Globális transzkripciós válasz karboanhidráz IX hiányosság egér stomach

Global transzkripciós válasz karboanhidráz IX hiányosság az egér gyomorban
Abstract
alapon
Szénsav anhydrases (CAS) egy család enzimek szabályozzák pH homeosztázis különböző szövetekben. CA IX egy kivételes tagja ennek a családnak, mert amellett, hogy az alapvető CA funkció, azt már összefüggésbe a számos más élettani és kóros folyamatokat. Funkciók javasolt CA IX közé szerepeket sejt adhéziós és a malignus sejtek invázióját. Ezen túlmenően, a CA IX valószínűleg szabályozza a sejtek proliferációját és differenciálódását, ami kimutatható volt Car9
- /- egerekben. Ezek az egerek voltak gyomor pit sejt hyperplasia és kiürülését vezető sejtek; Ugyanakkor a specifikus molekuláris mechanizmusok mögött a megfigyelt fenotípus továbbra is ismeretlenek. Ezért akartuk hatásának vizsgálatára CA IX hiány teljes genom génexpresszió gyomor nyálkahártyáját. Ezt végezzük Illumina Sentrix ®Mouse-6 Expression BeadChip tömbök. A kifejezés számos gén a figyelemre méltó szeres változást értékek igazoltuk QRT-PCR-rel.
Eredménye
CA IX-hiány okozta indukcióját 86 gének és elnyomása 46 gének a gyomor nyálkahártyáját. Volt 92,9% közötti összhang kapott eredmények microarray és QRT-PCR. A differenciáltan expresszálódó gének benne részt vevők fejlődési folyamatok és a sejtek differenciálódását. Ezen túlmenően, a CA IX hiány megváltozott expressziója felelős gének immunválasz és downregulált expresszióját több emésztő enzimek.
Következtetések
Microarray elemzés azonosított számos potenciális gének, amelyek megváltozott expressziója magyarázatot adhat a megzavart sejtvonal fenotípusát a Car9
- /- gyomor nyálkahártyáját. Az eredmények azt is jelezték, új szerepet CA IX szabályozásában immunológiai folyamatok és az emésztést. Ezek az eredmények megerősítik a koncepció, hogy a fő szerepe a CA IX nem szabályozásában pH a gyomornyálkahártya. Ehelyett szükséges a megfelelő funkció számos fiziológiai folyamatokat.
Alapon
a karbon-anhydrases (CAS) egy család cinktartalmú metalloenzimek, amelyek katalizálják a reverzibilis hidratáció a szén-dioxid a reakció: CO 2 + H 2 O ↔ H + + HCO 3 -. Részt vesznek számos élettani folyamat, mint a sav-bázis egyensúlyt, a CO 2 és a HCO 3 - közlekedés, légzés, csontreszorpció, ureagenesis, glikoneogenezist, lipogenezist, termelés testnedvek, és trágyázás [ ,,,0],1, 2]. A CA család áll 13 aktív izozimek emlősökben, amelyek 12 vannak kifejezve, és a funkció emberben [3]. A CA izozimek van változatos szöveti expressziós mintázatot, jellegzetes szubcelluláris lokalizációt, valamint egyedi kinetikai és gátló tulajdonságokkal.
CA IX dimer fehérje társított a sejtmembrán [4, 5]. Az érett formájában, CA IX áll egy N-terminális proteoglikán (PG) domént, egy CA katalitikus domént, transzmembrán régió és egy rövid intracitoplazmatikus farok a C-terminális [6]. CA IX az egyetlen tagja a CA család tartalmazó PG domént mellett a CA tartományhoz. Következésképpen, CA IX felvetődött, hogy részt vegyenek sejtadhéziós folyamatokban. Sőt, a MDCK (Madin-Darby kutya vese) epiteliális sejtekben, azt mutatja, hogy a CA IX csökkenti az E-cadherin által közvetített sejt-sejt adhézió kölcsönhatásban β-catenin [7].
