Исследователи разрабатывают инструмент, ускоряющий анализ и публикацию биомедицинских данных.

Исследователи из Медицинской школы Икана на горе Синай разработали инструмент, который ускоряет анализ и публикацию биомедицинских данных с нескольких месяцев или лет до нескольких минут. изменение способа, которым исследователи сообщают результаты своих исследований. До настоящего времени, Основной доступный метод обмена данными биомедицинских исследований - печатные публикации в научных журналах. Новый инструмент, BioJupies, полагается на облачные технологии для анализа и визуализации больших объемов данных, например, полученный путем секвенирования генома, как описано в выпуске за ноябрь 2018 г. Сотовые системы .

Секвенирование РНК - наиболее распространенный экспериментальный метод, используемый для профилирования клеток в биомедицинских исследованиях. В последние годы, технология секвенирования произвела революцию в том, как ученые исследуют генетические данные, и этот прогресс играет решающую роль в открытии и разработке лекарств. Традиционно Анализ последовательности РНК требует обширных навыков компьютерного программирования и доступа к местным высокопроизводительным вычислительным средствам. снижение скорости анализа биомедицинских данных, общий, и опубликовано.

Благодаря созданию BioJupies, Теперь пользователи могут загружать и анализировать свои данные о секвенировании РНК быстрее, чем раньше. Платформа использует конвейер облачных вычислений, который снижает стоимость обработки данных секвенирования РНК до менее одного цента на образец. BioJupies также производит полный, Открытый исходный код, интерактивный отчет из обработанных данных с учетом 300, 000 общедоступных наборов данных секвенирования РНК, которые необходимо получить, повторно проанализированы, и повторно используется для поддержки биомедицинских исследований.

"Поскольку количество генерируемых биомедицинских данных продолжает расти в геометрической прогрессии, также должны использоваться инструменты, используемые для их анализа и обмена, "сказал Ави Мааян, Кандидат наук, Директор Центра биоинформатики на горе Синай, Профессор, Кафедра фармакологических наук, факультет Icahn Institute for Data Science, и старший автор публикации. «BioJupies не только ускоряет анализ и интерпретацию данных, но он также предоставляет совершенно новый способ поделиться результатами с мировым исследовательским сообществом ».

Поскольку новые геномные технологии позволили собрать огромные объемы биомедицинской информации, которая может быть использована для усилий по прецизионной медицине, доступность, совместимость, и возможность повторного использования этих данных стала критически важной для научных исследований. BioJupies прокладывает путь исследователям, не имеющим вычислительной подготовки, для выполнения анализа секвенирования РНК без необходимости сотрудничества с биоинформатиками, позволяя большему количеству медицинских и научных достижений процветать в нашем мире, богатом данными.

• Исследователи изучают, можно ли рекомендовать диеты с низким содержанием глютена людям без аллергии.
• Исследование позволяет по-новому взглянуть на вспышки норовируса,