A metagenomikus elemzés segít megérteni a baktériumfajok szerepét a Crohns -betegségben

A Crohn -betegségben szenvedő betegek bélmetagenomjával kapcsolatos kutatások tisztázzák, hogy ez hogyan befolyásolja a bél mikrobiota taxonómiai és funkcionális összetételét. A leggyakoribb változások közé tartozik a hasznos mikrobák sokféleségének csökkenése és a megnövekedett mennyiség Escherichia coli és más gyulladással járó mikrobák. Az eredmények segíthetnek jobban megérteni a betegség okait és előrehaladását, valamint a kezelési sémák optimalizálása. Az eredményeket ben tették közzé BMC Genomics .

A Crohn -betegség súlyos gyulladásos bélbetegség, amely széles körben elterjedt a fejlett országokban. Ennek lehetséges okai között szerepel a genetikai hajlam, környezet és a betegek életmódja. A betegség az immunrendszer kóros reakciójához kapcsolódik az ember saját bélmikrobáihoz; a bél dysbiosis jellemző. Annak érdekében, hogy tanulmányozza a fejlődést, és megtalálja a hatékony diagnosztika és kezelés módszereit, A tudósok feltárják a baktériumok szerepét a kóros folyamatban.

A legígéretesebb megközelítések közé tartozik a metagenomikus elemzés - egy mikrobiális közösség teljes genetikai anyagának szekvenálása. Egy kutatócsoport, amely magában foglalja az ITMO Egyetem tudósait és a Szövetségi Fizikai-Kémiai Orvostudományi Kutató és Klinikai Központ szakembereit, együttműködve több orvosi központ klinikusával, nemrégiben vizsgálták a Crohn-betegségben szenvedő betegek bélmetagenomját. Felfedezték, hogy az ilyen betegek mikrobiota összetétele jelentősen eltér az egészséges alanyokétól:mivel a normális mikrobák aránya csökken, az emberben nem elterjedt kórokozó fajok kezdenek uralkodni.

Bár a dysbiosis típusa betegekről betegekre változott, többségükben többszörösére nőtt a bőség Escherichia coli . A tudósok elhatározták, hogy azonosítják azokat a géneket, amelyek megkülönböztetik az altípusokat Escherichia coli Crohn -betegségben szenvedő betegek bélrendszerében és gyakori Escherichia coli ami egészséges emberekben létezik. Az orosz lakossággal végzett összehasonlítás azt mutatta, hogy nincsenek ilyen egyetemes különbségek. A megfigyeléseket a világ minden tájáról származó egészséges alanyokról és Crohn -betegségben szenvedő betegekről nyilvánosan elérhető adatkészletek elemzése során megerősítették.

" Escherichia coli a legjobban tanulmányozott bélmikrobák közé tartozik, és az elsők között is felfedezték. A bélben megnövekedett bősége számos betegségben megfigyelhető. Metagenomikus elemzésünk kimutatta, hogy a Crohn-betegség genetikai tartalma összefügg Escherichia coli széles skálán mozog, annak ellenére, hogy fennáll a meggyőződés, hogy csak bizonyos fajták léteznek. Az eredmények alátámasztják azt az elképzelést, hogy a Crohn -betegség szindróma, azaz., olyan betegség, amelyben a hasonló megnyilvánulásokat több esetben minden esetben különböző tényezők okozzák, "kommentálja Alexander Tyakht, az ITMO Egyetem tudományos munkatársa.

A kutatás azt mutatta, hogy számos törzs Escherichia coli együtt tudnak élni az emberi bélben. Mivel a különböző genomokkal rendelkező törzsek jelentősen eltérő ökológiai szerepet játszhatnak, ugyanazok a kezelési sémák eltérő hatást gyakorolhatnak a különböző törzsekre. Ez a felfedezés lehetőséget kínál a bél mikrobiota egyensúlyának javítására Crohn -betegségben szenvedő betegeknél, míg a bakteriális genotípus személyre szabott elemzése lehetőséget kínál a leghatékonyabb gyógyszerek kiválasztására, probiotikumok, sőt széklet -transzplantációs (FMT) donorok minden beteg számára.

Ezek az eredmények is rezonálnak a tudósok korábbi kutatásaival, amelyek az izolált genom elemzését tartalmazták E. coli törzsek. Az új eredmények rávilágítanak arra, hogyan változik a mikrobiota a Crohn -betegségben szenvedő betegeknél, és hogy mely fajok és baktériumtörzsek vesznek részt annak kialakulásában. Ez, viszont, segíthet jobban megérteni a betegség kezdetét és előrehaladását, valamint a kezelési módszerek optimalizálása.

• A nyelv mikrobái felhasználhatók a hasnyálmirigyrák diagnosztizálására
• A tanulmány új utat nyit a fekélyes vastagbélgyulladás vagy a Crohns -betegség kezelésére