Crystal Hepp, a NAU Informatikai Iskolájának adjunktusa, Számítástechnika, és kiberrendszerek (SICCS), szennyvizet tesztel az észak-arizonai közösségekben, hogy segítsen meghatározni a SARS-CoV-2 terjedését, a COVID-19-t okozó vírus. Mivel a vírus emberi hulladékba kerül, úgy véli, hogy a szennyvíz járható út a felderítésére.
Míg a tudósok második vagy akár több COVID-19 kitörést jósolnak, Hepp úgy véli, hogy a szennyvízvizsgálatok korai és folyamatos figyelmeztető rendszerként működhetnek, különösen a vidéki közösségekben, akiket az egészségügyi dolgozók és az egészségügyi létesítmények nem szolgálnak ki, és figyelmeztetheti a szennyvíztelep üzemeltetőit a fokozott kockázatokra.
Létfontosságú lesz a felügyeleti tevékenységek folytatása, amelyek elősegíthetik a dinamikus regionális beavatkozási stratégiák kidolgozását. Fenntarthatónak lenni egy ekkora járvány idején, robusztusabb, megvalósítható és emberfüggetlen közösségi mintavételi módszert kell alkalmazni. "
Crystal Hepp, Egyetemi adjunktus, Informatikai Iskola, Számítástechnika, és a kiberrendszerek, NAU
Jelenleg, Hepp és csapata hetente Flagstaff hat helyszínén vizsgálja a befolyó (kezeletlen) és a szennyvíz (kezelt) mintákat. Munds Park, Kachina Village és Kayenta, a Navajo Nemzetben található. A projektben közreműködők Flagstaff városa, Pinewood egészségügyi kerület, Kachina Village Improvement District, a Navajo Törzsi Utility Hatóság és a TGen-North.
Jill Cocking doktorandusz, a SICCS Hepp Lab vezető kutatási szakembere, vezeti a munka laboratóriumi részét, és minden mintát úgy kezel, mintha fertőző lenne.
"Fogom ezt az anyagot, és eltávolítom a nukleinsavakat, -mondta Cocking.-A COVID-19 egy RNS-vírus (olyan vírus, amelynek genetikai anyaga ribonukleinsav), így a következő lépés az RNS DNS -vé alakítása, hogy a Centers for Disease Control and Prevention által tervezett vizsgálattal kimutatható legyen.
"A vizsgálat addig másolja a genetikai anyagot, amíg nem lesz elegendő ahhoz, hogy eszközeinkkel kimutassuk. Ha a koronavírus jelen van a szennyvízben, ez az elemzés tudatja velünk. "
Három beáramló szennyvíztisztító telep mintái április elején pozitív eredményt mutattak. Hepp, igazgató asszisztens a NAU Patogén és Mikrobiológiai Intézetében (PMI), megjegyzi, hogy a csapat nem talált pozitív eseteket a szennyvízben, ami azt jelzi, hogy a szennyvíztelep folyamata hatékony a vírus kezelésében.
A kutatók genetikai szekvenálási elemzést végeznek a beáramló pozitív mintákon, hogy különböző törzseket keressenek.
"A vírus mindig fejlődik, "Hepp mondta." Mindig új törzsek merülhetnek fel. Ha több különböző törzset találunk, különböző mutációkkal, ami azt jelzi, hogy a vírusnak idővel nagyobb esélye volt a mutációra a populáción belül, vagy hogy új behatolások történtek. A nagyobb számú törzs bármikor több fertőzött személyre utalhat. "
Hepp Jason Sahllal dolgozik, a PMI igazgatóhelyettese, ki fogja használni a bevált genomikai folyamatát, WG-GYORS, hogy megvizsgálja a törzsek sokféleségét.
"WG-FAST megközelítésünk lehetővé teszi a vírus törzsszintű azonosítását, törzskeverékek azonosítása és a klinikai és szennyvízminták egyeztetése, " - mondta Sahl." Ez a megközelítés képes azonosítani a keringő vírusokat anélkül, hogy közvetlenül mintát kellene vennie az emberekből, és függetlenül azonosítja az eseteket.
"Elkaphatja azokat a COVID-19 eseteket is, amelyek esetleg nem jelennek meg a kórházban, és figyelmeztetheti a közegészségügyi szerveket a keringő törzsekre, amely segít a kapcsolatok nyomon követésében, és tájékoztatja a nyilvánosságot a COVID-19 új hullámairól közösségeikben. "
"Ez a szekvenálási elemzés segít megérteni a közösségben keringő törzset, a vírus általános sokfélesége, és annak változása a különböző helyszínek között és az év különböző időpontjaiban, - mondta Dave Engelthaler, egyetemi docens és a TGen-North igazgatója.
Hepp tanulmánya várhatóan a nyár folyamán folytatódik. Reméli, hogy a Nemzeti Egészségügyi Intézeteken (NIH) keresztül finanszírozást tud biztosítani, és kiterjeszti a kutatást a járvány végére.