À la fois, il est à la fois difficile à gérer et il n'existe pas de thérapie hépatique anti-fibrosante approuvée par la FDA. Le microbiome - une collection complexe de microbes qui habitent l'intestin - peut être un indicateur inattendu de la santé.
Maintenant, une équipe collaborative de scientifiques du Salk Institute et de l'UC San Diego a créé un nouvel outil de diagnostic basé sur le microbiome qui, avec la précision des meilleurs médecins, identifie rapidement et à moindre coût la fibrose hépatique et la cirrhose plus de 90 pour cent du temps chez les patients humains.
La méthode non invasive repose sur un algorithme pour analyser les échantillons de selles des patients - qui contiennent des traces de ce qui vit dans l'intestin - et pourrait améliorer les soins aux patients et les résultats du traitement des maladies du foie. comme détaillé en ligne le 30 juin, 2020 en Métabolisme cellulaire .
Le microbiome est un capteur vivant dynamique de petits changements de santé et de maladie dans le corps, et en tant que tel, il fournit une lecture précise de la santé du corps. Parce que ce diagnostic est rapide et peu coûteux, cela pourrait être quelque chose qui devient largement utilisé, surtout dans les nombreuses régions qui manquent de cliniques spécialisées et de médecins. Dit simplement, cela pourrait changer la donne, avec des implications mondiales."
Ronald Evans, Co-auteur de l'étude et professeur,
Evans est également titulaire de la chaire March of Dimes.
La stéatose hépatique non alcoolique (NAFLD) est la principale cause de maladie hépatique chronique dans le monde et peut évoluer vers une fibrose et une cirrhose du foie et potentiellement un cancer, au fur et à mesure que le foie commence à subir des cicatrices et la mort cellulaire.
Mais les outils de diagnostic de la fibrose hépatique et de la cirrhose font défaut. Les biopsies sont invasives et peuvent manquer des régions lésées du foie, et les IRM sont chères et ne sont souvent pas disponibles dans les zones rurales.
Pour relever ces défis, l'équipe de recherche a exploré le microbiome comme moyen de répondre au besoin urgent d'un nouveau test pour identifier les patients à risque.
« Nous avons cherché à développer un universel, test non invasif de fibrose hépatique et de cirrhose basé sur une « signature microbiotique » de la maladie, " dit Michael Downes, un scientifique senior de Salk et co-auteur de l'étude.
En collaboration avec des scientifiques du département de médecine de l'UC San Diego, l'équipe a optimisé une méthode de calcul appelée apprentissage automatique pour découvrir une signature de maladie complexe basée sur 19 espèces bactériennes présentes dans les échantillons de selles d'un groupe de patients.
La signature est constituée des différentes quantités de bactéries, créer une empreinte digitale universelle pour identifier la fibrose et la cirrhose du foie.
L'étude a inclus 163 échantillons cliniques provenant de membres de la famille sains et malades afin d'identifier les variables indiquant une maladie du foie.
En utilisant les données du profilage génétique du microbiome et des métabolites des échantillons de selles, les chercheurs ont découvert une signature de microbiome associée à un diagnostic de cirrhose avec une précision de 94 %.
La signature du microbiome pourrait également déterminer le stade de la fibrose hépatique, ce qui pourrait permettre aux médecins de classer les patients en fonction de leur stade de la maladie et d'améliorer les stratégies de traitement.
"Ces résultats démontrent qu'il est possible d'utiliser l'apprentissage automatique pour identifier une signature universelle qui peut être utilisée pour un diagnostic précis d'une maladie, comme la cirrhose du foie, " dit Tae Gyu Oh, premier auteur de l'article et chercheur postdoctoral au laboratoire Evans.
"Les modèles que nous avons trouvés reflètent la complexité du microbiome et comment la santé intestinale affecte probablement la maladie."
Les chercheurs ont ensuite appliqué leur signature de microbiome à deux populations indépendantes de patients de Chine et d'Italie.
La signature de l'équipe pourrait identifier avec précision la cirrhose chez plus de 90 pour cent des patients, qui valide la puissance et la précision de l'algorithme à travers différentes génétiques et régimes alimentaires.
"Il est remarquable qu'une signature du microbiome intestinal dérivée de patients résidant dans le sud de la Californie pour une cirrhose ait pu prédire la cirrhose dans deux cohortes indépendantes résidant en Chine et en Italie."
"Cela parle des nouvelles découvertes qui n'ont pas encore été réalisées dans le rôle du microbiome intestinal pour diagnostiquer et stratifier les risques de maladie du foie, " dit Rohit Loomba, co-auteur et directeur du NAFLD Research Center de l'UC San Diego School of Medicine.
"Je pense que le pouvoir d'utiliser le microbiome comme outil de diagnostic commence seulement à être réalisé."
À l'avenir, les scientifiques examineront le lien de causalité entre le microbiome et la maladie du foie en vérifiant si la restauration de parties du microbiome entraîne une régression de la maladie ou si l'élimination de certaines bactéries l'aggrave.
L'équipe espère également que cette approche pourra être utilisée pour caractériser d'autres maladies, comme les maladies inflammatoires de l'intestin, cancer du colon, Il a été démontré que la maladie d'Alzheimer et d'autres maladies sont probablement affectées par un microbiome dérégulé.
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