gastric entholl Mouse Modeller mat prostaglandin E
2 Passerelle Aktivéierung weisen ähnlechen Gentherapie Ausdrock Profiler ze intestinal-Typ Mënsch gastric Kriibs VerfÜgung méiglech VerfÜgung Background VerfÜgung Gastric Cancers sinn nees besser ënnerscheet intestinal-Typ entholl allgemeng séiert a ganz wéineg ënnerscheet diffusen-Typ een no Lauren d'histological categorization. Obwuel Aféierungs- vun prostaglandin E 2 Passerelle gastric erhéijen an Mais an Zesummenaarbecht mat dereguléierte Wnt oder Name signalings ënnerstëtzt, huet et ongeléiste ob der gastric entholl Maus Modeller entweder vum Mënsch Typ gastric Kriibs recapitulate. Dës Etude évaluéieren d'Ähnlechkeet an Ausdrock tëscht gastric erhéijen vun transgenic Mais a verschidde Stoffer vum Mënsch Cancers profiling beschte-fit Mënsch erhéijen fir d'transgenic Mais Modeller ze fannen. VerfÜgung Resultater VerfÜgung Global Ausdrock profiling Ufank gastric erhéijen aus COX- fonnt 2 VerfÜgung /mPGES-1 VerfÜgung (C2mE) -related transgenic Mais (K19-C2mE VerfÜgung, K19-Wnt1 /C2mE VerfÜgung, an K19-Nog /C2mE VerfÜgung) Beruff gastric Cancers ënnert der puer Stoffer vum Mënsch Cancers dorënner Colon, Broscht, haett an gastric erhéijen. Next, Klassifikatioun vun de vun engem Gene Ënnerschrëft transgenic Mais C2mE-Zesummenhang Mënsch intestinal- fir z'ënnerscheeden an diffusen-Typ erhéijen zougedréckt C2mE-Zesummenhang transgenic Mais méi ähnlech huet een zu intestinal-Typ Verglach mat diffusen. Mir verroden endlech dass Aféierungs- vun Wnt Passerelle mat der prostaglandin E kooperéiere 2 Passerelle an Mais (K19-Wnt1 /C2mE VerfÜgung Mais) weider Charakteristike vun der Mënschheet erhéijen gastric intestinal-Typ reproduzéieren. VerfÜgung Conclusioun VerfÜgung Mir bewisen, datt C2mE-Zesummenhang transgenic Mais bedeitendst Ähnlechkeet weisen wann déi global Ausdrock profiling analyséiert gastric Kriibs ze intestinal-Typ. Dës Resultater hindeit, datt d'C2mE-Zesummenhang transgenic Mais, besonnesch K19-Wnt1 /C2mE VerfÜgung Mais, als beschte-fit Modell molekulare Mechanismus Basisdaten der tumorigenesis vum Mënsch gastric intestinal-Typ Cancers ze studéieren. VerfÜgung Background
Gastric Cancers histological Klassifikatioun op Lauren d'classically kategoriséiert an intestinal Typ an diffusen Typ baséiert sinn [1]. Intestinal-Typ gastric Cancers sinn duerch besser ënnerscheet, zesummenhängende an glandular-wëll Zell Gruppen charakteriséiert. D'intestinal Typ ass mat atrophic gastritis Multiple Schrëtt lues duerch Ufank datt duerch intestinal metaplasia, dysplasia an carcinoma duerno ass [2, 3]. Diffusen Typ entsprécht schlecht ënnerscheet, infiltrating an Net-zesummenhängende entholl Zellen. Obwuel diffusen Typ vun der Pluralitéit veräntwerten Schrëtt net charakteriséiert ass, weist dat méi metastatic phenotype mat aarmen hätt. VerfÜgung puer genetesch hire Restaurant méi sinn oft an entweder subtype vun gastric Kriibs observéiert. Overexpression vun ErbB2 VerfÜgung ass selektiv an intestinal-Typ erhéijen fonnt a kann als prognostic Bewaacher fir entholl Invasioun [4, 5] déngen. ErbB2 VerfÜgung Ausdrock Niveau war Rapport mat lymph Node oder Liewer Metastasen ze vergläichen [6, 7]. Groussen Verloscht am Ausdrock vu E-cadherin (CDH1 VerfÜgung) huet och vu 20% variéieren zéien an diffusen-Typ gastric Kriibs zu 90% vun Frequenz [8-10] beschriwwe ginn. D'ofgeholl Ausdrock vun CDH1 VerfÜgung ass vun Loh oder hypermethylation verursaacht. Spannen, ierflech diffusen gastric Kriibs ass vun germline Projet'en vun CDH1 VerfÜgung Gentherapie [11, 12] verursaacht. Zousätzlech, stattfannen an adenomatous polyposis belaascht (APC VerfÜgung), déi virun allem zu intestinal-Typ gastric Kriibs fonnt gëtt Wnt /β-catenin Passerelle activéiert [13]. Cyclooxygenase-2 (COX-2 VerfÜgung) dass ee vun den entscheedende Enzymen ass zu prostaglandin E synthesize 2 ass héich erop-reglementéiert intestinal-Typ Cancers Verglach mat diffusen-Typ gelackelt [14]. Dës genetesch hire Restaurant hätt als Pionéier vun all Zort vun gastric Kriibs souwéi d'histological Fonctiounen benotzt