Global transcriptional Äntwert ze carbonic anhydrase IX hunn an der Maus stomach

Global transcriptional Äntwert ze carbonic anhydrase IX hunn an der Maus Mo. VerfÜgung méiglech VerfÜgung Background VerfÜgung Carbonic anhydrases (Cas) sinn eng Famill vun Enzymen datt pH homeostasis regléieren an verschidde Stoffer. CA IX ass eng aussergewéinlech Member vun dëser Famill well zousätzlech zu der Basis CA Funktioun, huet et an e puer aner Fro gestallt an agebousst Prozesser agebonne ginn. Funktiounen vum CA IX proposéiert och Chargen zu Zell Haftung an malignant Zell Invasioun. Zousätzlech, CA IX reguléieren wahrscheinlech Zell Prolifératioun an dat, wat am Car9 bewisen huet VerfÜgung - /- Mais. Dës Mais haten gastric pit Zell hyperplasia an Ausschöpfung vun Chef Zellen; Ee, bleiwen der konkreter molekulare Mechanismen hannert der observéiert phenotypes onbekannt. Dofir, wollt mer den Effet vum CA IX hunn op ganzer-Nepgen Gentherapie Ausdrock vun gastric mucosa ze studéieren. Dëst war mat Illumina Sentrix gemaach ®Mouse-6 Expression BeadChip flamenden Ofgrond. Den Ausdrock vu verschiddene Genen mat bemierkenswäerte Wäerter fantastesch Ännerung vun QRT-Hinnen alleguer bestätegt gouf. VerfÜgung Resultater VerfÜgung CA IX hunn ëmmer Aféierungs- vun 86 Genen a Repressioun vun 46 Genen am gastric mucosa. Et war 92,9% concordance tëscht der vun microarray Analyse kritt Resultater an QRT-Hinnen alleguer. D'differentially ausgedréckt Genen agebaut déi zu Entwécklungsphase Prozesser Équipe an Zell dat. Zousätzlech, verännert CA IX hunn den Ausdrock vun Genen responsabel fir immun Äntwerte an downregulated den Ausdrock vu verschidde digestive Enzymen. VerfÜgung Konklusiounen VerfÜgung Microarray Analyse identifizéiert puer potentiell Genen verännert Ausdrock deem hätt an der gestéiert Zell antike phenotype am Car9 erklären VerfÜgung - /- gastric mucosa. D'Resultater uginn och eng Verfilmung Roll fir CA IX zu der Regelung vun immunologic Prozesser an unzereegen. Dës Conclusiounen esprit d'Konzept, datt d'Haaptrei Roll vum CA IX ass net d'Regulatioun vun pH am Mo. mucosa. Amplaz, ass et fir Fonktioun vun e puer gestallt Prozesser waren VerfÜgung Background VerfÜgung D'carbonic anhydrases (Cas) sinn eng Famill vun Zénk-haltege metalloenzymes datt d'Reversibelen hydration vu Kuelendioxid an der Reaktioun Meat:. CO 2 + H 2O ↔ H + + HCO 3 -. Si maache bei verschiddene gestallt Prozesser, wéi Seier-huel Gläichgewiicht, CO 2 an HCO 3 - Transport, sin, Schanken resorption, ureagenesis, gluconeogenesis, lipogenesis, Produktioun vun kierperleche Flëssegkeeten, an fertilization [ ,,,0],1, 2]. Den CA Famill besteet aus 13 aktiven isozymes zu Mamendéieren, 12 vun deenen am Mënschen ausgedréckt a Funktioun sinn [3]. Den CA isozymes hunn verschiddenste Otemschwieregkeeten Ausdrock zeréckzeféieren, charakteristesch subcellular localizations, souwéi eenzegaarteg kinetescher a inhibitory Eegeschaften. VerfÜgung CA IX ass eng dimeric FAQ mat der Zell Membran verbonne [4, 5]. An hiren alen Form, ass CA IX vun engem N-Uschloss proteoglycan (PG) Domain komponéiert, engem CA Katalysator Domän, eng transmembrane Regioun, an engem kuerzen intracytoplasmic Schwäif op der C-Kappgare [6]. CA IX ass den eenzege Member vun der CA Famill eng PG Domain an Zousätzlech zu der CA Domän mat. Demno, huet CA IX ugeholl gouf zu Zell Haftung Prozesser deelhuelen. MDCK (Madin-Darby canine Nier) epithelial Zellen, et war dës déi CA IX verklengert E-cadherin-mediated Zell-Zell Haftung vun Tatsaach, andeems déi proposéiert mat β-catenin [7]. VerfÜgung CA IX ass an nëmmen ausgedréckt puer normal Stoffer mat dem Ausdrock stäerkst zu Mënsch, Grenzwäerter, a Maus gastric mucosa ginn, wou et de Moment vun der gastric hëlt un den déiwe gastric Glands ass [8, 9]. CA IX ass fir d'basolateral Uewerfläch vun epithelial Zellen agespaart an ass vun all gréisser Zell Zorte vun der gastric epithelium [8] produzéiert. CA IX ass eng aussergewéinlech Member vun der CA Famill well et an e puer Cancers ausgedréckt ass dat aus CA IX negativ Stoffer och keen Auto opwerft, haett, cervical, spillt, esophageal, an Broscht carcinomas [6]. Allerdéngs hunn gastric Kriibs an premalignant lesions ofgeholl Ausdrock