A Szociális Fejlesztési Minisztérium felmérése szerint a Salmonella nemzetség baktériumai voltak az etiológiai ágensek a laboratóriumilag megerősített, 1999. és 2009. között Brazíliában jelentett élelmiszer-eredetű betegségek kitörésének 42,5% -ában.
Az akut hasmenést okozó fő baktériumok teljes genom szekvenálása a kutatás középpontjában áll a São Paulo Egyetem egy csoportjának, amelyet Juliana Pfrimer Falcão vezet, az egyetem Ribeirão Preto Gyógyszerészeti Tudományok Iskolájának (FCFRP-USP) professzora.
Ben megjelent cikkben PLOS ONE , az orvosbiológusok, Amanda Aparecida Seribelli és Fernanda Almeida, akik Falcão laborjába tartoznak, írja le, hogyan szekvenálták és vizsgálták egy adott szerovár 90 törzsének genomját Salmonella enterica ismert, mint S. Typhimurium (rövidítése Salmonella enterica Typhimurium szerovár alfaj).
A 90 törzset 1983 és 2013 között izolálták a Ribeirão Preto -i Adolfo Lutz Intézetben (São Paulo állam, Brazília) és Oswaldo Cruz Alapítvány (Fiocruz) Rio de Janeiróban. Portrét nyújtanak a brazíliai szalmonellózis járványról az elmúlt 30 évben, az ország minden régiójából érkeznek, és azokat élelmiszerekkel fertőzött betegektől vagy fertőzött élelmiszerektől, például baromfitól gyűjtötték, sertéshús, vagy saláta és más zöldségek.
"Az emberektől, vérmintákat kaptunk, agyi tályogok, és hasmenéses széklet, - mondta Seribelli.
Amikor az antibiotikumok hatását mind a 90 törzsben tesztelték, felfedezték, hogy a túlnyomó többség ellenálló a különböző antibiotikum -osztályokkal szemben, amelyek a gyógyszerkészlet részét képezik. A tanulmány 39 gént is azonosított, amelyek felelősek az antibiotikumokkal szembeni rezisztenciáért.
Fiocruzhoz kapcsolódó kutatók, A tanulmányban részt vett a São Paulo Állami Egyetem Agrár- és Állatorvostudományi Iskolája (FCAV-UNESP) és az Adolfo Lutz Intézet. A 90 törzs S. Typhimurium szekvenálták az Egyesült Államok Élelmiszer- és Gyógyszerügyi Hivatalában (FDA) Almeida doktori tartózkodása alatt.
A genomok összehasonlító elemzése, átiratok, és fenotípusai S. Typhimurium Brazíliában az emberektől és élelmiszerektől elkülönített törzseket a São Paulo Research Foundation (FAPESP) támogatta, az FDA, és az Oktatási Minisztérium Kari Fejlesztési Hivatala (CAPES).
A szalmonella két fajt tartalmaz, S. bongori és S. enterica . Ez utóbbi a fajfaj, nagyszámú alfaj és szerovárium, amelyek Brazíliában és világszerte minden más fajnál több élelmiszer -fertőzést okoznak. Az emberi és állati bélrendszer a kórokozó fő természetes tárolója, baromfival, a sertéshús és a kapcsolódó élelmiszertermékek, amelyek fő transzmissziós vektorok.
A hat alfaja S. enterica 2 -re vannak felosztva, 600 szerovár. A szerovár (a szerológiai variáns rövidítése) a baktérium- vagy vírusfajon belüli elkülönült variáció, amelyet azonos számú specifikus felületi antigén jellemez.
A legfontosabb alfaja S. enterica járványügyi szempontból az S. enterica enterica alfaj, ami a szalmonellózis néven ismert élelmiszer -fertőzést okozza. A tünetek a hasmenés, láz, gyomorgörcs, és hányás.
