Лечение антибиотиками может вызвать временное и долгосрочное нарушение микробов кишечника.

Триллионы микробов в кишечнике помогают здоровью человека, включая переваривание грудного молока, расщепляет клетчатку и помогает контролировать иммунную систему. Тем не мение, известно, что лечение антибиотиками нарушает структуру сообщества этих микробов - 500 к 1, 000 видов бактерий, оказывающих в основном благотворное влияние.

Исследование, проведенное в Университете Алабамы в Бирмингеме, теперь отслеживает это нарушение на уровне штамма микробов, заменяющего другой штамм того же вида у 30 человек - все они молодые, здоровые взрослые, от которых ожидается наличие стабильных микробных сообществ.

<цитата>

Как показал наш анализ, способность восстанавливать количество и стабильность новых штаммов индивидуальна для каждого человека ».

Кейси Морроу, Кандидат наук., руководитель исследовательской группы и почетный профессор отдела сотовой связи UAB, Биология развития и интегративная биология

Различия в выздоровлении могут иметь последствия для здоровья, - говорит Морроу.

"Возможно, что с возрастом люди каждый из которых отличается количеством и циклами лечения антибиотиками, резервуар микробных штаммов истощен, что приводит к внутрииндивидуальному выздоровлению конкретных штаммов микробов, - сказал он. - Понимание этой схемы выздоровления - включая появление определенных штаммов после приема антибиотиков - может быть важным фактором для долгосрочного здоровья ».

"В будущем, характеристика этих индивидуальных особенностей выздоровления также может быть использована для прогнозирования восприимчивости как к эндогенным, так и к экзогенным микробным патогенам ».

В исследовании UAB использовались биоинформатические инструменты для анализа ранее описанного исследования 18 человек, которым давали один антибиотик, цефпрозил, на неделю. Образцы их фекалий были собраны при предварительной обработке, в конце лечения антибиотиками и через три месяца после лечения. В исследовании UAB также были проанализированы ранее описанные данные 12 человек, которым давали комбинацию из трех антибиотиков - меропенема, гентамицин и ванкомицин - четыре дня. Их фекальные образцы были собраны при предварительной обработке; по окончании лечения; и в четыре, 38 и 176 дней после лечения. Также были проанализированы шесть контрольных лиц, которые не получали антибиотики.

В основном, исследователи UAB обнаружили, что штаммы 10 наиболее распространенных видов оставались стабильными в контроле. При однократном лечении антибиотиками индивидуумы, 15 из 18 человек после лечения имели преходящие новые штаммы, которые, по очереди, были заменены исходным штаммом через три месяца после лечения.

Наоборот, у лиц, принимавших тройные антибиотики, наблюдалось значительное увеличение новых штаммов, которые сохранялись в течение шести месяцев после лечения, по сравнению с индивидуальным антибиотиком и контрольными индивидуумами. Более того, доля транзиторных штаммов также была значительно выше у лиц, принимавших несколько антибиотиков. Это предполагало долгосрочное изменение к альтернативному стабильному состоянию микробиома, - говорит Морроу. Эти изменения произошли не из-за разницы в темпах роста.

"Учитывая важность микробиома для здоровья человека, мы думаем, что наши результаты с этими наборами данных могут быть использованы для оценки стабильности микробиома в различных условиях, - сказал Морроу. - Например, Теперь мы можем предоставить рекомендации клиническим исследователям, чтобы судить о влиянии определенных методов лечения заболеваний, например, рак или диабет, на микробном сообществе кишечника, что может иметь значение для оценки результатов. Более того, этот подход может быть применен к пациенту до и после госпитализации для выявления людей, которым может потребоваться дальнейшее управление их микробиомами ».

«В этом исследовании использовался инструмент биоинформатики для отслеживания деформации, ранее разработанный UAB, названный Сходство на основе окна Однонуклеотидный вариант, или WSS, для отслеживания микробных штаммов отдельных лиц от до лечения до лечения антибиотиками, "сказал Хёнмин Ку, Кандидат наук., Отдел генетики UAB и Центр геномных наук Heflin, кто руководил анализом информатики. «Этот метод продвигает анализ воздействия антибиотиков на микробиоту кишечника человека. Предыдущие исследования микробиома позволили определить общий таксономический профиль, включая информацию об относительной численности каждого вида, но показали ограничение, позволяющее различать каждый вид на уровне деформации или отслеживать одну и ту же деформацию у каждого человека на продольном уровне ».

В 2017 г. исследователи UAB использовали WSS, чтобы продемонстрировать первую прямую демонстрацию того, что микробы доноров фекалий, используемые для лечения пациентов с рецидивирующими инфекциями Clostridium difficile, оставались у реципиентов в течение месяцев или лет после трансплантации фекалий.

• Исследователи получают грант NIH в размере 3,2 миллиона долларов для более глубокого понимания синдрома Дауна.
• Новое лечение обещает обратить вспять целиакию