ginn. VerfÜgung Genom-grouss mRNA Ausdrock Profiler Gentherapie Ënnerschrëfte identifizéiert zu z'ënnerscheeden intestinal- an diffusen-Typ gastric Cancers. Boussioutas et al VerfÜgung. [15] gemellt, dass d'Gentherapie Ënnerschrëft ënnerscheed fir intestinal Typ geet Segregatioun d'bis-Regulatioun vun Verbreedung lues Zesummenhang mat DNA Gedächtnis, spindle Versammlungs- a chromosome. Down-reegelen Genen vun der Ënnerschrëft gi mat epithelial dat assoziéiert. Jinawath et al VerfÜgung. [16] entwéckelt och aner Gentherapie Ënnerschrëft datt differentially tëscht intestinal-Typ ausgedréckt ass an diffusen-Typ Cancers mat Japanesch gastric entholl Echantillon. D'intestinal-Typ Ënnerschrëft representéiert Opléisung vun Zell Zyklus Werdegang, iwwerdeems den Genen mat extracellular-Matrixentgasung (ECM) Associé sinn am diffusen Typ Ënnerschrëft dereguléierte. Dës Ënnerschrëfte kéinten déi Méiglechkeete vun biomarkers Entwécklungslänner bis depressiv /z'ënnerscheeden déi zwou Zorte vun béiden Medeziner an preclinical Fuerschunge beschäftegt. VerfÜgung Transgenic Mais datt gastric erhéijen presentéieren gëeegent Modeller entwéckelen gastric tumorigenesis zerwéiert, an Roman therapeutesch Ziler z'identifizéieren. Mir hun virdrun entwéckelt puer transgenic Mais an déi prostaglandin E 2 Produktioun Passerelle héich speziell zu gastric mucosa ageschalt ass. K19-C2mE VerfÜgung Mais ausdrécken COX-2 VerfÜgung an microsomal prostaglandin E synthase-1 (mPGES-1 VerfÜgung) inflammation-verbonne hyperplasia [17] entwéckelen. Dëst war duerch de Rekrutement vun mucosal macrophages mediated. Vun Kräizung war d'K19-C2mE VerfÜgung Mais mat K19-Wnt1 VerfÜgung Mais, zesumme Effet vun Wnt1 an PGE 2 op gastric tumorigenesis propagéieren. D'K19-Wnt1 /C2mE VerfÜgung Mais Nerve der Entwécklung vun dysplastic gastric adenocarcinoma fier d 'Wichtegkeet vun der Wnt Passerelle Aktivéierung de Grënner Zellen Strenz [18] ze halen. Fir d'zousätzlech Wierkung vun der Ennerdréckung vun Name Passerelle op de prostaglandin E 2 Aktivéierung, de Felipe Massa Mais vun K19-Nog /C2mE ënnersicht VerfÜgung sech etabléiert. D'K19-Nog /C2mE VerfÜgung Mais Ursaach der Entwécklung vun gastric hamartomas datt morphologically ähnlech sinn ze jonk polyposis (JP) [19]. Obwuel den detailléierte histological an Hypothesen-baséiert molekulare Analyse agebonne d'Jarnéier Roll vun prostaglandin E 2, Wnt an Nog Passerelle respektiv an gastric tumorigenesis, bleift et Synch ob d'K19-C2mE a seng Massa transgenic Mais Ähnlechkeet show ze intestinal Typ oder diffusen Typ vu mënschlechen gastric Cancers wann déi net-Buergermeeschter global Ausdrock Profil analyséiert. fir VerfÜgung ze identifizéieren déi de gastric erhéijen Zorte vu Mënsch (intestinal oder diffusen Typ) C2mE-Zesummenhang Mais si méi gläicht, am Verglach mir Ausdrock Profil vun déi zwou Zorte vu mënschlechen gastric Kriibs mat deene vun K19-C2mE VerfÜgung, K19-Wnt1 /C2mE VerfÜgung, an K19-Nog /C2mE VerfÜgung transgenic Mais. VerfÜgung Resultater VerfÜgung Allgemengen Gentherapie Ausdrock Profiler vun transgenic Déieren VerfÜgung Mir hu schonn e puer Zorte vun transgenic Mais an déi prostaglandin E 2 Passerelle ageschalt ass entwéckelt. K19-C2mE VerfÜgung Mais COX-2 VerfÜgung ausdrécken an mPGES-1 VerfÜgung hyperplasic gastric erhéijen induce. K19-Wnt1 /C2mE VerfÜgung Mais an déi zwee Wnt an prostaglandin E 2 Weeër sinn Ursaach dysplastic gastric erhéijen ausgeléist. K19-Nog /C2mE VerfÜgung Mais souwéi C2mE ausdrécken noggin gastric hamartomas entwéckelen. Fir Asiicht an de molekulare Mechanismus vun gastric tumorigenesis bidden, gastric Stoffer aus der transgenic Mais a Wëllschwäin-Typ Mais sech ze microarray Analyse ënnerworf. D 'Affymetrix GeneChip System, mRNA Ausdrock Niveauen sech fir 45.037 Studiebäihëllefe baut gemooss, dat sinn 21.066 Entrez Genen an 5.324 anere Message. Fräi Meenungsäusserung vun agefouert Gentherapie zu all transgenic Maus observéiert huet wéi virdrun gemellt [17-19]. VerfÜgung Genom-Skala Iwwerbléck vun der microarray Donnéeën Teamchef Ausdrock Ännerungen am dräi