Le gène bactérien découvert par l'équipe dans les sédiments fluviaux indiens ne ressemble à aucun gène connu de résistance aux antibiotiques. Mais lorsque le scientifique a comparé sa séquence d'ADN à des séquences d'ADN bactériennes déjà publiées, ils ont découvert qu'il était déjà présent dans plusieurs agents pathogènes, dont Salmonella et Pseudomonas, des Etats-Unis, Chine et Italie. Jusqu'à maintenant, personne n'avait réalisé qu'il s'agissait d'un gène de résistance.
L'équipe de recherche a nommé le gène gar car il offre une résistance aux antibiotiques aminosides qui portent un groupe garosamine. C'est le cas du dernier médicament aminoside, plazomycine, développé pour contourner la plupart des mécanismes de résistance aux aminosides existants.
Professeur Joakim Larsson, auteur principal de l'étude et directeur du Centre de recherche sur la résistance aux antibiotiques de l'Université de Göteborg, Suède, commentaires sur le résultat :
- C'est une bonne nouvelle que le gène gar semble encore assez rare, mais comme il se répand, cela compliquera probablement davantage le traitement de bactéries déjà multirésistantes. Pseudomonas aeruginosa , par exemple, est une cause fréquente de pneumonie nosocomiale. Pouvoir traiter les infections pulmonaires bactériennes secondaires est quelque chose qui nous inquiète particulièrement ces jours-ci alors que le monde est touché par la pandémie de covid-19.
Plutôt que d'étudier des isolats bactériens de patients, les chercheurs ont recherché de nouveaux gènes de résistance dans les rivières touchées par les eaux usées en Inde, un pays déjà aux prises avec une résistance croissante aux antibiotiques. L'approche des scientifiques consistant à étudier des échantillons environnementaux s'est avérée être un moyen efficace de découvrir des gènes de résistance qui, jusque là, ne sont portés que par quelques personnes.
- La découverte précoce de gènes de résistance peut nous aider à gérer leur propagation, faciliter les diagnostics basés sur les gènes et peut-être aussi guider l'industrie pour développer des médicaments qui peuvent contourner la résistance, dit Joakim Larsson.
Autour du monde, entreprises et chercheurs universitaires tentent de développer de nouveaux antibiotiques, mais leur succès est très limité. Même quand ils réussissent, l'évolution semble inéluctable :
- Chaque antibiotique que l'humanité a développé jusqu'à présent a finalement rencontré une résistance dans au moins certains des agents pathogènes qu'il était censé traiter. Le gène gar n'est que le dernier d'une série de gènes qui, un par un, réduisent la valeur des antibiotiques, dit Joakim Larsson.
Le groupe de recherche de Göteborg étudie le rôle de l'environnement dans la résistance aux antibiotiques, en particulier comme source de gènes de résistance qui peuvent passer d'espèces environnementales inoffensives à celles qui causent des maladies.
- L'énorme diversité de bactéries dans l'environnement qui nous entoure héberge probablement déjà des gènes pour chaque antibiotique que nous développerons un jour - à moins que nous ne commencions à penser très différemment à la façon dont les antibiotiques sont conçus, dit Joakim Larsson.