Žmogaus mikrobiomas sudaro tūkstančius mažų, anksčiau nenustatyti baltymai, nušviesti žmonių sveikatą ir ateityje atverti kelią narkotikų kūrimui.
Stanfordo universiteto mokslininkų komanda sudaro pagrindą žmogaus mikrobiomai, kad ateityje būtų galima ištirti, kaip trilijonai bakterijų, grybai, ir organizme esančios archajos konkuruoja dėl maistinių medžiagų, ištekliai, pulti, ir egzistuoja kartu.
Naujos išvados, kurie skelbiami žurnale Ląstelė, atskleisti daugiau apie labai įvairias žmonių floros rūšis, leidžia sukurti naujus gydymo būdus, kurie galėtų išgydyti ligas, net tie, kurie laikomi neišgydomais.
Rezultatai buvo gauti analizuojant 1, 773 su žmogumi susijusios metagenomos, paimtos iš keturių skirtingų kūno vietų. (Kreditas:Tsvetkov Maxim/Shutterstock)Tyrimo tikslas yra nustatyti ir ištirti mažus pasiuntinius baltymus, kuriuos naudoja žmogaus viduje gyvenantys mikrobai. Jie nustatė, kad iš tiesų egzistuoja stulbinanti žmogaus floros įvairovė, su daugiau nei 4, 000 molekulių šeimų, kurių dauguma dar nebuvo aprašyti ar atrasti.
„Kadangi daug sunkiau ieškoti sekų, koduojančių mažus baltymus, nei tralu ieškoti didelių baltymų, mūsų supratimas apie mažus mikrobų bendruomenių išreikštus baltymus visada buvo nepakankamas, „Nikos kirpidas, „Berkeley Lab“ vyresnysis mokslininkas ir tyrimo bendraautorius, sakė.
Jis pridūrė, kad maži baltymai, sudaryti iš 50 ar mažiau amino rūgščių, kurie gali praeiti pro ląstelių membranas ir ląstelių sienas, atlikti įvairias organizmui svarbias užduotis, tarpininkaujant organizmo ir aplinkos sąveikai. Iš tiesų, dėl savo mažo dydžio, jie gali lengvai sulankstyti į unikalias formas, kurios atspindi anksčiau nenustatytus biologinius blokus.
Pasiuntinių baltymų funkcijos, ir kadangi jas lengviau manipuliuoti ir sintetinti nei didesnes molekules, padaryti šiuos mažus baltymus gerais taikiniais ir naujų gydymo bei vaistų šaltiniais. Taip pat, jei mokslininkai gali manipuliuoti ir atkurti mažų baltymų formas, šios molekulės gali atverti duris pažangiai kuriant ir atrandant naują vaistą.
„Labai svarbu suprasti sąsają tarp žmogaus ląstelių ir mikrobiomo, “Daktaras Ami Bhatt, medicinos ir genetikos docentas bei vyresnysis mokslo darbuotojas, sakė.
„Kaip jie bendrauja? Kaip bakterijų padermės apsisaugo nuo kitų padermių? Šios funkcijos greičiausiai randamos labai mažuose baltymuose, kuris gali būti labiau linkęs išsiskirti už ląstelės ribų nei didesni baltymai, “ - pridūrė ji.
Tačiau, Kadangi baltymai yra labai maži, buvo sunku juos ištirti naudojant įprastus metodus.
„Bandydami nuspėti, kuriose bakterijų DNR sekose yra šių labai mažų genų, mes labiau linkę padaryti klaidą nei spėti teisingai. Taigi, iki dabar, mes sistemingai ignoravome jų egzistavimą. Tai buvo aiški akla vieta, “ - pridūrė ji.
Tyrime, tyrėjai sistemingai nustatė mažus baltymus, atlikdami lyginamąjį genomikos tyrimą 1, 773 su žmogumi susijusios metagenomos iš keturių skirtingų kūno vietų. Jie rado daugiau nei 4, 000 išsaugotų šeimų, kur dauguma yra nauji ir anksčiau neatrasti.
Įtariama, kad daugiau nei 30 procentų baltymų šeimų yra išskiriamos arba transmembraninės. Taip pat, daugiau nei 90 procentų mažų baltymų šeimų neturi žinomo domeno, ir maždaug pusė nėra atstovaujama etaloniniuose genomuose.
Mokslininkai tikisi toliau ir nuodugniai ištirti mažus baltymus. Maži baltymai gali būti manipuliuojami ir sintetinami lengviau ir greičiau nei didesnės molekulės. Kaip rezultatas, jie gali veikti kaip biologiniai jungikliai, norint perjungti funkcines būsenas arba sukelti reakcijas kitose ląstelėse. Vadinasi, jie galėtų atverti duris naujų vaistų kūrimui, kurie gali padėti gydyti daugelį ligų.