Študija na univerzi v Alabami v Birminghamu je zdaj odkrila to motnjo na ravni seva mikrobov, ki je nadomestil drug sev iste vrste pri 30 posameznikih - vsi mladi, zdravih odraslih, za katere se pričakuje, da imajo stabilne mikrobne skupnosti.
Kot je razvidno iz naše analize, sposobnost okrevanja glede na število in stabilnost novih sevov je specifična za vsakega posameznika. "
Casey Morrow, Doktor znanosti, vodja raziskovalne skupine in zaslužni profesor na Oddelku za celice UAB, Razvojna in integrativna biologija
Razlike pri okrevanju imajo potencialne posledice za zdravje, Morrow pravi.
"Možno je, da s staranjem posameznikov pri čemer se vsak razlikuje glede na število in cikle zdravljenja z antibiotiki, rezervoar mikrobnih sevov je izčrpan, kar ima za posledico vzorec okrevanja posameznih mikrobnih sevov znotraj posameznika, "je dejal." Razumevanje tega vzorca okrevanja-vključno s pojavom določenih sevov po antibiotikih-je lahko pomemben dejavnik za dolgoročno zdravje. "
"V prihodnosti, karakterizacijo teh posameznih vzorcev okrevanja bi lahko uporabili tudi za napoved občutljivosti na endogene in eksogene mikrobne patogene. "
Študija UAB je z bioinformatičnimi orodji analizirala prej opisano študijo 18 posameznikov, ki so prejeli en sam antibiotik, cefprozil, en teden. Njihovi vzorci blata so bili zbrani pri predhodni obdelavi, ob koncu zdravljenja z antibiotiki in tri mesece po zdravljenju. Študija UAB je analizirala tudi prej opisane podatke 12 posameznikov, ki so prejemali kombinacijo treh antibiotikov - meropenema, gentamicin in vankomicin - štiri dni. Njihovi vzorci blata so bili zbrani pri predhodni obdelavi; na koncu zdravljenja; in ob štirih, 38 in 176 dni po zdravljenju. Analizirali so tudi šest kontrolnih posameznikov, ki niso prejemali antibiotikov.
Na splošno, raziskovalci UAB so ugotovili, da so sevi 10 najbolj razširjenih vrst ostali stabilni pri kontrolah. Pri posameznikih, ki se zdravijo z enim antibiotikom, 15 od 18 posameznikov je imelo po zdravljenju prehodne nove seve, ki, po vrsti, tri mesece po zdravljenju so nadomestili s prvotnim sevom.
V nasprotju, posamezniki s trojnimi antibiotiki so pokazali znatno povečanje števila novih sevov, ki so obstajali kar šest mesecev po zdravljenju, v primerjavi z enim samim antibiotikom in kontrolnimi posamezniki. Poleg tega delež prehodnih sevov je bil tudi bistveno večji pri posameznikih z več antibiotiki. To je predlagalo dolgoročno spremembo v alternativno stabilno stanje mikrobioma, Morrow pravi. Do teh sprememb ni prišlo zaradi razlike v stopnjah rasti.
"Glede na pomen mikrobioma za zdravje ljudi, menimo, da se lahko naši rezultati s temi nizi podatkov uporabijo za oceno stabilnosti mikrobioma pod različnimi pogoji, "Je rekel Morrow." Na primer, zdaj lahko kliničnim preiskovalcem zagotovimo smernice za presojo vpliva nekaterih zdravil na bolezni, na primer raka ali sladkorne bolezni, na črevesno mikrobno skupnost, ki bi lahko bila pomembna za oceno rezultatov. Poleg tega ta pristop bi lahko uporabili pri pacientovi pre- in post-hospitalizaciji, da bi identificirali posameznike, ki bodo morda potrebovali nadaljnje obvladovanje svojih mikrobiomov. "
"Ta študija je uporabila orodje za bioinformatiko za sledenje sevom, ki ga je prej razvil UAB, imenovana različica enojnega nukleotida na osnovi oken, ali WSS, za sledenje mikrobnih sevov posameznikov od predhodnega zdravljenja do zdravljenja po antibiotikih, "je dejal Hyunmin Koo, Doktor znanosti, Oddelek za genetiko UAB in Heflinov center za genomske znanosti, ki je vodil analizo informatike. "Ta tehnika napreduje pri analizi vpliva antibiotikov na črevesno črevesno mikrobioto. Prejšnje študije mikrobioma so lahko določile celoten taksonomski profil, vključno z informacijami o relativni številčnosti vsake vrste, vendar je pokazal omejitev za razlikovanje vsake vrste na ravni seva ali sledenje istemu sevu pri vsakem posamezniku na vzdolžni ravni. "
Leta 2017 je raziskovalci UAB so uporabili WSS, da bi pokazali prvi neposredni dokaz, da so fekalni darovalci mikrobov - ki se uporabljajo za zdravljenje bolnikov s ponavljajočimi se okužbami s Clostridium difficile - po presajanju fekalij ostali pri prejemnikih še mesece ali leta.