Anotacija
Fonas
Naviko nekrozės factor- α (TNF-α) vaidina svarbų vaidmenį kuriant ir progresavimo skrandžio vėžio. Funkcinis polimorfizmas, -308 "G > A (rs1800629), kuris yra įsikūręs promotoriaus, TNFa genotipą TNFa Mes radome reikšmingą ryšį tarp variantas genotipų ir padidėjusia rizika skrandžio vėžio [ P Išvados Mūsų rezultatai rodo, kad funkcinis rengėjas -308 "G > a. polimorfizmas yra TNFa nurodomoji dalis:. Honkongas Y Ge Z Jing C Shi J Dong X Zhou F et al., (2013) Funkcinis Rėmėjas -308G > variantas naviko nekrozės faktoriaus alfa genas, susijusio su rizikos ir progresavimo skrandžio vėžio Kinijos gyventojų. PLoS ONE 8 (1): e50856. Doi: 10,1371 /journal.pone.0050856 redaktorius: Ramonas Andrade de Mello, Porto universitetas, Portugalija Įstojo: Gegužės 27, 2012; Priėmė: Balandis 29, 2012 m Paskelbta: Sausis 10, 2013 Visos teisės saugomos: © 2013 Hong et al., Tai atviros prieigos straipsnis platinama pagal Creative Commons Attribution licencija, kuri leidžia nevaržomai naudotis, paskirstymo ir dauginimąsi bet kokioje laikmenoje sąlygomis, su sąlyga, kad pirmasis autorius ir šaltinis įskaitomos Finansavimas:. Šis darbas buvo iš dalies remiamą "Six Talentų Summit" projektas Dziangsi provincijos (SWYY-71-028), Nacionalinės Gamtos mokslo fondo Jiangsu (BK2011194) ir nacionalinio Gamtos mokslo fondo Kinijos (30872084, 30972444 ir 81001274). Į finansuotojai neturėjo vaidmenį studijų dizainas, duomenų rinkimo ir analizės, sprendimų skelbti, ar ruošiant rankraštį konkuruojančių interesų.. Autoriai pareiškė, kad nėra konkuruojantys interesai egzistuoja Įvadas Skrandžio vėžys yra ketvirtoji dažniausia vėžio ir antra pagrindinė priežastis, dėl vėžio susijusių mirties visame pasaulyje, ir ypač paplitusi tam tikrose šalyse, įskaitant Kiniją [1], [2]. Nors tiksli etiologija skrandžio vėžiu išlieka būtų galima identifikuoti, kaupti Epidemiologiniai tyrimai rodo, kad mityba, rūkymas, alkoholio, ypač Helicobacter pylori buvo pasiūlyta, kad lėtinis uždegimas skrandžio gleivinės, kurias sukelia h. pylori TNFa medžiagos ir metodai etika pareiškimas tyrimas buvo patvirtintas Institucijų peržiūros valdybos Nanjing medicinos universitetas, Nanjing, Kinija. Tuo įdarbinimo, parašyta informuotas sutikimas buvo gautas iš visų dalyvaujančių šiame tyrime dalyviai. Tai nuolatinis molekulinės epidemiologinis tyrimas skrandžio vėžio atliekami pirmasis filialas ligoninės Nanjing medicinos universiteto Nandzingas, Kinija. Tyrimo dizainas ir įtraukimo į tyrimą kriterijai dalykų anksčiau buvo aprašyti kitur [22]. Trumpai tariant, du nepriklausomi ligoninių pagrindu kontrolinio atvejo tyrimai buvo įtrauktas į šio tyrimo. Apskritai, bandymas rinkinys įtraukti 750 skrandžio atvejus ir 835 amžių ir lytį atitikimo kontrolę įdarbinti antrosios dukterinė ligoninę Nanjing medicinos universiteto, Nanjing ir vėžio ligoninėje Nantong City, Nantong, Kinija nuo 2006 kovo iki sausio 2010, ir patvirtinimas rinkinys įtraukti 936 atvejus ir 1,060 kontrolę mokosi iš YIXING Liaudies ligoninė, Yixing, Kinija nuo sausio, 1999 gruodžio, 2006. Visos temos buvo etniniai Han kinų ateina iš skirtingų šeimų ir neturėjo kraujo ryšį. Visi pacientai buvo naujai diagnozuota histopathologically patvirtino, incidento skrandžio vėžiu ir buvo eilės įdarbino be jokių apribojimų amžiaus ir lyties. Histologiniai skyriai visais atvejais buvo recenzuojami dviejų patologai savarankiškai. Tie pacientai, kurie turėjo ankstesnę vėžio Metastazė vėžį iš kitų arba nežinomos kilmės, arba ankstesnė