PLOS ONE: Föreningen bland polymorfismer i EGFR Gene exoner livsstil och risk för magcancer med könsskillnader i kinesiska Han ämnen

Abstrakt

Bakgrund

epidermal tillväxtfaktorreceptor (EGFR) genen spelar en nyckelroll i tumöröverlevnad, invasion, angiogenes och metastasering. Nyligen genomförda studier har visat att magcancer (GC) var associerad med polymorfismer av EGFR-genen och miljöpåverkan, såsom livsstilsfaktorer. I denna studie var sju kända SNP i EGFR exoner undersöktes i en högrisk kinesiska befolkningen i Jiangsu-provinsen för att testa om genetiska varianter av EGFR exoner och livsstil förknippas med en ökad risk för GC.

Metodik /Ansvarig fynd

Ett fall-kontrollstudie sjukhusbaserad utfördes i Jiangsu-provinsen. Resultaten visade att rökning, alkohol och preferens för salt mat var signifikant associerade med risk för GC. Skillnaderna i livsstil mellan män och kvinnor kan vara så orsaken till högre incidens hos män än de hos kvinnor. Sju exon SNP genotypades rs2227983, rs2072454, rs17337023, rs1050171, rs1140475, rs2293347 och rs28384375. Det konstaterades att variant rs2072454 T-allelen och TT-genotyp var signifikant associerade med en ökad risk för GC. Intressant vårt resultat föreslog ACAGCA haplotypen kan vara förknippade med minskad risk för GC. Dock ingen signifikant association undersöks mellan de övriga sex SNP och risken för GC både i den totala befolkningen och åldersmatchning befolkningen även med könsskillnader.

Slutsatser

Rökning, dricka och preferens för salt mat var signifikant associerade med risk för GC i Jiangsu-provinsen med könsskillnader. Även om endast en SNP (rs2072454) var signifikant associerade med en ökad risk för GC, kombinerat de sex EGFR exon SNP tillsammans kan vara användbar för att förutsäga risken för GC

Citation:. Zhang J, Zhan Z, Wu J Zhang C, Yang Y, Tong S, et al. (2013) Föreningen bland polymorfismer i EGFR Gene exoner livsstil och risk för magcancer med könsskillnader i kinesiska Han ämnen. PLoS ONE 8 (3): e59254. doi: 10.1371 /journal.pone.0059254

Redaktör: Eithne Costello, Liverpool Cancer Research UK Centre, Storbritannien

Mottagna: 19 september 2012, Accepteras: 13 februari 2013, Publicerad: 29 mars 2013

Copyright: © 2013 Zhang et al. Detta är en öppen tillgång artikel distribueras enligt villkoren i Creative Commons Attribution License, som tillåter obegränsad användning, distribution och reproduktion i alla medier, förutsatt den ursprungliga författaren och källan kredit

Finansiering:. Denna studie stöddes av Priority Academic Program utveckling av Jiangsu högskolorna (PapD), Jiangsu Natural Science Foundation (BK2008461), National Natural Science Foundation i Kina (30.973.715 och 81.001.502), forskningsfonden Doktorsprogrammet för högre utbildning i Kina (20103237110011) , unga lärare i Nanjing University i traditionell kinesisk medicin. Finansiärerna hade ingen roll i studiedesign, datainsamling och analys, beslut att publicera, eller beredning av manuskriptet

Konkurrerande intressen:.. Författarna har förklarat att inga konkurrerande intressen finns

Introduktion

Även om både incidensen och mortaliteten i magcancer (GC) har minskat på senare år, GC var den fjärde vanligaste malignitet i världen under 2008, med cirka 989.600 nya fall. Män utveckla allmänhet GC dubbelt så ofta som kvinnor och cirka 72% av alla nya fall inträffar i utvecklingsländerna. I allmänhet, den högsta incidensen är i Asien, särskilt i östasiatiska länder som Korea, Japan och Kina [1].

I själva verket nästan 40% av alla GC fall inträffar i Kina, och det finns en anmärkningsvärd geografiska variationer i GC priser över hela Kina [2]. Mer än två tredjedelar av de patienter som diagnostiserats med GC i Kina har inoperabel sjukdom och en medianöverlevnad på sex till nio månader. Dessutom patienter med resekerbara tumörer, de lokala och avlägsna återfallsfrekvens är hög, och 5-års överlevnad är mindre än 30% [3]. Sun et al.
[4] bedömde effekterna av GC på den kinesiska befolkningen genom epidemiologiska analyser av sin dödlighet fördelning 1990-1992, visade resultaten att GC var den vanligaste orsaken till cancerrelaterad dödlighet i Kina .

