Egy tanulmány a Birminghami Alabamai Egyetemen most ezt a zavart követte nyomon olyan mikrobatörzs szintjén, amely ugyanazon faj másik törzsét váltotta fel 30 egyedben - mindegyik fiatal, egészséges felnőttek, akik várhatóan stabil mikrobiális közösségekkel rendelkeznek.
Ahogy elemzésünkből kiderül, az új törzsek számával és stabilitásával kapcsolatos helyreállítási képesség minden egyénre jellemző. "
Casey Morrow, Ph.D., a kutatócsoport vezetője és emeritus professzor az UAB Sejtosztályán, Fejlődési és integrációs biológia
A felépülési különbségek potenciális egészségügyi következményekkel járhatnak, Morrow azt mondja.
"Lehetséges, hogy az egyének öregedésével, mindegyik eltér az antibiotikum -kezelés számától és ciklusától, a mikrobiális törzsek tárolója kimerült, ennek eredményeként egyedi mikrobatörzsek esetén az egyénen belül helyreáll a minta, "Ennek a helyreállítási mintának a megértése-beleértve az antibiotikumokat követő bizonyos törzsek előfordulását-fontos szempont lehet a hosszú távú egészség szempontjából."
"A jövőben, ezeknek az egyedi specifikus helyreállítási mintáknak a jellemzése felhasználható az endogén és exogén mikrobiális kórokozók iránti érzékenység előrejelzésére is. "
Az UAB tanulmánya bioinformatikai eszközökkel elemezte a korábban leírt vizsgálatot 18 olyan személyről, akik egyetlen antibiotikumot kaptak, cefprozil, egy hétig. A székletmintákat az előkezelés során gyűjtötték, az antibiotikum-kezelés végén és a kezelés után három hónappal. Az UAB tanulmánya elemezte azokat a 12 személy korábban leírt adatait is, akik három antibiotikum - meropenem, - kombinációját kapták. gentamicin és vankomycin - négy napig. Székletmintáikat előkezeléskor gyűjtötték; a kezelés végén; és négykor, 38 és 176 nappal a kezelés után. Hat kontroll személyt is elemeztek, akik nem kaptak antibiotikumot.
Általánosságban, az UAB kutatói azt találták, hogy a 10 leggyakoribb faj törzse stabil maradt a kontrollokban. Egyetlen antibiotikum -kezelésben szenvedő egyéneknél 18 személy közül 15-nek volt átmeneti új törzse a kezelés után, viszont, három hónappal a kezelés után felváltották az eredeti törzset.
Ellentétben, a hármas antibiotikummal rendelkező személyek szignifikáns növekedést mutattak az új törzsekben, amelyek a kezelés után még hat hónapig fennmaradtak, az egyetlen antibiotikumhoz és a kontroll egyénekhez képest. Továbbá, az átmeneti törzsek aránya is szignifikánsan magasabb volt a több antibiotikumot kapó egyéneknél. Ez azt javasolta, hogy hosszú távon váltsanak egy alternatív stabil mikrobiom állapotra, Morrow azt mondja. Ezeket a változásokat nem a növekedési ütemek különbsége okozta.
"Tekintettel a mikrobiom fontosságára az emberi egészségben, úgy gondoljuk, hogy ezekkel az adathalmazokkal kapott eredményeink felhasználhatók a mikrobióma stabilitásának értékeléséhez különböző körülmények között, "Morrow mondta." Például most útmutatást tudunk adni a klinikai kutatóknak, hogy megítélhessék bizonyos betegségek kezelésének hatását, például rák vagy cukorbetegség, a bél mikrobiális közösségre vonatkozóan, ami jelentős lehet az eredmények értékelése szempontjából. Továbbá, ez a megközelítés alkalmazható a beteg kórházi kezelés előtti és utáni időszakában, hogy azonosítani lehessen azokat az egyéneket, akiknek szükségük lehet további mikrobiómák kezelésére. "
"Ez a tanulmány egy törzskövető bioinformatikai eszközt használt, amelyet korábban az UAB fejlesztett ki, ablak-alapú hasonlóság egyetlen nukleotid-variáns, vagy WSS, az egyének mikrobiális törzseinek nyomon követése az előkezeléstől az antibiotikum utáni kezelésig, - mondta Hyunmin Koo, Ph.D., UAB Genetikai Tanszék és Heflin Genomikai Tudományos Központ, aki az informatikai elemzést vezette. "Ez a technika elősegíti az antibiotikumok emberi bél mikrobiotára gyakorolt hatásának elemzését. A mikrobiom korábbi tanulmányai képesek voltak meghatározni egy általános rendszertani profilt, beleértve az egyes fajok relatív bőségi adatait, de korlátozást mutatott az egyes fajok megkülönböztetésére a törzs szintjén, vagy ugyanazon törzs nyomon követésére minden egyedben hosszanti szinten. "
2017 -ben az UAB kutatói a WSS segítségével mutatták be az első közvetlen bizonyítékot arra, hogy a széklet donor mikrobái - amelyeket visszatérő Clostridium difficile fertőzésben szenvedő betegek kezelésére használtak - a székletátültetés után hónapokig vagy évekig a recipiensekben maradtak.