Tutkimuksessa analysoitiin biopsianäytteitä tulehtuneista ja tulehtumattomista Crohnin taudin leesioista ohutsuolen kudoksessa heti, kun se poistettiin potilailta. Tutkijat käyttivät yksisoluista RNA-sekvensointia ja CyTOF-tekniikkaa tutkiakseen suoliston vaurioita reaaliajassa yhdellä solutasolla, tunnistetaan immuunisolut ja kiertävät verisolut ja niiden vuorovaikutus vauriossa ja sen ympärillä, ja kartoitetaan vaurion tuhansien solujen maisema.
Analyysi löysi allekirjoituksen tarkista solutyypeistä, ei ole aiemmin tunnistettu, joka korreloi potilaan vastustuskyvyn kanssa Crohnin taudin tavanomaiseen hoitoon, tulehduskipulääke, jota kutsutaan TNF-estäjäksi. TNF -estäjä on tärkein lääke, jota annetaan potilaille, joilla on kohtalainen tai vaikea Crohnin tauti, mutta noin 40 prosenttia potilaista, jotka käyttävät estäjää, eivät joko reagoi siihen tai Crohnin tauti pahenee.
Yksisoluinen profilointi voi muuttaa lääkkeiden löytämisen. Se todella antaa meille paljon enemmän selvyyttä tulehduksellisesta suolistosairaudesta ja siitä, miksi potilaat vastustavat ja mihin muuhun voimme kohdistaa. "
Kirjailija Miriam Merad, MD, PhD, Johtaja Precision Immunology Institute, Icahn School of Medicine Mount Sinai, Mount Sinai, syövän immunologian professori, Syöpäimmunologiaohjelman apulaisjohtaja Tischin syöpäinstituutissa ja Mount Sinai Human Immune Monitoring Centerin johtaja
Allekirjoituksen saaminen potilaiden tunnistamiseksi, jotka eivät tehoa estäjään, auttaa leikkauksen ja komplikaatioiden välttämisessä. Tämän tutkimuksen tulosten perusteella tutkijat ovat jo kehittäneet kliinisen tutkimuksen, jossa testataan, onko mahdollista löytää allekirjoitus verikokeesta, kun potilaalla todetaan tulehduksellinen suolistosairaus. Jos niin, lääkärit voisivat välttää TNF -estäjän käyttöä ja käyttää sen sijaan muita biologisia lääkkeitä, jotka toimivat kyseiselle potilaalle.
"Suunnittelimme tämän tutkimuksen tavalla, joka määrittelee tulehduksen ennennäkemättömällä tarkkuudella käyttämällä immunologiaa ja laskennallista biologiaa saadaksemme paremman käsityksen tästä taudista, "sanoi vastaava kirjailija Judy H. Cho, MD, Tarkkuuslääketieteen vanhempi apulaisdekaani, Charles Bronfmanin henkilökohtaisen lääketieteen instituutin johtaja, Ward-Coleman Käännösgenetiikan professori, ja lääketieteen professori, ja genetiikka ja genomitieteet, Icahnin lääketieteen koulussa. "Nämä tulokset korostavat nykyisten diagnostisten määritysten rajoituksia ja mahdollisuutta yksittäisten solujen kartoitusvälineisiin uusien biomarkkereiden tunnistamiseksi hoitovasteeseen ja räätälöityihin terapeuttisiin mahdollisuuksiin."
Tässä tutkimuksessa tarkasteltiin neljää potilasryhmää ja käytettiin yhden ryhmän yksisoluista analyysiä allekirjoituksen tunnistamiseksi. Tämän jälkeen tutkijat peittivät yksisoluisen analyysin tiedot useisiin, suuret tietojoukot, jotka koostuivat muista kolmesta potilasryhmästä, joiden kudokset oli analysoitu ja joiden tulokset TNF -estäjän kanssa olivat tiedossa. Käyttämällä algoritmia ja laskennallista biologiaa, tutkijat vahvistivat yksisoluisen sekvenssin tuloksista tunnistetun allekirjoituksen useissa, riippumattomia ryhmiä, joilla on tunnettuja hoitotuloksia.
"Tutkimuksemme osoittaa, että lähestymistavat, joissa yhdistetään tulehduksellisten leesioiden korkean resoluution kartoitus pienillä potilailla, joilla on joukko-RNA-sekvensointi suurissa kohorteissa, joilla on laaja kliininen karakterisointi, johtavat yleistettäviin näkemyksiin, korostamalla mahdollisuuksia muuttaa laajasti ymmärrystä ihmisen monitoimisista immuunivälitteisistä tulehdussairauksista, "sanoi vastaava kirjoittaja Ephraim Kenigsberg, PhD, Genetiikan ja genomitieteiden apulaisprofessori Icahnin tietotieteen ja genomitekniikan instituutissa. Ensimmäinen kirjoittaja Jerome C.Martin, PharmD, PhD, tutkijatohtori Precision Immunology Institute -instituutissa Icahnin lääketieteellisessä koulussa Siinailla, oli myös tärkeä rooli tässä tutkimuksessa.