vun CA IX dës [10]. An entholl Stoffer, ass CA IX vun der hypoxia-inducible Transkriptiouns Faktor 1 (HIF-1), déi hypoxia Photo'en zu der responsiven Element, Hypo Real Estate, vun de Promoteur VerfÜgung CA9 mediated mat der hypoxic phenotype Hausnummeren [11]. An hypoxic Konditiounen, sinn Kriibs Zellen haaptsächlech ofhängeg op selwescht ukuerbelt an hir Energie produzéiert. Dat selwescht entholl ukuerbelt generéiert Exzesser vun dono Produiten, wéi lactic Seier an H + datt aus der Zell bannen extruded muss ginn. Et gouf gewisen, datt CA IX zu der sauer vun der hypoxic extracellular MILIEU bäidroen kënnen, also entholl Zellen hëllefen de intracellular pH [12] ze neutraliséieren. An anere Wierder, oft CA IX overexpression beweist aarmséileg hätt a Resistenz zu klassescher audiovisuell an Chimioen [13]. Allerdéngs ass CA IX net nëmmen zu der hypoxic Regioune vun der erhéijen agespaart, wat beweist, datt et vläicht e puer aner Weeër ginn, datt seng Ausdrock regléieren. An Tatsaach, kann de Begrëff vum CA IX ënner normoxic Konditiounen duerch héich Zell Dicht entschlof gin, an dës Regelung ass vun phosphatidylinositol 3-kinase (PI3K) sécher [14] mediated. Ausserdem, ass de mitogen-ageschalt FAQ kinase (MAPK) Passerelle an der Regulatioun vun CA IX Ausdrock via Kontroll vun de Promoteur déi souwuel HIF-1-ofhängeg an -independent Signaler [15] zu CA9 Équipe. . Dëst Passerelle ass och mat der PI3K Passerelle an der SP1 (Spezifizitéit FAQ 1) Transkriptiouns Faktor VerfÜgung D'Generatioun vun Car9 interrelated VerfÜgung - /- Mais huet verroden, datt nieft pH Regulatioun a Zell Haftung, CA IX leie aner funktionell Rollen [16]. Dës Car9 VerfÜgung Mais Knockout huet keen abnormalities zu Wuesstem, reproduktive Potential, an Liewen span. Allerdéngs, schéinen CA IX hunn zu hyperplasia vun der gastric mucosa. D'hyperplastic mucosa enthale eng grouss Nummer an den Undeel vun der mucus-produzéiert pit Zellen hierkommen d'Zuel an den Undeel vum Chef Zellen reduzéiert huet. Den Total vun parietal Zellen selwecht bliwwen, an anere Wierder, CA IX-erhéijen Mais déi normal gastric pH, Seier secretion, an serum gastrin Niveauen. Sou, beweisen dëse Conclusiounen datt CA IX zu der Kontroll vun dat an Prolifératioun vu epithelial Zell lineages an der gastric mucosa dréit. A leschter Etude iwwerpréift ob d'Auswierkungen vun CA IX hunn duerch eng héich-Salz iessen, eng bekannte Co-Faktor vun carcinogenesis [17] geännert ginn hätt. Dës Resultater weisen, dass den héich-Salz iessen gehumpelt der glandular atrophy am Kierper mucosa zu Car9 fräi VerfÜgung - /- C57BL /6 Mais, wobäi dës Effekt war net zu BALB /c Mais observéiert. Allerdéngs huet keen metaplastic oder dysplastic abnormalities an der gastrointestinal epithelium vum CA IX-erhéijen C57BL /6 Mais gesinn. Sou, proposéiere dësen Observatioune datt CA IX hunn eleng net e wesentleche carcinogenic Faktor kann awer e carcinogenic Prozess vum nächste Zell Prolifératioun lancéieren konnt an /oder dat vun der gastric mucosa. VerfÜgung Dës Etude entworf gouf zu besser d'hyperplastic phenotype vun verstoen de Mo mucosa vun Car9 VerfÜgung - /- Mais well de molekulare Mechanismen hannert et momentan onbekannt sinn. Ausserdeem wollte mir der funktionell Rollen vun CA IX, méi speziell ass, fir als do eng grouss Beweiser ass weist, datt se méi wäit pH Regulatioun verlängeren. Fir dat Zil, eng Nepgen-grouss war Ausdrock Analyse gesuergt. Microarray analyteschen réischt puer Genen deem Ausdrock war bis Car9 VerfÜgung Gentherapie Stéierungen an der gastric mucosa geännert duerch. VerfÜgung Resultater VerfÜgung Transcriptional Äntwert ze Car9 hunn am Mo Mauer VerfÜgung Mo. RNS aus 6 Car9 VerfÜgung - /- Mais a 6 Wildwest-Typ Mais war vun microarray analyséiert. D'Analyse réischt 86 upregulated Genen an 46 Genen downregulated, eng fantastesch änneren präventive vun ± 1,4 fir Bastelen mat an downregulated Ausdrock, bzw. (Zréck zousätzlech Fichier 1: Lëscht vun Genen differentially am Mo vun Car9 ausgedréckt VerfÜgung - /- Mais). Dëse präventive Wäert huet wéi en adequate Niveau proposéiert uewen déi do eng héich Korrelatioun tëscht microarray ass an QRT-Hinnen alleguer Donnéeën, onofhängeg vun anere Facteuren, wéi