Crijevni mikrobiom utječe na zdravlje mozga, uključujući kako se mozak oporavlja od moždanog udara. Masne kiseline kratkog lanca, proizvod fermentacije iz bakterija u našim crijevima, ključna su komponenta zdravlja crijeva, ali njihova uloga u oporavku od moždanog udara nije istražena.
Sadler i sur. dodavao kratke lance masnih kiselina u pitku vodu miševa četiri tjedna prije nego što je izazvao moždani udar. Miševi koji su pili vodu s masnim kiselinama doživjeli su bolji oporavak od moždanog udara u usporedbi s kontrolnim miševima, uključujući smanjenje motoričkih oštećenja i povećani rast kralježnice na dendritima - ključnu memorijsku strukturu. Dodatno, miševi s dodatkom masnih kiselina izrazili su više gena povezanih s mikroglijom, imunološke stanice mozga. Aktivnost mikroglije mogla bi biti odgovorna za povećanje dendritičkih bodlji i poboljšanje ishoda moždanog udara. Ovaj odnos ukazuje na to da masne kiseline kratkog lanca mogu poslužiti kao glasnici u vezi crijeva i mozga utječući na to kako mozak reagira na ozljedu.