entholl Modeller vun K19-C2mE VerfÜgung, K19- Wnt1 /C2mE VerfÜgung an K19-Nog /C2mE VerfÜgung zimlech ähnlech waren, hierkommen overexpression vun Wnt1 nëmmen oder Nog nëmmen un den Ausdrock Ännerungen zu engem klengen Deel vun Genen (Dorënner 1) gefouert. Dëst deit drophin Meeschter expressional Ännerungen am dräi transgenic Mais vun der Aktivatioun vun PGE verursaacht huet 2 Passerelle. Hypergeometric Test fir Gentherapie Beräicherung gewisen dass d'Genen vun enger Heelung a demagogesch Äntwert Équipe huet sech vill mat der p-Wäert vun 1,5 kondenséiert × 10 -21 an 4,2 × 10 -13, respektiv, vun der Gentherapie Formatioun geännert vun der C2mE kopéiert. Figur 1 Genom-Skala Ausdrock Muster vun transgenic Mais gréisser Ännerunge weisen déi PGE 2 Aféierungs- verursaacht. Strooss zu Zeile sinn 5.440 Studiebäihëllefe ausgewielt baut vun fantastesch änneren loung vun 2 oder méi zu der Moyenne vun Wildwest-Typ an engem Verhältnis p-Wäert vun 0,01 oder manner, an Saile sinn Maus gastric Echantillon vun genotype gruppéiert. Genotypes sinn op widdert de heatmap gewisen. Déi rout-gréng Faarf Skala duerstellt log10 Verhältnis zu der Moyenne vun Wildwest-Typ Echantillonen, wéi an enger Faarf Bar op erop lénks gewise: rout Faarf Kuuscht Gentherapie an der Prouf an-reglementéiert ass, an gréng beweist verwandelt-reegelen. Virstellen:. Wildwest-Typ VerfÜgung Course vun Maus entholl Modeller ënnert engem Mënsch VerfÜgung gastric Kriibs subtype Fir ze bestätegen, datt d'Maus gastric entholl Modeller ze Mënsch gastric Kriibs ähnlech sinn, goufen d'Ausdrock Profiler mat deene vun de Mënscherechter Kriibs Verglach Echantillon. Éischt, Gentherapie Ausdrock Donnéeë vu mënschlechen Broscht, haett, Colon, an gastric erhéijen sech aus dem Domaine public gesammelt. Ähnlechkeet tëscht der Maus gastric erhéijen an déi véier Zorte vu mënschlechen Cancers ze schätzen, iwwerwaachter Klassifikatioun vun Haapt Komponent Analyse (PCA) war 1.925 Genen gehaal, mat deem méi wéi zwee-Weeër zu méi wéi 50 Echantillon vun all Mënsch Echantillon geännert huet. D'PCA mat der gewielter Genen fonnt dass Maus gastric Echantillon vun C2mE-Zesummenhang Mais waren déi enk ënnert de véier Stoffer zu Mënsch gastric Cancers Strooss iwwerpréift, d'global Ausdrock Ännerungen am gastric erhéijen vun der transgenic Mais besot Beruff deene mënschlechen gastric Cancers ( Figur 2). Figur 2 Allgemeng Ausdrock Ännerungen am gastric erhéijen vun C2mE-Zesummenhang transgenic Mais sinn déi ähnlech wéi déi vun der Mënschheet gastric Cancers. K19-C2mE VerfÜgung, K19-Wnt1 /C2mE VerfÜgung, an K19-Nog /C2mE VerfÜgung Maus gastric erhéijen a mënschlech gastric (diffusen, intestinal, an deer Zort), Colon, Broscht, an haett Cancers sech opgezeechent vun Haapt Komponent 1 bis 3 (PC1 un PC3) berechent 1.925 Genen benotzt déi méi wéi zwee-Weeër zu méi wéi 50 Echantillon vun all geännert huet. Entwéckele Bäitrag vun den dräi Komponente war 32%. Punkte vun blo gewisen: mënschlech gastric Cancers; Turquoise: mënschlech Colon Cancers; rout: mënschlech haett Cancers; gréng: mënschlech Broscht Cancers; Magenta:. Maus Modell erhéijen VerfÜgung Next, déi subtype vun gastric Kriibs an Optrag ze iwwerpréifen weist Kräiz-Arten Ähnlechkeet, goufen d'Maus erhéijen Verglach mam Mënsch gastric intestinal-Typ an diffusen-Typ Cancers op der Basis vun hiren Ausdrock Profiler. Virdrun Ausdrock profiling Studien vum Mënsch gastric entholl Echantillon hunn Gentherapie Ënnerschrëfte Kloeren, datt déi zwou Zorte klassifizéieren. Intestinal an diffusen Zorte sinn déi zwee grouss Zorte vu Kriibs op der Basis vun microscopic Wirklechkeet séiert [1]. Boussioutas et al VerfÜgung. [15] weisen datt Prolifératioun Genen huet an intestinal-Typ erhéijen iwwer-ausdrécke wéi an diffusen-Typ erhéijen; am Géigesaz, huet extracellular Matrixentgasung FAQ Genen vun diffusen-Typ Verglach mat intestinal-Typ erhéijen up-reegelen. Fir déi Zort vu mënschlechen gastric Kriibs ze bestëmmen normalized der Maus Modeller gi méi gläicht, mir de Mënsch Donnéeën [20] zu der Moyenne vun normal Echantillonen, a ausgewielt 