radioterapija arba chemoterapija buvo atmesti. Kontrolė buvo įdarbinti iš sveikų, kurie ieško fizinę apžiūrą į ambulatorijas pagal atitinkamą ligoninę ir buvo dažnio suderinta atvejais pagal amžių (± 5 metai) ir lytį. Vėžio nemokamai kontrolė yra genetiškai nesusiję su atvejais ir neturėjo individualaus istoriją vėžio. Kiekvienas pacientas paaukoti 5 ml veninio kraujo po teikiant rašytinį informuoto sutikimo. Atsako dažnis, atvejų ir kontrolinės grupės tiriamųjų buvo ir virš 85%. Visas genomo DNR buvo išskirtas ir išvalytas nuo leukocitų periferinės kraujo proteinazės K virškinimą ir fenolio /ekstrahuojant chloroformu. TNFa Statistinė analizė Prieš tolesnei analizei, alelių dažniai TNFa charakteristikos tyrimas gyventojų dažnio pasiskirstymas demografinių charakteristikų ir klinikiniais požymiais dviejų rinkinių tyrimo grupės yra parodyta 1 lentelėje nustatytais atvejais ir kontrolė buvo suderinta pagal amžių ir seksas ( P genotipa- rezultatai TNFa jei įvertinti, ar TNFa asociacija tarp TNFa polimorfizmai kandidačių genų buvo siūloma daryti įtaką vėžio progresavimą. Mes tada vertinama, ar TNFa Diskusijos pagrindinės išvados mūsų tyrime yra reikšmingas ryšys tarp TNFa Iki šiol, keletas molekulinės epidemiologijos tyrimai buvo atliekami siekiant ištirti ryšį tarp asociaciją TNFa Be to, mes nustatėme, kad TNFa interpretuojant mūsų rezultatus, kai kurie kiti apribojimai taip pat turėtų būti suinteresuotos. Pirma, nes mūsų tyrimas buvo ligoninė pagrindu projektavimas, atrankos šališkumo dalykų, kurie buvo susijusios su tam tikro genotipo gali egzistuoti galimybė. Tačiau genotipas skirstiniai mūsų kontrolės buvo panašus į paskirstymo pranešta kitose Kinijos studijų ir atitiko HWE. Todėl atrankos paklaida, kalbant apie genotipo paskirstymo nebūtų didelis. Antra, h. pylori Taigi, mūsų rezultatai rodo -308G > a. polimorfizmas į promotoriaus TNFa
genas, buvo pasiūlyta pakeisti TNF-alfa ir įtaka vėžio rizikai gamybą. Šiame tyrime siekėme ištirti, ar šis polimorfizmas turi poveikį rizikos ir progresavimo skrandžio vėžio Kinijos gyventojų.
Metodai
-308 "G >, a polimorfizmo naudojant TaqMan metodą dviejų etapų atvejo-kontrolės tyrimo, susidedančiu iš 1686 skrandžio vėžiu sergantiems pacientams ir 1895 vėžio nemokamai dalykų iš viso. Logistikos regresija buvo naudojamas įvertinti genetinius asociacijas su atsiradimo ir progresavimo skrandžio vėžio.
Rezultatai
= 0,034, šansų santykis (ŠS) = 1,39, 95% pasikliautinasis intervalas (PI) = 1,01-1,67, AP /A. vs vS]. Panašūs rezultatai buvo pastebėtas replikacijos tyrimo tolesniems. Kai kartu iš dviejų tyrimų duomenis, mes radome daugiau reikšmingas ryšys ( P
= 0,001, arba = 1.34, 95% PI = 1.13-1.59), ypač vyresnio amžiaus tiriamųjų (> 65 metų). Be to, pacientams, vežančios variantas genotipus turėjo žymiai didesnį paplitimą T4 stadijos liga ( P
= 0,001, arba = 2.19, 95% PI = 1,39-3,47) ir tolimos metastazės (, p
= 0,013, arba = 1.61, 95% PI = 1,10-2,35)
įtakoti imlumą ir progresavimą skrandžio vėžio Kinijos gyventojų
( h. Pylori
) infekcija, yra gerai žinomi priežastys skrandžio vėžio [3], [4]. Tačiau didelis paplitimas šių rizikos veiksnių ne visuomet sukelti didelis sergamumas skrandžio vėžiu, rodo, kad kitos imlios veiksnių, tokių kaip genetinių variantų ir aplinkos skirtumų gali papildomai prisidėti prie skrandžio kancerogenezėje. Neseniai, atsiranda požymių, buvo pasiūlyta, kad genetiniai polimorfizmas šalyse kandidatėse genų buvo susijęs su polinkiu į skrandžio vėžio [5], [6], [7].
