Alpha Tauri 3D grafika | Shutterstock
A tanulmány azt is javasolta, hogy hasonló megközelítés alkalmazható étrendünk állati és gombás összetevőinek meghatározására.
A DNS -vonalkód egy olyan technika, amely rövid DNS -szekvenciákat használ a szervezet fajának gyors azonosítására. A föld körül, a tudósok együttműködtek annak érdekében, hogy minden élőlény DNS -vonalkódját lekérjék.
A DNS metabarcoding egy speciális vonalkód, amely több szervezetet tartalmazó mintákra is alkalmazható. Ugyanazokat a referencia -adatbázisokat használja, mint a vonalkód, de lehetővé teszi a vegyes mintákból származó taxonok azonosítását nagy teljesítményű szekvenálási módszerekkel. A technika lehetőségei kiterjedtek, ezzel gyakorlatilag bármely mintában meghatározható a fajösszetétel.
A jelenlegi tanulmány, amely nemrég jelent meg a folyóiratban mSystems , kimutatták, hogy az emberi székletmintákban lévő étrendi növényi DNS -t amplifikálni és szekvenálni lehet a vadon élő állatok vizsgálatában általánosan alkalmazott technikákkal.
"A DNS -szekvenálás nagy mennyiségű új adatot adott nekünk olyan dolgokról, mint a bél mikrobiológiája és a személyes genetika. Ez a tanulmány azt sugallja, hogy ugyanez az erőteljes technológia mesélhet arról is, hogy mit eszünk, amit gyakran nehéz mérni.
Vezető szerző Lawrence David, a Duke Genomikai és Számítási Biológiai Központból
Sok technikát már használnak a táplálékbevitel felmérésére, de legtöbbjük attól függ, hogy az emberek önállóan számolnak be arról, hogy mit ettek. Ez az adatgyűjtési módszer a memória hibáitól és a jelentések elfogultságától függ, valamint attól függ, hogy egy személy kognitív képességgel válaszol-e a felmérésekre.
A DNS metakódolásával, a tudósok felerősíthetik a székletmintában lévő DNS -t, és referencia -adatbázis segítségével leképezhetik a szekvenciákat az élelmiszerekre.
"Úgy gondolok a DNS metabarkódolására, mint egy szupermarket vonalkódjára. Egy adott DNS -szekvenciát úgy tekinthetünk, mint egy egyedi azonosítót egy adott élelmiszerfajra, " mondja Brianna Petrone társszerző, szintén a Duke Egyetemről.
David és társszerzője, Aspen Reese a Harvard Egyetemről, felkérték a vizsgálat megkezdésére, miután találkoztak Rob Pringle ökológusokkal a Princetoni Egyetemről és Tyler Kartzinellel a Brown Egyetemen. Ezek a kutatók DNS metabarkódolással elemezték az afrikai szavanna növényevőinek összetett táplálékhálóit.
David és Reese azon tűnődött, vajon a módszer felhasználható -e az emberek tanulmányozására is.
Egyre több munka folyik a mikrobiom területén, ami azt jelzi, hogy bizonyos élelmiszerek valószínűleg megváltoztatják vagy alakítják a bélben lévő specifikus baktériumok szintjét, de gyakran nincsenek kísérő táplálkozási adataink a mikrobiológiai vizsgálatokhoz. "
Lawrence David
A tanulmányhoz, a kutatók kivették a DNS -t a hűtőházból, amelyet az egyik korábbi tanulmányukban használt székletből vontak ki.
"Pár éve történt egy tanulmányunk, amelyben élelmiszereket készítettünk a mikrobiom diéta beavatkozás résztvevői számára, és pontosan tudtuk, mit esznek egy adott héten, amikor összegyűjtötték a székletüket, " - mondja David.
Vonalkód -régiót szekvenáltak a kloroplasztisz DNS -ből 11 emberből vett mintákban, akik mind szabadon választott, mind ellenőrzött étrendet követtek.
Sikeresen amplifikálták a növényi DNS -t a minták körülbelül felében, amely 70% -ra nőtt, amikor kontrollált fogyasztó emberek mintáit vették, növényekben gazdag étrendet alkalmaztak.
A szekvenált DNS legtöbbje megfelel az emberek által széles körben fogyasztott emberi tápláléknak, beleértve a szemeket is, zöldségek és gyümölcsök.
"Átfogó, jó egyetértés volt a tanulmány résztvevői által vezetett naplókban szereplő élelmiszerek és a székletből szekvenált élelmiszerek között, " - mondja David. "Ha egy ételt beírtak az étrendbe, az idő mintegy 80% -ában, ezt a metabarkódolási megközelítést is megtaláltuk. "
A PCR -kudarc viszonylag magas aránya és az egyes növények szekvenciaszintű megkülönböztetésének képtelensége a jövőben javítanivalót hagy maga után.
Például, Fejes káposzta, brokkoli, A karalábé és a Brüsszel -csíra mind ugyanazon faj növényfajtái, és a kutatók nem tudtak különbséget tenni közöttük a kloroplasztisz DNS -szekvenciák használatával.
Az étrendben az egyetlen nem észlelhető élelmiszer volt a kávé, valószínűleg annak köszönhető, hogy a DNS megsérült vagy felhígult a pörkölés és a főzés során.
David arra számít, hogy a DNS -metabarkódolást a jövőbeni tanulmányokban fogják használni, valamint a korábbi tanulmányok étrend elemzéséhez.
Ehhez a tanulmányhoz hasonlóan El tudnám képzelni, hogy ezt az archivált DNS -hez szokták, hogy lássák, vannak -e mögöttes táplálkozási különbségek, amelyek megmagyarázhatják a vizsgálat során megfigyelhető mikrobiológiai mintákat. Előre menni, azt is el tudjuk képzelni, hogy ezt használják új mikrobiológiai vizsgálatok során, hogy azonosítsák a kapcsolatot bizonyos élelmiszerek és a bélbaktériumok között, valamint a tágabb táplálkozási tanulmányokban, a hagyományos étrend -értékelési technikák kiegészítéseként. "
Lawrence David
Az új számítási modellezési módszer megjósolja, hogy a bél mikrobái hogyan változnak az idő múlásával
Hogyan segítenek a gazdaszervezeti tényezők, például a tüdő mikrobiomája a SARS -CoV -2 fertőzésben?
A probiotikumok terápiás előnyöket kínálhatnak a biopoláris betegek számára
A gyermekek immunisak a SARS-CoV-2 fertőzésre
A fehérvérsejtek és szerepük az agyban
A genetikailag csípő bélbaktériumok csökkentik a vastagbélrák kockázatát az egerek tanulmányaiban
100 új gén felfedezése segíthet a pigmentációs betegségek kutatásában
A londoni Kings College és a Rotterdami Erasmus MC Egyetemi Orvosi Központ kutatói által vezetett új tanulmány 124 gént fedezett fel, amelyek kulcsszerepet játszanak az emberi haj színének meghatározá
Az étrendben lévő antioxidánsok növelhetik a bélrák kockázatát,
új tanulmányból kiderül Az élelmiszerekben található antioxidánsok egészségügyi előnyeit számos tudományos szakirodalom bizonyította. Most, egy új tanulmány azt mutatja, hogy a túl sok jó dolog nem bi
A császármetszéssel született nőknél nagyobb az elhízás és a cukorbetegség kockázata
Egy új tanulmány megjelent a nyílt hozzáférésű folyóiratban JAMA hálózat nyitva 2020 áprilisában azt sugallja, hogy a császármetszéssel született nőknél nagyobb a kockázata az elhízás, valamint a 2