Plaz Intensitéit an Zyklus loung [18]. Déi fantastesch Ännerungen gounge vun 10,46 bis -12,14. Ëmzestoussen, ass eng Lëscht vun Genen e präventive Wäert vun ± 2,5-fantastesch benotzt gewisen (Bedeitung 1 an 2). Wann Dir dëse Kritären, all d'Genen mat vill (p &Si besteet; 0,05) verännert Ausdrock ugewise sinn, dat ass, 14 Genen mat entschlof Ausdrock an 21 Genen mat repressed Ausdrock. D'Lëscht vun all de reegelen Genen war System forcéiert (kuckt zousätzlech Fichier 2: Fonctionnement Annotation vun Genen am Mo vun Car9 reegelen VerfÜgung Mais Knockout), Beräicherung vun hydrolase Aktivitéit, Entwécklungsphase Prozesser, Zell dat, proteolysis, peptidase Aktivitéit weist, strukturell Protein Aktivitéit, an immun System Prozess, ënner anerem. Déi funktionell Annotation Kategorien an der Gentherapie Zuelen an all Kategorie an Table 3.Table 1 Genen mat upregulated Ausdrock mat engem präventive Wäert vun 2,5-fantastesch gewisen. VerfÜgung Gene Symbol
Beschreiwung
GenBank number

FC

QRT-PCR

Cym
chymosin
NM_001111143
10.46
19.66
Slc9a3
solute Ballgewënn Famill 9 (Natrium /Waasserstoff exchanger), Member 3 VerfÜgung NM_001081060 VerfÜgung 8,07 VerfÜgung 10,72 VerfÜgung U46068 VerfÜgung cDNA Haaptrei U46068, ët Variant 2 VerfÜgung NM_153418 VerfÜgung 5,95 VerfÜgung Dmbt1 VerfÜgung geläscht an malignant Gehir erhéijen 1 VerfÜgung NM_007769 VerfÜgung 5,68 VerfÜgung 5,29 VerfÜgung Il1rl1 VerfÜgung interleukin 1 receptor-wëll 1, ët Variant 2 VerfÜgung NM_010743 VerfÜgung 5,38 VerfÜgung 8,95 VerfÜgung Tm4sf5 VerfÜgung transmembrane 4 superfamily Member 5 zur VerfÜgung NM_029360 VerfÜgung 4,26 VerfÜgung 9130204L05Rik VerfÜgung RIKEN cDNA 9130204L05 Gentherapie VerfÜgung NM_001101461 VerfÜgung 4,19 VerfÜgung Sftpd VerfÜgung dass nach verbonne FAQ D VerfÜgung NM_009160 VerfÜgung 4,11 VerfÜgung 3,69 VerfÜgung Nccrp1 VerfÜgung Net-spezifesch cytotoxic Zell receptor FAQ 1 homolog (zebrafish) VerfÜgung NM_001081115 VerfÜgung 3,81 VerfÜgung Pkp4 VerfÜgung plakophilin 4, ët Variant 1 VerfÜgung NM_026361 VerfÜgung 3,54 VerfÜgung 1.09 VerfÜgung Sprr2d VerfÜgung kleng proline-räiche FAQ 2D VerfÜgung NM_011470 VerfÜgung 3,46 VerfÜgung Gm14446 VerfÜgung virausgesot Gentherapie 14446, ët Variant 2
NM_001101605 VerfÜgung 3,45 VerfÜgung Sprr3 VerfÜgung kleng proline-räiche FAQ 3 VerfÜgung NM_011478 VerfÜgung 3,39 VerfÜgung Sprr2i VerfÜgung kleng proline-räiche FAQ 2I VerfÜgung NM_011475 VerfÜgung 3,31
Sprr1a VerfÜgung kleng proline-räiche FAQ 1A VerfÜgung NM_009264 VerfÜgung 3,30 VerfÜgung IVL VerfÜgung involucrin VerfÜgung NM_008412 VerfÜgung 3,08 VerfÜgung Serpinb12 VerfÜgung serine (oder cysteine) peptidase inhibitor , clade B (ovalbumin), Member 12 VerfÜgung NM_027971 VerfÜgung 3,02 VerfÜgung Krt10 VerfÜgung keratin 10 VerfÜgung NM_010660 VerfÜgung 3,01 VerfÜgung Gm94 VerfÜgung Gentherapie 94 VerfÜgung NM_001033280 virausgesot
2,94 VerfÜgung Krt13 VerfÜgung keratin 13 VerfÜgung NM_010662 VerfÜgung 2,94 VerfÜgung Gsdmc2 VerfÜgung gasdermin C2, ët Variant 2 VerfÜgung NM_177912 VerfÜgung 2,88 VerfÜgung Lor VerfÜgung loricrin
NM_008508 VerfÜgung 2,84 VerfÜgung Dmkn VerfÜgung dermokine, ët Variant 2 VerfÜgung NM_172899 VerfÜgung 2,78 VerfÜgung Ly6d VerfÜgung lymphocyte antigen 6 komplex, nët D VerfÜgung NM_010742 2,69 VerfÜgung
Krt1 VerfÜgung keratin 1 VerfÜgung NM_008473 2,52 VerfÜgung Table 2 Genen mat downregulated Ausdrock e präventive Wäert vun -2.5-fantastesch benotzt. VerfÜgung Gene Symbol
Beschreiwung
GenBank Zuel VerfÜgung FC
QRT-Hinnen alleguer
Try4 VerfÜgung 4 trypsin
NM_011646 VerfÜgung -12,14 VerfÜgung Prss1 VerfÜgung protease, serine, 1 (trypsin 1) VerfÜgung NM_053243 VerfÜgung -10,57 VerfÜgung Amy2a5 VerfÜgung Amylas 2a5, pancreatic VerfÜgung NM_001042711
-9,85 VerfÜgung Cela2a VerfÜgung chymotrypsin-wëll elastase Famill, Member 2A VerfÜgung NM_007919 VerfÜgung -7,59 VerfÜgung -16,23 VerfÜgung Gm12888 VerfÜgung virausgesot Gentherapie 12888 VerfÜgung NM_001033791 VerfÜgung - 7,12 VerfÜgung Gdf9 VerfÜgung Wuesstem dat Faktor 9 VerfÜgung NM_008110 VerfÜgung -7,04 VerfÜgung Blm VerfÜgung Bléi Syndrom homolog (mënschlech), ët Variant 1 VerfÜgung NM_007550 VerfÜgung -6,27 VerfÜgung Pnlip VerfÜgung pancreatic lipase VerfÜgung NM_026925 VerfÜgung -6,23 VerfÜgung -23,88 VerfÜgung Cfd VerfÜgung Faktor D komplementar (adipsin) VerfÜgung NM_013459 VerfÜgung -5,35 VerfÜgung -27,45 VerfÜgung Ctrb1 VerfÜgung chymotrypsinogen B1 VerfÜgung NM_025583 VerfÜgung -5,00 VerfÜgung Mug1 VerfÜgung murinoglobulin 1 VerfÜgung NM_008645 VerfÜgung -4,30 VerfÜgung Sostdc1 VerfÜgung sclerostin Domän mat 1 VerfÜgung NM_025312
