Laut enger Ëmfro vum Ministère fir Sozial Entwécklung, Bakterien vun der Gattung Salmonella waren d'etiologesch Agenten an 42,5% vun de Labo bestätegt Liewensmëttelburne Krankheeten, déi a Brasilien tëscht 1999 an 2009 gemellt goufen.
Ganz Genome Sequenzen vun den Haaptbakterien, déi akuten Diarrhoe verursaachen, ass de Fuerschungsfokus fir eng Grupp op der University of São Paulo gefouert vum Juliana Pfrimer Falcão, e Professer an der Universitéit Ribeirão Preto School of Pharmaceutical Sciences (FCFRP-USP).
An engem Artikel publizéiert am PLOS NËMMEN , biomedizinesch Wëssenschaftler Amanda Aparecida Seribelli a Fernanda Almeida, déi zum Falcão säi Labo gehéieren, beschreift wéi se d'Genome vun 90 Stämme vun engem spezifesche Serovar sequenzéiert an ënnersicht hunn Salmonella enterica bekannt als S. Typhimurium (eng Ofkierzung vun Salmonella enterica Subspecies serovar Typhimurium).
Déi 90 Stämme goufen isoléiert tëscht 1983 an 2013 um Adolfo Lutz Institut zu Ribeirão Preto (São Paulo Staat, Brasilien) an Oswaldo Cruz Foundation (Fiocruz) zu Rio de Janeiro. Si bidden e Portrait vun der Epidemiologie vun der Salmonellose a Brasilien an de leschten 30 Joer, kommen aus alle Regiounen vum Land a si gi vu Patienten gesammelt mat iessbarer Infektiounen oder aus kontaminéierte Liewensmëttel wéi Gefligel, Schwäin, oder Salat an aner Geméis.
"Vun de Mënschen, mir kruten Bluttproben, Gehir Abscessen, an Diarrho Feeën, "Sot de Seribelli.
Wann d'Aktioun vun Antibiotike an all den 90 Stämme getest gouf, et gouf entdeckt datt déi grouss Majoritéit resistent géint verschidde Klassen vun Antibiotike sinn, déi Deel vum Arsenal vun der Medizin sinn. D'Studie identifizéiert och 39 Genen verantwortlech fir d'Resistenz géint Antibiotike.
Fuerscher verbonne mam Fiocruz, D'São Paulo State University School of Agrarian and Veterinary Sciences (FCAV-UNESP) an den Adolfo Lutz Institut hunn un der Studie deelgeholl. Déi 90 Stämme vun S. Typhimurium goufen an der USA Food and Drug Administration (FDA) sequenzéiert wärend dem Almeida säin Doktorat bleiwen.
D'komparativ Analyse vun de Genome, Transkriptome, a Phenotypen vun S. Typhimurium Stämme isoléiert vu Mënschen a Liewensmëttel a Brasilien gouf ënnerstëtzt vun der São Paulo Research Foundation - FAPESP, der FDA, an dem Educatiounsministère Büro fir Fakultéitentwécklung (CAPES).
Salmonella enthält zwou Aarte, S. bongori an S. enterica . Déi lescht ass d'Typaart, mat enger grousser Unzuel vun Ënnersorten a Serovaren, déi méi Liewensmëttel -infizéiert Infektiounen verursaache wéi all aner Aart a Brasilien a weltwäit. De Mënsch an d'Déierendarmstrakt ass den Haapt natierlechen Reservoir fir dëse Pathogen, mat Gefligel, Schweinefleesch a verbonne Liewensmëttelprodukter déi als grouss Iwwerdroungsvektoren déngen.
Déi sechs Ënnerarten vun S. enterica ginn an 2 ënnerdeelt, 600 Serovaren. E Serovar (kuerz fir serologesch Variant) ass eng markant Variatioun bannent enger Aart vu Bakterien oder Virus, geprägt vun der selwechter Unzuel vu spezifeschen Uewerflächeantigenen.
Déi wichtegst Ënneraarten vun S. enterica aus dem epidemiologesche Standpunkt ass S. enterica Ënneraarten enterica, déi d'Liewensmëttelinfektioun verursaacht bekannt als Salmonellose. Symptomer sinn Diarrho, Féiwer, Bauchschmerzen, an iwelzeg.
