Nalazi su objavljeni u Znanost .
Tehnika modeliranja koju su izumili Andrey Morgun s Farmaceutskog fakulteta OSU -a i Natalia Shulzenko s Carlson College of Veterinary Medicine države Oregon poznata je kao analiza transkingdom mreže.
Ljudski crijevni mikrobiom je zajednica od više od 10 bilijuna mikrobnih stanica iz oko 1, 000 različitih vrsta bakterija, i analiza mreže transkingdom integrira više vrsta "omics" podataka - metagenomskih, metabolom, lipidomski, proteomska, itd. - u određivanju kako interakcije između određenih vrsta crijevnih mikroba pomažu ili ometaju biološke funkcije u domaćinu.
U ovom slučaju, mikrobne interakcije uključivale su koliko dobro tijelo reagira na vrstu liječenja raka poznatu kao antiprogramirana proteinska terapija stanične smrti, skraćeno na terapiju anti-PD-1. Omogućuje imunološkim stanicama da snažnije reagiraju na rak.
Bilo je prilično dramatično. Utvrdili smo da promjena crijevnog mikrobioma može uzeti pacijenta s uznapredovalim melanomom koji nikada nije reagirao na imunoterapiju, koja ne uspijeva oko 60% vremena s ovom vrstom raka, i pretvoriti pacijenta u onoga koji na to reagira. "
Andrey Morgun, Izvanredni profesor farmaceutskih znanosti, Farmaceutski fakultet OSU
Morgun i bivši postdoktorski istraživač OSU -a Richard Rodrigues, sada u Nacionalnom institutu za rak, bili su dio suradnje koju su vodili imunolozi Giorgio Trinchieri i Amiran Dzutsev iz NCI-a te medicinski onkolozi Hassane Zarour i Diwakar Davar sa Sveučilišta u Pittsburghu koji su testirali sposobnost transplantacije fekalne mikrobiote da pomogne pacijentima od melanoma u imunoterapiji protiv PD-1.
Znanstvenici su prikupili uzorke izmeta od pacijenata koji su posebno dobro reagirali na terapiju te su u kliničkom ispitivanju dali uzorke, kolonoskopijom, naprednim pacijentima s melanomom koji nikada prije nisu reagirali na imunoterapiju.
Pacijenti su tada primali lijek anti-PD-1 pembrolizumab, i ovaj put je imao željeni učinak, pretvaranje osoba koje ne odgovaraju u odgovore. Analizom mreže Transkingdom potvrđena je uloga mikrobioma.
"Spajajući sve zajedno, pokazali smo da transplantacija fekalne mikrobiote i lijek protiv PD-1 mogu promijeniti crijevni mikrobiom i učinkovito reprogramirati mikrookruženje tumora tako da se prevlada otpornost na PD-1, "Rekao je Morgun.
Od 15 pacijenata s uznapredovalim melanomom - agresivnim oblikom raka kože - koji su primili kombinirano liječenje, njih šest pokazalo je ili smanjenje tumora ili stabilizaciju bolesti koja je trajala više od godinu dana.
"Obećavajući nalazi očito zahtijevaju više istraživanja u većim kliničkim ispitivanjima, "Morgun je rekao." Na taj način možemo bolje identificirati mikroorganizme, biomarkeri krvotoka i intratumora za odabir pacijenata s melanomom koji će najvjerojatnije imati koristi od terapije temeljene na mikrobiomima. Zaista očekujemo da ćemo na kraju identificirati skupinu bakterija s visokim postotkom uspjeha za pretvaranje osoba koje ne reagiraju na imunoterapiju u osobe koje reagiraju. "