méi grousse Volume vu Genom Sequenzen, a wäert weider wichteg Abléck an d'Liewenszyklen vun eise bakterielle Symbionte werfen. "

• Biologesch Faktore net verantwortlech fir rassistesch Differenzen an der Kolorektalkriibs Heefegkeet
• Wësse vu Geschlechtsdifferenzen am ënneschten Harnweeër kënnen hëllefen Duerchbréch bei der Diagnostik ze stimuléieren,