infekcija yra svarbus žingsnis siekiant, skrandžio vėžio išsivystymo [8], [9]. Tokiu atveju, genetinių variantų uždegimas susijusių citokinų genų gali būti potencialūs jautrumo veiksniai šios ligos. Vienas iš svarbiausių citokinų, susijusių su H. pylori
infekcija yra auglio nekrozės faktoriaus (TNF) -α kuri yra koduojama , TNFa
geno [10]. TNF-α yra pleiotropic citokinų daugiausia gaminamas aktyvintos monocitų ir makrofagų ir vaidina svarbų vaidmenį uždegimine reakcija [11]. Buvo pasiūlyta, kad per išraiška TNF-alfa parodė reikšmingą stiprumo dozės-atsako kaip rizikos žymenų iš anksto navikinių skrandžio vėžio [12].
genas yra esančių III žmogaus leukocitų antigenas klasės regione chromosomos 6 (6p21) ir yra labai polimorfinės. Polimorfizmas į TNFa
geno buvo įrodyta, kad didelę įtaką savo išraiška lygį [13]. Todėl daugelis tyrimų bandė ištirti, ar polimorfizmas į TNFa pervežimas rengėjas gali būti naudojamas kaip spėjamą faktoriumi jautrumo įvairioms ligoms, įskaitant skrandžio vėžio. Tarp daugelio polimorfizmas į TNFa
promotorius, TNFa
-308 "G >, A polimorfizmo buvo beprotiškai studijavo ir yra funkcinis tyrimas rodo, kad -308A alelis yra susijęs su padidėjusia TNF-alfa gamybos [14]. Kaip skrandžio vėžio buvo atlikta keletas tyrimų ištirti ryšį tarp asociacijų TNFa
-308 "G >, A polimorfizmo ir skrandžio vėžys įvairiose populiacijose, tačiau rezultatai sudaro šie tyrimai lieka imtinai [15], [16], [17], [18], [19]. Iki šiol, du paskelbtos metaanalizės šiuo klausimu pasiūlė, kad -308 "G >, A polimorfizmo buvo susijęs su skrandžio vėžiu Vakarų gyventojų, bet ne Azijos gyventojų [20], [21]. Čia, šiame tyrime, mes atlikome santykinis didelį dviejų etapų atvejo-kontrolės tyrimą, kuris apėmė apie 1686 skrandžio vėžiu sergantiems pacientams ir 1895 vėžio nemokamai dalykų iš viso toliau įvertinti TNFa
-308 įtaką "G > a. polimorfizmas skrandžio vėžio rizikos ir progresavimo į Kinijos gyventojų
Studijų gyventojų
DNR išskyrimas ir genotipo
-308 "G >, A polimorfizmo buvo genotipą naudojant TaqMan-sulietuvinti" MGB metodą (taikoma BIOSYSTEMS Foster City, CA, JAV), kuri naudoja du alelių konkrečių TaqMan MGB zondai ir PGR pradmenų pora aptikti specifinis SNP taikiniu. Iš pradmenų ir zondų seka yra paprašius. Reakcijos mišinys 10 įxL pateikta 20 ng genomo DNR, 3.5 įxL 2 × TaqMan genotipo Master Mix, 0,25 įxL pradmenų ir zondai sumaišoma ir 6,25 įxL du kartus distiliuotas vanduo. Amplifikacijos buvo atlikta pagal šias sąlygas: 50 ° C temperatūroje 2 min, 95 ° C temperatūroje 10 min, po to 45 ciklų 95 ° C temperatūroje 15 sekundžių, ir 