Kommensale bakterier i tarmen produserer forbindelser som hemmer SARS-CoV-2

Forskere fra Yonsei University i Sør-Korea har funnet ut at visse kommensale bakterier som befinner seg i tarmkanalen produserer forbindelser som hemmer SARS-CoV-2.

Forskningen vil bli presentert 20. juni på World Microbe Forum, et nettmøte i American Society for Microbiology (ASM), Federation of European Microbiological Societies (FEMS), og flere andre samfunn som vil finne sted online 20.-24. juni.

Tidligere kliniske funn har vist at noen pasienter med moderat til alvorlig COVID-19 har gastrointestinale symptomer, mens andre viste tegn på infeksjon utelukkende i lungene.

"Vi lurte på om tarmbaserte bakterier kunne beskytte tarmen mot invasjon av viruset, "sa Mohammed Ali, en ph.d. student i medisin ved Yonsei University, Seoul, Sør-Korea.

For å undersøke denne hypotesen, forskerne screenet dominerende bakterier som bor i tarmen for aktivitet mot SARS-CoV-2. Søket deres avslørte at Bifidobacteria, som tidligere har vist seg å undertrykke andre bakterier som H. pylori og har vist seg å være aktive mot irritabel tarmsyndrom, hadde slik aktivitet, sa Ali.

Etterforskerne brukte også maskinlæring for å søke etter potensielle sykdomskampforbindelser i databaser som inneholder mikrobielt produserte molekyler, oppdage noen som også kan være nyttige mot SARS-CoV-2.

For å trene modellen utnyttet vi tidligere datasett for koronavirus der flere forbindelser ble testet mot mål fra koronavirus. Denne tilnærmingen ser ut til å være betydelig ettersom disse målene deler funksjoner som er felles med SARS-CoV-2 . "

Mohammed Ali, PhD student i medisin, Yonsei universitet

Ali understreket den økologiske naturen til sin tilnærming til dette arbeidet, observere at mange eksisterende antibiotika og kreftbehandlinger er forbindelser som bakterier bruker for å konkurrere med hverandre i mage -tarmkanalen, og at disse opprinnelig ble renset fra mikrobielle sekresjoner.

"Å finne mikrober som skiller ut anti-coronavirus-molekyler vil være en lovende metode for å utvikle naturlig eller konstruert probiotika for å utvide våre teknikker for forebygging av terapier, å gi en mer bærekraftig måte å bekjempe virusinfeksjonen, "sa Ali.

• Ny forskning identifiserer en kobling mellom tarmmikrobiomet og slag
• Studie baner vei for utvikling av nye terapier for C. difficile infeksjon