S. enterica subsp. az enterica volt a fő oka a 31, 700 szalmonellózis -esetet jelentettek Brazíliában 2000 és 2015 között. Ennek az alfajnak a leggyakrabban izolált szerovárjai S. Typhimurium és S. Enteritidis .
S. Enteritidis az egyik vezető szalmonellózist okozó szerovár. Először egy járványban terjedt el, amely Európában a kilencvenes években kezdődött. S. Typhimurium volt a legelterjedtebb szerovár a járvány előtt, és továbbra is fertőzéseket okoz.
Almeida szerint a vizsgálatban elemzett mind a 90 törzs tartozott S. Typhimurium . Egy másik kutató az FCFRP-USP-nél (szintén az egyetem klinikáján dolgozik, Toxikológiai és Bromatológiai Elemző Laboratórium) jelenleg a szerovárt tartalmazó mintákat szekvenálja és elemzi S. Enteritidis .
Almeida elvitte a 90 törzset S. Typhimurium Genomjaikat az FDA Maryland -i Élelmiszerbiztonsági és Alkalmazott Táplálkozási Központjában szekvenálták Marc W. Allard kutató felügyelete alatt, " ő mondta.
S. Typhimurium genomja 4,7 millió bázispárt tartalmaz. Rövid elmélkedés azt mondja, hogy a tanulmány sok adatot generált, pontosabban 423 millió bázist, ami 90 genom összegének felel meg.
Miután visszatért Ribeirão Pretoba, Almeida Seribellivel dolgozott a különböző törzsek genomjainak összehasonlító elemzésén, hogy megértsék azok sokféleségét és a köztük lévő evolúciós kapcsolatokat.
Almeida szerint az alkalmazott technika nagy áteresztőképességű genotipizálás volt SNP-kkel (kimondott "snipp", rövidítve az egy nukleotid polimorfizmusokkal), amely lehetővé tette számukra, hogy DNS -szekvenálás segítségével azonosítsák az egyes törzsek genetikai összetételét (genotípusát). Az SNP -k a genetikai variációk leggyakoribb markerei. A filogenetikai eredmények elválasztották a 90 törzset S. Typhimurium két csoportba, A és B.
"Az élelmiszerekből gyűjtött minták csoportja eltér az emberektől, "Seribelli kifejtette." Az élelmiszer -izolátumokat viszonylag hasonló számban osztották el az A és a B csoport között, ami arra utal, hogy Brazíliában egynél több altípus kering az élelmiszerekben. A humán izolátumok gyakoribbak voltak a B csoportban, ami arra utal, hogy egy adott altípus valószínűleg alkalmazkodott az emberekhez. "
A FAPESP által finanszírozott kutatásuk másik fontos részében a tudósok mind a 90 törzsben mérték az antibiotikum -rezisztenciát. A tanulmány szerint A törzsek 65 (72,2%) szulfonamidokkal szemben ellenállónak bizonyultak, 44 (48,9%) sztreptomicinre, 27 (30%) tetraciklinre, 21 (23,3%) gentamicin és hét (7,8%) ceftriaxon, cefalosporin antibiotikum.
Az SNP -k elemzése 39 gént azonosított, amelyek rezisztensek voltak az antimikrobiális vagy antibiotikumok különböző osztályaival szemben, mint aminoglikozid, tetraciklin, szulfonamid, trimetoprim, béta-laktám, fluorokinolon, fenikolt és makrolidot. Pontmutációkat is találtak néhány génben, mint a gyrA, gyrB, parC és parE.