CA IX fejezzük csak kevés normál szövetekben az expressziós lét legerősebb a humán, patkány és egér gyomor nyálkahártya, ahol jelen van a gyomor boxba a mély gyomor mirigyek [8, 9]. CA IX korlátozódik a bazolaterális felszínén hámsejtek és által termelt összes fő sejttípus a gyomornyálkahártya [8]. CA IX egy kivételes tagja a CA család, mert van kifejezve több rákok eredő CA IX negatív szövetek, beleértve a vese, a tüdő, a méhnyak, a petefészek, a nyelőcső, és emlő karcinómák [6]. Azonban, a gyomorrák és premalignus léziók kimutatták csökkent expressziója CA IX [10]. A tumor szövetekben, CA IX kapcsolódik a hipoxiás fenotípus által közvetített hypoxia által indukálható transzkripciós faktor 1 (HIF-1), amely kötődik a hypoxia érzékeny elemet, HRE, a CA9 katalógusa promoter [11]. Hipoxiás körülmények között, a rákos sejtek függnek elsősorban anaerob anyagcsere saját energiatermelést. Ez az anaerob tumor anyagcsere generál túlkapásait savas termékek, mint például a tejsav és a H +, amelyeket meg kell extrudálni a sejt belsejéből. Bebizonyosodott, hogy a CA IX hozzájárulhat a savasodás a hipoxiás extracelluláris miliő, ily módon segítve a tumorsejtek, hogy semlegesítse az intracelluláris pH [12]. Ennek megfelelően, CA IX overexpressziója gyakran azt jelzi, rossz a prognózisa, és ellenáll a klasszikus radio- és kemoterápiás kezelések [13]. Azonban CA IX nem korlátozódott a hipoxiás régióiban a daganatok, jelezve, hogy talán lehet valami más utakat, amelyek szabályozzák a kifejezést. Tény, hogy a kifejezés a CA IX lehet indukált normoxiás körülmények között a magas sejtsűrűség, és ez a szabályozás által közvetített foszfatidilinozitol 3-kináz (PI3K) jelátviteli [14]. Sőt, a mitogén-aktivált protein kináz (MAPK) útvonal szabályozásában vesz részt a CA IX expressziós keresztül az irányítást a CA9 katalógusa promoter mindkét HIF-1-függő és -független jelek [15]. Ez az út is összefügg a PI3K-útvonal és az SP1 (specificitás protein 1) transzkripciós faktor.
A generációs Car9
- /- egerek feltárta, hogy amellett, hogy a pH szabályozása és sejt adhézió, CA IX rendelkezik más funkcionális szerepek [16]. Ezek Car9 katalógusa egereknek nem mutattak rendellenességet növekedés, szaporodási képességük, és élettartamát. Azonban, CA IX hiányosság eredményezte hiperplázia a gyomor nyálkahártyáját. A hyperplasiás nyálkahártya tartalmazott megnövekedett száma és aránya a nyálka-termelő sejtek pit mivel a száma és aránya vezető sejtek csökkent. A teljes száma parietalis sejtek változatlan maradt, és ennek megfelelően, a CA IX-hiányos egerek normális a gyomor pH, sav szekréció, és a szérum gasztrin szint. Így ezek a megállapítások azt mutatják, hogy a CA IX hozzájárul az irányítást differenciálódását és proliferációját epithelialis sejtvonal a gyomor nyálkahártyáját. Egy korábbi tanulmány azt vizsgálta, hogy a hatását CA IX hiány lehet módosítani a magas sótartalmú diéta, egy ismert ko-faktorral carcinogenezis [17]. Ezek az eredmények azt mutatták, hogy a magas sótartalmú diéta enyhén növelte a mirigyes sorvadás a szervezetben nyálkahártyáján Car9
- /- C57BL /6 egerekben, míg ez a hatás nem volt megfigyelhető a BALB /c egerekben. Azonban nem metaplasztikus vagy dysplasiás rendellenességek mutatkoztak a gastrointestinalis epithelium CA IX-deficiens C57BL /6 egerekben. Így ezek a megfigyelések arra utalnak, hogy a CA IX hiány önmagában nem jelentős tényező, de rákkeltő kezdeményezheti rákkeltő folyamatot érintő sejtburjánzás és /vagy differenciálás a gyomor nyálkahártyáját.
Ez a tanulmány célja az volt, hogy jobban megértsük a hyperplasticus fenotípus a gyomor nyálkahártyája Car9 katalógusa - /- egerekben, mert a molekuláris mechanizmusok mögött jelenleg ismeretlen. Ezen kívül, azt akartuk, hogy pontosabban megvilágítani a funkcionális szerepek CA IX, hiszen egyre több bizonyíték mutatja, hogy jóval túlmutatnak pH szabályozás. Erre a célra egy genomra kiterjedő expressziós analízist végeztünk. Microarray adatok elemzése során több gén, amelynek expressziója következtében megváltozott Car9 katalógusa génelrontási a gyomor nyálkahártyáját. Katalógusa Eredmények
