Le microbiome humain fabrique des milliers de petits, protéines auparavant non identifiées, faire la lumière sur la santé humaine et pourrait ouvrir la voie au développement de médicaments à l'avenir.
Une équipe de chercheurs de l'Université de Stanford jette les bases du microbiome humain pour une future enquête sur la façon dont les milliards de bactéries, champignons, et les archées présentes dans le corps se disputent les nutriments, Ressources, attaque, et coexister les uns avec les autres.
Les nouvelles découvertes, qui sont publiés dans la revue Cellule, en savoir plus sur les espèces très diverses de la flore humaine, permettant de formuler de nouveaux traitements qui pourraient potentiellement guérir des maladies, même ceux qui sont considérés comme incurables.
Les résultats sont venus d'une analyse de 1, 773 métagénomes associés à l'homme échantillonnés à partir de quatre sites corporels différents. (Crédit :Tsvetkov Maxim/Shutterstock) Les chercheurs de l'étude visent à identifier et à examiner les petites protéines messagères utilisées par les microbes vivant à l'intérieur des humains. Ils ont constaté qu'il existe en effet une diversité étonnante de la flore humaine, avec plus de 4, 000 familles de molécules, dont la plupart n'ont pas encore été décrits ou découverts.
"Parce qu'il est beaucoup plus difficile de rechercher des séquences codant pour de petites protéines que de rechercher de grandes protéines, notre compréhension des petites protéines exprimées par les communautés microbiennes a toujours fait défaut, " Nikos Kyrpides, un scientifique principal du Berkeley Lab et co-auteur de l'étude, mentionné.
Il a ajouté que de minuscules protéines composées de 50 acides aminés ou moins, qui peut traverser les membranes cellulaires et les parois cellulaires, effectuer diverses tâches vitales pour l'organisme, médiation des interactions entre l'organisme et l'environnement. En réalité, avec leur petite taille, ils peuvent facilement se plier en des formes uniques qui représentent des blocs de construction biologiques auparavant non identifiés.
Les fonctions des protéines messagères, et comme ils sont plus faciles à manipuler et à synthétiser que les molécules plus grosses, font de ces minuscules protéines de bonnes cibles et sources de nouvelles thérapies et médicaments. Aussi, si les scientifiques peuvent manipuler et recréer les formes des minuscules protéines, ces molécules peuvent ouvrir les portes du développement avancé et de la découverte d'un nouveau médicament.
« Il est extrêmement important de comprendre l'interface entre les cellules humaines et le microbiome, » Dr Ami Bhatt, professeur adjoint de médecine et de génétique et chercheur principal, mentionné.
« Comment communiquent-ils ? Comment les souches de bactéries se protègent-elles des autres souches ? Ces fonctions sont susceptibles d'être trouvées dans de très petites protéines, qui peut être plus susceptible que des protéines plus grosses d'être sécrétées à l'extérieur de la cellule, " elle a ajouté.
Cependant, puisque les protéines sont très petites, il a été difficile de les étudier en utilisant des méthodes conventionnelles.
"Nous avons été plus susceptibles de faire une erreur que de deviner correctement en essayant de prédire quelles séquences d'ADN bactérien contiennent ces très petits gènes. Donc, jusqu'à maintenant, nous avons systématiquement ignoré leur existence. Cela a été un angle mort clair, " elle a ajouté.
Dans l'étude, les chercheurs ont systématiquement identifié de petites protéines en réalisant une étude de génomique comparative sur 1, 773 métagénomes associés à l'homme provenant de quatre endroits différents du corps. Ils en ont trouvé plus de 4, 000 familles conservées, où la plupart sont nouveaux et n'ont pas été découverts auparavant.
Plus de 30 pour cent des familles de protéines étaient suspectées d'être sécrétées ou transmembranaires. Aussi, plus de 90 pour cent des petites familles de protéines n'ont pas de domaine connu, et environ la moitié ne sont pas représentés dans les génomes de référence.
Les chercheurs espèrent étudier les petites protéines de manière plus approfondie et plus approfondie. Les petites protéines peuvent être manipulées et synthétisées plus facilement et plus rapidement que les molécules plus grosses. Par conséquent, ils peuvent agir comme des commutateurs biologiques pour basculer entre les états fonctionnels ou déclencher des réactions dans d'autres cellules. D'où, ils pourraient ouvrir la porte au développement de nouveaux médicaments, qui peut aider à traiter de nombreuses maladies.
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