122 Genen déi zu intestinal Typ am Géigendeel Richtung geännert huet an diffusen Typ [gesinn Weider Fichier 1], intestinal an diffusen Zorte ze klassifizéieren vun der normalized Daten benotzt. Déi falsch Entdeckung Taux gouf ugeholl 2,4% ze ginn. Der Richtegkeet vun Klass Cepheid Formatioun anhand Gentherapie war geschate vun 85% ze verloossen-eent-out Kräiz-Confirmatioun vum Mënsch Echantillon. Mir iwwerpréift och ob dës Gentherapie Formatioun aner gastric Kriibs Datesaz [15] korrekt benotzt ginn ze klassifizéieren. Den Test Datesaz dorënner 22 intestinal-Typ, 35 diffusen-Typ, an zéng normal Echantillonen, a gouf zu der Moyenne vun all normal Echantillon normalized. De Feeler Taux war 25% am Ganzen, an 29% an 18% vun diffuse- an intestinal-Typ Cancers, bzw.. VerfÜgung Fir den Ausdrock Musteren vun der Ënnerschrëft Genen an Maus erhéijen fir déi vun der Mënschheet gastric Cancers, Hierarchie Käre vergläichen Analyse huet mat Maus gastric Daten a mënschlech intestinal- an diffusen-Typ Donnéeën baut gesuergt. Den Ausdrock Muster vun eiser geännert Ënnerschrëft Genen fir Ënnerscheedung intestinal- an diffusen-Typ gastric Cancers verroden, datt de gastric erhéijen aus C2mE-Zesummenhang transgenic Mais méi ähnlech sech wéi mënschlech gastric Cancers ze-Typ intestinal zu diffusen-Typ Mënsch gastric Cancers (Dorënner 3 ). Vun linear discriminant Analyse, all C2mE-Zesummenhang gastric erhéijen ausser een K19-Wnt1 /C2mE Prouf huet den intestinal-Typ erhéijen klassifizéiert. Figur 3 Expression Profiler vun C2mE-Zesummenhang gastric erhéijen sinn ze Mënsch intestinal-Typ gastric Cancers Strooss. Strooss zu Zeile sinn 93 Genen déi p-Wäert begéint manner ewéi 0,001 an ëmgedréint änneren Richtung tëscht intestinal-Typ an diffusen-Typ Mënsch gastric Cancers, an der Strooss an Saile sinn Mënsch a Maus gastric erhéijen. Als Distanz Moossnam, war cosine Korrelatioun benotzt. Linkage Method fir Käre war Duerchschnëtt linkage. Echantillon vun rout gewisen: mënschlech intestinal Typ gastric Cancers; blo: mënschlech diffusen Typ; Giel: K19-C2mE VerfÜgung Mais; Magenta: K19-Wnt1 /C2mE VerfÜgung: Turquoise: K19-Nog /C2mE VerfÜgung. Déi rout-gréng Faarf Skala duerstellt log10 Verhältnis zu der Moyenne vun Wildwest-Typ oder normal Echantillonen, wéi an enger Faarf Bar op erop lénks gewise. VerfÜgung Expression Muster vun den Genen zu Mënsch gastric Kriibs an engem subtype spezifesch Manéier oft dereguléierte
Et ass bekannt, datt amplification oder overexpression vun e puer Genen vun enger subtype-spezifesch Manéier fonnt ginn. E-cadherin Gentherapie kennen oder Verloscht gi speziell an diffusen-Typ gastric Kriibs [11, 12] fonnt. Am Géigesaz, amplification vun ErbB2 VerfÜgung Gentherapie ass observéiert nëmmen zu intestinal Typ, an net vun diffusen Typ gemellt [6, 7]. Loh vun am colorectal carcinoma (DCC VerfÜgung) geläscht gëtt Kannerbetreiung an iwwer d'Halschent vun intestinal-Typ observéiert [21, 22]. Ausdrock Nivo'en vun den dräi Genen huet tëscht Mais a mënschlech gastric Kriibs Zorte (Table 1) am Verglach. CDH1 VerfÜgung Ausdrock war zu Mënsch diffusen Typ vill rofgaang ass awer net am intestinal Typ wéi erwaart. An der dräi transgenic Mais, war Cdh1 VerfÜgung Gentherapie net zu all vun transgenic Mais erofgaangen am Verglach mat Wëld-Typ inferring, datt ee vun de stäerkste charakteristesche Ännerungen am mënschleche diffusen Typ gastric Kriibs net an der Maus Modeller observéiert gouf. Up-Regulatioun vun ErbB2 VerfÜgung zu Mënsch intestinal-Typ microarray Daten, an och an eiser Maus Donnéeën observéiert gouf. DCC VerfÜgung Ausdrock war zu Mënsch intestinal-Typ reduzéiert wéi erwaart, iwwerdeems d'Reduktioun vun der Gentherapie am Mais Modell observéiert huet, besonnesch an K19-Wnt1 /C2mE VerfÜgung Mais. Den Ausdrock vun der dräi Genen déi Otemschwieregkeeten-Typ vun der mënschlecher gastric Kriibs Definitioun och d'Iddi ënnerstëtzen, dass d'Maus Modeller méi ähnlech sinn ze intestinal-Typ Mënsch cancer.Table 1 Expression Ännerunge vun subtype-spezifesch Genen an mouse a mënschlech gastric erhéijen. VerfÜgung zu Mouse
