Bactérias comuns que causam doenças transmitidas por alimentos consideradas resistentes aos antibióticos

O Ministério da Saúde do Brasil recebeu relatórios de 11, 524 surtos de doenças transmitidas por alimentos entre 2000 e 2015, com 219, 909 pessoas que adoeceram e 167 morreram em decorrência das doenças em questão. As bactérias causaram a maioria dos surtos dessas doenças, incluindo diarreia e gastroenterite. Os mais frequentes foram Salmonella spp., com 31, 700 casos diagnosticados no período (14,4% do total), Staphylococcus aureus (7,4%), e Escherichia coli (6,1%).

p Segundo levantamento do Ministério do Desenvolvimento Social, bactérias do gênero Salmonella foram os agentes etiológicos em 42,5% dos surtos de doenças transmitidas por alimentos confirmados em laboratório relatados no Brasil entre 1999 e 2009.

p O sequenciamento do genoma completo das principais bactérias causadoras de diarreia aguda é o foco de pesquisa de um grupo da Universidade de São Paulo liderado por Juliana Pfrimer Falcão, professora titular da Faculdade de Ciências Farmacêuticas de Ribeirão Preto (FCFRP-USP).

p Em um artigo publicado em PLOS ONE , as cientistas biomédicas Amanda Aparecida Seribelli e Fernanda Almeida, que pertencem ao laboratório de Falcão, descrever como eles sequenciaram e investigaram os genomas de 90 cepas de um sorovar específico de Salmonella enterica conhecido como S. Typhimurium (uma abreviatura de Salmonella enterica subespécie sorovar Typhimurium).

p As 90 cepas foram isoladas entre 1983 e 2013 no Instituto Adolfo Lutz, em Ribeirão Preto (SP, São Paulo, Brasil). Brasil) e Fundação Oswaldo Cruz (Fiocruz) no Rio de Janeiro. Eles fornecem um retrato da epidemiologia da salmonelose no Brasil nos últimos 30 anos, vindo de todas as regiões do país e tendo sido coletado de pacientes com infecções de origem alimentar ou de alimentos contaminados, como aves, carne de porco, ou alface e outros vegetais.

p "Dos humanos, recebemos amostras de sangue, abscessos cerebrais, e fezes diarreicas, "Seribelli disse.

p Quando a ação dos antibióticos em cada uma das 90 cepas foi testada, descobriu-se que a grande maioria era resistente às diferentes classes de antibióticos que fazem parte do arsenal da medicina. O estudo também identificou 39 genes responsáveis ​​pela resistência aos antibióticos.

p Pesquisadores filiados à Fiocruz, Participaram do estudo a Faculdade de Ciências Agrárias e Veterinárias da Universidade Estadual Paulista (FCAV-UNESP) e o Instituto Adolfo Lutz. As 90 variedades de S. Typhimurium foram sequenciados na Food and Drug Administration (FDA) dos Estados Unidos durante o doutorado de Almeida.

p A análise comparativa dos genomas, transcriptomas, e fenótipos de S. Typhimurium cepas isoladas de humanos e alimentos no Brasil foi apoiado pela Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - FAPESP, o FDA, e a Secretaria de Desenvolvimento do Corpo Docente do Ministério da Educação (CAPES).

Salmonelose

p Salmonella compreende duas espécies, S. bongori e S. enterica . O último é a espécie-tipo, com um grande número de subespécies e sorovares que causam mais infecções de origem alimentar do que qualquer outra espécie no Brasil e no mundo. O trato intestinal humano e animal é o principal reservatório natural desse patógeno, com aves, carne suína e produtos alimentícios relacionados servindo como principais vetores de transmissão.

p As seis subespécies de S. enterica são subdivididos em 2, 600 serovares. Um sorovar (abreviação de variante sorológica) é uma variação distinta dentro de uma espécie de bactéria ou vírus caracterizado por ter o mesmo número de antígenos de superfície específicos.

p As subespécies mais importantes de S. enterica do ponto de vista epidemiológico é S. enterica subespécie enterica, que causa a infecção de origem alimentar conhecida como salmonelose. Os sintomas são diarreia, febre, dores de estômago, e vômito.

p S. enterica subsp. enterica foi a principal causa do 31, 700 casos de salmonelose notificados no Brasil entre 2000 e 2015. Os sorovares mais frequentemente isolados desta subespécie são S. Typhimurium e S. Enteritidis .

p S. Enteritidis é um dos principais sorovares causadores de salmonelose. Ele se espalhou pela primeira vez em uma pandemia que começou na Europa na década de 1990. S. Typhimurium era o sorovar mais prevalente antes da pandemia e continuou a causar infecções.

