Entdecken mënschlech Geschicht vum Mo. Bakterien

mënschlech Geschicht Entdecken vu Moo Bakterien VerfÜgung méiglech VerfÜgung leschten Analyse vum Mënsch pathogens hunn verroden dass hire vergläicht mat der congruent sinn mat der Hypothes Muster vum antike a modern mënschlech Bevëlkerung Migratiounen. Phylogenetic Beem vun analyséieren vun der Bakterie Helicobacter pylori VerfÜgung an der polyoma JC Virus aus geografesch verschiddenste Gruppen Mënschenhandel geholl vergläichen enk mat Ëmgang vun de Populatiounen an deem si fonnt ginn. VerfÜgung Charles Darwin ugeholl datt d'Verdeelung a Form vun Parasiten war evolutionarily bedeitend. Hien bemierken, zum Beispill, datt "... de Pediculi [opzeféieren] zu verschiddene Länner aus de verschiddene Meeschterschafte vun Mann gesammelt ... ënnerscheeden, an net nëmmen am Faarf, mä zu der Struktur vun hirem doud an fofzeng. An all Fall am déi vill ugedait kritt waren d'Differenzen konstant "goufen [1]. Méi kuerzem, hunn e puer Fuerschung Gruppen [2-7] interessant kennenzeléieren tëscht dem Entwécklungsstadium Relatiounen tëscht verschiddene bakteriell an Haren analyséieren vun de Mënschen an der Muster vun Migratiounen vun modern Mënschen uechter d'Welt. VerfÜgung A besonnesch interessant Fall Fotografen fonnt ass, datt vun Helicobacter pylori VerfÜgung, engem Gramm-negativ Bakterie verbonne mat gastritis, peptic ulcers, an gastric Kriibs datt zu Halschent vun all Mënsch globalen an kann [8]. D'Entdeckung, datt eng bakteriell Wonn un wat sech als chronesch Krankheeten [8] war e markant Beispill vun der Tatsaach Féierung konnt dat ustiechend Krankheeten hunn nach net eruewert gouf. Déi weider Qualifikatiounen immun hunn Syndrom (AIDS) Aids, outbreaks vun Ebola am Central Afrika, an der aktueller Verbreedung vun West Nil Virus an den USA a vun schwéieren Fouss Otmungsproblemer Syndrom (Technik) aus Asien déi geléinte vun der pervasiveness a gesondheetlech Konsequenzen vun ustiechend Agenten och am Alter vun Impfpass an antimicrobial an antiviral Therapien. Vill ustiechend Krankheeten sinn Gedanken ze hunn soll mat der Entwécklung vun der Landwirtschaft an de Fëllement vun urbane Kritiken. Wann, amplaz, si vill pathogens 'Relatiounen mat Mënschen vill méi al, wär et net aussergewéinlech sinn ze déif verännert Associatiounen tëscht de Mënschen an hirer microbial an Haren Eruewerer fannen. VerfÜgung D'verännert Geschicht vum H. pylori VerfÜgung Beispill déi vläicht vun der coevolution vun enger Bakterie a seng eenzeg bekannt Provider. Den H. pylori VerfÜgung Nepgen ass relativ kleng bei 1,67 megabases, mat engem Minimum vu komplementar vun metabolic Genen [9]. Variant tëscht H. pylori VerfÜgung isolates vu verschiddene Leit oder souguer aus eng Persoun ass grouss, flénke eenzegaarteg Fangerofdréck fir bal all isoléieren sou wäit Mondial. D'coding Genen sinn net ganz verschidden, awer: Meeschter vun der Variant existeiert am drëtte huel Positioun am codons oder duerch inversions oder translo-signéieren, déi encoded Aminosaier-Seier Message relativ ähnlech verloosse [2]. Dëst Aminosaier-Seier Haaptrei Conservatioun ass fir Impfungen Fuerschung Chance, wéi een Impfstoff ass wahrscheinlech op vill analyséieren effikass ze sinn. Méi interessant de Fait