Mënscherechter
C2mE
Wnt1/C2mE
Nog/C2mE
Diffuse
Intestinal
CDH1
1.13*
1.00
1.10
0.43*
1.09
ErbB2
1.37*
1.43*
1.25*
0.92
1.37*
DCC
0.91
0.85*
0.94
0.98
0.71*
Ausdrock Wäerter sinn am Duerchschnëtt Logbuch nennen (woubäi 10) zu Wildwest-Typ oder normal Echantillon gewisen. Stäerchen beweist T-Test p-Wäert &Si besteet; 0,05. VerfÜgung Ennerscheed tëscht PGE2 Passerelle-ageschalt Maus Modeller VerfÜgung Saachen aus dräi Maus Modeller mat PGE 2 Passerelle Aktivéierung verschiddene Histologie weisen. K19-C2mE VerfÜgung hyperplasia mat macrophage einfach entwéckelt, hierkommen K19-Wnt1 /C2mE VerfÜgung dysplasia entwéckelt [17, 18]. K19-Nog /C2mE VerfÜgung entwéckelt hamartoma gläicht Mënsch jonk polyposis [19]. Mir versichten nächst differentially ausgedréckt Genen ënnert der dräi Maus Modeller ze identifizéieren déi eis de beschte-fit Modell ënnert der dräi ze bewäerten erlaabt gastric intestinal-Typ Kriibs ze studéieren. Mat ANOVA p-Wäert loung vun 0,001, ausgewielt mir 155 Genen déi anescht ënnert der dräi Gruppen regulariséiert goufen. Puer vun dësen Genen zougedréckt Ausdrock Ännerungen an der selwechter Richtung tëscht K19-Wnt1 /C2mE VerfÜgung an K19-Nog /C2mE VerfÜgung (Dorënner 4). Wnt Passerelle Genen Porcn VerfÜgung, eng acyltransferase néideg fir Wnt FAQ secretion, β-catenin (Ctnnb1 VerfÜgung), an Tcfe2a VerfÜgung (TCF3 VerfÜgung zu Mënsch) waren an K19-Wnt1 /C2mE VerfÜgung overexpressed mais, awer net zu K19-Nog /C2mE VerfÜgung (Dorënner 4). TGF-β /Name Passerelle Genen Smad3 VerfÜgung an Tgfbr2 VerfÜgung och sech weider-reglementéiert an Bmp2 VerfÜgung war verwandelt-reglementéiert K19-Wnt1 /C2mE VerfÜgung awer net zu K19-Nog /C2mE VerfÜgung . Figur 4 Wnt /β-catenin reglementaresche Genen si weider-reglementéiert Wnt1 /C2mE Mais. Strooss zu Zeile sinn 155 Studiebäihëllefe baut déi sech anescht reglementéiert ënnert dräi genotypes, K19-C2mE VerfÜgung, K19-Wnt1 /C2mE VerfÜgung, an K19-Nog /C2mE VerfÜgung, mat ANOVA p-Wäert loung 0,001. Saile weisen Maus gastric Prouf gruppéiere vun genotype an genotypes sinn op widdert de heatmap gewisen. Faarf Skala ass selwecht wéi an Dorënner 1. VerfÜgung An K19-Nog /C2mE VerfÜgung Mais, e puer Genen déi tumorigenesis Promotioun goufen Bastelen oder erof-reegelen, obwuel si net an der afgerappt vun Name Passerelle gemellt ginn. ROCKII VerfÜgung ass speziell an-reglementéiert K19-Nog /C2mE VerfÜgung, a seng overexpression ass via modulating actin cytoskeleton Organisatioun vun verschidden Zorte vun Cancers mat Werdegang assoziéiert. Down-reegelen Genen RAMP2 VerfÜgung an PPARGC1A VerfÜgung gehéieren, an hir inactivation oder ënner-Ausdrock huet dës bzw. haett Kriibs an hepatoma Entwécklung ze bedeelegen. VerfÜgung Zanter Dereguléierung vum Wnt Passerelle dorënner APC VerfÜgung oder CTNNB1
stattfannen an intestinal-Typ Verglach mat diffusen-Typ méi dacks observéiert goufen [23, 24], uginn de Resultater datt K19-Wnt1 /C2mE VerfÜgung kéinten e Modell Offer datt intestinal-Typ erhéijen ënnert der dräi beschte-passt C2mE-Zesummenhang Mais. VerfÜgung Diskussioun VerfÜgung déi heiteg Étude uginn, datt de Mënsch intestinal-Typ gastric Cancers bedeitendst Ähnlechkeet C2mE-Zesummenhang Mais, virun allem zu K19-Wnt1 /C2mE VerfÜgung Mais déi global Ausdrock profiling Schatzkummer. D'Cepheid vun ähnlechen entholl Typ vun global Ausdrock Profil ass mat der phenotypes vun der transgenic Mais konsequent. Aktueller Beweiser huet annoncéiert, dass inflammation Niveau deen vun der up-reegelen Ausdrock /Aktivitéit vun COX-2 VerfÜgung an mPGES-1 VerfÜgung ass severer zu intestinal-Typ gastric Kriibs Verglach mat diffusen-Typ een, obschonn zwee Typen ëmmer ass vun erhéijen sinn ze Helicobacter pylori VerfÜgung dinn datt inflammation un d'Personal vum Site zu induce si bekannt [14, 25-28]. Dëst Wëssen ënnerstëtzt eis observation datt gastric erhéijen an C2mE-Zesummenhang Mais an déi PGE 2 Passerelle Collectioun Ähnlechkeet ageschalt ass gastric erhéijen zu intestinal-Typ. Zousätzlech, activating a kennen CTNNB1 VerfÜgung an APC inactivating VerfÜgung si méi dacks zu