Studija na Sveučilištu Alabama u Birminghamu sada je pratila ovaj poremećaj na razini soja mikroba koji je zamijenio drugi soj iste vrste u 30 jedinki - svi su mladi, zdrave odrasle osobe za koje bi se očekivalo da imaju stabilne mikrobne zajednice.
Kao što je pokazano iz naše analize, sposobnost oporavka s obzirom na broj i stabilnost novih sojeva specifična je za svakog pojedinca. "
Casey Morrow, Dr. Sc., vođa istraživačkog tima i profesor emeritus na Odjelu za ćelije UAB -a, Razvojna i integrativna biologija
Razlike u oporavku imaju potencijalne zdravstvene posljedice, Kaže Morrow.
"Moguće je kako pojedinci stare, pri čemu se svaki razlikuje u broju i ciklusima liječenja antibioticima, rezervoar mikrobnih sojeva je iscrpljen, što rezultira intraindividualnim obrascem oporavka za određene mikrobne sojeve, "Razumijevanje ovog obrasca oporavka-uključujući pojavu određenih sojeva nakon antibiotika-može biti važno razmatranje za dugoročno zdravlje."
"U budućnosti, karakterizacija ovih pojedinačnih obrazaca oporavka mogla bi se također koristiti za predviđanje osjetljivosti i na endogene i na egzogene mikrobne patogene. "
Studija UAB koristila je bioinformatičke alate za analizu prethodno opisane studije na 18 osoba koje su dobile jedan antibiotik, cefprozil, na tjedan dana. Njihovi fekalni uzorci prikupljeni su pri prethodnoj obradi, na kraju liječenja antibioticima i tri mjeseca nakon liječenja. Studija UAB također je analizirala prethodno opisane podatke 12 pojedinaca koji su dobili kombinaciju tri antibiotika - meropenema, gentamicin i vankomicin - četiri dana. Njihovi su uzorci izmeta prikupljeni pri prethodnoj obradi; na kraju liječenja; i u četiri, 38 i 176 dana nakon tretmana. Analizirano je i šest kontrolnih osoba koje nisu primale antibiotike.
Općenito, istraživači UAB -a otkrili su da su sojevi 10 najzastupljenijih vrsta ostali stabilni u kontroli. U pojedinačnih pojedinačnih lijekova antibioticima, 15 od 18 osoba imalo je prijelazne nove sojeve nakon tretmana, zauzvrat, zamijenjeni su izvornim sojem tri mjeseca nakon tretmana.
U kontrastu, pojedinci s trostrukim antibioticima pokazali su značajan porast novih sojeva koji su trajali čak šest mjeseci nakon liječenja, u usporedbi s pojedinačnim antibiotikom i kontrolnim pojedincima. Nadalje, udio prolaznih sojeva također je bio značajno veći kod pojedinaca s više antibiotika. To je sugeriralo dugoročnu promjenu u alternativno stabilno stanje mikrobioma, Kaže Morrow. Do ovih promjena nije došlo zbog razlike u stopama rasta.
"S obzirom na važnost mikrobioma u ljudskom zdravlju, mislimo da se naši rezultati s ovim skupovima podataka mogu koristiti za procjenu stabilnosti mikrobioma pod različitim uvjetima, "Morrow je rekao." Na primjer, sada možemo pružiti smjernice kliničkim istražiteljima da procijene utjecaj određenih tretmana na bolesti, poput raka ili dijabetesa, na crijevnu mikrobnu zajednicu koja bi mogla biti značajna za procjenu ishoda. Nadalje, ovaj pristup mogao bi se primijeniti na pacijente prije i poslije hospitalizacije kako bi se identificirali pojedinci kojima je potrebno daljnje zbrinjavanje njihovih mikrobioma. "
"Ova studija koristila je alat za bioinformatiku za praćenje naprezanja koji je prethodno razvio UAB, nazvana varijanta jednoličnosti nukleotida zasnovana na prozoru, ili WSS, za praćenje mikrobnih sojeva pojedinaca od predliječenja do liječenja nakon antibiotika, "rekao je Hyunmin Koo, Dr. Sc., UAB Odjel za genetiku i Heflin centar za genomsku znanost, koji je vodio analizu informatike. "Ova tehnika unaprjeđuje analizu utjecaja antibiotika na mikrobiotu crijeva čovjeka. Prethodne studije mikrobioma mogle su utvrditi ukupni taksonomski profil, uključujući podatke o relativnoj brojnosti svake vrste, ali je pokazalo ograničenje razlikovanja svake vrste na razini soja ili praćenja istog soja kod svakog pojedinca na uzdužnoj razini. "
2017. godine, istraživači iz UAB -a koristili su WSS kako bi pokazali prvu izravnu demonstraciju da su fekalni donatorski mikrobi - korišteni za liječenje pacijenata s ponavljajućim infekcijama Clostridium difficile - ostali u primatelja mjesecima ili godinama nakon fekalnih transplantacija.