ass, datt H. pylori VerfÜgung eng extrem héich Taux vun recombination huet, méi héich an Tatsaach wéi déi vun engem aneren ze Datum charakteriséiert Gebeitechnik [3, 10]. VerfÜgung Normalerweis, esou en héijen Taux vun recombination géif maachen eng Gebeitechnik d'verännert Geschicht ganz schwiereg, well Informatiounen iwwer d'Origine vun all stattfannen inferring verluer gin wier wéi et an engem Bevëlkerung a. Mä zesummen mat de Modus vun Transmissioun vun H. pylori VerfÜgung, dat extrem héijen Taux vun recombination eigentlech kann verännert inferences méi einfach maachen. Rei vu Studien, proposéiere staark dass H. pylori VerfÜgung normalerweis innerhalb Famillen ugekënnegt ass, meeschtens aus Mamm ze Kand [11, 12]. Sou, d'Transmissioun vun H. pylori VerfÜgung zu puer Manéieren mimics déi vun maternally iwwerdroen Kënschtlech DNA [13]. Well Kënschtlech DNA Alleng aus een Elterendeel iwwerdroen ass (d'Mamm) an recombine net, ass et derwäert eng ideal genetesch System fir inferring Mënsch verännert Geschicht (kuckt hei ënnendrënner) [14, 15] gin. Wann H. pylori VerfÜgung ass jo virun allem maternally iwwerdroen, gëtt neien analyséieren generell net eng Persoun während hir Liewensdauer globalen; mengen dat géif zesumme mat den héijen Taux vun recombination, datt d'Projet'en datt bannent der Bevëlkerung vu Bakterien an individuell de Mo. cumuléiert gëtt relativ eenheetleche ginn. Dat soll an enger Plaaz komm sin vun analyséieren Resultat, dass zu all aner ganz enk Zesummenhang sinn, vill vun de Projet'en wouvun déi an eenzelne Bakterien Priedegt hunn. Verbuchen an verschidden Leit fonnt gëtt also méi anescht aus all aner wéi wann et manner recombination. VerfÜgung meescht ustiechend Krankheeten séier an der ganzer Welt verbreet an analyséieren aus verschiddene Regioune sinn relativ ähnlech, mä éischter probéieren vum H. pylori VerfÜgung aus Leit aus verschiddene Regioune vun der Welt réischt zimlech staark geographescher Raumopdeelung an europäesch an asiatesch H. pylori VerfÜgung Zorte [2-4]. Kuerzem, Falush a Kollegen [5] hunn dëst Raumopdeelung zu gréissere Detail iwwerpréift. No sequencing aacht Genen - insgesamt 3.850 nucleotides - vun 370 vu 27 Mënsch Populatiounsschichte ofgeleet analyséieren, hunn si 1.418 polymorphic Nukleotid Positiounen. Si applizéiert dann eng nei Drëttubidder Outil, Struktur [16], déi entwéckelt gouf Mënsch genetesch Struktur aus multilocus genotype Daten ze soen. De Programm benotzt Bayesian Methoden subgroups mat charakteristeschen allele Ofstänn ze identifizéieren, an Stärekéip vun der subgroups, esouguer an der Präsenz vun recombination [16]. Wann dës Technik un d'H. pylori VerfÜgung Message applizéiert gouf, huet véier Haaptgrënn Stärekéip fonnt - zwee aus Afrika an een all aus Europa an Asien (Dorënner 1a) [5]. Figur 1 D'Bezéiungen tëscht Mënsch Populatiounen, wéi aus H. pylori berechent VerfÜgung zu Mamm a vum Kënschtlech DNA Daten fonnt. (En) Relatioun tëscht modern subpopulations vun H. pylori VerfÜgung [5]. All subpopulation ass vun engem Krees mat engem Duerchmiesser proportional zu der genetesch Diversitéit an et vertrueden. D'Zentren vun de Kreeser gi vun engem phylogenetic Bam weist d'Relatiounen tëscht de véier subpopulations waren. Bakterien