A tanulmány a vékonybélszövet gyulladt és nem gyulladt Crohn -betegség elváltozásainak biopsziás mintáit elemezte, amint eltávolították a betegekből. A kutatók egysejtes RNS szekvenálást és CyTOF technológiát használtak, hogy valós időben, egysejtes szinten vizsgálják a bél elváltozásait, az immunsejtek és a keringő vérsejtek azonosítása és kölcsönhatásuk a lézióban és annak környékén, és az elváltozásban több ezer sejtből álló táj feltérképezése.
Az elemzés pontos sejttípusokat talált, korábban nem azonosították, amely korrelál a beteg Crohn -betegség standard terápiájával szembeni rezisztenciájával, TNF-gátlónak nevezett gyulladáscsökkentő gyógyszer. A TNF -gátló a fő szer közepes vagy súlyos Crohn -betegségben szenvedő betegeknek, de az inhibitort szedő betegek körülbelül 40 százaléka végül nem reagál rá, vagy rosszabbodik a Crohn -betegsége.
Az egysejtes profilozás megváltoztathatja a gyógyszerek felfedezését. Valójában sokkal világosabb lesz számunkra a gyulladásos bélbetegségekről, és arról, hogy miért ellenállnak a betegek, és mi mást célozhatnánk meg. "
Társszerző szerző, Miriam Merad, Orvos, PhD, A Precíziós Immunológiai Intézet igazgatója, a Sinai -hegyi Icahn Orvostudományi Iskolában, A Sínai -hegy professzora a rákimmunológiában, A Tisch Rákintézet Rákimmunológiai Programjának társigazgatója és a Sínai-hegyi Emberi Immunfigyelő Központ igazgatója
Az aláírás birtokában azonosítani kell azokat a betegeket, akiknek nem sikerül az inhibitor alkalmazása, segít elkerülni a műtétet és a szövődményeket. E tanulmány eredményei alapján, A kutatók már kifejlesztettek egy klinikai vizsgálatot, amely azt vizsgálja, hogy lehetséges -e megtalálni az aláírást egy vérvizsgálat során, amikor a betegnél gyulladásos bélbetegséget diagnosztizálnak. Ha igen, az orvosok elkerülhetik a TNF -gátló használatát, és ehelyett más biológiai szereket használhatnak, amelyek az adott beteg számára működnek.
"Ezt a tanulmányt úgy terveztük, hogy soha nem látott pontossággal határozzuk meg a gyulladást immunológia és számítási biológia segítségével, hogy jobban megértsük ezt a betegséget, - mondta Judy H. Cho társszerző, Orvos, A precíziós orvostudomány dékánja, A Charles Bronfman Személyre szabott Orvostudományi Intézet igazgatója, Ward-Coleman, a transzlációs genetika professzora, és az orvostudomány professzora, valamint a genetika és a genomtudományok, az Icahn Orvostudományi Egyetemen. "Ezek az eredmények hangsúlyozzák a jelenlegi diagnosztikai vizsgálatok korlátait és az egysejtes térképezési eszközökben rejlő lehetőségeket az új biomarkerek azonosítására a kezelésre adott válasz és a személyre szabott terápiás lehetőségek tekintetében."
Ez a tanulmány négy betegcsoportot vizsgált, és az egyik csoport egysejtes elemzését használta az aláírás azonosítására. A kutatók ezután az egysejtes elemzésből származó adatokat több, nagy adathalmazok, amelyek a másik három betegcsoportból álltak, akiknek a szöveteit elemezték, és akiknek a TNF -gátló eredményei ismertek voltak. Egy algoritmus és számítási biológia segítségével, a kutatók megerősítették az egysejtű szekvencia eredményeiből származó aláírást a többszörösben, független csoportok ismert kezelési eredményekkel.
"Tanulmányunk azt mutatja, hogy azok a megközelítések, amelyek kombinálják a gyulladásos elváltozások nagy felbontású egysejtes feltérképezését kis számú betegben, nagy tömeges RNS-szekvenálással nagy csoportokban, kiterjedt klinikai jellemzéssel, általánosítható betekintést eredményeznek, kiemelve annak lehetőségét, hogy széles körben átalakuljon az emberi multifaktoriális immun-közvetített gyulladásos betegségek megértése, -mondta a társszerző, Ephraim Kenigsberg, PhD, Az Icahn Adattudományi és Genomtechnológiai Intézet genetikai és genomtudományi adjunktusa. Az első szerző Jerome C. Martin, PharmD, PhD, a Sinaj -hegyi Icahn Orvostudományi Iskola Precision Immunológiai Intézetének posztdoktori munkatársa, szintén nagy szerepet játszott ebben a kutatásban.