S. enterica subsp. enterica war d'Haaptursaach vun den 31, 700 Fäll vu Salmonellose gemellt a Brasilien tëscht 2000 an 2015. Déi dacks isoléiert Serovare vun dëser Ënneraart sinn S. Typhimurium an S. Enteritidis .
S. Enteritidis ass eng vun de féierende Salmonellose verursaache Serovaren. Et huet sech fir d'éischt an enger Pandemie verbreet, déi an Europa an den 1990er ugefaang huet. S. Typhimurium war dee meescht verbreete Serovar virun der Pandemie an huet weider Infektiounen verursaacht.
Laut Almeida, all 90 Stämme, déi an der Studie analyséiert goufen, gehéieren zu S. Typhimurium . En anere Fuerscher bei FCFRP-USP (schafft och an der Uni Klinesch, Toxicological and Bromatological Analysis Laboratory) ass de Moment sequencing an analyséiert Proben déi de Serovar enthalen S. Enteritidis .
Almeida huet déi 90 Stämme vun S. Typhimurium an d'USA am 2015. "Hir Genome goufen am FDA's Center for Food Safety and Applied Nutrition zu Maryland sequenzéiert ënner der Opsiicht vum Fuerscher Marc W. Allard, " hie sot.
S. Typhimurium 's Genom enthält 4,7 Millioune Basisparen. Kuerz Reflexioun seet eis datt d'Studie e Bierg vun Daten generéiert huet, méi spezifesch 423 Millioune Basen entspriechend der Zomm vun 90 Genom.
No sengem Retour op Ribeirão Preto, Den Almeida huet mam Seribelli un enger vergläichender Analyse vun de Genome vun de verschiddene Stämme geschafft fir hir Diversitéit an déi evolutiv Relatiounen tëscht hinnen ze verstoen.
Laut Almeida, d'Technik benotzt war Héichduerchgangs Genotyping mat SNPs (ausgeschwat "Snips" a kuerz fir Single-Nukleotid Polymorphismen), déi et hinnen erlaabt hunn d'genetesch Zesummesetzung (Genotyp) vun all Stamm mat DNA Sequencing z'identifizéieren. SNPs sinn déi allgemeng Marker vun der genetescher Variatioun. Déi phylogenetesch Resultater hunn déi 90 Stämme vun S. Typhimurium an zwou Gruppen, A und B.
"D'Grupp Proben aus Iessen gesammelt ënnerscheede sech vun der Grupp gesammelt vu Mënschen, "Seribelli erkläert." Liewensmëttelisolater goufen tëscht Gruppen A a B a relativ ähnlechen Zuelen verdeelt, suggeréiert datt méi wéi een Ënnertyp a Liewensmëttel a Brasilien zirkuléiert. Mënschlech Isolate ware méi verbreed an der Grupp B, suggeréiert datt e spezifeschen Ënnertyp méiglecherweis dem Mënsch ugepasst ass. "
An engem anere wichtegen Deel vun hirer Fuerschung finanzéiert vum FAPESP, d'Wëssenschaftler gemooss Antibiotikaresistenz an all den 90 Stämme. Laut der Studie, 65 (72,2%) vun de Stämme ware resistent géint Sulfonamiden, 44 (48,9%) zu Streptomycin, 27 (30%) zu Tetracyclin, 21 (23,3%) fir Gentamicin a siwen (7,8%) fir Ceftriaxon, e Cephalosporin Antibiotikum.
D'Analyse vun SNPs identifizéiert 39 Genen fir Resistenz géint verschidde Klassen vun antimikrobiellen oder Antibiotike, wéi Aminoglycosid, Tetracyclin, Sulfonamid, trimethoprim, Beta-Laktam, Fluorquinolon, Phenicol a Makrolid. Punktmutatiounen goufen och an e puer vun de Genen fonnt, wéi gyrA, gyrB, parC und parE.