intestinal-Typ Kriibs observéiert. Nee APC VerfÜgung Loh /stattfannen waren an diffusen-Typ gastric Kriibs observéiert hierkommen, 60% vun intestinal-Typ eent fonnt goufen [24, 29, 30]. Stattfannen an CTNNB1 VerfÜgung Kannerbetreiung war zu intestinal-Typ een [13] observéiert. Dëst ass och concordant mat eiser leschter fannen dass K19-Wnt1 /C2mE VerfÜgung Mais wat nëmmen adenocarcinoma ënnert der dräi C2mE-Zesummenhang Mais aktivéieren verwandelt Baach Genen vun Wnt /β-catenin Passerelle entwéckelen. VerfÜgung normalerweis, verschidden Zorte vun transgenic Mais fir ee entholl Typ sinn néideg tëscht Mais entholl Modeller a mënschlech erklären, déi fir d'Moyenne am Verglach ofgebaut goufen vun all de iwwerpréift entholl Echantillon vun all Mais Modell Bastelen oder erof-reegelen sech zanter den Genen profiling Ähnlechkeet zu global Ausdrock ze iwwerpréifen. Mat dëser Approche, Lee et al VerfÜgung. [31] analyséiert Gentherapie Ausdrock Donnéeë vu siwen Maus hepatocellular carcinomas (HCCs) dorënner fënnef Pärelen mat mënschlechen HCCs Modeller ze identifizéieren déi mënschlech Kriibs oder eng Zort vu mënschlechen Kriibs recapitulate, an fonnt dass puer subclasses vum Mënsch HCC rescht Mais Modeller vun Ausdrock Muster. Hershkowitz et al VerfÜgung. [32] benotzt och d'selwecht normalization Method, an fonnt dass charakteristesche Ausdrock Musteren an mënschlechen Broscht erhéijen observéiert zu 13 Maus Broscht entholl Modeller conserved goufen. Zënter der sinn Donnéeën vun Ausdrock Profil fir Maus gastric erhéijen fir eis K19-C2mE VerfÜgung a seng Massa Mais limitéiert sinn, dee mer verschidden Trainer d'Ähnlechkeet vun gastric erhéijen tëschent den zwou Aarten ze bewäerten. Amplaz Moyenne vun all Echantillon vun den Donnéeën als Referenz Ausdrock nennen ze berechnen vun benotzt, normalized mir d'Maus gastric Daten zu der Moyenne vun Wildwest-Typ Echantillon. Fir eis Mais Ausdrock Profiler mat deene vun de Mënscherechter gastric Cancers vergläichen, fir d'Gene Ënnerschrëft Mënsch intestinal- klassifizéieren an diffusen-Typ gastric Cancers war och aus original ee geännert duerch d'Expressioun Daten zu der Moyenne vun normal gastric Echantillon norméierend. Dat huet eis erlaabt, fir opzeweisen, datt C2mE-Zesummenhang transgenic Mais Mënsch intestinal-Typ gastric erhéijen an Ausdrock profiling gläichen. VerfÜgung Se Gentherapie Ausstralung tëscht Maus Modeller awer dass gläichzäiteg Aféierungs- vun Wnt1 an PGE 2 dereguléierte net nëmmen Gentherapie Ausdrock vun Ctnnb1 VerfÜgung an Porcn VerfÜgung zu Wnt sécher awer och Smad3 VerfÜgung an Tgfbr2 VerfÜgung zu TGF-β /Name sécher. Am Bezug op déi crosstalk tëscht TGF-β /Name an Wnt Weeër huet an Multiple virdrun Studien gemellt gouf, ginn d'dereguléierte Ausdrock vun de Genen vun den zousätzleche sécher Weeër kéint duerch positiv an negativ Feedback op d'Weeër aus der up-reegelen Wnt sécher erkläert. Zum Beispill, ass Name sécher bekannt ze β-catenin Aktivitéit zu intestinal Stammzellen [33] oofgesinn. Name sécher konnt an K19-Wnt1 /C2mE VerfÜgung repressed ginn, well Bmp2 VerfÜgung Ausdrock war vill verwandelt-reegelen. Erhéijung vun Smad3 VerfÜgung an Tgfbr2 VerfÜgung kéinten aus den negativen Feedback vun Name duerchgesat ginn Ennerdréckung sécher, wéi an enger Etude op TGF-β entschlof fibrosis [34] bewisen. Am Géigesaz zu K19-Wnt1 /C2mE VerfÜgung transgenic Mais, Ausdrock Ännerunge vun der Wnt Passerelle Genen goufen K19-C2mE VerfÜgung an K19-Nog /C2mE VerfÜgung Mais net observéiert. Et géif vu groussen Interessi ginn fir weider der crosstalk vun der Massa transgenic Mais sécher Weeër analyséieren. VerfÜgung Konklusiounen VerfÜgung genetesch esou Maus (Bijou) Modeller nëtzelech Handwierksgeschir Mechanismus vun tumorigenesis ze studéieren, eng nei Zil fir Drogenofhängeger ze validéieren Entwécklung, an biomarkers ze fannen. Fortschrëtter vun genetesch Wëssenschaft hunn eis erlaabt eng Varietéit vun transgenic oder Knockout Modeller vun mënschlech Krankheeten ze entwéckelen. Den Haaptgrond Fro op Pärelen als Krankheet Modeller benotzt gëtt, ob de