La recherche sera présentée le 20 juin au World Microbe Forum, une réunion en ligne de l'American Society for Microbiology (ASM), la Fédération des sociétés européennes de microbiologie (FEMS), et plusieurs autres sociétés qui auront lieu en ligne du 20 au 24 juin.
Des découvertes cliniques antérieures ont montré que certains patients atteints de COVID-19 modéré à sévère présentent des symptômes gastro-intestinaux, tandis que d'autres ont montré des signes d'infection uniquement dans les poumons.
"Nous nous sommes demandé si les bactéries résidentes de l'intestin pouvaient protéger l'intestin de l'invasion du virus, " dit Mohammed Ali, un doctorat étudiant en médecine à l'université Yonsei, Séoul, Corée du Sud.
Pour étudier cette hypothèse, les chercheurs ont criblé les bactéries dominantes habitant l'intestin pour l'activité contre le SARS-CoV-2. Leur recherche a révélé que les bifidobactéries, qui ont déjà été montrés pour supprimer d'autres bactéries telles que H. pylori et se sont avérés actifs contre le syndrome du côlon irritable, avait une telle activité, dit Ali.
Les chercheurs ont également utilisé l'apprentissage automatique pour rechercher des composés potentiels de lutte contre la maladie dans des bases de données contenant des molécules produites par des microbes, en découvrir certains qui pourraient également s'avérer utiles contre le SRAS-CoV-2.
Pour entraîner notre modèle, nous avons utilisé des ensembles de données sur les coronavirus précédents dans lesquels plusieurs composés ont été testés contre des cibles de coronavirus. Cette approche semble être importante car ces cibles partagent des caractéristiques communes avec le SARS-CoV-2 ."
Mohammed Ali, Doctorant en médecine, Université Yonsei
Ali a souligné le caractère écologique de son approche de ce travail, observant que de nombreux antibiotiques et traitements anticancéreux existants sont des composés que les bactéries utilisent pour entrer en compétition les unes avec les autres dans le tractus gastro-intestinal, et que ceux-ci ont été initialement purifiés à partir de sécrétions microbiennes.
« Trouver des microbes qui sécrètent des molécules anti-coronavirus sera une méthode prometteuse pour développer des probiotiques naturels ou modifiés afin d'étendre nos techniques de prévention thérapeutique, fournir un moyen plus durable de lutter contre l'infection virale, " dit Ali.