"Et ass opfälleg dat S. Typhimurium ass resistent géint Antibiotike déi benotzt kënne ginn fir d'Krankheet ze behandelen, "Sot de Seribelli." Dës Medikamenter si verfügbar fir Dokteren fir ze benotzen fir Infektiounen ze bekämpfen déi Resistenz weisen. Si sinn eng zweet Verteidegungslinn wann Mikroorganismen net vum Immunsystem vum Patient ëmbruecht ginn well Salmonellose normalerweis selbstbegrenzend ass an d'Benotzung vun Antibiotike net erfuerdert. Den Haaptprobleem ass wann dëst net klappt an d'Bakterien invasiv ginn. "
En anere Punkt deen d'Wëssenschaftler opmierksam gemaach huet war den Ënnerscheed tëscht de Stämmresistenz iwwer d'30-Joer Probe-Sammlungsperiod. "Proben vun S. Typhimurium gesammelt an der Mëtt vun den 1990er huet méi Resistenz géint Antibiotike gewisen wéi Proben aus spéider Joeren. Dëst kéint duerch d'Entstoe vun de fréien 1990er vum Serovar erkläert ginn S. Enteritidis , déi zënterhier eng vun den Haaptursaache vun der Salmonelleninfektioun ginn ass, "Sot de Seribelli.
S. Enteritidis ass zënter de 1950er bekannt awer fir eng Zäit, et huet manner Fäll vun der Krankheet verursaacht. Dëst gouf radikal geännert vum S. Enteritidis Pandemie, déi ugefaang huet an de spéiden 1980er a fréien 1990er an Europa an dann iwwer d'Welt verbreet ass.
"Zanter, S. Enteritidis war eng vun de meescht prevalente Serovaren a Brasilien a weltwäit. Als Resultat vun, et ass e Serovar deen och mat Antibiotike bekämpft ka ginn wann néideg, "Sot de Seribelli.
Laut Almeida, S. Typhimurium bleift ee vun den Haapt Serovaren isoléiert vu Mënschen, Déieren a Liewensmëttel a Brasilien a weltwäit.
Wéi vun der S. Enteritidis Pandemie an der Mëtt vun den 1990er, d'Zuel vun de resistente Stämme ass anscheinend erofgaang am Verglach mat der Zuel déi viru den 1990er war, awer ob d'Virulenz vun dëse Stämme eropgaang ass fir se un dës nei Nisch z'adaptéieren ass onbekannt.
"De Schlësselfind vun dëser Fuerschung ass d'Entdeckung vun enger grousser Zuel vu Resistenzgenen an de Proben, bedenkt datt se vu Mënschen a Liewensmëttel isoléiert waren. Dëst weist op de ganz bedeitende Risiko vu Kontaminatioun a Brasilien haut vu Liewensmëttel, déi Salmonellastämme enthalen, déi resistent géint Antimikrobien sinn, "Sot den Almeida.
D'Halschent vun den Drogen, déi am Gebrauch sinn, beschiedegen Darmbakterien,
Wat Dir ësst kann de Wee änneren wéi Antibiotike Ären Darm beaflossen
De Wëssenschaftler beweist d'Roll vum Mikrobiom bei der Adipositas
Fuerscher manipuléieren Bakterienaarten am Darm mat Diät
Wéi hëllefen Hostfaktoren wéi de Lungemikrobiom bei der SARS -CoV -2 Infektioun?
Bluttest fir mikrobiell DNA kéint vu Kriibs warnen
Leaky Darm a mikrobiell Dysbiose kéinte bäidroe fir den Zytokin Stuerm a schwéier kranke COVID-19 Fäll
Wéi dWelt de grausame Meilesteen vun dräi Milliounen Doudesfäll aus der COVID-19 Krankheet ukënnt, en neit Virdruck Fuerschungspabeier gepost op bioRxiv * Server weist datt dPräsenz vun Darmbakterie
Spermmikrobiom opgedeckt mat RNA Sequencing
Eng nei Studie bericht déi éischt jeemools detailléiert Beschreiwung vum mënschleche Spermemikrobiom, méi nei RNA Sequencing Techniken ze benotzen déi fäeg sinn tëscht Sperma RNA an déi vu bakterielle
Kleng Beweiser fir mRNA COVID-19 Impfstoffassoziéiert Thrombozytopenie,
proposéiert nei FDA Studie Och wann eng ganz Rëtsch Impfungen ausgerullt gi fir géint de Coronavirus Krankheet 2019 (COVID-19) Pandemie ze bekämpfen, e puer sérieux negativ Effekter goufen gemellt, a