Nový diagnostický nástroj na báze mikrobiómu môže identifikovať fibrózu pečene,

cirhóza Chronické ochorenie pečene predstavuje závažný globálny problém verejného zdravia, ktorý postihuje približne 844 miliónov ľudí. podľa Svetovej zdravotníckej organizácie. Patrí medzi hlavné príčiny úmrtnosti v Austrálii, Spojené kráľovstvo a Spojené štáty.

V rovnakom čase, je to ťažko zvládnuteľné a neexistuje žiadna antifibrotická pečeňová terapia schválená FDA. Mikrobióm-komplexná zbierka mikróbov, ktoré obývajú črevo-môže byť neočakávaným indikátorom zdravia.

Teraz, tím spolupráce vedcov zo Salk Institute a UC San Diego vytvoril nový diagnostický nástroj na báze mikrobiómov, ktorý:s presnosťou najlepších lekárov, rýchlo a lacno identifikuje fibrózu pečene a cirhózu viac ako 90 percent času u ľudských pacientov.

Neinvazívna metóda sa spolieha na algoritmus na analýzu vzoriek stolice pacienta-ktorý obsahuje stopy toho, čo žije v čreve-a mohla by viesť k zlepšeniu starostlivosti o pacienta a výsledkov liečby ochorenia pečene, podrobne online 30. júna, 2020 v Bunkový metabolizmus .

Mikrobióm je dynamický živý senzor malých zmien zdravia a chorôb v tele, a ako taký, poskytuje presné odčítanie zdravia tela. Pretože je táto diagnostika rýchla a lacná, môže to byť niečo, čo sa bežne používa, najmä v mnohých oblastiach, v ktorých chýbajú špecializované kliniky a lekári. Jednoducho povedané, môže to byť skutočný menič hier, s celosvetovými dôsledkami “.

Ronald Evans, Študujte spoluzodpovedajúceho autora a profesora,

Evans je tiež držiteľom kresla March of Dimes.

Nealkoholické stukovatenie pečene (NAFLD) je hlavnou príčinou chronických ochorení pečene na celom svete a môže progredovať do fibrózy a cirhózy pečene a potenciálne rakoviny, pretože pečeň začína pociťovať zjazvenie a bunkovú smrť.

Diagnostické nástroje na fibrózu a cirhózu pečene však chýbajú. Biopsie sú invazívne a môžu vynechať poranené oblasti pečene, a MRI sú drahé a často nie sú dostupné vo vidieckych oblastiach.

Na riešenie týchto výziev, výskumný tím skúmal mikrobióm ako spôsob, ako splniť naliehavú potrebu nového testu na identifikáciu rizikových pacientov.

„Snažili sme sa vyvinúť univerzálny, neinvazívny test na fibrózu a cirhózu pečene založený na „mikrobiómovom podpise“ choroby, “hovorí Michael Downes, vedec zo Salu a spoluautor štúdie.

V spolupráci s vedcami z Katedry medicíny UC San Diego, tím optimalizoval výpočtovú metódu nazývanú strojové učenie, aby odhalila komplexný podpis choroby na základe 19 bakteriálnych druhov prítomných vo vzorkách stolice pacientskej skupiny.

Podpis tvoria rôzne množstvá baktérií, vytvorenie univerzálneho odtlačku prsta na identifikáciu fibrózy a cirhózy pečene.

Štúdia zahŕňala 163 klinických vzoriek od zdravých aj chorých rodinných príslušníkov s cieľom identifikovať premenné, ktoré svedčili o ochorení pečene.

Pomocou údajov z mikrobiómového genetického profilovania a z metabolitov zo vzoriek stolice vedci objavili podpis mikrobiómu, ktorý bol spojený s diagnózou cirhózy s 94 -percentnou presnosťou.

Mikrobiómový podpis môže tiež určiť štádium fibrózy pečene, čo by mohlo umožniť lekárom hodnotiť pacientov na základe ich štádia ochorenia a zlepšiť stratégie liečby.

"Tieto zistenia ukazujú, že je možné použiť strojové učenie na identifikáciu univerzálneho podpisu, ktorý je možné použiť na presnú diagnostiku choroby," ako je cirhóza pečene, “hovorí Tae Gyu Oh, prvý autor príspevku a postdoktorandský výskumník v laboratóriu Evans.

"Vzory, ktoré sme našli, odrážajú zložitosť mikrobiómu a to, ako zdravie čriev pravdepodobne ovplyvňuje choroby."

Vedci potom aplikovali svoj mikrobiómový podpis na dve nezávislé populácie pacientov z Číny a Talianska.

Podpis tímu mohol presne identifikovať cirhózu u viac ako 90 percent pacientov, ktorá overuje silu a presnosť algoritmu v rôznych genetikách a diétach.

"Je pozoruhodné, že črevný mikrobiómový podpis odvodený od pacientov s cirhózou žijúcich v južnej Kalifornii dokázal predpovedať cirhózu v dvoch nezávislých kohortách s bydliskom v Číne a Taliansku."

„Hovorí o nových objavoch, ktoré sa ešte len majú uskutočniť v úlohe črevného mikrobiómu na diagnostiku a stratifikáciu rizika ochorenia pečene, “hovorí Rohit Loomba, spoluzodpovedajúci autor a riaditeľ Výskumného centra NAFLD na Lekárskej fakulte UC San Diego.

„Myslím si, že sila používania mikrobiómu ako diagnostického nástroja sa začína realizovať.“

V budúcnosti, vedci preskúmajú príčinnú súvislosť medzi mikrobiómom a ochorením pečene testovaním, či obnovenie častí mikrobiómu vedie k regresii ochorenia alebo odstránenie určitých baktérií zhoršuje.

Tím tiež dúfa, že tento prístup možno použiť na charakterizáciu ďalších chorôb, zápalové ochorenie čriev, rakovina hrubého čreva, Alzheimerova choroba a ďalšie ochorenia, u ktorých je dokázané, že sú pravdepodobne ovplyvnené dysregulovaným mikrobiómom.

• Prieskum odhaľuje významný vplyv na duševné zdravie počas pandémie COVID-19
• Ústna hygiena a závažnosť COVID-19-spojenie