A mikrobióma keresésen alapuló módszer javíthatja a betegségek felismerésének és diagnosztizálásának hatékonyságát

A mikrobioma-alapú betegségek besorolása a jól validált, betegségspecifikus modellek vagy markerek. Azonban, a jelenlegi modellekből hiányzik ez az információ sok betegségről. "

Dr. SU Xiaoquan, a Kínai Tudományos Akadémia (CAS) Qingdao Bioenergetikai és Bioprocessziós Intézetének (QIBEBT) Egysejtes Központjából.

Továbbá, SU azt mondta:több betegség ugyanazokat a biomarkereket ismerheti meg - a mikroorganizmusokat, amelyek valami szokatlant jeleznek, mint például a rákos sejtekben található mutált fehérje, megnehezítve a kutatók mindegyik helyes osztályozását.

E betegségek leküzdése érdekében a betegségek felismerése és osztályozása érdekében SU és közös szoftvercsapata az Single-Cell Center-ből, A QIBEBT és a Mikrobiome Innovációs Központ (CMI), Kaliforniai Egyetem, San Diego (UCSD), kifejlesztett egy új keresési megközelítést, amely az emberi test teljes mikrobiális közösségén alapul, együttesen mikrobiómának nevezik. Minden embernek van mikrobiomája, még akkor is, ha nincs betegségük.

A hagyományos modellek egészséges alanyok mintáit hasonlítják össze olyan személyek mintáival, akikről ismert, hogy bizonyos betegségeik vannak. Az új módszerrel, az adott kiugró érték alapján történő kereséssel, nem olyan ismert biomarkerek, amelyek számos betegséget kódolhatnak, a kutatók azonosítani tudják a betegséghez kapcsolódó mikrobiom állapotot különböző kohorszokon vagy szekvenáló platformokon.

Ebben az új megközelítésben a kutatócsoport kétlépcsős folyamatot alkalmaz a betegségek azonosítására. Első, az egészséges egyének alapadatbázisában keresnek, hogy kimutassák a mikrobióma kiugró újdonságát - vagy bármely ismert anomáliát, amely megkülönbözteti a mikrobiomot az egészséges állapottól. Ezt követően keresik ezt a kiugró értéket egy betegség-specifikus példák adatbázisában.

"A stratégiánk pontossága, érzékenység és sebesség felülmúlja a modell alapú megközelítéseket, - mondta SU.

A keresés eredményei gyors előrejelzéseket adhatnak, amelyek segítenek az orvosoknak a betegségek diagnosztizálásában és kezelésében.

"Ez a keresésen alapuló stratégia ígéretet mutat, mint fontos első lépést a mikrobiom nagy adat alapú diagnózisban, "Rob Knight szerint A CMI és az UCSD igazgatója. "Tekintettel arra, hogy a mikrobiom-szekvenálási fókusz az egészségesről a beteg gazdaszervezetre összpontosult, az itt kapott eredmények azt javasolják, hogy több alapminta kerüljön hozzáadásra a különböző földrajzi helyekről. "

XU Jian, Az Egysejtű Központ igazgatója, QIBEBT, egyetért. Következő, a közös kínai-amerikai csapat azon dolgozik, hogy kollégáit arra ösztönözze, hogy csatlakozzanak összehangolt erőfeszítésekhez a mikrobioma adatbázis további bővítése érdekében, hogy a világ minden népességét és minden ökoszisztémáját magába foglalja.

"A Microbiome keresőmotorral, A keresés ugyanolyan szabványossá válhat, és lehetővé teheti az új mikrobiológiai vizsgálatokat, mint a BLAST elvégzése az új DNS -szekvencia ellen ma. " - mondta XU.

Ezt a munkát a Kínai Nemzeti Természettudományi Alapítvány támogatta, a Kínai Tudományos Akadémia, a Nemzeti Egészségügyi Intézetek, a Nemzeti Tudományos Alapítvány, az Alfred P. Sloan Alapítvány és az Országos Egészségügyi és Orvosi Kutatási Tanács.

A Qingdao Bioenergetikai és Bioprocessziós Technológiai Intézet (QIBEBT), A Kínai Tudományos Akadémiát (CAS) 2006 -ban alapították. Az intézet fő székhelye Qingdaóban található, Shandong tartomány, Kína. Az intézet több mint 500 főből álló csapatból áll, 207 végzős hallgató, és 64 post-docs.

A QIBEBT Kína egyik elsődleges nemzeti kutatóintézete a megújuló energiák és a zöld anyagok területén, elsősorban az erőforrások kutatására és fejlesztésére összpontosítva, technológiák, termékek és eljárások bioalapú energiához és anyagokhoz.

A QIBEBT célja, hogy szisztematikus és fenntartható megoldásokat nyújtson Kína bioenergia -szükségleteire a tudomány integrálásával, technológia, és mérnöki tevékenység az ipari biológia területén, zöld vegyipari technológia, és folyamatmérnöki.

• A gyakran használt szájvíz növeli a laktáttermelő baktériumokat, amelyek csökkentik a nyál pH-ját
• Az emésztési tünetek gyakoriak a COVID-19 betegeknél,