Felfedezni az emberi történelem gyomor baktérium

Felfedezni az emberi történelem gyomor baktérium katalógusa Abstract katalógusa legfrissebb elemzése humán patogének azt mutatták, hogy azok evolúciós történettel kongruens a feltételezett minta az ősi és a modern emberi népességvándorlásra. Filogenetikai fák törzseinek a Helicobacter pylori baktérium katalógusa és a polióma JC vírus vett földrajzilag eltérő embercsoportok szorosan korrelál kapcsolatokat a populációk, ahol megtalálható.
Charles Darwin felismerte, hogy az elosztó és formája paraziták volt evolúciós jelentős. Azt is megjegyezte, hogy például "... a Pediculi [tetvek] összegyűjtött a különböző országokban a különböző versenyeken az ember ... különböznek, nem csak a szín, de a szerkezet a karom és a végtagokon. Minden esetben az amely számos példány kaptuk az eltérések, állandó "[1]. Újabban több kutatócsoport [2-7] találtam érdekes korrelációt evolúciós közötti kapcsolatokat a különböző bakteriális és vírusos törzsek házigazdája emberek és a minta a migráció a modern ember az egész világon.
Egy különösen érdekes eset az, hogy a Helicobacter pylori
, egy Gram-negatív baktérium társított gyomorhurut, gyomorfekély, és a gyomorrák, amelyek megfertőzhetik akár a fele minden ember [8]. A felfedezés, hogy a bakteriális fertőzés is vezethet, amit figyelembe vették a krónikus betegségek [8] volt példája annak, hogy a fertőző betegségek még nem sikerült legyőzni. A folytatódó szerzett immunhiányos tünetegyüttes (AIDS) járvány, járvány az Ebola Közép-Afrikában, és a jelenlegi elterjedése a nyugat-nílusi vírus az Egyesült Államokban és a súlyos akut légúti szindróma (SARS) Ázsiában bizonyítaniuk elterjedtsége és egészségi következményei fertőző ágensek korában is az oltás és az antimikrobiális és antivirális terápiát. Számos fertőző betegségek vélhetően merültek egyidejűleg a mezőgazdaság fejlődését és a növekvő városi élet. Ha ehelyett számos patogén "kapcsolatok az emberek sokkal idősebb, nem lenne meglepő, ha mélyebb evolúciós egyesületek emberek és a mikrobák és betolakodó vírusokat.
A evolúciótörténeti H. pylori katalógusa nyújthat példát a Koevolúció baktérium és az egyetlen ismert host. A H. pylori
genom viszonylag kicsi 1,67 megabázisában, minimális komplement metabolikus gének [9]. Változás a H. pylori katalógusa izolátumok különböző emberek, vagy akár egy ember nagy, ami egyedülálló ujjlenyomatok csaknem minden izolátum eddig beírt. A kódoló gének nem nagyon változatos, azonban: A legtöbb variáció előfordul a harmadik bázis pozíciót kodonok vagy inverziók vagy translo-kationok, így a kódolt aminosav-szekvenciák viszonylag hasonló [2]. Ez aminosav szekvencia megőrzése szerencsés vakcina kutatás, mint az egyik vakcina valószínűleg hatásos sok törzs. További érdekes az a tény, hogy a H. pylori
rendkívül magas aránya rekombináció, magasabb valójában, mint bármely más organizmus mai napig jellemzett [3, 10].
Általában egy ilyen magas aránya rekombináció tenné hogy következtetünk az organizmus evolúciós története nagyon nehéz, hiszen az információ eredetét egyes mutációk eltűnne szétterjed a lakosság. De párosulva az átviteli mód a H. pylori katalógusa, ez a rendkívül magas aránya rekombináció is tulajdonképpen, hogy az evolúciós következtetéseket könnyebb. Számos tanulmány azt sugallják, hogy a H. pylori katalógusa általában továbbítják a családon belül, általában az anya és gyermeke [11, 12]. Így az átviteli H. pylori katalógusa valamilyen módon utánozza az anyára továbbított mitokondriális DNS [13]. Mivel a mitokondriális DNS-t továbbítani kizárólag az egyik szülő (az anya), és nem rekombinálódnak bizonyult, hogy ideális genetikai rendszer vezethető le az emberi evolúciós történelem (lásd alább) [14, 15]. Ha H. pylori katalógusa valóban túlnyomórészt az anyára továbbítani, új törzsek általában nem fertőz egy személy élettartamuk során együtt a nagyarányú rekombináció, ez azt jelentené, hogy a mutációk, amelyek felhalmozódnak a populáción belül a baktériumok az egyén gyomor lesz viszonylag homogén. Ennek eredményeképpen egy raj törzsek, amelyek szorosan kapcsolódnak egymáshoz, amely számos, a mutációk, amelyek történtek egyes baktériumok. Raj megtalálható a különböző emberek így még eltér egymástól, mint ha volt kevesebb rekombináció.