Modell vum mënschleche Krankheet recapitulates. Mir entwéckelt virdrun e puer gastric entholl transgenic Mais an déi prostaglandin E 2 Passerelle ageschalt ass. Obwuel mir detailléierte histological Analyse mat der transgenic Mais gehaal, blouf et Synch ob global molekulare Ännerungen am transgenic Mais Charakteristike vun der Mënschheet gastric erhéijen reproduzéieren oder net. Dëse Rapport ass initial Beweiser gëtt, datt K19-C2mE VerfÜgung an hir Massa Mais, K19-Nog /C2mE VerfÜgung, K19-Wnt1 /C2mE VerfÜgung, show Ähnlechkeet Mënsch gastric Kriibs, virun allem zu intestinal-Typ eent vun d'Analys vun mRNA Ausdrock Profil. Ënner anerem, Reduktioun vun Bastelen oder erof-reegelen Genen speziell zu K19-Wnt1 /C2mE VerfÜgung oder K19-Nog /C2mE VerfÜgung bzw. opgrond datt K19-Wnt1 /C2mE VerfÜgung Mais wär déi bescht-fit Maus Modell fir intestinal-Typ gastric erhéijen. Dës Conclusiounen géif déi eventuell verschidde Virdeeler vun eiser Zukunft Studien dorënner Opkläerungsaarbecht vun gastric tumorigenesis an optimal therapeutesch Zil- Identifikatioun. VerfÜgung Method VerfÜgung Mo. Otemschwieregkeeten Echantillon VerfÜgung Bau vun transgenic Mais hunn an eiser leschter Studien beschriwwe ginn [17-19 ]. der K19-Wnt1 VerfÜgung an K19-Nog VerfÜgung analyséieren overexpress Wnt1 VerfÜgung an Nog VerfÜgung Genen, respektiv, speziell am Mo. kuerz,. K19-C2mE VerfÜgung der mPGES-1 VerfÜgung Gentherapie an COX-2 VerfÜgung Genen gläichzäiteg a speziell am Mo. overexpresses. K19-Wnt1 /C2mE VerfÜgung an K19-Nog /C2mE VerfÜgung sinn Massa transgenic Mais mat K19-Wnt1 VerfÜgung an K19-Nog VerfÜgung, bzw.; souwuel Maus analyséieren hunn K19-C2mE VerfÜgung. Fir Ausdrock profiling, dräi Wildwest-Typ C57BL /6, fënnef K19-Wnt1 VerfÜgung, dräi K19-C2mE VerfÜgung, fënnef K19-Wnt1 /C2mE VerfÜgung, zwee K19-Nog VerfÜgung, an dräi K19- Nog /C2mE VerfÜgung Mais sech benotzt. All Déieren an dëser Etude benotzt goufen weiblech Mais Alter 18-65 Wochen. D'glandular Mo vun all Maus war fir microarray Analyse geschnidde. All Déier Studien sech am Aklang mat gutt Déier Praxis duerchgefouert wéi vun de Finanzpolitiker Déieren Care an Benotzt Comité (IACUC) definéiert. VerfÜgung Microarrays VerfÜgung GeneChip Mouse Genom 430 2.0 flamenden Ofgrond (Affymetrix Galaxy) benotzt goufen d'Iwwerwachung Ausdrock Profiler vun der gastric Echantillon. Total RNS war mat der RNeasy Mini Kit (QIAGEN) an der Behandlung mat TRIzol (Invitrogen Corp.) virbereet, an Fortgeschratten Crna war mat Norm Affymetrix Ëmwelt- virbereet. D'Signal intensities vun de Studiebäihëllefe baut sech vun der Affymetrix Power Tools RMA Method an Resolver Software (Rosetta Biosoftware), ëmgesat normalized an Verhältnis Wäerter un der Moyenne vun Echantillon Wildwest-Typ Logbuch sech fir all Prouf berechent vun Resolver benotzt. All d'microarray Date goufen um Gene Expression Omnibus (Geo) ënnert Donnéeën Bäitrëtt verschéckt keen. GSE16902 [35]. VerfÜgung Ëffentlech Mënsch microarray Donnéeën VerfÜgung Mënscherechter gastric Kriibs [20] an Broscht Kriibs [36] microarray Date goufen vun den online Bäiluecht vun der Datebank Stanford Microarray Sensor [37]. D'gastric Kriibs Daten gehéieren 68 intestinal-Typ Kriibs, 13 diffusen-Typ Kriibs, an 15 normal gastric Echantillon. Der Broscht Kriibs Daten gehéieren 115 Broscht entholl a siwen normal Otemschwieregkeeten Echantillon. Mënsch Colon Kriibs Donnéeën [38], dorënner 100 colorectal Kriibs a fënnef normal Otemschwieregkeeten Echantillonen, sech aus NCBI Geo ënner Bäitrëtt GSE5206 Sensor. D'Ann Arbor haett entholl Donnéeën [39] dorënner 86 haett adenocarcinomas an 10 Net-neoplastic haett Echantillon gouf vun de Vereenegte Staaten National Cancer Institut Websäit [40] kritt. Ausdrock Wäerter sech ze log10 (Verhältnis zu geometreschen ronn vun normal Echantillon) fir mat Maus Donnéeën ze vergläichen transforméiert. VerfÜgung Intestinal vs. diffusen Typ Ënnerschrëft Genen Mënscherechter gastric entholl Donnéeë vu Chen et al