transzkripciós válasz Car9 hiány a gyomorfal katalógusa gyomor RNS 6 Car9 katalógusa - /- egerekben és 6 vad típusú egerekben elemeztük microarray. Az elemzés kimutatta, 86 serkentett gének és 46 játszó gének, egy szeres változást cut-off ± 1,4 felfelé és downregulált kifejezés volt (lásd a további fájl 1: List gének eltérő módon fejeződnek ki a gyomorban Car9 katalógusa - /- egerek). Ez cut-off érték javasolták megfelelő szintet, amely igen magas korrelációt microarray QRT-PCR adatok, függetlenül attól, hogy más tényezők, mint a folt intenzitása és ciklus küszöb [18]. A hajtás változások között mozgott 10,46 -12,14 az. Itt, egy listát a gének egy cut-off érték ± 2,5-szeres látható (1. és 2. táblázat). Ha ezek a kritériumok, mind a gének szignifikánsan (p < 0,05) a megváltozott expresszióját mutatja, hogy van, 14 gének indukált expresszióját, és 21 gének elfojtott kifejezést. A lista az összes szabályozott gének funkcionálisan jegyzetekkel (lásd egyéb fájl 2: Funkcionális annotáció gének szabályozzák a gyomorban Car9
egereknek), bemutatva gazdagodását Hidrolázaktivitáson fejlődési folyamatokat, a sejtosztódást, a proteolízis peptidáz aktivitást, szerkezeti molekula aktivitás, és az immunrendszer folyamat, többek között. A funkcionális magyarázat kategóriák és gén számok minden kategóriában táblázatban 3.Table 1 gének serkentett kifejezés használatával cut-off érték 2,5-szeresére. Katalógusa Gene szimbólum
Leírás Matton GenBank number

FC

QRT-PCR

Cym
chymosin
NM_001111143
10.46
19.66
Slc9a3
solute hordozó család 9 (nátrium /hidrogén cserét), 3 tag katalógusa NM_001081060 katalógusa 8,07 katalógusa 10.72 katalógusa U46068 katalógusa cDNS-szekvencia U46068, transzkripciós variáns 2 | NM_153418 katalógusa 5,95 katalógusa Dmbt1
törölt rosszindulatú agydaganatok 1 katalógusa NM_007769 katalógusa 5,68 katalógusa 5,29 katalógusa Il1rl1 katalógusa interleukin 1 receptor-szerű 1 transzkripciós variáns 2 | NM_010743 katalógusa 5,38 katalógusa 8,95
Tm4sf5 katalógusa transzmembrán 4 szupercsaládtagot 5 katalógusa NM_029360 katalógusa 4,26 katalógusa 9130204L05Rik katalógusa RIKEN cDNS 9130204L05 gén katalógusa NM_001101461
4,19 katalógusa Sftpd katalógusa felületaktív asszociált protein D
NM_009160
4,11
3,69
Nccrp1
nem-specifikus citotoxikus sejt-receptor-protein 1 homológját (zebradánió)
NM_001081115
3,81
Pkp4
plakophilin 4, átirat 1. változat katalógusa NM_026361 katalógusa 3,54 katalógusa 1.09 katalógusa Sprr2d katalógusa kis prolingazdag fehérje 2D katalógusa NM_011470
3,46 katalógusa Gm14446 katalógusa megjósolta gén 14446, transzkripciós variáns 2
NM_001101605
3,45 katalógusa Sprr3
kis prolingazdag protein 3 katalógusa NM_011478 katalógusa 3,39 katalógusa Sprr2i katalógusa kis prolingazdag fehérje 2I katalógusa NM_011475
3,31
Sprr1a katalógusa kis prolingazdag fehérje 1A katalógusa NM_009264
3,30 katalógusa IVL katalógusa involukrin katalógusa NM_008412 katalógusa 3,08 katalógusa Serpinb12 katalógusa szerin (vagy cisztein) peptidáz inhibitor , kládja B (ovalbumin), 12 tag katalógusa NM_027971 katalógusa 3,02 katalógusa Krt10 katalógusa keratin 10 katalógusa NM_010660 katalógusa 3,01 katalógusa Gm94
megjósolta gén 94 katalógusa NM_001033280
2,94 katalógusa Krt13 katalógusa keratin 13
NM_010662 katalógusa 2,94 katalógusa Gsdmc2 katalógusa gasdermin C2, transzkripciós variáns 2 | NM_177912 katalógusa 2,88 katalógusa Lor katalógusa loricrin
NM_008508
2,84 katalógusa Dmkn katalógusa dermokine, transzkripciós variáns 2 | NM_172899
2,78 katalógusa Ly6d katalógusa limfocita antigén 6 komplex, locus D katalógusa NM_010742
2,69
Krt1 katalógusa keratin 1 katalógusa NM_008473
2,52 katalógusa 2. táblázat gének downregulált kifejezés használatával cut-off érték -2,5-szeres. katalógusa Gene szimbólum
Leírás Matton GenBank szám
FC Matton QRT-PCR Matton Try4 katalógusa tripszin 4
NM_011646 katalógusa -12,14 katalógusa Prss1 katalógusa proteáz, szerin, 1 (tripszin 1) hotelben NM_053243 katalógusa -10,57 katalógusa Amy2a5 katalógusa amiláz 2a5, hasnyálmirigy katalógusa NM_001042711
