Kommensale bakterier i den menneskelige tarm producerer forbindelser, der hæmmer SARS-CoV-2

Forskere fra Yonsei University i Sydkorea har fundet ud af, at visse kommensale bakterier, der findes i tarmene i mennesker, producerer forbindelser, der hæmmer SARS-CoV-2.

Forskningen vil blive præsenteret den 20. juni på World Microbe Forum, et onlinemøde i American Society for Microbiology (ASM), Federation of European Microbiological Societies (FEMS), og flere andre samfund, der finder sted online 20.-24. juni.

Tidligere kliniske fund har vist, at nogle patienter med moderat til svær COVID-19 har gastrointestinale symptomer, mens andre viste tegn på infektion udelukkende i lungerne.

"Vi spekulerede på, om tarmbebyggede bakterier kunne beskytte tarmen mod invasion af virussen, "sagde Mohammed Ali, en ph.d. studerende i medicin ved Yonsei University, Seoul, Sydkorea.

For at undersøge denne hypotese, forskerne screenede dominerende bakterier, der beboer tarmen for aktivitet mod SARS-CoV-2. Deres søgning afslørede, at Bifidobacteria, som tidligere har vist sig at undertrykke andre bakterier som H. pylori og har vist sig at være aktive mod irritabel tarmsyndrom, havde sådan aktivitet, sagde Ali.

Efterforskerne brugte også maskinlæring til at søge efter potentielle sygdomsbekæmpende forbindelser i databaser indeholdende mikrobielt producerede molekyler, opdager nogle, der også kan vise sig nyttige mod SARS-CoV-2.

For at træne vores model udnyttede vi tidligere coronavirus -datasæt, hvor flere forbindelser blev testet mod mål fra coronavirus. Denne tilgang synes at være vigtig, da disse mål deler funktioner til fælles med SARS-CoV-2 . "

Mohammed Ali, Ph.d. -studerende i medicin, Yonsei Universitet

Ali understregede den økologiske karakter af sin tilgang til dette arbejde, observerer, at mange eksisterende antibiotika og kræftbehandlinger er forbindelser, som bakterier bruger til at konkurrere med hinanden i mave -tarmkanalen, og at disse oprindeligt blev oprenset fra mikrobielle sekret.

"At finde mikrober, der udskiller anti-coronavirus-molekyler, vil være en lovende metode til at udvikle naturlige eller konstruerede probiotika til at udvide vores terapeutiske forebyggelsesteknikker, at levere en mere bæredygtig måde at bekæmpe virusinfektionen på, "sagde Ali.

• Ny forskning identificerer en forbindelse mellem tarmmikrobiomet og slagtilfælde
• Undersøgelse baner vej for udvikling af nye terapier til C. difficile infektion