Des scientifiques extraient le génome humain complet d'un « chewing-gum » vieux de plusieurs milliers d'années

Il semble que le chewing-gum ne soit pas une nouvelle tendance ! Les chercheurs ont trouvé un chewing-gum de 5, 700 ans et il a fourni des indices concernant l'ADN ancien. Une étude avec les résultats a été publiée dans la revue Communication Nature . Il est intitulé, « Un 5, Génome humain de 700 ans et microbiome oral à partir de poix de bouleau mâché.

Une équipe de l'Université de Copenhague a utilisé un morceau de gomme excavé qui a été mâché et en a extrait le génome humain. La gomme était préparée à partir de poix de bouleau et servait à mâcher à loisir, ils ont spéculé. D'après les experts, c'est la première fois que l'ensemble du génome ancien est extrait d'un artefact excavé autre que des os.

Reconstitution artistique de la femme qui mâchait la poix de bouleau. Elle s'appelle Lola. Illustration de Tom Björklund.

Il a été rapporté que la poix de bouleau était utilisée à l'époque paléolithique comme colle. C'est une substance gommeuse noir brunâtre obtenue en chauffant l'écorce du bouleau. Une fois refroidi, il doit être mâché pour le rendre utilisable au quotidien comme colle. Il peut également avoir été utilisé comme remède contre les maux de dents ou comme antiseptique, disent certains experts. Il peut également avoir été utilisé comme chewing-gum à loisir, ajoutent-ils. Ils ont écrit, « Les plus anciens exemples de brai mâché trouvés en Europe remontent à la période mésolithique et l'analyse chimique par chromatographie en phase gazeuse-spectrométrie de masse (GC-MS) a montré que beaucoup d'entre eux étaient fabriqués à partir de bouleau ( Betula pendula )".

La fouille de Syltholm, à l'est de Rødbyhavn dans le sud du Danemark a été réalisée par le musée Lolland-Falster lors de leurs travaux sur le tunnel de Fehmarn. Theis Jensen, un étudiant post-doctorant au Globe Institute travaillait sur son doctorat et faisait partie des fouilles de Syltholm. Jensen a dit, « Syltholm est complètement unique. Presque tout est scellé dans la boue, ce qui signifie que la préservation des restes organiques est absolument phénoménale. Il ajouta, "C'est le plus grand site de l'âge de pierre au Danemark et les découvertes archéologiques suggèrent que les personnes qui occupaient le site exploitaient fortement les ressources sauvages jusqu'au néolithique, qui est la période où l'élevage et les animaux domestiques ont été introduits pour la première fois dans le sud de la Scandinavie.

Chercheur principal, Professeur agrégé Hannes Schroeder du Globe Institute, Université de Copenhague, a déclaré dans un communiqué, « C'est incroyable d'avoir obtenu un génome humain ancien complet à partir d'autre chose que de l'os. De plus, nous avons également récupéré de l'ADN de microbes oraux et de plusieurs agents pathogènes humains importants, ce qui en fait une source très précieuse d'ADN ancien, surtout pour les périodes où nous n'avons pas de restes humains.

Après un examen détaillé du génome, ils ont découvert que l'utilisateur de la gomme était une femme et qu'elle était plus apparentée aux chasseurs-cueilleurs qui vivaient en Europe centrale qu'à ceux qui vivaient dans les régions scandinaves centrales. Ils ont supposé à partir du génome qu'elle avait très probablement les yeux bleus, cheveux foncés et peau foncée. À partir du chewing-gum, l'équipe a également isolé l'ADN de la plante et des animaux qui auraient pu entrer en contact avec celui-ci. Ils ont notamment trouvé du canard et des noisettes que la femelle aurait pu consommer avant ou au moment de mâcher le chewing-gum, ils ont spéculé.

Ensuite, les chercheurs ont examiné le génome des microbes trouvés dans le chewing-gum. Il s'agissait probablement du génome du microbiote, les organismes commensaux et les bactéries opportunistes de la bouche et du tractus gastro-intestinal de la femelle qui le mâchait. Schroeder a expliqué, « La conservation est incroyablement bonne, et nous avons réussi à extraire de nombreuses espèces bactériennes différentes qui sont caractéristiques d'un microbiome buccal. Nos ancêtres vivaient dans un environnement différent et avaient un mode de vie et un régime alimentaire différents, et il est donc intéressant de savoir comment cela se reflète dans leur microbiome. L'un des génomes microbiens découverts serait celui du virus d'Epstein-Barr, il ajouta. Ils écrivent aussi qu'ils ont trouvé, " Neisseria subflava et Rothia mucilaginosa , ainsi que plusieurs bactéries incluses dans le complexe rouge (c'est-à-dire Porphyromonas gingivalis , Tannerella forsythia , et Treponema denticola )". Schroeder a également dit, « Cela peut nous aider à comprendre comment les agents pathogènes ont évolué et se sont propagés au fil du temps, et ce qui les rend particulièrement virulentes dans un environnement donné. À la fois, cela peut aider à prédire comment un agent pathogène se comportera à l'avenir, et comment il pourrait être contenu ou éradiqué.

L'équipe a conclu que « les morceaux de brai de bouleau mâché sont une excellente source d'ADN ancien humain et non humain. En train de mâcher, l'ADN est piégé dans le brai où il est préservé en raison des propriétés aseptiques et hydrophobes du brai qui inhibent à la fois la décomposition microbienne et chimique. Ils ont en outre écrit, « Les informations génomiques conservées dans les morceaux de brai de bouleau mâchés offrent un instantané de la vie des gens, fournir des informations sur l'ascendance génétique, phénotype, état de santé, et même de subsistance. En outre, l'ADN microbien fournit des informations sur la composition de notre microbiome oral ancestral et l'évolution de microbes oraux spécifiques et d'agents pathogènes humains importants.

Cette étude a été financée par la Fondation Villum et le programme de recherche de l'UE Horizon 2020 à travers les actions Marie Curie.

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