. [20] goufen benotzt eng intestinal vs. diffusen Typ classifier ze entwéckelen. Mir ausgewielt Genen datt den Kriteren erfëllt: (1) T-Test p-Wäert &Si besteet; 0,001 tëscht den zwou Gruppen, (2) Géigendeel Ännerungen am Duerchschnëtt Ausdrock vun Ënnerschrëft Genen vun intestinal-Typ erhéijen an déi vun Ënnerschrëft Genen vun diffusen-Typ erhéijen. Déi falsch Entdeckung Taux war vun der Benjamini an Hochberg Method [41] geschat. VerfÜgung ënnerschriwwe stoung = (duerchschnëttlech Logbuch Verhältnis vun Gene weider-reglementéiert intestinal-Typ erhéijen an Ugrëff-reglementéiert diffusen: D'entholl Klassen vun Maus a mënschlech Echantillon waren déi linear discriminant Analyse mat der Ënnerschrëft stoung déi folgend Formule definéiert virausgesot -type erhéijen) - (duerchschnëttlech Logbuch Verhältnis vu Genen verwandelt-reglementéiert intestinal-Typ erhéijen a weider-reglementéiert diffusen-Typ erhéijen) VerfÜgung Maus kombinéiert a mënschlech Gentherapie Ausdrock Donnéeën VerfÜgung fir mam Mënsch Maus Donnéeën ze kombinéieren gastric Kriibs microarray Donnéeën, Maus a mënschlech Date goufen du-ratioed fir de geometreschen Duerchschnëtt vu Wëllschwäin-Typ an normal Echantillonen, bzw.. Wann et méi wéi een ewell fir e Gene zu engem microarray virbereet war, goufen d'averaged Ausdrock ze nennen fir de Gene benotzt. mat nëmmen homologous Genen Next, datt an zwee flamenden Ofgrond vertruede sinn, fusionéiert mir d'Maus a mënschlech Donnéeë liwweren an engem eenzege Datesaz. D'Maus microarray enthält 45.037 Studiebäihëllefe ausgedréckt, wat zu 21.066 Entrez Genen entspriechen, an de Mënsch microarray enthält 6.688 Ämter, déi bis 4.463 Entrez Genen entspriechen. Wann se fusionéiert huet, waren 4.094 homologous Genen identifizéiert. Beräicherung statistique Analyse VerfÜgung D'hypergeometric Test fir Gene Ontologie VerfÜgung war mat der Gene Set Annotator entwéckelt vun Rosetta Inpharmatics standing [42]. Fir déi aner statistesch Analyse vun dëser Etude, benotzt gouf de MatlabLanguage Software (MathWorks Galaxy). VerfÜgung Deklaratioune VerfÜgung Merci VerfÜgung D'Auteuren wéi géif Dr. Tsutomu Kobayashi fir seng Ënnerstëtzung vun der microarray Experimenter ze soen, an Dr. András Mizuarai fir seng Diskussioun an Kommentaren op der mëttelalterlech Handschrëft VerfÜgung Electronic zousätzlecht Material VerfÜgung 12864_2009_2499_MOESM1_ESM.XLS Weider Fichier 1:. eng Lëscht vun intestinal Typ vs. diffusen Typ Ënnerschrëft Genen. Haaptrei Bäitrëtt, Gentherapie Symbol, an der Moyenne vun log10 nennen an intestinal-Typ an diffusen-Typ, respektiv, fir jiddereng vun den 122 cDNAs gewisen. (XLS 28 KB) Auteuren 'original deposéiert Fichieren fir Biller VerfÜgung sinn ennen d'Linken op d'Auteuren' original deposéiert Fichieren fir Biller. 12864_2009_2499_MOESM2_ESM.pdf Auteuren 'original Datei fir Figur 1 12864_2009_2499_MOESM3_ESM.pdf Auteuren' original Datei fir Figur 2 12864_2009_2499_MOESM4_ESM.pdf Auteuren 'original Datei fir Figur 3 12864_2009_2499_MOESM5_ESM.pdf Auteuren' original Datei fir Figur 4
Antibiotesch Resistenz verduebelt an nëmmen zwee Joerzéngten
Spermmikrobiom opgedeckt mat RNA Sequencing
D'Erhéijung vun der Biodefense Risiken aus der synthetescher Biologie
Fecal Transplantatioun vu bestëmmte Spender besser wéi anerer
Nei entdeckt grouss Phagen verschwannen d'Liewen/Net-Liewensgrenz
De vaginale Mikrobiom kann d'Effizienz vun der HIV -Präventiounstherapie beaflossen
Fastfood kann e Premier Täter bei Teenager Depressioun sinn
Firwat ass Depressioun sou e wuessende Problem bei Teenager an Amerika? Eng Äntwert ass dAart vu Liewensmëttel déi se iessen, laut enger neier Etude vu Fuerscher vun der University of Alabama zu Birmi
IBD vill méi heefeg wéi erwaart,
a wäert nëmmen an Zukunft eropgoen Et ginn dräimol sou vill Leit mat der chronescher a schlechter Darmstéierung genannt inflammatoresch Darmkrankheet (IBD) wéi jee geduecht, laut enger neier Etude pre
Oral Hygiène a Gravitéit vum COVID-19-d'Verbindung
Britesch Fuerscher hunn eng Verbindung fonnt tëscht enger schlechter mëndlecher Hygiène an der Schwéierkraaft vun der COVID-19 Krankheet verursaacht duerch e schwéieren akuten Atmungssyndrom Coronavir