-4,17 VerfÜgung Tmed6 VerfÜgung transmembrane emp24 FAQ Transport public 6 VerfÜgung NM_025458 VerfÜgung -4,07 VerfÜgung Cpa1 VerfÜgung carboxypeptidase A1 VerfÜgung NM_025350 VerfÜgung -3,95 VerfÜgung Slc27a2 mat
Musée gouf Famill 27 (fatty Seier Fernsehn), Member 2 VerfÜgung NM_011978 VerfÜgung -3,80 VerfÜgung Adipoq VerfÜgung reguléieren, C1Q an collagen Domain wouvun VerfÜgung NM_009605 VerfÜgung -3,74 VerfÜgung -20,51 VerfÜgung Car3 VerfÜgung carbonic anhydrase 3 VerfÜgung NM_007606 VerfÜgung -3,72 VerfÜgung -15,39 VerfÜgung EGF VerfÜgung epidermal Wuesstem Faktor VerfÜgung NM_010113 VerfÜgung -3,68 VerfÜgung -3,71
Abpg VerfÜgung bindend FAQ ESO androgen VerfÜgung NM_178308 VerfÜgung -3,67 VerfÜgung Slc38a5 VerfÜgung Musée gouf Famill 38, Member 5 zur VerfÜgung NM_172479 VerfÜgung -3,64 VerfÜgung Chia VerfÜgung chitinase, dono VerfÜgung NM_023186 VerfÜgung -3,52 VerfÜgung LOC638418 VerfÜgung virausgesot: gläicht Ela3 FAQ VerfÜgung XM_914439 VerfÜgung -3,48 VerfÜgung LOC100043836 VerfÜgung virausgesot: gläicht lacrimal androgen-verbindlech FAQ Delta, ët Variant 1 VerfÜgung XM_001481113 VerfÜgung -3,41 VerfÜgung EG640530 VerfÜgung virausgesot: virausgesot Gentherapie, EG640530 VerfÜgung XM_917532 VerfÜgung -3,37 VerfÜgung Nrn1 VerfÜgung neuritin 1 VerfÜgung NM_153529 VerfÜgung -3,36 VerfÜgung Cela3b VerfÜgung chymotrypsin-wëll elastase Famill, Member 3B VerfÜgung NM_026419 VerfÜgung -3,32 VerfÜgung -75,74 VerfÜgung Spink3 VerfÜgung serine peptidase inhibitor, Kazal Typ 3 VerfÜgung NM_009258
-3,32 VerfÜgung Scd1 VerfÜgung stearoyl-Coenzyme A desaturase 1 VerfÜgung NM_009127 VerfÜgung -3,27 VerfÜgung Ctrl VerfÜgung chymotrypsin-wëll VerfÜgung NM_023182 VerfÜgung -3,19 VerfÜgung Gper
G FAQ-kräftegen estrogen receptor 1 VerfÜgung NM_029771 VerfÜgung -2,96 VerfÜgung Sycn VerfÜgung syncollin VerfÜgung NM_026716 VerfÜgung -2,91 VerfÜgung Bhlha15 VerfÜgung Basis Wendel-Glück-Wendel Famill, Member A15 VerfÜgung NM_010800 VerfÜgung -2,77 VerfÜgung Cpb1 VerfÜgung carboxypeptidase B1 (Otemschwieregkeeten) VerfÜgung NM_029706 VerfÜgung -2,73 VerfÜgung -18,22 VerfÜgung Slc5a8 VerfÜgung Musée gouf Famill 5 (Kaliumiodid Fernsehn), Member 8 VerfÜgung NM_145423 VerfÜgung -2,68 VerfÜgung Cyp2e1 VerfÜgung cytochrome P450, Famill 2, subfamily E, polypeptide 1 VerfÜgung NM_021282 VerfÜgung -2,65 VerfÜgung Zg16 VerfÜgung zymogen granule FAQ 16 VerfÜgung NM_026918 VerfÜgung -2,57 VerfÜgung Table 3 d'funktionell Annotation Kategorien fir de Genen reegelen CA IX hunn. VerfÜgung Fonctionnement Kategorie VerfÜgung
Total reegelen Genen VerfÜgung Upregulated Genen
Downregulated Genen
Entwécklungsbiologie Prozesser VerfÜgung * VerfÜgung 20 zu 13 VerfÜgung 7 VerfÜgung Keratinization an keratinocyte dat
8 VerfÜgung 8 VerfÜgung 0 VerfÜgung Aktivitéit Strukturfongen Protein VerfÜgung 13 zu 13 zu 0 VerfÜgung Embryo ofgestouss, weiblech Schwangerschaft, an menstrual Zyklus VerfÜgung 3 VerfÜgung 3
0 VerfÜgung Initiativ Prozess VerfÜgung 4 VerfÜgung 3 VerfÜgung 1 VerfÜgung Multi-Gebeitechnik Prozess VerfÜgung 5 zur VerfÜgung 5 zur VerfÜgung 0 VerfÜgung Zell dat 16 VerfÜgung
zu 4 VerfÜgung serine-Typ endopeptidase Aktivitéit, serine hydrolase Aktivitéit, an serine-Typ peptidase Aktivitéit VerfÜgung 9 VerfÜgung 3 VerfÜgung 6 VerfÜgung Proteolysis VerfÜgung 15 VerfÜgung 6
9 VerfÜgung Peptidase Aktivitéit VerfÜgung 14 VerfÜgung 5 zur VerfÜgung 9 VerfÜgung Endopeptidase Aktivitéit 10
4 VerfÜgung 6 VerfÜgung Trypsin an chymotrypsin Aktivitéit VerfÜgung 4