-9,85 katalógusa Cela2a katalógusa kimotripszinszerű elasztáz család tagja, a 2A katalógusa NM_007919 katalógusa -7,59 -16,23 katalógusa katalógusa Gm12888 katalógusa megjósolta gén 12888 katalógusa NM_001033791 katalógusa - 7.12 katalógusa GDF9 katalógusa növekedési differenciálódási faktor 9 katalógusa NM_008110 katalógusa -7,04 katalógusa BLM katalógusa virágzás szindróma homológ (emberi), transzkripciós variáns 1 katalógusa NM_007550 katalógusa -6,27 katalógusa Pnlip katalógusa hasnyálmirigy lipáz katalógusa NM_026925 katalógusa -6,23 -23,88 katalógusa katalógusa CFD
kiegészítik D faktor (adipsin) hotelben NM_013459 katalógusa -5,35 -27,45 katalógusa katalógusa Ctrb1 katalógusa kimotripszino B1 katalógusa NM_025583 katalógusa -5,00 katalógusa Mug1 katalógusa murinoglobulin 1 katalógusa NM_008645 katalógusa -4,30 katalógusa Sostdc1 katalógusa sclerostin domént tartalmazó 1 katalógusa NM_025312
-4,17 katalógusa Tmed6 katalógusa transzmembrán emp24 fehérje közlekedés területén, amely 6 katalógusa NM_025458 katalógusa -4,07 katalógusa Cpa1 katalógusa karboxipeptidáz A1 katalógusa NM_025350 katalógusa -3,95 katalógusa Slc27a2
oldott vivőanyag család 27 (zsírsav transporter), tag 2 | NM_011978 katalógusa -3,80 katalógusa Adipoq katalógusa adiponektin C1Q és kollagén domént tartalmazó katalógusa NM_009605 katalógusa -3,74 -20,51 katalógusa
Car3
karboanhidráz 3 katalógusa NM_007606 katalógusa -3,72 -15,39 katalógusa katalógusa EGF katalógusa epidermális növekedési faktor katalógusa NM_010113 katalógusa -3,68 -3,71 katalógusa
Abpg
androgén kötő fehérje gamma katalógusa NM_178308 katalógusa -3,67 katalógusa Slc38a5 katalógusa oldott vivőanyag család 38 tagja 5 katalógusa NM_172479 katalógusa -3,64 katalógusa Chia katalógusa kitináz, savas katalógusa NM_023186
-3,52 katalógusa LOC638418
megjósolta: hasonló Ela3 fehérje katalógusa XM_914439 katalógusa -3,48 katalógusa LOC100043836 katalógusa megjósolta: hasonló könny- androgén-kötő fehérje delta, transzkripciós variáns 1 katalógusa XM_001481113 katalógusa -3,41 katalógusa EG640530 katalógusa megjósolta: megjósolta gén EG640530 katalógusa XM_917532 katalógusa -3,37 katalógusa Nrn1 katalógusa neuritint 1 katalógusa NM_153529 katalógusa -3,36 katalógusa Cela3b katalógusa kimotripszinszerű elasztáz család tagja, 3B katalógusa NM_026419 katalógusa -3,32 -75,74 katalógusa katalógusa Spink3 katalógusa szerin peptidáz gátló, Kazal 3. típusú katalógusa NM_009258
-3,32 katalógusa Scd1 katalógusa sztearoil-koenzim A deszaturáz 1 katalógusa NM_009127 katalógusa -3,27 katalógusa Ctrl
kimotripszinszerű katalógusa NM_023182 katalógusa -3,19 katalógusa Gper
G-fehérjéhez kapcsolt ösztrogénreceptor 1 katalógusa NM_029771 katalógusa -2,96 katalógusa Sycn katalógusa syncollin katalógusa NM_026716 katalógusa -2,91 katalógusa Bhlha15 katalógusa alap helix-loop-helix család, tag a15 katalógusa NM_010800 katalógusa -2,77 katalógusa Cpb1 katalógusa karboxi B1 (szövet) hotelben NM_029706 katalógusa -2,73 -18,22 katalógusa katalógusa Slc5a8 katalógusa oldott hordozó család 5 (jodid transzporter), a 8 katalógusa NM_145423 katalógusa -2,68 katalógusa CYP2E1 katalógusa citokróm P450 család 2, alcsalád e, polipeptid 1 katalógusa NM_021282 katalógusa -2,65 katalógusa Zg16 katalógusa zimogén szemcse fehérje 16 katalógusa NM_026918 katalógusa -2,57 katalógusa 3. táblázat a funkcionális magyarázat kategóriákban a gének által szabályozott CA IX hiány. katalógusa funkcionális kategória katalógusa
Az összes gének
serkentett gének
játszó gének
fejlődési folyamatok * katalógusa 20 katalógusa 13
7 katalógusa keratinization és keratinocitadifferenciálódás
8 katalógusa 8 katalógusa 0 katalógusa strukturális molekula aktivitását
13 katalógusa 13 katalógusa 0 katalógusa embrióbeültetésben, nő a terhesség, és a menstruációs ciklus katalógusa 3 katalógusa 3
0 katalógusa Ritmikus folyamat katalógusa 4 katalógusa 3 katalógusa 1 katalógusa Multi-szervezet folyamat katalógusa 5 katalógusa 5 katalógusa 0 katalógusa sejtdifferenciálódását
16
12 katalógusa 4 katalógusa szerin típusú endopeptidáz aktivitású szerin Hidrolázaktivitáson és szerin-típusú peptidáz aktivitás katalógusa 9 katalógusa 3 katalógusa 6 katalógusa proteolízis katalógusa 15 katalógusa 6
9 katalógusa peptidáz aktivitás
14 katalógusa 5 katalógusa 9 katalógusa endopeptidáz aktivitása
10 katalógusa 4 katalógusa 6 katalógusa tripszin és kimotripszin aktivitását katalógusa 4
1 katalógusa 3 katalógusa Hidrolázaktivitáson