"Feltűnő ez S. Typhimurium ellenáll a betegség kezelésére alkalmazható antibiotikumoknak, "Seribelli mondta." Ezek a gyógyszerek az orvosok rendelkezésére állnak az ellenállást mutató fertőzések leküzdésére. Ez egy második védelmi vonal, amikor a beteg immunrendszere nem pusztítja el a mikroorganizmusokat, mivel a szalmonellózis általában önkorlátozó, és nem igényel antibiotikumokat. A fő probléma az, amikor ez nem sikerül, és a baktériumok invazívvá válnak. "
Egy másik pont, amely felhívta a tudósok figyelmét, a törzsek rezisztenciája közötti különbség a 30 éves mintavételi időszakban. "A minták S. Typhimurium A kilencvenes évek közepén gyűjtött anyag nagyobb rezisztenciát mutatott az antibiotikumokkal szemben, mint a későbbi évekből származó minták. Ez azzal magyarázható, hogy a kilencvenes évek elején megjelent a szerovár S. Enteritidis , amely azóta a szalmonellafertőzés egyik fő oka lett, - mondta Seribelli.
S. Enteritidis az 1950 -es évek óta ismert, de egy ideig, kevesebb betegséget okozott. Ezt gyökeresen megváltoztatta a S. Enteritidis világjárvány, amely a nyolcvanas évek végén és a kilencvenes évek elején kezdődött Európában, majd elterjedt a világban.
"Azóta, S. Enteritidis Brazíliában és világszerte az egyik legelterjedtebb szerovár. Ennek eredményeként ez egy szerovár, amely szükség esetén antibiotikumokkal is leküzdhető, - mondta Seribelli.
Almeida szerint S. Typhimurium továbbra is az egyik fő emberből elszigetelt szerovár, állatok és élelmiszerek Brazíliában és világszerte.
Mint a S. Enteritidis járvány a kilencvenes évek közepén, a rezisztens törzsek száma nyilvánvalóan csökkent az 1990 -es évek előttihez képest, de hogy ezeknek a törzseknek a virulenciája nőtt -e ahhoz, hogy alkalmazkodni tudjanak ehhez az új réshez, nem ismert.
"A kutatás legfontosabb megállapítása, hogy nagyszámú rezisztencia gént fedeztek fel a mintákban, tekintve, hogy elszigetelődtek az emberektől és az élelmiszerektől. Ez arra utal, hogy ma Brazíliában nagyon jelentős a fertőzés veszélye Brazíliában olyan élelmiszerek miatt, amelyek antimikrobiális szerekkel szemben ellenálló Salmonella törzseket tartalmaznak, - mondta Almeida.
A fekélyes vastagbélgyulladás biológiai terápiáira adott válasz lehetséges potenciális molekuláris előrejelzői
A tejsavbaktériumok és a bélbaktériumok hozzájárulnak a rozs egészségügyi előnyeihez,
A bél mikrobioma a gyermekek viselkedési problémáihoz kapcsolódik
A kutatások azt mutatják, hogy a bél mikrobái hogyan befolyásolják a gyomorinfluenzát
A kutatók új módszert találnak a betegségek elleni védekezésre az MS modellben
Az egészségtelen bélmikrobióma csökkenti az agy szinaptikus metszését,
A tanulmány leírja a kezdeti kiindulási egészséges bél mikrobióma adatbázist és a bőségprofilt
A szeptember 11 -én közzétett tanulmány leírja az egészséges bél mikrobioma kezdeti adatbázisát és bőségprofilját. 2019 a PLOS ONE nyílt hozzáférésű folyóiratban, Charles Hadley King, a George Washing
A SARS-CoV-2 érzékenységgel kapcsolatos változások a gyermekek felső légúti mikrobiómájában
A kutatók tesztelték a 21 éves kor alatti gyermekek orr -garat mikrobiomáját, és megállapították, hogy a mikrobioma az életkorral változik. Specifikus baktériumok, amelynek bősége is változik az életk
Kevés bizonyíték az mRNS COVID-19 vakcinával összefüggő thrombocytopeniára,
új FDA tanulmányt javasol Még akkor is, ha számos oltóanyagot fejlesztettek ki a 2019-es koronavírus-járvány (COVID-19) világjárvány elleni küzdelem érdekében, súlyos káros hatásokat jelentettek, thro