Nalazi pružaju uvid u mikrobiome predindustrijskog poljoprivrednog stanovništva, što može pružiti prijeko potreban kontekst za tumačenje zdravlja modernih mikrobioma.
Tijekom godina, znanstvenici su primijetili da oni koji žive u industrijski razvijenim društvima imaju značajno drugačiji mikrobiom u odnosu na zajednice lovaca i sakupljača širom svijeta. Od ovoga, sve veći broj dokaza povezuje promjene u našem mikrobiomu s mnogim bolestima modernog industrijaliziranog svijeta, kao što je upalna bolest crijeva, alergije, i pretilosti.
Sadašnja studija pomaže okarakterizirati promjenu crijevnih mikrobioma i naglašava vrijednost drevnih nužnika kao izvora bio-molekularnih informacija.
Piers Mitchell sa Sveučilišta Cambridge specijalizirao se za sadržaj crijeva prošlih ljudi kroz analizu neobičnih podloga. Gledajući pod mikroskopom sadržaj arheoloških WC -a i osušenih izmeta, on i njegov tim naučili su mnogo o crijevnim parazitima koji su mučili naše pretke.
"Mikroskopska analiza može pokazati jaja parazitskih crva koji su živjeli u crijevima, ali mnogi mikrobi u crijevima jednostavno su premali da bi se vidjeli, "komentira Mitchell." Ako želimo utvrditi što predstavlja zdrav mikrobiom za suvremene ljude, trebali bismo početi promatrati mikrobiome naših predaka koji su živjeli prije upotrebe antibiotika, brza hrana, i druge zamke industrijalizacije ".
Kirsten Bos, specijalist za drevnu bakterijsku DNK s Instituta Max Planck za znanost o ljudskoj povijesti i suvoditelj studije, bio prvi skeptičan u pogledu izvedivosti istraživanja sadržaja zahoda koji su dugo bili u kvaru.
"Na početku nismo bili sigurni hoće li molekularni potpisi sadržaja crijeva opstati u zahodima kroz stotine godina. Mnogi naši uspjesi u drevnom pronalaženju bakterija do sada su došli iz kalcificiranih tkiva poput kostiju i zubnog kamenca, koji nude vrlo različite uvjete očuvanja. Štoviše, "kaže Bos, "Zaista sam se nadao da će ovi podaci promijeniti moju perspektivu."
Tim je analizirao sediment iz srednjovjekovnih zahoda u Jeruzalemu i Rigi, Latvija datira iz 14.-15. St. N. E. Prvi izazov bio je razlikovati bakterije koje su nekad činile drevna crijeva od onih koje je unijela okolina, neizbježna posljedica rada s arheološkim materijalom.
Znanstvenici su identificirali širok raspon bakterija, arheja, protozoa, parazitski crvi, gljivice i drugi organizmi, uključujući mnoge svojte za koje je poznato da nastanjuju crijeva modernog čovjeka.
"Čini se da su nužnici doista vrijedni izvori i za mikroskopske i molekularne informacije, “zaključuje Bos.
Susanna Sabin, doktorand MPI-SHH koji je vodio studiju, usporedio DNK zahoda s onima iz drugih izvora, uključujući mikrobiome iz industrijskog i krmnog stanovništva, kao i otpadne vode i tlo.
"Utvrdili smo da mikrobiom u Jeruzalemu i Rigi ima neke zajedničke karakteristike - pokazali su sličnost s modernim mikrobiomima sakupljačima lovaca i modernim industrijskim mikrobiomima, ali su bili dovoljno različiti da su formirali vlastitu jedinstvenu skupinu. Ne znamo za moderan izvor koji sadrži mikrobni sadržaj koji ovdje vidimo. "
Korištenje zahoda, gdje se izmet mnogih ljudi miješa, omogućio je istraživačima neviđen uvid u mikrobiome čitavih zajednica.
Ti su zahodi dali nam mnogo reprezentativnije podatke o širem predindustrijskom stanovništvu ovih regija nego što bi to imao pojedinačni uzorak fekalija. Kombinirajući dokaze svjetlosne mikroskopije i drevne DNK analize omogućuje nam da identificiramo nevjerojatnu raznolikost organizama prisutnih u crijevima naših predaka koji su živjeli prije stoljeća. "
Piers Mitchell, Sveučilište Cambridge
Unatoč obećanju ovog novog pristupa istraživanju mikrobioma, izazovi ostaju.
"Trebat će nam još mnogo studija na drugim arheološkim nalazištima i vremenskim razdobljima kako bismo u potpunosti razumjeli kako se mikrobiom mijenjao u ljudskim skupinama s vremenom, "kaže Bos." Međutim, napravili smo ključni korak u pokazivanju da oporavak DNK drevnog crijevnog sadržaja iz prošlih zahoda može funkcionirati. "