Legtöbb fertőző betegségek gyorsan terjedt az egész világon, és törzsek különböző régiók viszonylag hasonló, de a kezdeti mintavétel a H. pylori katalógusa az emberek a különböző régiókban a világ feltárt meglehetősen erős földrajzi elkülönülését az európai és ázsiai H. pylori katalógusa típusú [2-4]. Nemrégiben Falush és munkatársai [5] megvizsgálta a particionálás részletesebben. Szekventálás után nyolc gének - összesen 3850 nukleotid - 370 törzsből származó 27 emberi populációkban, megtalálták 1418 polimorf nukleotid pozíciójában. Ezután alkalmazott új elemzési eszköz, SZERKEZET [16], hogy alakult az a következtetés, az emberi genetikai szerkezet multilokusz genotípus adatokat. A program Bayes módszerek azonosítására alcsoportok jellegzetes allél frekvenciákat, és klaszterek az alcsoportok, még a jelenlétében rekombináció [16]. Ha ezt a technikát alkalmazták a H. pylori katalógusa szekvenciák, négy fő csoportot találtak - két afrikai és egy-egy Európa és Ázsia (1a ábra) [5]. 1. ábra A kapcsolatok között az emberi populációkban, mint számítva H. pylori
talált gyomor és a mitokondriális DNS-adatok. (A) közötti kapcsolatok modern részpopulációinak H. pylori katalógusa [5]. Minden szubpopuláció képviseli egy kör átmérője arányos a genetikai sokféleséget is. A központok a körök csatlakozott egy filogenetikai fa mutatja a kapcsolatot a négy alcsoportokban. Baktériumok minden szubpopuláció találhatók elsősorban az emberek, akik származnak jelzett régiók. (B) A népesség-szintű filogenetikai fa a H. pylori katalógusa földrajzi populációk látható (a). (C) A medián-joining hálózat az emberi populációk származó mitokondriális DNS [14]. Egy ilyen hálózat látható másik potenciális evolúciós kapcsolatot a klaszterek közötti. Minden kör képviseli a klaszter mitokondriális típusú átmérőjű arányos a frekvencia az adott típus a populációk. Minden nem-afrikai populációk származik egy afrikai származása; A hálózati kapcsolatok ezen belül leszármazás nagyítva (felső). (A, b), amely alkalmas az [5]; (C) átvéve [14]. Katalógusa Minden klaszter által talált Falush és munkatársai [5] lehetne alcsoportokra oszlik; például az "Afrika 1 klaszter lehetett osztani tovább nyugat és dél-afrikai subclusters, és a kelet-ázsiai klaszter lehetne bontani a kelet-ázsiai, Amerind és maori subclusters. A földrajzi particionálás belül 200 európai törzsek különösen bonyolult, feltehetően azért, mert számos csoport söpörte hátra Európában az elmúlt évezredek. Európai törzsek is időnként megjelentek az amerikai kontinensen, Ausztráliában, és azok között a dél-afrikaiak, feltehetően tükrözi gyarmati hódítás.
