Полученные данные дают представление о микробиомах доиндустриальных сельскохозяйственных популяций. что может обеспечить столь необходимый контекст для интерпретации состояния здоровья современных микробиомов.
С годами Ученые отметили, что люди, живущие в индустриальных обществах, имеют заметно иной микробиом по сравнению с сообществами охотников-собирателей по всему миру. Из этого, растущее количество доказательств связывает изменения в нашем микробиоме со многими болезнями современного индустриального мира, например, воспалительное заболевание кишечника, аллергия, и ожирение.
Настоящее исследование помогает охарактеризовать изменение микробиомов кишечника и подчеркивает ценность древних туалетов как источников биомолекулярной информации.
Пирс Митчелл из Кембриджского университета специализируется на содержимом кишечника людей прошлого посредством анализа необычных субстратов. Рассматривая под микроскопом содержимое археологических туалетов и высушенные фекалии, он и его команда изучили тома о кишечных паразитах, которые преследовали наших предков.
«Микроскопический анализ может показать яйца паразитических червей, обитавших в кишечнике, но многие микробы в кишечнике слишком малы, чтобы их можно было увидеть, - комментирует Митчелл. - Если мы хотим определить, что составляет здоровый микробиом для современных людей, мы должны начать изучать микробиомы наших предков, которые жили до применения антибиотиков, быстрое питание, и другие атрибуты индустриализации ».
Кирстен Бос, специалист по древней бактериальной ДНК из Института истории человечества Макса Планка и соруководитель исследования, сначала скептически относился к возможности исследования содержимого туалетов, которые давно вышли из строя.
«Вначале мы не были уверены, сохранятся ли молекулярные сигнатуры содержимого кишечника в уборных в течение сотен лет. Многие из наших успехов в извлечении древних бактерий до сих пор были связаны с кальцинированными тканями, такими как кости и зубной камень, которые предлагают очень разные условия хранения. Тем не менее, "говорит Бос, «Я действительно надеялся, что данные здесь изменят мою точку зрения».
Команда проанализировала отложения из средневековых туалетов в Иерусалиме и Риге. Латвия, датируемая 14-15 веками нашей эры. Первой задачей было отличить бактерии, которые когда-то формировали древний кишечник, от бактерий, занесенных окружающей средой. неизбежное следствие работы с археологическим материалом.
Исследователи идентифицировали широкий спектр бактерий, археи простейшие, паразитические черви, грибы и другие организмы, включая многие таксоны, населяющие кишечник современного человека.
"Похоже, уборные действительно являются ценными источниками как микроскопической, так и молекулярной информации, "заключает Бос.
Сюзанна Сабин, аспирант MPI-SHH, который руководил исследованием, сравнил ДНК уборной с ДНК из других источников, включая микробиомы промышленных и кормовых популяций, а также сточные воды и почва.
«Мы обнаружили, что микробиом в Иерусалиме и Риге имел некоторые общие характеристики - они действительно демонстрировали сходство с микробиомами современных охотников-собирателей и современными промышленными микробиомами, но были достаточно разными, чтобы образовать свою уникальную группу. Мы не знаем современного источника, содержащего микробное содержимое, которое мы видим здесь ».
Использование уборных, где смешаны фекалии многих людей, позволил исследователям получить беспрецедентное представление о микробиомах целых сообществ.
<цитата>Эти туалеты дали нам гораздо более репрезентативную информацию о более широком доиндустриальном населении этих регионов, чем отдельные образцы фекалий. Объединение данных световой микроскопии и анализа древней ДНК позволяет нам идентифицировать удивительное разнообразие организмов, присутствующих в кишечнике наших предков, живших много веков назад ».
Пирс Митчелл, Кембриджский университет
Несмотря на обещание этого нового подхода к исследованию микробиома, проблемы остаются.
«Нам потребуется еще много исследований на других археологических объектах и в другие периоды времени, чтобы полностью понять, как микробиом менялся в группах людей с течением времени, - говорит Бос. мы сделали ключевой шаг в демонстрации того, что извлечение ДНК древнего кишечного содержимого из туалетов прошлого может работать ».
Веганская диета может увеличить количество кишечных микробов, которые способствуют снижению веса
Криптоспоридиоз усугубляется часто используемыми пробиотиками.
Создание физической и генетической карты Cannabis sativa
Пересадка кала от одних доноров лучше, чем от других
Препарат для похудания Wegovy одобрен FDA
Пища избирательно влияет на кишечные микробы - результаты исследования
Ученые раскрыли загадочный случай синдрома автомобильной пивоварни
Исследователи из Китая сделали важное открытие, которое объясняет запутанный случай с 27-летним мужчиной, который в прошлом был в состоянии алкогольного опьянения, не употребляя алкоголь. Они обнару
Хронический кашель можно облегчить с помощью нового препарата
Пара исследований показала, что хронический кашель и его мучительные симптомы можно облегчить с помощью нового лекарства. Также, препарат не имеет побочных эффектов, которые могут ограничить его приме
Микробиом полового члена является резервуаром для бактерий, связанных с бактериальным вагинозом.
Среди инфекций, передающихся половым путем (ИППП), бактериальный вагиноз поражает более 20 процентов женщин во всем мире. Заболевание возникает из-за размножения определенных бактерий во влагалище.