1 VerfÜgung 3 VerfÜgung Hydrolase Aktivitéit VerfÜgung 22 VerfÜgung 8 VerfÜgung 14 VerfÜgung Strukturfongen entstoend vun cytoskeleton VerfÜgung 5 zur VerfÜgung 5 zur VerfÜgung 0 VerfÜgung Zell Kommunikatioun VerfÜgung 4 VerfÜgung 4 VerfÜgung 0 VerfÜgung Metallocarboxypeptidase Aktivitéit, carboxypeptidase Aktivitéit, an metalloexopeptidase Aktivitéit VerfÜgung 3 VerfÜgung 0 VerfÜgung 3 VerfÜgung Serine-Typ endopeptidase inhibitor Aktivitéit, endopeptidase inhibitor Aktivitéit, an protease inhibitor Aktivitéit VerfÜgung 4 VerfÜgung 2 VerfÜgung 2 VerfÜgung Taxis an chemotaxis VerfÜgung 4 VerfÜgung 3 VerfÜgung 1 VerfÜgung Äntwert un extern Impulser VerfÜgung 7 VerfÜgung 4 VerfÜgung 3 VerfÜgung immun System Prozess VerfÜgung 10 VerfÜgung 5 zur VerfÜgung 5 zur VerfÜgung Verdeedegungsminister Äntwert VerfÜgung 7 VerfÜgung 5 zur VerfÜgung 2 VerfÜgung positiv Regulatioun vun Zell dat VerfÜgung 3 VerfÜgung 2 VerfÜgung 1 VerfÜgung PPAR sécher Passerelle VerfÜgung 3 VerfÜgung 0 VerfÜgung 3 VerfÜgung Leukocyte Migratioun VerfÜgung 3 VerfÜgung 2 VerfÜgung 1 VerfÜgung * E Vertrieder Kategorie fir déi folgend phpNuke Kategorien:. epidermis morphogenesis, Otemschwieregkeeten morphogenesis, epidermis Entwécklung, ectoderm Entwécklung, Otemschwieregkeeten Entwécklung, Uergel Entwécklung, Präparaten Struktur Entwécklung, Präparaten Struktur morphogenesis, bewosst Entwécklungsphase Prozess, multicellular organismal Entwécklung, an epidermal Zell dat VerfÜgung Confirmatioun vun microarray Resultater vun QRT-Hinnen alleguer VerfÜgung Neierung an der Ausdrock Niveau vun ausgewielt Genen huet confirméiert, an microarray Resultater goufen duerch QRT-Hinnen alleguer gestäerkt mat der selwechter RNS Echantillon wéi déi fir de microarray benotzt. Véierzéng Genen mat bemierkenswäerte fantastesch änneren Wäerter sech fir Confirmatioun ausgewielt baséiert op de Resultater vun funktionell Annotation. Déi gewielte Genen Vertrieder aus verschiddene funktionell Kategorien Équipe. Dräizéng (92.9%) aus 14 Genen zougedréckt concordant Resultater tëscht microarray Analyse an QRT-Hinnen alleguer (Bedeitung 1 an 2, well 1). Déi eenzeg discrepant Resultat war Pkp4 VerfÜgung, déi laut der microarray upregulated war an änneren net no der QRT-Hinnen alleguer (1.09-fantastesch). Figur 1 Préifen vun microarray Daten aus Car9 - /- Mais vun QRT-Hinnen alleguer. Den Ausdrock vun verschiddenen ungen zu 6 Car9 VerfÜgung - /- Mais gouf zu 6 Wildwest-Typ Kontrollen un dass am Verglach. D'normalized Wäerter vun triplicate Experimenter si gewisen. A, QRT-Hinnen alleguer Analyse vun 6 Genen mat entschlof Ausdrock. B, QRT-Hinnen alleguer Evaluatioun vun 8 Genen mat repressed Ausdrock. Statistesch Differenze relativ zu Wildwest-Typ Mais huet alles. * P &Si besteet; 0,05; ** P &Si besteet; . 0,01 VerfÜgung Diskussioun VerfÜgung A leschter Etude weisen eng hyperplastic phenotype vun gastric Kierper mucosa zu Car9 VerfÜgung - /- Mais [16]. CA IX hunn Nerve overproduction vun gastric pit Zellen an Reduktioun vum Chef Zellen. Zimlech iwwerraschend, d'gastric pH vun CA IX-erhéijen Mais bleift onverännert. Baséierend op dës Observatiounen, kann se ofgeschloss sinn, datt den Haapt Roll vum CA IX am Mo. mucosa ass net ze pH Regulatioun dinn mee et ass fir normal gastric morphogenesis an homeostasis bannent de gastric mucosa néideg. An dësem Pabeier, Rapport mir hire Restaurant zu mRNA Ausdrock dass de phenotypic Ännerungen bäidroen kéinten am Mo vun Car9 VerfÜgung -deficient Mais gemellt. Allerdéngs muss een an Rücksicht huelen, datt e puer vun dësen Ännerungen renger Differenzen an der famill Undeeler vun verschiddenen Zell Zorte bannent de gastric mucosa spigelen kann VerfÜgung Wéi erwaart, déi Car9 VerfÜgung -. /- Phenotype geännert den Ausdrock vun Genen vun Entwécklungsphase Prozesser an Zell dat Équipe. D'Ausschöpfung vun Chef Zellen zu Car9 VerfÜgung - /- gastric mucosa kënnen déi bedeitendst downregulation vun der Basis Wendel-Glück-Wendel Famill, Member A15 /Mist1 VerfÜgung (Bhlha15 VerfÜgung) Gentherapie, erklärt ginn dat ass eng Klass B Basis Wendel-Glück-Wendel (bHLH) Transkriptiouns Faktor datt acinar Zell-spezifesch Ausdrock geet [19]. Mist1 Gentherapie Ausdrock ass zu enger grousser Partie vun Stoffer mat serous Typ secretion dorënner d'Bauchspaicheldrüs, salivary Glands, Chef Zellen vun de Mo, Paneth Zellen vun de klenge Daarm, zukunftsträchteg vesicles, an lacrimal Glands observéiert [20]. D'Auteuren vun Mist1 VerfÜgung Bleck normal Panz Hals Zell redifferentiation an zymogenic Chef Zellen wéi all basal zymogen-secreting Zellen zu