60 ° C temperatūroje 1 min. Pagal gamintojo instrukcijas, amplifikacijos buvo atliekami 384 šulinėlių ABI 7900HT Real Time PCR sistemos (Applied Biosystems, Foster City, CA, JAV) ir alelių diskriminacijos buvo atlikta naudojant TVS 2.4 Programinė įranga (Applied Biosystems, Foster City, CA, JAV). Genotipa- normos šiose VNP-ai buvo visų pirma 98%. Siekiant užtikrinti genotipo tikslumą, du neigiamas eksperimentinis kontrolė (vanduo) ir du teigiami eksperimentiniai kontrolė su žinomo genotipo buvo įtraukta į kiekvieną reakcijos plokštelės. Be to, apie 5% mėginių buvo atsitiktinės atrankos būdu pakartotinai genotipavimo gauti patvirtinimą,; o rezultatai buvo 100% Współbrzmieniowy
-308G > a. ĮVAIROVĖ bandomosios rinkinys kontrolės, patvirtinimo nustatyti ir derinant nustatyti buvo vertinami pagal išvykimo iš Hardy-Weinberg pusiausvyros (HWE), naudojant gėris-of-fit χ2 testą. Skirtumai Atsižvelgiant į amžių, lytį paskirstymo ir dažniai genotipų TNFa
-308G >, A polimorfizmo tarp atvejų ir kontrolės vertino Pirsono χ2 testą. Sąsajos tarp -308G >asociacijos; A genotipas ir rizikos skrandžio vėžiu, taip pat klinikinių charakteristikų pacientų buvo matuojamas apskaičiuojant šansų santykį (AR) ir 95% pasikliautinasis intervalas (CIS) iš besąlygiško logistinė regresinė analizė su pagal amžių koregavimas ir lytį. Visi statistinės analizės buvo atliekamos su programine įranga SAS 9.1.3 (SAS Institute, Cary, NC, JAV) ir dviejų šoninių P pervežimas vertė yra mažesnė nei 0,05 buvo laikomas statistiškai reikšmingas.
rezultatai
= 0,383 ir 0,424 bandymo komplekto ir P
= 0,164 ir 0,061 į patvirtinimo rinkinys, atitinkamai). Nors daugiau vyresnio amžiaus tiriamųjų (> 65years) ir moterims buvo pristatyti į bandymo komplekto nei patvirtinimo rinkinys, reikšmingai nesiskyrė amžių ir lytį tarp atvejų ir kontrolės buvo pastebėtas, kai mes kartu du gyventojus (1 lentelė). Bandymų rinkinys, ten buvo 295 CARDIA skrandžio vėžys (CGC) pacientams ir 455 ne CARDIA skrandžio vėžys (NCGC) pacientų; 406 pacientai diagnozuotas 299 difuzinio tipo skrandžio vėžio ir kaip žarnyno tipo. Klinikinė TNM stadija yra suskirstyti pagal gylį invazijos, limfmazgių metastazių ir tolimoje metastazių. Iš TNM etape pacientų testo rinkinį iš I-IV procentų buvo 26,8%, 22,0%, 35,5%, o 15,7%, atitinkamai. Iš 936 pacientų patvirtinimo rinkinys, 358 buvo CGC ir 578 buvo NCGC; 539 pacientai diagnozuotas 397 difuzinio tipo skrandžio vėžio ir kaip žarnyno tipo. Maždaug buvo rasta 27,7%, 19,8%, 42,2% ir 10,3% pacientų turėti TNM stadija I, II, III ir IV ligas, atitinkamai.
