A doença de Crohn é uma doença inflamatória intestinal grave, amplamente disseminada em países desenvolvidos. Entre seus possíveis fatores causais estão a predisposição genética, ambiente e estilo de vida dos pacientes. A doença está associada a uma reação anormal do sistema imunológico aos micróbios intestinais de uma pessoa; a disbiose intestinal é típica. Para estudar seu progresso e encontrar métodos de diagnóstico e tratamento eficazes, os cientistas exploram o papel das bactérias no processo patológico.
Entre as abordagens mais promissoras está a análise metagenômica - sequenciamento do material genético total de uma comunidade microbiana. Uma equipe de pesquisa, incluindo cientistas da ITMO University e especialistas do Centro Federal de Pesquisa e Clínica de Medicina Físico-Química, em colaboração com médicos de vários centros médicos, investigou recentemente o metagenoma intestinal de pacientes com doença de Crohn. Foi descoberto que a composição da microbiota em tais pacientes é significativamente diferente em comparação com a de indivíduos saudáveis:conforme a fração de micróbios normais diminui, espécies patogênicas que não são prevalentes em humanos começam a dominar.
Embora o tipo de disbiose varie de paciente para paciente, a maioria deles manifestou um aumento várias vezes na abundância de Escherichia coli . Os cientistas começaram a identificar os genes específicos que distinguem os subtipos de Escherichia coli que habitam o intestino de pacientes com doença de Crohn e Escherichia coli que existe em pessoas saudáveis. A comparação realizada na população russa mostrou falta de tais diferenças universais. As observações foram confirmadas durante a análise dos conjuntos de dados disponíveis publicamente sobre indivíduos saudáveis e pacientes com doença de Crohn de todo o mundo.
" Escherichia coli é considerado um dos micróbios intestinais mais bem estudados e também foi um dos primeiros a ser descoberto. Sua abundância aumentada no intestino é observada em várias doenças. Nossa análise metagenômica mostrou que o conteúdo genético da doença de Crohn associada Escherichia coli varia muito, apesar da crença existente de que existem apenas algumas variedades específicas. Os resultados apóiam o conceito de que a doença de Crohn é uma síndrome, ou seja, uma doença em que manifestações semelhantes em vários casos são causadas por diferentes fatores em cada caso, "comenta Alexander Tyakht, um associado de pesquisa na ITMO University.
A pesquisa indicou que várias cepas de Escherichia coli pode coexistir no intestino humano. Como cepas com diferentes genomas podem desempenhar papéis ecológicos significativamente diferentes, os mesmos esquemas de tratamento podem ter um efeito diferente em diferentes cepas. Esta descoberta oferece uma oportunidade para melhorar o equilíbrio da microbiota intestinal em pacientes com doença de Crohn, enquanto a análise personalizada do genótipo bacteriano oferece uma oportunidade para selecionar os medicamentos mais eficientes, probióticos e até mesmo doadores de transplante de massa fecal (FMT) para cada paciente.
Essas descobertas também ressoam com as pesquisas anteriores dos cientistas que envolveram a análise do genoma de isolados E. coli Deformação. Os novos resultados lançam luz sobre como a microbiota muda em pacientes com doença de Crohn e quais espécies e cepas de bactérias participam de seu desenvolvimento. Esse, por sua vez, pode ajudar a entender melhor o início e o progresso da doença, bem como otimizar os métodos de tratamento.
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