Alleen al in de Verenigde Staten, de markt voor op microbioom gebaseerde landbouwproducten zal naar verwachting in 2025 meer dan $ 10 miljard waard zijn. Onderzoek naar het menselijk microbioom heeft het afgelopen decennium meer dan $ 1,7 miljard overschreden.
Wetenschappelijke studie van microbiomen groeit exponentieel, met onderwerpen die variëren van de invloed van darmmicrobiota op het functioneren van de hersenen bij mensen tot de impact van mariene bacteriën op klimaatverandering.
Om deze buitengewone thematische diversiteit aan te pakken, overeenstemming bereiken over een definitie van microbioom, en richtlijnen na te streven voor investeringen in onderzoek, het door de Europese Unie gefinancierde Microbiome Support-project bracht een panel van deskundigen van 28 instellingen in verschillende landen samen. De conclusies zijn gepubliceerd in het tijdschrift Microbioom .
Brazilië was in het panel vertegenwoordigd door het Genomics for Climate Change Research Centre (GCCRC), een van de Engineering Research Centres (ERC's) gefinancierd door São Paulo Research Foundation - FAPESP. In dit geval, haar partner is de Braziliaanse Agricultural Research Corporation (EMBRAPA). GCCRC wordt gehost door de Universiteit van Campinas (UNICAMP), en de hoofdonderzoeker is professor Paulo Arruda.
De discussie kwam tot conclusies die heel duidelijk onderscheid maken tussen de concepten microbiota en microbioom. Microbiota is de gemeenschap van micro-organismen in een bepaalde omgeving, zoals uw bureau, planten, huid, of darm. Microbiota is overal. Als u de functies toevoegt die het in die omgeving uitvoert, je hebt het over microbioom."
Rafael Soares Correa de Souza, Leider van het microbioomteam, Genomics voor onderzoekscentrum voor klimaatverandering
Souza wordt ondersteund door FAPESP via een postdoctorale beurs.
"Als we het hebben over het microbioom van een plant, bijvoorbeeld, we verwijzen niet alleen naar de micro-organismegemeenschap die in de plant aanwezig is, maar ook naar alle functies die door die gemeenschap worden uitgevoerd, zoals opname van voedingsstoffen, bescherming tegen ziekteverwekkers en droogteresistentie, onder vele anderen, " hij zei.
Vooruitgang in genetische sequencing en bio-informatica in de afgelopen decennia hebben wetenschappers in staat gesteld om niet alleen te ontdekken dat micro-organismen zoals bacteriën, schimmels, en protozoa zijn veel diverser dan ze dachten, maar ook dat veel van hun functies tot voor kort slecht werden begrepen of simpelweg onbekend waren.
Deze tools kunnen nu worden gebruikt om de gemeenschap van micro-organismen en hun "theater van activiteit" te identificeren, de term bedacht door het panel voor het "hele spectrum" van moleculen die ze produceren, inclusief hun structurele elementen (nucleïnezuren, eiwitten, lipiden, polysachariden) en metabolieten, en de "moleculen geproduceerd door naast elkaar bestaande gastheren en gestructureerd door de omringende omgevingsomstandigheden".
"Het concept van microbioom is veel holistischer dan het concept van microbiota, ' zei Souz.
Er zijn veel op microbioom gebaseerde producten op de markt gekomen, en het definiëren van concepten is belangrijk, onder andere, om de communicatie met de samenleving te vergemakkelijken en wetgevers een basis te bieden om over dit onderwerp wetgeving uit te vaardigen.
Vlees van kippen wiens dieet is aangevuld met microbiële middelen die de noodzaak van antibiotica elimineren, kan zelfs in Europa in supermarkten worden gekocht, een strikt gereguleerde markt. Fecale microbiota-transplantatie is een goedgekeurde behandeling voor antibioticaresistente infecties in Brazilië en de VS.
Gezien het potentieel van het veld, Microbiome Support werd opgericht om te beslissen over onderzoeksprioriteiten voor financiering door Horizon Europe, het EU-initiatief voor wetenschappelijk onderzoek en innovatie dat Horizon 2020 zal opvolgen en tussen 2021 en 2027 100 miljard euro zal investeren in alle onderzoeksgebieden.
"Hier bij GCCRC willen we begrijpen hoe we het microbioom kunnen moduleren om de landbouwprestaties van planten te verbeteren, opbrengst verhogen, en het gebruik van kunstmest en landbouwchemicaliën te verminderen om de veiligheid van het milieu te verbeteren en de gevaren voor de menselijke gezondheid te elimineren. Brazilië is een van 's werelds grootste landbouwproducenten, dus dit is een kans voor onze wetenschap en industrie, ' zei Souz.