p De acordo com Almeida, todas as 90 cepas analisadas no estudo pertenciam a S. Typhimurium . Outro pesquisador da FCFRP-USP (também atuando na Clínica da universidade, Laboratório de Análises Toxicológicas e Bromatológicas) está sequenciando e analisando amostras contendo o sorovar S. Enteritidis .

p Almeida tirou 90 cepas de S. Typhimurium para os EUA em 2015. "Seus genomas foram sequenciados no Centro de Segurança Alimentar e Nutrição Aplicada da FDA em Maryland, sob a supervisão do pesquisador Marc W. Allard, " ele disse.

p S. Typhimurium O genoma de contém 4,7 milhões de pares de bases. Uma breve reflexão nos diz que o estudo gerou uma montanha de dados, mais especificamente 423 milhões de bases correspondentes à soma de 90 genomas.

p Após seu retorno a Ribeirão Preto, Almeida trabalhou com Seribelli em uma análise comparativa dos genomas de várias linhagens para entender sua diversidade e as relações evolutivas entre elas.

p De acordo com Almeida, a técnica usada foi a genotipagem de alto rendimento com SNPs (pronuncia-se "snips" e abreviatura de polimorfismos de nucleotídeo único), o que lhes permitiu identificar a composição genética (genótipo) de cada cepa por meio do sequenciamento de DNA. SNPs são os marcadores mais comuns de variação genética. Os resultados filogenéticos separaram as 90 cepas de S. Typhimurium em dois grupos, A e B.

p “O grupo de amostras coletadas de alimentos diferiu do grupo coletado de humanos, "Seribelli explicou." Isolados de alimentos foram distribuídos entre os grupos A e B em números relativamente semelhantes, sugerindo que mais de um subtipo está circulando nos alimentos no Brasil. Isolados humanos foram mais prevalentes no grupo B, sugerindo que um subtipo específico provavelmente se adaptou aos humanos. "

p Em outra parte importante de sua pesquisa financiada pela FAPESP, os cientistas mediram a resistência aos antibióticos em cada uma das 90 cepas. De acordo com o estudo, 65 (72,2%) das cepas mostraram-se resistentes às sulfonamidas, 44 (48,9%) para estreptomicina, 27 (30%) para tetraciclina, 21 (23,3%) para gentamicina e sete (7,8%) para ceftriaxona, um antibiótico cefalosporina.

Origem da resistência

p A análise dos SNPs identificou 39 genes para resistência a diferentes classes de antimicrobianos ou antibióticos, como aminoglicosídeo, tetraciclina, sulfonamida, trimetoprim, beta-lactama, fluoroquinolona, fenicol e macrolídeo. Mutações pontuais também foram encontradas em alguns dos genes, como gyrA, gyrB, parC e parE.

p "É impressionante que S. Typhimurium é resistente a antibióticos que podem ser usados ​​para tratar a doença, "Seribelli disse." Esses medicamentos estão disponíveis para os médicos para uso no combate a infecções que apresentam resistência. Eles são uma segunda linha de defesa quando os microorganismos não são mortos pelo sistema imunológico do paciente, uma vez que a salmonelose é normalmente autolimitada e não requer o uso de antibióticos. O principal problema é quando isso falha e as bactérias se tornam invasivas. "

p Outro ponto que chamou a atenção dos cientistas foi a diferença entre a resistência das cepas ao longo dos 30 anos de coleta de amostras. "As amostras de S. Typhimurium coletadas em meados da década de 1990 mostraram mais resistência aos antibióticos do que amostras de anos posteriores. Isso pode ser explicado pelo surgimento no início de 1990 do sorovar S. Enteritidis , que desde então se tornou uma das principais causas de infecção por salmonela, "Disse Seribelli.

p S. Enteritidis é conhecido desde 1950, mas por um tempo, causou menos casos da doença. Isso foi radicalmente mudado pelo S. Enteritidis pandemia, que começou no final da década de 1980 e início da década de 1990 na Europa e depois se espalhou pelo mundo.

p "Desde então, S. Enteritidis tem sido um dos sorovares mais prevalentes no Brasil e no mundo. Como resultado, é um sorovar que também pode ser combatido com antibióticos se necessário, "Disse Seribelli.

p De acordo com Almeida, S. Typhimurium continua sendo um dos principais sorovares isolados de humanos, animais e alimentos no Brasil e no mundo.

p A partir de S. Enteritidis pandemia em meados da década de 1990, o número de cepas resistentes aparentemente diminuiu em comparação com o número prevalente antes da década de 1990, mas não se sabe se a virulência dessas cepas aumentou para permitir que se adaptassem a esse novo nicho.

p “A principal descoberta desta pesquisa é a descoberta de um grande número de genes de resistência nas amostras, considerando que eles estavam isolados de humanos e alimentos. Isso aponta para o risco muito significativo de contaminação no Brasil hoje de alimentos contendo cepas de Salmonella que são resistentes a antimicrobianos, "Disse Almeida.

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