22 katalógusa 8 katalógusa 14 katalógusa strukturális összetevője citoszkeleton katalógusa 5 katalógusa 5 katalógusa 0 katalógusa Sejtkommunikáció katalógusa 4 katalógusa 4 katalógusa 0 katalógusa Metallocarboxypeptidase aktivitás, karboxipeptidáz aktivitása, és metalloexopeptidase tevékenység katalógusa 3 katalógusa 0 katalógusa 3 katalógusa szerin típusú endopeptidáz inhibitor aktivitás, endopeptidáz inhibitor aktivitás és a proteáz inhibitor aktivitás
4 katalógusa 2 | 2 | Taxik és kemotaxis
4 katalógusa 3 katalógusa 1 katalógusa válasz a külső inger katalógusa 7 katalógusa 4 katalógusa 3
immunrendszer folyamat katalógusa 10 katalógusa 5 katalógusa 5 katalógusa védelem reakcióját katalógusa 7 katalógusa 5 katalógusa 2 | Pozitív szabályozása sejtek differenciálódása katalógusa 3 katalógusa 2 | 1 katalógusa PPAR szignalizációs katalógusa 3 katalógusa 0 katalógusa 3 katalógusa leukocita migrációt katalógusa 3 katalógusa 2 | 1 katalógusa * a képviselő kategóriában a következő átfedő kategóriák: epidermisz morphogenesis, szövet alakfejlődést, epidermisz fejlesztés, ektoderma fejlesztés, szöveti fejlődés, szervek fejlődését, anatómiai szerkezet fejlesztése, anatómiai szerkezete alakfejlődést, celluláris fejlődési folyamat, többsejtű organizmus fejlődését, és az epidermális sejtek differenciálódását. katalógusa megerősítése microarray eredmények QRT-PCR
Változások az expressziós szintek kiválasztott gének is megerősítették, és microarray eredményeket validált QRT-PCR-azonos RNS minták, mint amelyeket a microarray. Tizennégy gének jelentős szeres változást értékeket választottunk ki validálás eredményei alapján a funkcionális magyarázat. A kiválasztott gének képviselői a különböző funkcionális kategóriákba. Tizenhárom (92,9%) 14-ből gén mutatott egybehangzó eredményei között microarray és QRT-PCR (1. és 2. táblázat, 1. ábra). Az egyetlen eltérő eredmény Pkp4 katalógusa, melyet serkentett szerint microarray, és nem változott szerint QRT-PCR (1,09-szeres). 1. ábra ellenőrzése microarray adatok Car9 - /- egerek QRT-PCR-rel. A kifejezés a különböző transzkriptumok 6 Car9
- /- egerek, összehasonlítva a 6 vad típusú kontrollok. A normalizált értékeket három párhuzamos kísérletek láthatók. A, QRT-PCR analízise 6 gének expresszióját indukálta. B, QRT-PCR értékelése 8 gének elfojtott kifejezést. Statisztikailag szignifikáns különbséget a vad típusú egerekhez határoztuk meg. * P < 0,05; ** P < 0.01.
Megbeszélés katalógusa Egy korábbi tanulmány kimutatta a hyperplasticus fenotípus gyomor nyálkahártya test Car9 katalógusa - /- egerekben [16]. CA IX hiány vezetett túltermelés gyomor- pit sejtek csökkentését vezető sejteket. Meglepő módon, a gyomor pH-CA IX-hiányos egerekben változatlan maradt. Ezen megfigyelések alapján arra lehet következtetni, hogy a legfontosabb szerepe a CA IX a gyomor nyálkahártya nem kapcsolódik a pH-szabályozás, de ez szükséges a normális gyomor- morfogenezis és a homeosztázis belül a gyomor nyálkahártyáját. Ebben a cikkben beszámolunk változások mRNS expresszió, amelyek hozzájárulhatnak a fenotípusos változásokat jelentett a gyomorban Car9 katalógusa hiányban egerekben. Azonban azt kell figyelembe venni, hogy néhány ezek a változások csak különbségeket tükrözik a relatív aránya a különböző sejttípusok a gyomor nyálkahártyáját.
Ahogy az várható volt, a Car9 katalógusa - /- fenotípus megváltozott a kifejezés résztvevő gének fejlődési folyamatok és a sejtek differenciálódását. Kimerülése vezető sejtek Car9 katalógusa - /- gyomornyálkahártya magyarázata lehet jelentős downregulációját alapvető helix-loop-helix család tagja, a15 /Mist1 katalógusa (Bhlha15 katalógusa) gén, amely egy B osztályú alap helix-loop-helix (bHLH) transzkripciós faktor, amely mutat acinussejtek-specifikus kifejezés [19]. Mist1 génexpresszió figyelhető meg a legkülönbözőbb szövetek savós típusú szekréciós beleértve a hasnyálmirigy, a nyálmirigyek, vezető sejtek a gyomor, a Paneth-sejtek, a vékonybél, az ondóhólyag, a és könnymirigyek [20]. Törlését Mist1 katalógusa blokkok normál nyálkahártya nyaki sejt redifferentiation be zimogén legfőbb sejtek, mint az összes bazális zimogén-kiválasztó sejtek Mist1 katalógusa - /- egerek mutatnak több szerkezeti hibák [21].
