Az enzim előkezelés nagyon pontos képet ad a bőrbaktériumokról

Célunk, hogy megtanuljuk a különféle bőrbaktériumok ilyen betegségekben betöltött szerepét. "

Dr. Köberle Martin, A Dermatoinfectology Laboratórium vezetője, Klinikum Rechts der Isar, a Müncheni Műszaki Egyetem (TUM)

A bőrgyógyászok korábbi erőfeszítései a mikrobiom részletes összetételének vizsgálatára akadályokat jelentettek. Az ok:Az agarlemezeken termesztett hagyományos kultúrákban nem minden baktérium virágzik és szaporodik egyformán jól. Ennek eredményeként néhány lassan növekvő faj teljesen figyelmen kívül hagyható. Az újabb genetikai elemzési módszerek hátránya, hogy nagy mennyiségű DNS -szekvenciát rögzítenek a bőrsejtekből és az elhalt baktériumok töredékeiből. Ez csökkenti az eredmények információs értékét.

A genetikai búza elválasztása a pelyvától

Dr. Köberle és a biológus, Dr. Yacine Amar, mind professzor Biedermann csapatának tagja a TUM Bőr- és Allergológiai Klinikáján és Poliklinikáján, nemzetközi módszerrel együttműködésben kidolgoztak egy módszert a nem célzott DNS-fajok eltávolítására, interdiszciplináris csapat. A benzonáz enzim különleges tulajdonságait használták. Elpusztítja azokat a nukleotidláncokat, amelyek öröklődő információkat hordoznak minden élőlényben, rövid töredékekre bontva azokat. Csak azok az élő baktériumok kerülhetik el az enzim pusztulását, amelyek DNS -ét külső sejtfal védi.

A benzonázt egy ideje használják, például a fehérjék tisztítására:Az enzimek minden idegen DNS- és RNS -fragmentumot felbontanak. Ezeket centrifugában lehet eltávolítani, hátrahagyva a fehérjéket. A bőrbaktériumok kiválasztása ugyanezen elv szerint működik:A bőrsejtekből vagy elhalt baktériumokból származó genetikai anyagot az enzim feldarabolja, majd elválaszthatja a mintától. A fennmaradó baktériumokat mechanikusan el lehet pusztítani, lehetővé téve a DNS tanulmányozását.

"Kísérleteink azt mutatták, ezzel a módszerrel, valóban teljes mértékben megszüntethetjük a nem célzott DNS-t, és kiválaszthatjuk a bőr mikrobiomját, "-mondja a projekt vezetője, Yacine Amar. A laboratóriumban kezdetben mesterséges mintákat tanulmányozott, amelyek emberi sejtek, valamint elhalt és élő baktériumok keverékét tartalmazták, és szigorú protokoll szerint hoztak létre, és benzonázzal előkezelték. nagyon pontos kép az ép baktériumok összetételéről, "mondja a kutató. A valódi bőr tamponok elemzése ugyanolyan sikeres volt:a mintákban nem találtak halott baktériumokból származó maradék DNS -t.

Dr. Köberle bízik abban, hogy ez a megközelítés a jövőbeni kutatásokban is kulcsszerepet játszik:"Az élő bőrbaktériumok enzim-alapú kiválasztása segíthet abban, hogy megtaláljuk a mikrobiális biomarkereket bizonyos bőrbetegségekre, és azonosítsuk azokat a baktériumokat, amelyek pozitív hatással vannak a betegség lefolyásáról. Talán egyszer felhasználják őket a kezelésekben. " A mikrobiomák elemzésének új módszerét már számos bőrbetegségekkel foglalkozó kohorsz -vizsgálatban alkalmazzák a TUM Klinikán és a Bőrgyógyászati ​​Poliklinikán.

• Az UC San Diego szennyvíz-felügyeleti rendszere lehetővé teszi a legtöbb COVID-19 eset korai felismerését
• A Sinai-hegy több mint 4 millió dollárt ítélt oda az anális rák szűrésének értékelésére magas kockázatú nőknél