det är nu allmänt accepterat att patogenesen av GC innebär en multifaktoriell interaktion mellan miljö triggers och genetisk känslighet. Epidemiologiska studier har identifierat ålder, könsskillnader och ett antal miljöfaktorer som kan bidra till utvecklingen av GC, inklusive en salt kost, rökning, alkoholkonsumtion och Helicobacter pylori
infektion [5] - [8] . Andra studier har identifierat värdfaktorer och genetiska förändringar som också spelar en viktig roll i utvecklingen och utvecklingen av GC genom interaktioner gen-miljö [9], [10]

epidermal tillväxtfaktorreceptor (EGFR) genen. ligger i den korta armen av den humana kromosomen 7, och bildar ett glykoprotein med en molekylvikt av 170 kDa som har en hög affinitet för dess ligander, inklusive epidermal tillväxtfaktor (EGF) och transformerande tillväxtfaktor alfa (TGF-α). EGFR deltar i flera viktiga tumorigena mekanismer, såsom tumöröverlevnad, invasion, angiogenes och metastasering. EGFR-uttryck har observerats i talrika humana tumörer, och flera studier visade att överuttryck av EGFR korrelerar med en dålig prognos [11]. I GC, korrelerar EGFR-överuttryck med avancerad tumörstadium och en dåligt kliniskt utfall [12]. Men de roller som EGFR uttryck och genetiska förändringar spelar i gastric cancer är fortfarande oklara. Dessutom har endast ett fåtal single nucleotide polymorphisms (SNP) befunnits associera med GC utveckling och resultat [11], [13].

I denna studie hypotesen vi att miljöexponeringar och könsskillnader fungera som effekt modifierare på en bakgrund av genetisk variation i EGFR-exoner som kan påverka EGFR funktion och därmed forma GC känslighet. För att testa denna hypotes, var en sjukhusbaserad studie genomförd i vilken 387 GC fall och 392 cancerfria kontroller i en högrisk kinesiska befolkningen genotypanalyserades för sju kända SNP i EGFR-exoner, nämligen rs2227983 A > G, rs2072454 C > T, rs17337023 A > T, rs1050171 G > A, rs1140475 C > T, rs2293347 G > A och rs28384375 T >. C

Material och metoder

Rekrytering av målen och kontroll Deltagarna

I början 401GC fall och 420 kontroller identifierades; 3 fall av cancer brist på frågeformulär andra såväl som 11 tumörer än adenokarcinom uteslöts; 18 kontroller uteslöts av omåttlig serum cancerrelaterade biomarkörer och 10 kontroller uteslöts efter geografiskt avvikelse. Sammantaget en sammanlagd befolkning med 387 fall och 392 kontroller fanns tillgängliga för den aktuella studien på grund av potentiella maktanalyser, är det synd att kontrollerna var cirka 10 år yngre än fall, alltså en åldersmatchnings befolkning med 294 fall och 294 kontroller extraherades från den totala befolkningen för insamling av åldersmatchning. Alla försökspersoner var genetiskt orelaterade etniska hankineser. De patienter med primär GC rekryterades från Institutionen för kirurgisk Gastroenterology i Jiangsu Provence sjukhuset i traditionell kinesisk medicin (TCM) mellan januari 2008 och juli 2010 i Nanjing stad, Jiangsu-provinsen. Cancerfria friska kontroller följd rekryterades från Jiangsu Hospital of TCM, och de var sjukhus besökare för en årlig hälsokontroll under samma period. För att ingå i studien, patienterna (a) män eller kvinnor över 20 år gamla men enligt 80 år gammal, (b) måste vara av hankineser etnicitet (självrapporterade), (c) kom från tre regioner i Jiangsu provinsen och var tvungen att vara en lokal bosatt i minst 5 år, (d) måste ha nyligen histopatologiskt diagnosen primär GC, (e) var tvungen att sakna tidigare maligna tumörer i andra organ, och (f) inte hade antitumörterapi före rekrytering , inklusive kemoterapi och strålbehandling. Utbildade intervjuare använde en pre-testad frågeformulär för att samla in epidemiologiska data från deltagarna, det vill säga, demografiska faktorer såsom ålder och kön, och kända riskfaktorer för GC (såsom rökning, alkoholkonsumtion, och en familjehistoria av mag-tarmkanalen cancer) . Individer som rökte en eller flera gånger per dag för över ett år definierades som rökare och de som konsumerade tre eller fler alkoholhaltiga drycker i veckan i över sex månader ansågs vara kroniska alkoholkonsumenter [14], [15]. Efter att ha undertecknat informerade samtycke former, varje försöksdone 3-5 ml perifert blod som skall användas för genom-DNA-extraktion. Forskningen Protokollet godkändes av Institutional Review Board Jiangsu Provence Hospital of TCM.

Genomisk DNA-isolering från perifera blodceller

En kommersiell blod DNA-extraktion kit (AxyPrep-96 kit, Axygen, CA, USA) användes för att extrahera genomiskt DNA från blodprover. De renade DNA: n förvarades vid -20 ° C tills de användes för genotyp testning. Kvaliteten av DNA bestämdes genom agarosgelelektrofores.

Genotypning

Polymeraskedjereaktion-ligering detekteringsreaktion (PCR-LDR) metoder användes för genotypning [16]. Primers syntetiserades av Shanghai Sangon bioteknik Branschen (No.698, Xiangmin Rd, Songjiang District, Shanghai, Kina). Varje uppsättning av ligasdetektionsreaktions prober innefattade ett gemensamt sond och två discriminating prober för de två typerna (tabell S1).

Mål-DNA-sekvenser amplifierades med användning av en multiplex PCR-metod. PCR för varje försöksperson utfördes i en slutvolym av 20

• PLOS ONE: en polymorfism (rs2295080) i mTOR Promoter Region och dess anslutning med Gastric Cancer i en kinesiska befolkningen
• PLOS ONE: Prognostic värde av Cancerstamceller Marker CD133 Expression i Gastric cancer: En systematisk Review