Másik érdekes jelölt tekintettel a sejtvonal zavar gyomornyálkahártya CA IX-deficiens egerek epidermális növekedési faktor
(EGF
), amelynek a kifejezés, amely jelentősen csökkent, ha összehasonlítjuk a vad típusú egerekben. Között a növekedési faktorok, az EGF család tartalmazza a fontos hatóanyagok gyomor nyálkahártyáját. EGF egy egyláncú polipeptid, 53 aminosavat, amely megtalálható főleg a submandibularis mirigyek és Brunner-mirigyek a gyomor-bél traktus [22]. EGF kötődik és aktiválja az epidermális növekedési faktor receptor eredményező sejtproliferáció, differenciálódás és túlélés [23]. Érdekes módon, számos kutató számolt be, hogy az EGF-receptorok dúsított rágcsáló vezető sejtekben [24, 25], ami arra utal, hogy fontos az EGF funkció ezekben a sejtekben. Ezért változások a kifejezés a EGF receptor ligandumok vagy, ebben az esetben, az EGF hozzájárulhat az differenciálódását és funkcióját vezető sejtek.
Egyik erősen túlszabályozott gének E tanulmány törlésre került rosszindulatú agydaganatok 1
(Dmbt1
), amely tartozik a scavenger receptor cisztein-gazdag (SRCR) szupercsalád fehérjék. Ez egy szupercsalád a szekretált és membránhoz kötött fehérjék SRCR domének, amelyek erősen konzervált le szivacsok [26, 27]. A kifejezés a DMBT1 a legmagasabb hámban és általában megfigyelhető az apikális sejt felszínén vagy luminális exokrin váladékok. Egerekben DMBT1 leginkább erősen kifejeződik a gyomor-bél rendszer [28]. DMBT1 javasolt, hogy egy tumorszuppresszor [26, 29, 30] és /vagy egy szabályozó epiteliális differenciálódását [31], valamint azt is, szerepet veleszületett immunológiai védekezés és gyulladás [32, 33]. DMBT1 található, a kripta sejtek a humán, egér, nyúl vékonybél [31, 34, 35], valamint a nyaki régió a normál humán gyomornyálkahártya [36], amely túlnyomórészt őssejtek /progenitor sejtek. Így ez a gén potenciálisan részt vesz a fiziológiai megújító folyamat gastrointestinalis epitélium. A szerepe DMBT1 a veleszületett immunrendszer védekező igazolták a különböző vizsgálatokban. Az emberi DMBT1 glikoprotein, kifejezve a nyálmirigyek, a légutakat, és a genitáliák, megköti a különböző bakteriális kórokozók vírusok [37-40]. Továbbá, expressziója egér DMBT1 a gasztrointesztinális traktusban szabályozza a baktériumok [41, 42], és expresszióját növelte a fertőzés során [43]. Azt is kimutatták, hogy összefüggés van egy Dmbt1 katalógusa variáns allél Crohn-betegség, és van egy korreláció expressziós szintje Dmbt1 katalógusa gyulladásos bélbetegség súlyossága [44].
Továbbá DMBT1 kötődik felületaktív fehérjéket SP-D és az SP-A. Ezek kollagén- tartalmazó, (C-típus) kalcium-függő lektinek nevezett collectins, amelyek kölcsönhatásba lépnek glikokonjugátumok és a lipideket a felületen a mikroorganizmusok többnyire keresztül a szénhidrát felismerés domének (CRD) [45]. SP-D és az SP-A részt vesz számos immun funkciókat, beleértve a vírusos semlegesítés, aggregáció és megölése baktériumok és gombák, és az apoptotikus és nekrotikus sejtek. Az immunológiailag naiv tüdő, azok downregulate gyulladásos reakciókat, de amikor megtámadta az LPS vagy apoptotikus sejtek az általuk okozott fagocitózis a makrofágok, a pro-gyulladásos citokin termelést, és javítása adaptív immunválasz [46]. Érdekes, hogy a jelen vizsgálatban, továbbá a Dmbt1 katalógusa, a kifejezés a felületaktív asszociált protein D
(Sftpd vagy SP-D
) volt nagyon indukálódik Car9
- /- egerekben. Így a upreguláció mindkét Dmbt1
és Sftpd
azt sugallják, hogy a CA IX hiány által indukált immunreakciót folyamat a gyomor nyálkahártyáját. Azt is meg kell jegyezni, hogy a CA IX javasolták, hogy kötődik a dendritikus sejteket egy receptor által közvetített módon, és scavenger receptorokhoz úgy tűnik, hogy fontos szerepet játszanak ebben a folyamatban [47]. Ezen túlmenően, a CA IX tűnik, hogy aktiválja egy immunválaszt egy olyan mechanizmus jellemző hősokkfehérjék. Így, CA IX lehetne közvetlenül kölcsönhatásba DMBT1 keresztül scavenger receptor.