Mist1 VerfÜgung - /-. Mais Multiple strukturell Mängel weisen [21] En anert interessant Kandidat VerfÜgung mat wat fir Zell antike Stéierung vun der gastric epithelium vum CA IX-erhéijen Mais ass epidermal Wuesstem Faktor VerfÜgung (EGF VerfÜgung), deen Ausdrock ass dass vill rofgaang ass wann am Verglach zu Wildwest-Typ Mais. Dorënner Wuesstem Faktoren, ëmfaasst de EGF Famill wichtege Beroder fir gastric mucosa. EGF ass eng Single-Ketten polypeptide vun 53 Aminosaier Pestiziden, deen haaptsächlech an der submandibular Glands an Brunner d'Glands vun der gastrointestinal TRACT fonnt gëtt [22]. EGF Photo'en a activéiert de Faktor epidermal Wuesstem receptor zu bewosst Prolifératioun doraus, dat, an Iwwerliewe [23]. Spannen, hunn e puer Enquêteuren gemellt dass EGF kenne zu Knabberdéieren Chef Zellen beräichert ginn [24, 25], an dësen Zellen d'Wichtegkeet vun EGF Funktioun suggeréiert. Dofir hire Restaurant an der Expressioun vun EGF receptor ligands oder, an dësem Fall, kéint EGF zu der dat a Funktioun vum Chef Zellen droen. VerfÜgung Ee vun de stäerkste betraff upregulated Genen vun dëser Etude am malignant Gehir erhéijen 1 VerfÜgung geläscht war (Dmbt1 VerfÜgung), déi fir de Ralley receptor cysteine-räich (SRCR) superfamily vu Proteinen gehéiert. Dëst ass eng superfamily vun secreted an Membran-gebonnen Proteinen mat SRCR Beräicher déi héich conserved erof ze sponges sinn [26, 27]. Den Ausdrock vun DMBT1 ass den héchsten an epithelia an ass normalerweis op der enger steriler Zell Uewerfläch oder zu luminal exocrine secretions observéiert. An Mais, ass DMBT1 stäerkste betraff am gastrointestinal System ausgedréckt [28]. DMBT1 ass proposéiert e entholl suppressor [26, 29, 30] an /oder engem regulator vun epithelial dat [31], esou wéi se Rollen an Leitmotiv immun Ofwier an inflammation gin [32, 33]. DMBT1 ass an der Krypta Zellen vun de Mënscherechter, Maus, an Kanéngchen kleng Daarm [31, 34, 35] an den Hals Regioun vun normale Mënsch gastric mucosa etabléiert [36], déi virun allem vun Desaccord /Grënner Zellen zesummegesat sinn. Soumat ass dëst Gentherapie eventuell an d'Fro gestallt oofgedicht Prozess vun gastrointestinal epithelia Équipe. Eng wichteg Roll fir DMBT1 zu Leitmotiv immun Verteidegung huet an verschidde Studien bewisen ginn. De Mënsch DMBT1 glycoprotein, ausgedréckt an salivary Glands, Airways, an genital TRACT, Photo'en verschidde bakteriell pathogens an Viren [37-40]. Ausserdeem, Ausdrock vun Maus DMBT1 an der gastrointestinal TRACT ass duerch Bakterien reegelen [41, 42], a seng Ausdrock ass während Wonn sech [43]. Et gouf och gewisen, datt et eng Associatioun vun engem Dmbt1 VerfÜgung Variant allele mat Crohn d'Krankheet an et ass eng Korrelatioun vun Ausdrock Niveau vun Dmbt1 VerfÜgung mat demagogesch bowel Krankheet Gravitéit [44]. VerfÜgung Weideren DMBT1 Photo'en dass nach Proteinen SP-d an SP-E. Dës sinn collagen- wouvun, (C-Typ) Kalzium-ofhängeg lectins genannt collectins déi mat glycoconjugates an Fetten op der Uewerfläch vun microorganisms haaptsächlech duerch hir rechnen Unerkennung Beräicher (CRDs) [45] zesummekomm. SP-D an SP-A si zu enger Rei vun immun Funktiounen Équipe, dorënner Haren neutralization, Usammlung an Dout vu Bakterien a liewen, a Minnen vun apoptotic an necrotic Zellen. An immunologically granzt Longen, downregulate se demagogesch Reaktiounen, mä wou mat LPe oder apoptotic Zellen erausgefuerdert se phagocytosis vun macrophages, pro-demagogesch cytokine Produktioun, an der Opléisung vun de Lycée immun Äntwerte [46] induce. Et ass interessant, dass am Moment studéieren, zousätzlech zu Dmbt1 VerfÜgung, den Ausdrock vu dass nach verbonne FAQ D VerfÜgung (Sftpd oder SP-D VerfÜgung) war an Car9 héich entschlof VerfÜgung - /- Mais. Sou, VerfÜgung der upregulation souwuel Dmbt1 VerfÜgung an Sftpd hindeit datt CA IX hunn eng immun Prozess vun der gastric mucosa entschlof. Et soll och ze bemierken, datt CA IX erschéngen an engem receptor-mediated Art a Ralley kenne ugeholl gouf zu dendritic Zellen ze kruet eng wichteg Roll an deem Prozess [47] ze spillen. Zousätzlech, schéngt CA IX eng immun Äntwert vun engem Mechanismus charakteristesche ze aktivéieren Schock Proteinen ze Hëtzt. Sou, direkt CA IX