A filogenetikai a klaszterek (1b ábra) és azok alegységei [5] mintát mutatnak hasonló alkalmazásával kapott mitokondriális DNS variáció (1c ábra) [14, 15]. A modern emberi génállomány, mint arra következtetni, mitokondriális DNS és alátámasztották Y kromoszóma vizsgálatok azt gondolták, hogy volt egy afrikai eredetű körülbelül 150,000-200,000 éve [14, 15, 17, 18]. Az eredeti emberi populáció majd elterjedt és változatos Afrikában közel 100.000 évvel, mielőtt bővülő nyugat-Ázsia és Európa a dél- és kelet-ázsiai körülbelül 50000-60000 évvel ezelőtt, felváltva a meglévő archaikus populációi emberek ezekben a régiókban. Későbbi vándorlások elterjedt Ausztráliában 40000 évvel ezelőtt, majd a csendes-óceáni szigeteken, majd később Észak-Amerikában, mintegy 15.000 évvel ezelőtt (2. ábra) [14, 15, 17, 18]. A figyelemre méltó közötti hasonlóság ezt a nézetet az emberi történelem és az elvégzett vizsgálatok eredményei a H. pylori katalógusa vezettek Falush és munkatársai [5], valamint a többiek [2] állapította meg, hogy a H. pylori katalógusa evolúció ösvényén a modern emberi terjeszkedés és a migráció. Ez a munka így biztosítja más típusú adatok elemzése az emberi evolúció és a migráció, független mitokondriális DNS és Y-kromoszómák, amelyek értékesek lesznek további vizsgálatok. Sajnos azonban becslésével divergencia nyúlik a H. pylori
különösen nehéz, köszönhetően a rendkívül magas aránya rekombináció [10]. További mintavételi és analitikai módszerek szükség lehet további vizsgálatot a vándorló hipotézist. 2. ábra A térkép a minta a tágulási és migrációjának modern emberek az egész világon, származó tanulmányok A mitokondriális DNS-t és Y-kromoszómák [14, 15, 17, 18]. A számok hozzávetőleges idő (években, mielőtt a jelen), amikor a modern emberek először a megjelölt régióban. Katalógusa Más kórokozók is javasoltak, hogy kövesse evolúciós történettel hasonló a házigazdák. Az egyik legérdekesebb példa, bár egy nem-humán gazda, az, hogy a levéltetvek, egy baktérium talált bennük, és két plazmid társított baktérium. Funk et al.
[19] megállapította, hogy a kikövetkeztetett intraspecifrc törzsfejlődésekre e négy genomok teljesen egybevágó. Visszatérve a humán patogének, az emberi polyomavírus JC vírus (JCV) osztható genotípusok, amelyek megfelelnek a legnagyobb kontinentális föld tömegek [6]. Mint a H. pylori katalógusa, JCV - amely okozhat progresszív multifokális leukoencephalopathia (elvesztése Myelinizáció a központi idegrendszer) - igen széles körben elterjedt az emberek között eredményeként familiáris átvitel. Összesen 12 ismert altípusa lett megadva, az európai, afrikai és ázsiai disztribúció [7]. Bár a közvetlen következtetések egy afrikai eredetű JCV problematikus, mert nincs megfelelő külső csoport, amellyel a root a filogenetikai fa, amikor egy afrikai eredetű feltételezzük, ésszerű evolúciós történelem feltételezhetjük (3. ábra). [7] Mint H. pylori katalógusa, levezetése molekuláris divergencia nyúlik jelenleg problémás JCV. További vizsgálatok szükségesek az evolúciós történelem ezen emberi kórokozók Ezért szükséges. 3. ábra Relationships of humán polióma a JC vírus (JCV) altípusok emberekben található különböző részein a világ [7]. Levelek utalnak egyes altípusok. (A) A feltételezték mintázata terjedésének JCV altípusai a világban (kivéve az amerikai); (B) származtatott fejlődéstörténetét JCV altípusok, feltételezve egy afrikai eredetű vírus. Átvéve [7].
Tisztázásához minták az evolúció az emberi kórokozók végül további bizonyítékot nem csak a történelem, hanem az emberi evolúció és a történelem. Ez különösen igaz a kórokozókat, mint a H. pylori katalógusa, amelyek túlnyomórészt az anya-gyermek átviteli mód, utánozva a mitokondriális DNS evolúció. H. pylori katalógusa 's oki szerepét számos krónikus gyomorbetegségek csak egy a sok példa arról az ismert vagy feltételezett szerepét egy fertőző ágens, ami krónikus betegségek. Baktériumok jelenlétének gyanúja, hogy részt vesz a fejlesztés érelmeszesedés, stroke, és a Crohn-betegség, míg a vírusok ismert, hogy vezet az AIDS és a különböző formái a krónikus hepatitis. Méhnyakrák, hepatocelluláris karcinóma, Burkitt-limfóma, Kaposi-szarkóma, és talán a diabetes mellitus szintén vagy ismert vagy feltételezett, hogy a vírusos eredetű. Ha néhány mindennapok krónikus betegségek bizonyulnak bakteriális vagy vírusos eredetű, világszerte felmérések ezen kórokozók emberi populációkban kell végezni azonnal, hogy ismeretek fejlődése és sokfélesége E kórokozók lehet építeni a kutatási programokat, amelyek célja, hogy enyhítheti a körülmények okoznak. katalógusa

• Összehasonlítása növények használt bőr és gyomor problémák Trinidad és Tobago ázsiai ethnomedicine
• Azonosítása DNS metiláció változások kapcsolódó emberi gyomor cancer