Crystal Hepp, NAU Informatikos mokyklos docentas, Kompiuterija, ir kibernetinės sistemos (SICCS), bando nuotekas Šiaurės Arizonos bendruomenėse, kad padėtų nustatyti SARS-CoV-2 plitimą, virusas, sukeliantis COVID-19. Kadangi virusas patenka į žmogaus atliekas, ji mano, kad nuotekos yra perspektyvus būdas jas aptikti.
Nors mokslininkai prognozuoja antrus ar net kelis COVID-19 protrūkius, Heppas mano, kad nuotekų bandymai gali veikti kaip išankstinė ir nuolatinė įspėjimo sistema, ypač kaimo bendruomenėse, kurių nepritaria sveikatos priežiūros darbuotojai ir medicinos įstaigos, ir gali įspėti nuotekų įrenginių operatorius apie padidėjusią riziką.
Labai svarbu tęsti priežiūros veiklą, kuri gali padėti kurti dinamiškas regionines intervencijos strategijas. Kad būtų tvarus tokio masto protrūkio metu, tvirtesnis, reikia įgyvendinti įmanomą ir nuo žmogaus nepriklausomą bendruomenės atrankos metodą “.
Crystal Hepp, Docentas, Informatikos mokykla, Kompiuterija, ir kibernetines sistemas, NAU
Šiuo metu, Heppas ir jos komanda kas savaitę tikrina įleidžiamus (neapdorotus) ir nuotekų (apdorotus) mėginius šešiose Flagstaffo vietose, Mundso parkas, Kachinos kaimas ir Kayenta, esantis Navajo tautoje. Projekto bendradarbiai yra Flagstafo miestas, Pinewood sanitarinis rajonas, Kachinos kaimo tobulinimo rajonas, Navajo genčių paslaugų tarnyba ir „TGen-North“.
Doktorantė Jill Cocking, SICCS „Hepp Lab“ vyresnysis tyrimų specialistas, vadovauja laboratoriniam darbo komponentui ir kiekvieną mėginį laiko infekciniu.
„Aš paimu šią medžiagą ir pašalinu nukleorūgštis, "sakė Cocking." COVID-19 yra RNR virusas (virusas, kurio genetinė medžiaga yra ribonukleino rūgštis), todėl kitas žingsnis yra RNR paversti DNR, kad ją būtų galima aptikti atliekant Ligų kontrolės ir prevencijos centrų sukurtą tyrimą.
"Tyrimas daro genetinės medžiagos kopijas, kol jų užtenka aptikti mūsų prietaisais. Jei koronaviruso yra nuotekose, ši analizė mums praneš “.
Balandžio pradžioje mėginiai iš trijų įtakingų nuotekų vietų buvo teigiami. Hepp, direktoriaus asistentas NAU Patogenų ir mikrobiomų institute (PMI), pažymi, kad komanda nenustatė jokių teigiamų nuotekų atvejų, tai rodo, kad nuotekų valymo įrenginys yra veiksmingas gydant virusą.
Mokslininkai atliks teigiamų mėginių genetinę sekos analizę, ieškodami skirtingų padermių.
„Virusas visada vystosi, "Heppas sakė." Visada gali atsirasti naujų padermių. Jei rasime keletą skirtingų padermių su skirtingomis mutacijomis, tai rodo, kad laikui bėgant virusas turėjo daugiau galimybių mutuoti populiacijoje arba kad atsirado naujų užsikrėtimų. Didesnis padermių skaičius bet kuriuo metu gali rodyti daugiau užsikrėtusių asmenų “.
Heppas dirba su Jasonu Sahlu, PMI direktoriaus padėjėjas, kas naudos jo sukurtą genomikos vamzdyną, WG-FAST, ištirti padermių įvairovę.
„Mūsų WG-FAST metodas gali padėti nustatyti viruso padermės lygį, nustatyti štamų mišinius ir suderinti klinikinius ir nuotekų mėginius, "sakė Sahlis." Šis metodas gali atpažinti cirkuliuojančius virusus, nereikalaujant tiesiogiai imti žmonių mėginių, ir nepriklausomai nustatys atvejus.
„Jis taip pat gali užfiksuoti COVID-19 atvejus, kurie gali būti nepateikti ligoninei, ir gali įspėti visuomenės sveikatos agentūras apie cirkuliuojančias padermes, kurie padės atsekti kontaktus ir informuos visuomenę apie naujas COVID-19 bangas jų bendruomenėse “.
„Ši sekos analizė padės mums suprasti bendruomenėje cirkuliuojančią įtampą, bendrą viruso įvairovę ir kaip ji keičiasi skirtingose vietovėse ir skirtingu metų laiku, “ - sakė Dave'as Engelthaleris. docentas ir „TGen-North“ direktorius.
Tikimasi, kad Heppo tyrimas tęsis visą vasarą. Ji tikisi gauti finansavimą per Nacionalinius sveikatos institutus (NIH) ir pratęsti tyrimą iki protrūkio pabaigos.