mat DMBT1 via engem Ralley receptor so konnt. VerfÜgung An Tatsaach, de Stéierungen Car9 VerfÜgung Gentherapie ëmmer disregulation vu verschiddene Genen datt zu immun Prozesser verwéckelt sinn. Dëst corroborates d'Resultater vun enger viregter Etude wou gastric submucosal inflammation am Kierper Regioun an eng Majoritéit vun C57BL /6 Car9 nogewise gouf VerfÜgung - /- Mais [17]. Am Moment studéieren, Il1rl1 /ST2 VerfÜgung ët Variant 2 mRNA war absolut wéinst CA IX hunn entschlof. D'Il1rl1 /ST2 VerfÜgung Gentherapie ass e Member vun der interleukin-1 (IL-1) receptor Famill a produzéiert eng soluble secreted Form (sST2) an engem transmembrane Form (ST2L), kodéiert vun ët Varianten 2 an 1, respektiv. D'Membran-gebonnen Form vun hematopoietic Zellen an der soluble Form ass virun allem während Här iwert mech selwer [48] allem ausgedréckt. Besonnesch, ass ST2L zéien an murine a mënschlech Th2 Zellen ausgedréckt a kann esou engem spezifeschen Bewaacher vun Th2 Zellen zu kënschtlech VerfÜgung Experimenter [49-52] benotzt ginn. Dofir, huet d'Funktioun vun ST2L ugeholl gouf mat Th2 Zell-mediated immunological Äntwerte an IL-33, eng nei entdeckten Member vun der IL-1 cytokine Famill ze vergläichen, ass wéi eng spezifesch ligand fir ST2L [53] gemellt. Spannen, hunn e puer Studien gewisen, datt de Niveau vun soluble ST2 zu Sera an asthmatic Krankheet nik ass [54, 55]. Dofir, huet et schonn ugedeit, datt soluble ST2 och eng kritesch Roll an Th2 Zell-mediated Krankheeten spille kann. An Tatsaach, huet et bewisen ass, dass soluble ST2 Akten als verschiddene decoy receptor fir IL-33 e murine thymoma Zell Linn benotzen, EL-4, déi ST2L stably dréckt, an engem murine Modell vun Asthma [56]. Dëst deit drophin, datt soluble ST2 negatif der Produktioun vun Th2 cytokines duerch IL-33 sécher an allergescher airway inflammation modulates. Et ass interessant, dass d'mRNA Niveau vun IL-33 am Moment studéieren ze notéieren, och ~ 2-fantastesch nik war, obschons dës Ännerung net statistesch relevant war. Sou, schéngt et plausibel datt CA IX iergendwéi an Regulatioun vun der Th2 Äntwert Équipe ass. VerfÜgung CA IX och d'Bléi Syndrom homolog vill downregulated zu der Entwécklung vun der immun System als CA IX hunn bäidroen kéinten (mënschlech) VerfÜgung Gentherapie (Blm VerfÜgung), déi en ATP-ofhängeg DNA helicase encodes datt zu engem evolutionarily conserved Famill vun RecQ helicases gehéiert [57]. Stattfannen vun Blm VerfÜgung eng rare Mënsch autosomal recessive Stéierungen bewierkt Bloom d'Syndrom (BS) genannt, déi vun markéiert Frankräich Onstabilitéit charakteriséiert ass. BS ass mat Wuesstem retardation, schwéierste waat fir stäerkste Kriibs Typen, an immunodeficiency [58], mat der Pai zwou Funktiounen ausmaachen fréi Doud [59] assoziéiert. D'Funktioune vum BLM hunn nëmmen deelweis charakteriséiert ginn. Mä, ass et schonn gewisen, datt BLM eng Roll an der Verbreedung an Iwwerliewe vu béiden Entwécklungslänner an eeler T lymphocytes huet, a seng Läschen féiert T-Zell excellence [60] zu defekt. Ausserdeem, déi geplangten Knockout vun Blm VerfÜgung zu kompromettéiert B Zell Entwécklung an Ënnerhalt bäigedroen, staark leider T Zell-ofhängeg an -independent antibody Äntwerte der immunization, an engem propensity fir Entwécklungslänner B Zell lieft [61]. Dofir, ass et erdenklech datt Car9 VerfÜgung - /- Mais bäibruecht excellence Äntwerte kompromettéiert VerfÜgung Eng onerwaart Opklärung war, datt e puer kleng proline-räiche Proteinen VerfÜgung (Sprr VerfÜgung) waren zum Beispill upregulated inklusiv. Sprr1a VerfÜgung, Sprr2d VerfÜgung, Sprr2e VerfÜgung, Sprr2i VerfÜgung, an Sprr3 VerfÜgung. Mä nëmmen déi Aféierungs- vun Sprr1a VerfÜgung war statistesch relevant. SPRR Proteinen waren ursprénglech als ze lues fir Uschloss squamous Zell dat identifizéiert wou se Etüd vun der cornified fonnt ginn [62]. Zousätzlech sinn SPRR Proteinen zu verschiddenen nonsquamous Stoffer, ausgedréckt, an hir biologesch Funktioun ass net ze strukturell Proteinen vun der cornified Enveloppe limitéiert [63]. Et gouf gewisen, datt SPRR Proteinen an der Äntwert op verschidde Logik vun ville Stoffer ouni stratified epithelium deelhuelen. An der biliary TRACT, erschéngen SPRR2 Memberen