Tény, hogy a zavar a Car9 katalógusa gén okozta disregulation számos gén, amelyek részt vesznek az immunrendszer folyamatokat. Ez alátámasztja az eredményeket egy korábbi vizsgálatban, ahol a gyomor nyálkahártya alatti gyulladás volt kimutatható a szervezetben régióban többségében C57BL /6 Car9
- /- egerekben [17]. A jelen tanulmányban Il1rl1 /ST2 katalógusa transzkripciós variáns 2 mRNS-t erősen indukálta miatt CA IX hiány. A Il1rl1 /ST2
gén tagja a interleukin-1 (IL-1) receptor család, és létrehoz egy oldható szekretált formája (sST2), és egy transzmembrán forma (ST2L) által kódolt transzkripciós variánsa 2 és 1, ill. A membrán-kötött formában van kifejezve elsősorban a vérképző sejtek és az oldható forma túlnyomórészt által kifejezett fibroblasztokban [48]. Különösen ST2L van preferenciálisan expresszálódnak a rágcsáló és humán Th2 sejtek, és lehet használni, mint egy specifikus markere a Th2 sejtek in vitro
kísérletekben [49-52]. Ezért, a funkció a ST2L javasolták, hogy korrelálnak a Th2-sejtek által közvetített immunológiai válaszok és az IL-33, egy újonnan felfedezett tagja az IL-1 citokin család, nem számoltak be, mint egy specifikus liganduma ST2L [53]. Érdekes módon, számos tanulmány kimutatta, hogy az oldható ST2 a szérumban megemelkedik asztmás betegség [54, 55]. Ezért azt javasolták, hogy az oldható ST2 is kritikus szerepet játszanak a Th2-sejtek által közvetített betegségek. Tény, hogy kimutatták, hogy az oldható ST2 működik, mint egy antagonisztikus csali receptor az IL-33 egy rágcsáló nevű timusz daganat sejtvonal az EL-4, amely stabilan kifejezi ST2L, és egy rágcsáló modell asztma [56]. Ez azt sugallja, hogy az oldható ST2 negatívan modulálja a termelés a Th2 citokinek révén az IL-33 jelátviteli allergiás légúti gyulladás. Érdekes megjegyezni, hogy a jelen tanulmány, az mRNS-szint az IL-33 szintén emelkedett ~ 2-szeres, bár ez a változás nem volt statisztikailag szignifikáns. Vagyis úgy tűnik, valószínű, hogy a CA IX valamilyen módon részt vesz a szabályozás a Th2 választ.
CA IX is hozzájárulnak az immunrendszer CA IX hiány jelentősen csökkent expressziót a virágzás szindróma homológ (emberi) hotelben gén (BLM
), amely kódol egy ATP-függő DNS-helikáz, hogy tartozik egy evolúciósan konzervált családjába RecQ helikázok [57]. Mutációja BLM katalógusa okoz ritka humán autoszomális recesszív rendellenesség, az úgynevezett Bloom-szindróma (bs), amelyet az jellemez, jelentős genetikai instabilitást. BS társul növekedési retardáció, mély érzékenység legtöbb ráktípus, és immunhiányos [58], az utóbbi két tulajdonság számviteli korai halál [59]. A funkciók BLM már csak részben jellemzi. Azonban kimutatták, hogy a BLM szerepe van a proliferációját és túlélését mind a fejlődő és érett T-limfociták, és törlését vezet hibás T-sejt-immunitás [60]. Ezen túlmenően, a feltételes knockout BLM katalógusa hozzájárult kompromittált B-sejt-fejlődés és a karbantartás, erősen károsodott T-sejt-függő és -független ellenanyag-válaszok az immunizálás után, és hajlamosak a fejlődő B-sejtes limfómák [61]. Ezért elképzelhető, hogy Car9 katalógusa - /- egerek kompromittálta szerzett immunitás válaszokat.