an all subpopulation sinn virun allem an de Leit fonnt, déi aus der Regioun stamen gewisen. (B) A Bevëlkerung-Niveau phylogenetic Bam vun der geographescher subpopulations VerfÜgung H. pylori dës Distanz an (e). (C) A Steiren-Bäitrëtt Reseau vu mënschlechen Populatiounen aus Kënschtlech DNA ofgeleet [14]. Esou engem Réseau weist alternative Potential verännert Relatiounen tëscht Stärekéip. All Krees duerstellt engem Koup vun Kënschtlech Typen mat engem Duerchmiesser proportional zu der Frequenz vun deem Typ an der subpopulations. All Net-afrikanesch Populatiounsschichte ginn vun engem afrikanesche antike ofgeleet; de Reseau vu Relatioune bannent dëser antike ass (uewen) hues. (En, b) Un aus [5]; (C) ugepasst aus [14] zu All Stärekoup vun Falush a Kollegen fonnt [5] an subgroups ënnerdeelt ginn hätt. zum Beispill, kéint de "Afrika 1 'Stärekoup weider an West an South African subclusters ënnerdeelt ginn, an den Osten Asien Stärekoup an Osten asiatesch, Amerind, a Maori subclusters opgespléckt ginn hätt. Der geographescher Raumopdeelung am 200 europäesch analyséieren war besonnesch schwiereg, viraussiichtlech well villen Gruppen hunn zréck an hir geheit an Europa an den leschten puer millennia Ferrara. Europäesch analyséieren och an der vergiessen, Australien heiansdo wossten, an ënnert Südafrika, viraussiichtlech Kolonial Eruewerungen bidden. VerfÜgung D'phylogenetic Relatiounen vun dëse Stärekoup (Dorënner 1b) an hir Ënnerdelungen [5] weisen op engem Muster gläicht, datt dèi mat Kënschtlech DNA Variant (Dorënner 1c) [14, 15]. D'modern Mënsch Gentherapie Pool, wéi aus Kënschtlech DNA opgrond an duerch Y chromosome Studien corroborated, geduecht ass ongeféier 150,000-200,000 Joer eng afrikanesch Originen ze hunn [14, 15, 17, 18]. D'Original mënschlech Bevëlkerung da verbreet an an Afrika fir bal 100.000 Joer diversifizéiert, ier an Western Asien an Europa ausbreet, an an dem Süden an Osten Asien virun ongeféier 50,000-60,000 Joer, an deene Regiounen déi bestehend archaiescher Populatiounen vun de Mënschen ze ersetzen. Kierzunge Migratiounen verbreet an Presidenten vun 40.000 Joer, dunn un de Pazifik Islands, a spéider an Nordamerika, ongeféier 15.000 Joer (Dorënner 2) [14, 15, 17, 18]. Déi bemierkenswäert Ähnlechkeet tëschent dëser Vue vun der Mënschheet an d'Resultater vu Studien vun H. pylori VerfÜgung gefouert Falush a Kollegen [5] wéi och anerer [2] ze schléissen, datt H. pylori VerfÜgung Evolutioun de Wee gefollegt huet vum moderne Mënsch Expansioun a Migratioun. Dës Aarbecht gëtt also aner Zort vun Daten fir Analyse vun mënschlech Entwécklung a Migratioun, onofhängeg vun Kënschtlech DNA an Y chromosomes, datt an weider Studien wäertvoll ginn. Leider awer, staamt aus H. pylori VerfÜgung de Féiss estimating ass besonnesch schwéier, fir déi extrem héich Taux vun recombination Wéint [10]. Zousätzlech probéieren an analytesch Techniken kann de Opbau Hypothes fir weider Test gefrot ginn. Figur 2 Eng Plang vun der Muster vum Ausbau a Migratioun vun modern Mënschen uechter d'Welt, ofgeleet vu Studien vun Kënschtlech DNA an Y chromosomes [14, 15, 17, 18]. Zuelen déi geschätzte Zäit (am Joer virun de Moment) wann modern Mënschen, déi éischt an der uginn Regioun wossten. VerfÜgung Aner