zu Modifikatioun vun der biliary Barrière ënner Konditiounen vun Stress [64] ze bedeelegen. Anerersäits, well e Roman Stress-inducible afgerappt Vermëttler vun gp130 cytokines zu cardiomyocytes mat engem cardioprotective Effekt géint ischemic Stress [65] identifizéiert SPRR1A gouf. Ausserdeem, an Mais, war SPRR2A FAQ gemellt héich zu gastric mucosa vun Helicobacter heilmannii VerfÜgung [66] Krankheet entschlof ginn. Ausserdeem, ass et ugeholl ginn datt SPRR1A enger Erhuelung-verbonne FAQ ass well seng Aféierungs- zu neuronal Verletzung mat regenerative Muecht deemolegt Weltbild, mat quasi all blesséiert däischtere root ganglion Zelle SPRR1A eng Woch no sciatic Nerve blesséiert ausdrécken [67]. Dofir, sinn SPRR Genen viraussiichtlech an Äntwert zu verschiddene Stress Konditiounen entschlof an zu Zell Schutz, Otemschwieregkeeten Remodeling droen, an /oder Otemschwieregkeeten Erhuelung. An d'Liicht vun dëse Conclusiounen schéngt et plausibel datt CA IX hunn e Stress Zoustand vun der gastric mucosa schaaft, déi zu upregulation vun e puer Schutzpatrounin Facteuren beaflosst. VerfÜgung Eis Analyse identifizéiert mRNAs aus véier Memberen vum Musée gouf Famill Proteinen an gin misregulated der Car9 VerfÜgung - /- Mais Mo. mucosa. Dës Musée gouf Proteinen sinn zu Membran Transport vun verschiddenen Molekülle Équipe. Den Ausdrock vun Slc9a3 VerfÜgung war staark, hierkommen, déi Ausdrock vun Slc27a2 VerfÜgung, Slc38a5 VerfÜgung entschlof, an Slc5a8 VerfÜgung repressed war. D'Basis Funktioun vun SLC9A3 oder NHE3 ass den Austausch vun extracellular Na + fir intracellular H +, also entweder eng Lut an intracellular pH dauernd oder wann, un der Aktioun vun anere Transporter Koppel, eng Hausse vun Zell Volumen [ ,,,0],68]. An der gastrointestinal TRACT, ass SLC9A3 an der enger steriler Membran an Recycling endosomes vun der ileum, jejunum, Colon, an Mo. ausgedréckt [69]. Weider Studien sinn waren d'méiglech System léisst tëscht CA IX an SLC9A3 an der gastric mucosa ze entschlësselen. VerfÜgung verwonnerlech, dorënner déi downregulated Genen mir e puer Genen vun unzereegen Équipe fonnt. Dës abegraff trypsin 1 VerfÜgung, Amylas 2a5 VerfÜgung, chymotrypsin-wëll elastase Familljemember 2A VerfÜgung, an pancreatic lipase VerfÜgung mat statistesch relevant p-Wäerter an anerer, wéi chymotrypsinogen B1 VerfÜgung, carboxypeptidase A1 VerfÜgung, an carboxypeptidase B1 VerfÜgung mat nonsignificant p-Wäerter. D'deemno vun dëser fannen bleift onkloer. Eng méiglech Erklärung fir dës kéint ginn, datt downregulation vun dësen Enzymen engem Lycée Evenement ass. Wann et gëtt ugeholl, datt dës Enzymen vum Chef Zellen produzéiert ginn, déi reduzéiert Zuel vu Chef Zellen am Car9 VerfÜgung - /- Mais gastric mucosa kann och eng Diminutioun an den Montant vun der Enzymen féieren se produzéieren. Allerdéngs bleift genau Mechanismus hannert dëse Phänomen opgekläert ze ginn. VerfÜgung Konklusiounen VerfÜgung An Conclusioun, CA IX hunn war dës déi Ausdrock vun verschiddene Genen vun der gastric mucosa ze vergréisseren. D'Zuel vun de betraffene Genen an der Hellegkeet vun Ännerungen décidéiert relativ héich, wat beweist, datt CA IX eng bemierkenswäert Roll an gastric Funktiounen huet. Microarray Analyse réischt puer Genen vun Entwécklungsphase Prozesser Équipe an Zell dat, wat d'Zell antike Stéierung vun der gastric epithelium vun Car9 erkläre kéint VerfÜgung - /- Mais. Spannen, sinn e puer vun de geregelte Genen vun dëser Etude identifizéiert Équipe souwéi Funktiounen vun der immun an Ofwier Äntwerte vun unzereegen. Dëst brengt hindeit datt CA IX hunn d'immun System vun der gastric epithelium Kompromëss da lo nach eng aner Roll fir dës Salle Aktivitéit. VerfÜgung Method VerfÜgung Déieren Modell an Otemschwieregkeeten Virbereedung VerfÜgung Generation vun der geziilte Stéierungen vun der Car9 VerfÜgung Gene gouf duerch Ortova Delger et al beschriwwe virdrun. [16]. (tissue)
NM_029706
GGTTTCCACGCAAGAGAG
GTTGACCACAGGCAGAACA
Cym
chymosin
NM_001111143
ATGAGCAGGAATGAGCAG
TGACAAGCCACCACTTCACC
Dmbt1
deleted

• Schwannoma vun de Mo: e Fall Rapport
• En der histologically ënnerscheet gastric amyloidosis aus scirrhous gastric Kriibs benotzt Bild mucosal resection: e Fall Rapport