Microbiome Sich-baséiert Method kann d'Effizienz bei der Detektioun an der Diagnostik vun der Krankheet verbesseren

Big Data mécht grouss Verspriechen wann et drëm geet Abléck iwwer mënschlecht Verhalen a Gesondheet ze bidden. De Problem ass wéi d'Informatioun benotzt gëtt déi se op eng effizient Manéier ubitt. En internationalt Team vu Fuerscher huet eng Mikrobiom Sich-baséiert Method proposéiert, iwwer Microbiome Sichmotor (MSE), fir de Räichtum vun de verfügbaren Gesondheetsdaten ze analyséieren fir mënschlech Krankheeten z'entdecken an ze diagnostizéieren.

Si hunn hir Method de 17. Mäerz verëffentlecht, 2020 an m Systemer , e peer-reviewed Open Access Journal vun der American Society for Microbiology.

Mikrobiom-baséiert Krankheet Klassifikatioun hänkt vu gutt validéiert of, Krankheet-spezifesch Modeller oder Markéierer. Wéi och ëmmer, aktuell Modeller feelen dës Informatioun fir vill Krankheeten. "

Dr SU Xiaoquan, vum Single-Cell Center um Qingdao Institut fir Bioenergie a Bioprozess Technologie (QIBEBT) vun der Chinese Academy of Sciences (CAS)

Zousätzlech, SU gesot, verschidde Krankheeten kënnen déiselwecht Biomarker deelen - d'Mikroorganismen déi eppes aussergewéinleches uginn, sou wéi e mutéiert Protein a Kriibszellen fonnt, et mécht et méi schwéier fir d'Fuerscher jidderee korrekt ze klassifizéieren.

Fir dës Themen fir Krankheet Detektioun a Klassifikatioun ze bekämpfen, SU a seng gemeinsam Software Team vum Single-Cell Center, QIBEBT an den Center for Microbiome Innovation (CMI), Universitéit vu Kalifornien zu San Diego (UCSD), eng nei Sich Approche entwéckelt baséiert op der ganzer mikrobieller Gemeinschaft e mënschleche Kierper enthält, kollektiv de Mikrobiom genannt. All Persoun huet e Mikrobiom, och wa se keng Krankheet hunn.

Traditionell Modeller vergläichen Proben vu gesonde Sujete mat deene vu Leit bekannt fir spezifesch Krankheeten ze hunn. Mat der neier Method, andeems Dir op der spezifescher Ausléiser baséiert, anstatt bekannte Biomarker déi fir verschidde Krankheeten codéiere kënnen, d'Fuerscher kënnen de Mikrobiomzoustand identifizéieren, deen mat der Krankheet assoziéiert ass iwwer verschidde Kohorten oder Sequencingplattformen.

An dëser neier Approche, d'Fuerschungsteam beschäftegt en zwee-Schrëtt Prozess fir d'Krankheet z'identifizéieren. Éischten, si sichen eng Baseline Datebank vu gesonde Individuen fir eng spezifesch Mikrobiom Ausleefer Neiheet z'entdecken - oder eng bekannte Anomalie déi de Mikrobiom vun engem gesonde Staat differenzéiert. Si sichen dann no deem Ausléiser an enger Datebank vu Krankheetsspezifesche Beispiller.

"Eis Präzisioun vun eiser Strategie, Empfindlechkeet a Geschwindegkeet besser wéi modellbaséiert Approche, "Sot de SU.

D'Resultater vun der Sich kënne séier Prognosen ubidden fir Kliniker ze hëllefen Krankheeten ze diagnostizéieren an ze behandelen.

"Dës Sich-baséiert Strategie weist Verspriechen als e wichtegen éischte Schrëtt an der Mikrobiom grouss Daten-baséiert Diagnos, "laut dem Rob Knight, Direkter vum CMI an UCSD. "Am Liicht vun der allgemenger Verréckelung vum Mikrobiom-Sequencing Fokus vu gesonde bis kranke Hosten, d'Resultater hei plädéiere fir méi Baseline Proben aus verschiddene geografesche Plazen ze addéieren. "

XU Jian, Direkter vum Single-Cell Center, QIBEBT, averstanen. Als nächst, de gemeinsame Sino-USA Team schafft fir hir Kollegen ze encouragéieren eng koordinéiert Ustrengung unzeschléissen fir weider d'Mikrobiome Datebank auszebauen, fir all Populatioun an all Ökosystem um Globus opzehuelen.

"Mam Microbiome Sichmotor, Eng Sich maachen kann als Standard ginn an et erméiglecht fir nei Mikrobiomstudien wéi e BLAST géint Är nei DNA Sequenz ze maachen ass haut. "XU sot.

Dës Aarbecht gouf vun der National Natural Science Foundation of China ënnerstëtzt, der chinesescher Akademie vun de Wëssenschaften, National Instituter fir Gesondheet, der National Science Foundation, d'Alfred P. Sloan Foundation an den National Health and Medical Research Council.

De Qingdao Institut fir Bioenergie a Bioprozess Technologie (QIBEBT), Chinesesch Akademie vun de Wëssenschaften (CAS) gouf 2006 gegrënnt. Den Haaptquartier vum Institut ass zu Qingdao, Shandong Provënz, China. Den Institut besteet aus engem Team vun iwwer 500 Mataarbechter, 207 Studenten, an 64 Post-Docs.

QIBEBT ass eng vun de primäre nationale Fuerschungsinstituter vu China fir erneierbar Energie a gréng Materialien, fokusséiert haaptsächlech op Fuerschung an Entwécklung vun de Ressourcen, Technologien, Produkter a Prozesser fir biobaséiert Energie a Materialien.

QIBEBT ass gewidmet fir systematesch an nohalteg Léisunge fir d'Bioenergiebedierfnesser vu China ze liwweren andeems d'Wëssenschaft integréiert gëtt, Technologie, an Ingenieur am Beräich vun der industrieller Biologie, gréng chemesch Technologie, a Prozess Engineering.

• Allgemengt gebrauchte Mondwäsch erhéicht Laktat-produzéierend Bakterien, déi de Spaut pH senken
• Verdauungssymptomer sinn üblech bei COVID-19 Patienten,