Forskere henter ut et fullstendig menneskelig genom fra en tusenvis av år gammel "tyggegummi"

Det virker som tyggegummi ikke er en ny trend! Forskere har funnet tyggegummi som er 5, 700 år gammel, og det har gitt ledetråder om gammelt DNA. En studie med funnene ble publisert i tidsskriftet Naturkommunikasjon . Det er tittelen, “A 5, 700 år gammelt menneskelig genom og muntlig mikrobiom fra tygget bjørk. "

Et team fra Universitetet i København brukte et utgravd tyggegummi som ble tygget og ekstrahert menneskelig genom fra det. Tyggegummien ble tilberedt av bjørkekrone og ble brukt til å tygge på fritiden, spekulerte de. Ifølge eksperter, dette er første gang at hele det gamle genomet er hentet ut fra en utgravd gjenstand enn bein.

Kunstnerisk rekonstruksjon av kvinnen som tygget bjørkeplassen. Hun har fått navnet Lola. Illustrasjon av Tom Björklund.

Det har vært rapporter om at bjørkhøyden ble brukt i paleolittisk tid som lim. Det er et brunsvart gummiaktig stoff laget ved å varme barken på bjørketreet. Når det er avkjølt, det må tygges for å gjøre det brukbart i daglig bruk som lim. Det kan også ha blitt brukt som tannverk eller et antiseptisk middel, sier noen eksperter. Det kan også ha blitt brukt som tyggegummi i fritiden, legger de til. De skrev, "De eldste eksemplene på tygget bek som finnes i Europa, dateres tilbake til mesolitikum og kjemisk analyse av gasskromatografi-massespektrometri (GC-MS) har vist at mange av dem var laget av bjørk ( Betula pendula ) ".

Utgravningen på Syltholm, øst for Rødbyhavn i Sør-Danmark ble utført av Museum Lolland-Falster under arbeidet med Femern-tunnelen. Theis Jensen, en doktorgradsstudent ved Globe Institute jobbet med doktorgraden sin og var en del av Syltholm -utgravningene. Jensen sa, “Syltholm er helt unik. Nesten alt er forseglet i gjørme, som betyr at bevaring av organiske rester er helt fenomenal. ” Han la til, "Det er det største steinalderstedet i Danmark, og de arkeologiske funnene tyder på at menneskene som okkuperte stedet utnyttet ville ressurser sterkt inn i yngre steinalder, som er perioden da oppdrett og husdyr først ble introdusert i Sør -Skandinavia. ”

Lederforsker, Førsteamanuensis Hannes Schroeder fra Globe Institute, Universitetet i København, sa i en uttalelse, "Det er fantastisk å ha fått et komplett gammelt menneskelig genom fra alt annet enn bein. Hva er mer, vi hentet også DNA fra orale mikrober og flere viktige menneskelige patogener, som gjør dette til en veldig verdifull kilde til gammelt DNA, spesielt i perioder hvor vi ikke har noen menneskelige levninger. "

Ved detaljert titt på genomet fant de ut at brukeren av tannkjøttet var en hunn, og hun var mer i slekt med jeger-samlere som bodde i Sentral-Europa sammenlignet med de som bodde i sentrale skandinaviske regioner. De spekulerte fra genomet om at hun mest sannsynlig hadde blå øyne, mørkt hår og mørk hud. Fra tyggegummiet isolerte teamet også DNA fra planten og dyrene som kan ha kommet i kontakt med den. De fant spesifikt and og hasselnøtter som hunnen kunne ha spist før eller rundt tyggegummiet, spekulerte de.

Deretter så forskerne på genomet til mikrober som ble funnet i tyggegummiet. Disse var sannsynligvis genomet til mikrobiota, kommensale organismer og opportunistiske bakterier i munnen og mage -tarmkanalen til hunnen som tygget den. Schroeder forklarte, “Bevaringen er utrolig god, og vi klarte å trekke ut mange forskjellige bakteriearter som er karakteristiske for et oralt mikrobiom. Våre forfedre levde i et annet miljø og hadde en annen livsstil og kosthold, og det er derfor interessant å finne ut hvordan dette gjenspeiles i mikrobiomet deres. ” Et av det mikrobielle genomet som ble funnet ble sagt å være av Epstein-Barr-virus, han la til. De skriver også at de er stolte, “ Neisseria subflava og Rothia mucilaginosa , samt flere bakterier inkludert i det røde komplekset (dvs. Porphyromonas gingivalis , Tannerella forsythia , og Treponema denticola ) ". Schroeder sa også:"Det kan hjelpe oss å forstå hvordan patogener har utviklet seg og spredt seg over tid, og hva som gjør dem spesielt virulente i et gitt miljø. Samtidig, det kan bidra til å forutsi hvordan et patogen vil oppføre seg i fremtiden, og hvordan det kan inneholdes eller utryddes. "

Teamet konkluderte med at "biter av tygget bjørk er en utmerket kilde til gammelt menneskelig og ikke-menneskelig DNA. I gang med å tygge, DNA blir fanget i banen der det er bevart på grunn av de aseptiske og hydrofobe egenskapene til banen som både hemmer mikrobiell og kjemisk forfall. ” De skrev videre, "Den genomiske informasjonen som er bevart i tyggede bjørkekrater, gir et øyeblikksbilde av menneskers liv, gi informasjon om genetiske aner, fenotype, helsestatus, og til og med livsopphold. I tillegg, det mikrobielle DNA gir informasjon om sammensetningen av vårt forfedres orale mikrobiom og utviklingen av spesifikke orale mikrober og viktige menneskelige patogener. ”

Denne studien ble finansiert av Villum Foundation og EUs forskningsprogram Horizon 2020 gjennom Marie Curie Actions.

• ACS spesialutgave fremhever toppforskningstrender og sentrale utviklinger innen kjemi
• Ulike mutasjoner i et enkelt gen kan ha utallige effekter på menneskers helse