Tutkijat ottavat ihmisen genomin tuhansia vuosia vanhasta ”purukumista”

Näyttää siltä, ​​että purukumi ei ole uusi trendi! Tutkijat ovat löytäneet purukumin, joka on 5, 700 vuotta vanha ja se on antanut vihjeitä muinaisesta DNA:sta. Tutkimus havainnoista julkaistiin lehdessä Luonnonviestintä . Sen otsikko on, "A 5, 700-vuotias ihmisen perimä ja suun mikrobiomi pureskellusta koivupiikistä. ”

Kööpenhaminan yliopiston tiimi käytti kaivettua purukumia, joka oli pureskeltava ja uutettu ihmisen genomista. Kumi valmistettiin koivupiikistä ja sitä käytettiin pureskella vapaa -ajalla, he spekuloivat. Asiantuntijoiden mukaan tämä on ensimmäinen kerta, kun koko muinainen genomi on uutettu muista louhituista esineistä kuin luista.

Taiteellinen rekonstruktio naisesta, joka pureskeli koivun kentällä. Hänen nimensä on Lola. Kuvitus:Tom Björklund.

On raportoitu, että koivupiikkiä käytettiin paleoliittisina aikoina liimana. Se on ruskehtavan musta kumimainen aine, joka valmistetaan kuumentamalla koivun kuorta. Kun se jäähtyy, sitä on pureskeltava, jotta se olisi käyttökelpoinen päivittäisessä käytössä liimana. Sitä on voitu käyttää myös hammassärky- tai antiseptisenä aineena, sanovat jotkut asiantuntijat. Sitä on voitu käyttää myös purukumina vapaa -ajalla, he lisäävät. He kirjoittivat, ”Vanhimmat Euroopassa löydetyt esimerkit pureskellusta piikistä ovat peräisin mesoliittiselta kaudelta, ja kaasukromatografia-massaspektrometria (GC-MS) -kemiallinen analyysi on osoittanut, että monet niistä on valmistettu koivusta ( Betula pendula ) ”.

Syltholmin kaivaukset, Rødbyhavnista itään Etelä-Tanskassa museo Lolland-Falster suoritti Fehmarn-tunnelin parissa työskentelyn aikana. Theis Jensen, Globe -instituutin jatko -opiskelija työskenteli väitöskirjansa parissa ja oli osa Syltholmin kaivauksia. Jensen sanoi, ”Syltholm on täysin ainutlaatuinen. Lähes kaikki on suljettu mutaan, mikä tarkoittaa, että orgaanisten jäänteiden säilyttäminen on aivan ilmiömäistä. ” Hän lisäsi, "Se on Tanskan suurin kivikautinen alue ja arkeologiset löydöt viittaavat siihen, että alueen miehittäneet ihmiset käyttivät voimakkaasti luonnonvaroja hyvin neoliittiseen aikaan, Se on aika, jolloin viljely ja kotieläimet tuotiin ensimmäisen kerran Etelä -Skandinaviaan. ”

Johtava tutkija, Apulaisprofessori Hannes Schroeder Globe -instituutista, Kööpenhaminan yliopisto, sanoi lausunnossaan, ”On hämmästyttävää saada täydellinen muinainen ihmisen perimä kaikesta muusta kuin luusta. Mikä on enemmän, haimme myös DNA:ta suullisista mikrobeista ja useista tärkeistä ihmisen patogeeneistä, mikä tekee tästä erittäin arvokkaan muinaisen DNA:n lähteen, varsinkin ajanjaksoiksi, jolloin meillä ei ole ihmisjäännöksiä. ”

Tarkastellessaan perimää yksityiskohtaisesti he huomasivat, että purukumin käyttäjä oli nainen ja hän oli enemmän sukulaisia ​​metsästäjä-keräilijöihin, jotka asuivat Keski-Euroopassa verrattuna niihin, jotka asuivat Keski-Skandinavian alueilla. He arvelivat genomista, että hänellä oli todennäköisesti siniset silmät, tummat hiukset ja tumma iho. Purukumista ryhmä erotti myös kasvin ja sen kanssa mahdollisesti kosketuksiin joutuneiden eläinten DNA:n. He löysivät erityisesti ankkaa ja hasselpähkinöitä, joita naaras olisi voinut syödä ennen purukumin pureskelua tai sen aikana, he spekuloivat.

Seuraavaksi tutkijat tarkastelivat purukumista löytyneiden mikrobien genomia. Nämä olivat luultavasti mikrobiston genomi, pureskelevan naisen suun ja ruoansulatuskanavan kommensaaliset organismit ja opportunistiset bakteerit. Schroeder selitti, "Säilytys on uskomattoman hyvä, ja onnistuimme poistamaan monia erilaisia ​​bakteerilajeja, jotka ovat ominaisia ​​suun mikrobiomille. Esivanhempamme asuivat erilaisessa ympäristössä ja heillä oli erilainen elämäntapa ja ruokavalio, ja siksi on mielenkiintoista tietää, miten tämä heijastuu heidän mikrobiomiinsa. ” Yksi löydetyistä mikrobien genomeista sanottiin olevan Epstein-Barr-virusta, hän lisäsi. He myös kirjoittavat olevansa huijareita, " Neisseria subflava ja Rothia mucilaginosa , sekä useita punaiseen kompleksiin kuuluvia bakteereja (esim. Porphyromonas gingivalis , Tannerella forsythia , ja Treponema denticola ) ”. Schroeder sanoi myös, "Se voi auttaa meitä ymmärtämään, kuinka taudinaiheuttajat ovat kehittyneet ja levinneet ajan myötä, ja mikä tekee niistä erityisen virulentteja tietyssä ympäristössä. Samaan aikaan, se voi auttaa ennustamaan, kuinka taudinaiheuttaja käyttäytyy tulevaisuudessa, ja miten se voitaisiin rajoittaa tai hävittää. ”

Työryhmä päätteli, että ”pureskellut koivunpitsat ovat erinomainen muinaisen ihmisen ja ei-ihmisen DNA:n lähde. Pureskelun aikana, DNA jää loukkuun kentässä, jossa se säilyy, koska äänenkorkeuden aseptiset ja hydrofobiset ominaisuudet estävät sekä mikrobien että kemiallisen hajoamisen. ” He kirjoittivat edelleen, ”Koivupiran pureskeltuihin paloihin tallennettu genomitieto tarjoaa tilannekuvan ihmisten elämästä, antaa tietoa geneettisistä syntyperistä, fenotyyppi, terveydentila, ja jopa toimeentuloa. Lisäksi, Mikro -DNA antaa tietoa esi -isiemme suun mikrobiomimme koostumuksesta ja spesifisten suun mikrobien ja tärkeiden ihmisen patogeenien kehityksestä. ”

Tätä tutkimusta rahoittivat Villum -säätiö ja EU:n tutkimusohjelma Horisontti 2020 Marie Curie -toimien kautta.

• ACS:n erikoisnumero tuo esille huippututkimustrendit ja kemian tärkeimmät kehitykset
• Yhden geenin eri mutaatioilla voi olla lukemattomia vaikutuksia ihmisten terveyteen