pathogens hunn och vergläicht mat der ze verfollegen gläicht hir Gäscht proposéiert ginn. Ee vun de stäerkste interessant Beispiller, obwuel mat engem Net-Mënsch Gaaschtland ass, datt vu Blatlais, eng Bakterie am se fonnt, an zwee mat de Bakterie verbonne plasmids. Funk et al. VerfÜgung [19] fonnt, datt d'opgrond intraspecifrc phylogenies vun deene véier genomes komplett congruent goufen. Zréckgoen zu Mënsch pathogens, kann de Mënsch polyomavirus JC Virus (JCV) an genotypes ënnerdeelt ginn, datt op déi grouss Kontinent Land Sonnemassen sëlwecht [6]. Wéi H. pylori VerfÜgung, JCV - déi progressiv multifocal leukoencephalopathy (Verloscht vun myelination an der Mëtt nervös System) féieren kann - ass ganz verbreet am Beraich Mënschen als Resultat vun familial Transmissioun. Eng total vun 12 bekannt bestemmt definéiert, mat europäeschen, afrikanesch, an asiatesch distributions [7]. Obschonn direkt inferences vun engem afrikanesche Urspronk fir JCV problematesch sinn, well et keng ugepasste sehbehënnert ass mat deem d'phylogenetic Bam zu root, wann eng afrikanesch Originen gemengt ass, kann eng räsonnabel verännert Geschicht Hypothes ginn (Dorënner 3) [7]. Als mat H. pylori VerfÜgung, Datumen molekulare Féiss inferring ass am Moment Problemer fir JCV. Weider Enquête an déi verännert Geschicht vun dëse Mënsch pathogens ass dofir néideg. Figur 3 hir Hëllef ze froen vun der Mënschheet polyoma JC Virus (JCV) zu Mënschen aus verschiddenen Deeler vun der Welt fonnt bestemmt [7]. Bréiwer kuckt eenzelne bestemmt. (En) D'Hypothes Muster vun Verbreedung vun JCV bestemmt duerch d'Welt (ausser de vergiessen); (B) en opgrond Phylogenes vun JCV bestemmt, eng afrikanesch Originen fir de Virus unzehuelen. Ugepasst aus [7]. VerfÜgung d'Musteren vun Evolutioun vum Mënsch pathogens Elucidating schlussendlech déi kënnen zousätzlech Beweiser, net nëmmen iwwer hir Geschicht, mä och ëm de Mënsch Evolutioun an der Geschicht. Dat wäert virun allem wouer fir pathogens wéi H. pylori VerfÜgung dass e virun allem Mamm-Kand Modus vun Transmissioun hunn, Kënschtlech DNA Evolutioun Wäerr. H. pylori VerfÜgung senger causative Roll am puer chronescher Mo. Konditiounen ass just een vun villen aktuell Beispiller vun de bekannte oder verdächtegt Roll vun enger ustiechend Agent fir chronesch Krankheeten Haaptfiguren. Bakterien si verdächtegt an der Entwécklung vun arteriosclerosis, Schlag, an Crohn d'Krankheet Équipe gin, hierkommen Viren bekannt ginn zu AIDS an déi verschidde Forme vu chronescher hepatitis ze bréngen. Cervical Kriibs, hepatocellular carcinoma, Burkitt d'lymphoma, Kaposi d'sarcoma, a vläicht Zockerkrank zockerkrank sinn och entweder bekannt oder verdächtegt vun Haren Hierkonft ze ginn. Wann e puer vun de ganzen chronescher Krankheeten beweisen vun bakteriell oder Haren Urspronk, weltwäit Ëmfroen vun dësen pathogens zu Mënsch Populatiounsschichte ginn soll direkt duerchgefouert ginn, sou datt Wëssen iwwer d'Evolutioun an Diversitéit vun dësen pathogens kann an der Fuerschung Programmer Uerden ginn entworf ze gewinnt de Konditiounen, déi se féieren. VerfÜgung

• Verglach vu Planzen fir Haut an Mo. Problemer zu Trinidad an Tobago mat asiatësch ethnomedicine
• Identifikatioun vun der mënschlecher gastric cancer