Váratlan eredmény az volt, hogy több kis prolingazdag fehérjék katalógusa (Sprr katalógusa) arra nevezetesen serkentett beleértve Sprr1a katalógusa, Sprr2d katalógusa, Sprr2e katalógusa, Sprr2i katalógusa, és Sprr3 katalógusa. Azonban csak az indukciós Sprr1a katalógusa volt statisztikailag szignifikáns. SPRR fehérjéket eredetileg azonosították markerek terminál a pikkelyes sejt differenciálódás, ha azok prekurzorai a elszarusodott burok [62]. Továbbá, SPRR fehérjék expresszálódnak különböző nonsquamous szövetek, valamint ezek biológiai funkciója nem korlátozódik a szerkezeti fehérjék a elszarusodott burok [63]. Bebizonyosodott, hogy a SPRR fehérjék részt vesznek a választ, hogy a különböző feszültségek számos szövetben anélkül, hogy rétegzett hám. Az epeutak, SPRR2 tagjai úgy tűnik, hogy hozzájáruljon módosítását epeúti akadály körülmények stressz [64]. Hasonlóképpen SPRR1A már azonosították új stressz-indukált downstream közvetítő gp130 citokinek szívizomsejtek a szívvédő hatása az ischaemiás stressz [65]. Ezenkívül egereken, SPRR2A fehérjét leírták, hogy nagymértékben indukált gyomornyálkahártya által fertőzött Helicobacter heilmannii katalógusa [66]. Ezen túlmenően, azt javasolták, hogy SPRR1A egy regenerációs-asszociált protein, mert indukció a neuronális sérülés korrelál a regenerációs képessége, gyakorlatilag minden sérült dorzális gyökér ganglion neuronok expresszáló SPRR1A után egy héttel ülőideg-sérülés [67]. Ezért SPRR gének feltehetően indukált válaszként különböző stressz körülmények, és hozzájárul a sejt védelem, a szöveti remodelling, és /vagy a szövetek regenerálódását. A fenti megállapítások fényében úgy tűnik valószínűnek, hogy a CA IX hiány teremt stressz állapot a gyomor nyálkahártyájának, ami túlszabályzását valamilyen védő tényezők.
Elemzésünk azonosított mRNS négy tagja oldott hordozó család proteinek misregulated a a Car9 katalógusa - /- egerekben a gyomor nyálkahártyáját. Ezek oldott anyag hordozó proteinek részt vesznek a membrán transzportban különböző molekulák. A kifejezés a Slc9a3 katalógusa erősen indukálódik, mivel a kifejezés Slc27a2 katalógusa, Slc38a5 katalógusa, és Slc5a8 katalógusa volt elfojtott. Az alapvető funkciója SLC9A3 vagy NHE3 a csere az extracelluláris Na + intracelluláris H +, ezáltal akár megemeli az intracelluláris pH vagy, ha párosul a cselekvés más szállítók, növelik a sejtek térfogatának [ ,,,0],68]. A gyomor-bél traktusban, SLC9A3 expresszálódik az apikális membrán és újrahasznosítása endoszómák az ileum, jejunum, vastagbél és a gyomor [69]. További vizsgálatok szükségesek annak tisztázására lehetséges összjátéka CA IX és SLC9A3 a gyomor nyálkahártyáját.
Meglepő módon az egyik játszó gének találtunk néhány résztvevő gének emésztést. Ezek közé tartozott tripszin 1
, amiláz 2a5 katalógusa, kimotripszin-szerű elasztáz családtag 2A katalógusa, és a hasnyálmirigy lipáz
statisztikailag szignifikáns a p-értékek és mások, mint például a kimotripszinogén B1 katalógusa, karboxipeptidáz A1 katalógusa, és a karboxi-B1 katalógusa a szignifikáns p-értékeket. A következménye ennek megállapítása továbbra is tisztázatlan. Egy lehetséges magyarázat az lehet, hogy downregulation ilyen enzim a másodlagos esemény. Ha azt feltételezzük, hogy ezek az enzimek által termelt fő sejtek, a csökkentett számú vezető sejtek a Car9
- /- egerek gyomornyálkahártya is okozhatja mennyiségének csökkenése az enzimek termelnek. Azonban a pontos mechanizmus mögött ez a jelenség még nem tisztázott.
Következtetések
Összefoglalva, CA IX hiány mutatkozott, hogy megváltoztassa a különböző gének expresszióját a gyomor nyálkahártyáját. A számos érintett gének és a nagysága a változások viszonylag magas volt, jelezve, hogy a CA IX van egy figyelemre méltó szerepet gyomor funkciókat. Microarray analízis kimutatta, több részt vevő gének fejlődési folyamatok és a sejtek differenciálódását, ami megmagyarázhatja a sejtvonal zavar gyomornyálkahártya a Car9
- /- egerekben. Érdekes, hogy néhány, a szabályozott azonosított gének ebben a vizsgálatban részt emésztés, valamint a funkciók az immunrendszer és a védelmi válaszokat. Ez arra utal, hogy a CA IX hiány veszélyezteti az immunrendszert a gyomornyálkahártya ami újabb szerepe multifunkcionális enzim. Katalógusa módszerek katalógusa Állatmodellrendszerek és szövet előkészítése katalógusa Generációs célzott zavar a Car9 katalógusa gén korábban már leírt Ortova Gut et al. [16]. (tissue)
NM_029706
GGTTTCCACGCAAGAGAG
GTTGACCACAGGCAGAACA
Cym
chymosin
NM_001111143
ATGAGCAGGAATGAGCAG
TGACAAGCCACCACTTCACC
Dmbt1
deleted

• Schwannoma a gyomor: a esetismertetés
• Lokalizált gyomor amyloidosis differenciált szövettanilag scirrhous gyomorrák segítségével endoszkópos nyálkahártya reszekció: a esetismertetés