La enfermedad de Crohn es una enfermedad inflamatoria intestinal grave que está muy extendida en los países desarrollados. Entre sus posibles factores causales se encuentran la predisposición genética, medio ambiente y estilo de vida de los pacientes. La enfermedad está asociada con una reacción anormal del sistema inmunológico a los propios microbios intestinales de una persona; La disbiosis intestinal es típica. Para estudiar su progreso y encontrar los métodos de diagnóstico y tratamiento eficientes, los científicos exploran el papel de las bacterias en el proceso patológico.
Entre los enfoques más prometedores se encuentra el análisis metagenómico:secuenciación del material genético total de una comunidad microbiana. Un equipo de investigación que incluye científicos de la Universidad ITMO y especialistas del Centro Federal de Investigación y Clínica de Medicina Físico-Química en colaboración con médicos de varios centros médicos ha investigado recientemente el metagenoma intestinal de pacientes con enfermedad de Crohn. Se descubrió que la composición de la microbiota en estos pacientes es significativamente diferente en comparación con la de los sujetos sanos:a medida que disminuye la fracción de microbios normales, Las especies patógenas que no prevalecen en los seres humanos comienzan a dominar.
Aunque el tipo de disbiosis varió de un paciente a otro, la mayoría de ellos manifestaron un aumento varias veces en la abundancia de Escherichia coli . Los científicos se propusieron identificar los genes específicos que distinguen los subtipos de Escherichia coli habitando el intestino de pacientes con enfermedad de Crohn y Escherichia coli que existe en personas sanas. La comparación realizada con la población rusa mostró la falta de tales diferencias universales. Las observaciones se confirmaron durante el análisis de los conjuntos de datos disponibles públicamente sobre sujetos sanos y pacientes con enfermedad de Crohn de todo el mundo.
" Escherichia coli se considera uno de los microbios intestinales mejor estudiados y también fue uno de los primeros en ser descubierto. Su mayor abundancia en el intestino se observa en una serie de enfermedades. Nuestro análisis metagenómico mostró que el contenido genético de la enfermedad de Crohn asociada Escherichia coli varia ampliamente, a pesar de la creencia existente de que solo existen algunas variedades específicas. Los resultados apoyan el concepto de que la enfermedad de Crohn es un síndrome, es decir., una enfermedad en la que manifestaciones similares en múltiples casos son causadas por diferentes factores en cada caso, "comenta Alexander Tyakht, investigador asociado en la Universidad ITMO.
La investigación indicó que varias cepas de Escherichia coli puede coexistir en un intestino humano. Dado que las cepas con diferentes genomas pueden desempeñar funciones ecológicas significativamente diferentes, los mismos esquemas de tratamiento pueden tener un efecto diferente en diferentes cepas. Este descubrimiento ofrece una oportunidad para mejorar el equilibrio de la microbiota intestinal en pacientes con enfermedad de Crohn. mientras que el análisis personalizado del genotipo bacteriano ofrece la oportunidad de seleccionar los medicamentos más eficientes, probióticos e incluso donantes de trasplante de masa fecal (FMT) para cada paciente.
Estos hallazgos también resuenan con la investigación anterior de los científicos que involucró el análisis del genoma de aislados E. coli son. Los nuevos resultados arrojan luz sobre cómo cambia la microbiota en pacientes con enfermedad de Crohn y qué especies y cepas de bacterias participan en su desarrollo. Esta, Sucesivamente, puede ayudar a comprender mejor la aparición y el progreso de la enfermedad, así como optimizar los métodos de tratamiento.
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