asociacija tarp TNFa
-308 "G >, A polimorfizmo ir skrandžio vėžio rizika
-308" G >, A polimorfizmo tarp pacientų ir kontrolės dviejų studijų rinkinys pateikiami lentelėje 2. pastebėtų genotipas dažniai į bandymų rinkinys, patvirtinimo rinkinį ir kartu nustatyti kontrolės buvo visi panašius į HWE ( P
= 0,481, 0,448 ir 0,946, atitinkamai). Mes tada naudojamas Pearsono χ2 testo ir logistinės regresijos analizę, siekiant įvertinti tarp asociaciją, TNFa
-308 "G >, A polimorfizmo ir skrandžio vėžio riziką. Bandymų rinkinys, mes nustatėme, kad ten buvo daugiau variantas genotipai (GA /AA) tokiu atveju, grupės, nei kontrolinėje grupėje ( P
= 0,034). Palyginti su asmenų su GG genotipą, mes nustatėme šiuos dalykus su GA /AA genotipo turėjo didesnę riziką skrandžio vėžiu (pakoreguota arba = 1.39, 95% PI = 1.01-1.67). Panašūs asociacijos buvo pastebėtas replikacijos tyrimo (GA vs GG: AR = 1,29, 95% PI = 1,02-1,65 ir AP /A. vs GG: AR = 1,31, 95% PI = 1,03-1,65). Kai mes kartu duomenis iš dviejų tyrimų, labiau reikšmingas ryšys buvo pastebėtas (GA vs GG: AR = 1,33, 95% PI = 1,12-1,59 ir AP /A. vs GG: AR = 1,34, 95CI% = 1,13-1,59 )
-308 "G > a. polimorfizmas vaidina skirtingą vaidmenį pogrupių amžių, lytį, auglio vietą ir histologinių tipų, mes tada atliekamas sluoksniuojant analizę remiantis šių kintamųjų , Kaip parodyta 3 lentelėje, sluoksninė analizė parodė, kad padidėjo rizika, susijusi su TNFa
-308GG /GA genotipai buvo labiau akivaizdu, vyresnio amžiaus tiriamųjų (> 65years) ( P
< 0.001, arba = 1.70, 95% PI = 1,28-2,25). Be to, nėra reikšmingas skirtumas buvo pastebėtas lyties, auglio vietą ir histologinių tipų stratifikacijos
-308 "G > a. Polimorfizmo ir klinikinių charakteristikos pacientams, sergantiems skrandžio vėžiu
-308 "G >, A polimorfizmo turi poveikį klinikinių charakteristikų pacientų, įskaitant TNM etape, tolimos metastazės, limfmazgių metastazių ir gylio naviko infiltracijos. Kaip parodyta 4 lentelėje, mes nustatėme, kad pacientai vežančios variantas genotipus turėjo žymiai didesnį paplitimą T4 etape įsiveržė gylis ( P pervežimas = 0,001, arba = 2,19, 95% PI = 1,39-3,47), ir tolima metastazės ( p
= 0,013, arba = 1.61, 95% PI = 1,10-2,35), nurodant polimorfizmas gali būti susijęs su skrandžio vėžio progresavimą.
-308 "G >, A polimorfizmo ir skrandžio vėžio rizika ir progresavimą. TNF-α yra svarbus imuninės tarpininkas uždegiminio atsako ir buvo pasiūlyta būti endogeninė navikų aktyvatorius žmogaus kancerogenezėje [23], [24], [25]. Skrandžio vėžio, Senthilkumar , et al.,
Parodė, kad TNF-α iRNR ir baltymų raiškos žymiai padidėjo skrandžio adenokarcinoma sirgusių pacientų, naudojant RT-PGR, Imunoblotingo ir imunohistocheminis [12]. Iš -308G >įtaka, A polimorfizmo dėl išraiškos lygį, TNFa
anksčiau buvo tiriami. . Karen ir kt
parodė, kad -308G >, A polimorfizmo gali turėti įtakos faktoriaus afinitetas privalomos ir sukelti faktorius privalomu į -308A alelio, bet ne -308G alelių, kurie vėliau sukelti padidėjusio išraiškos iš TNFa
[14]. Atsižvelgiant, kad TNF- yra iki-reguliuojamas skrandžio vėžio, yra įmanoma, kad asmenys, pernešančiu -308A alelį (ty. GA /AA), kuris yra susijęs su padidėjusiu lygio TNF-alfa, turi padidintą riziką skrandžio vėžio. Todėl biologiškai tikėtina, kad TNFa
-308G > a. Suteikia individų imlumą skrandžio vėžio
-308G >, A polimorfizmo ir skrandžio vėžio riziką. Tačiau šių tyrimų rezultatai lieka neaiškūs. Yra du paskelbtas meta analizę tarp asociacijų TNFa
-308G > A ir skrandžio vėžio rizika, kad nustatė šį polimorfizmas kaip rizikos veiksnys skrandžio vėžiui Kaukazo gyventojų, bet ne Azijos gyventojų [20] , [21]. Kai peržiūrėjo dvi metaanalizė, mes nustatėme, tik 3 studijas su 513 atvejais ir 714 kontrolės ir 5 tyrimų su 833 atvejais 1375 kontrolę Kinijos gyventojų Iš viso Iš viso buvo įtraukti į metaanalizes Zhang ET al.,
[20] ir Gorouhi , et al.,
[21], atitinkamai (5 lentelė). Tyrimų skaičius su ir mėginio dydį iš šių tyrimų gali būti per mažai, kad generuoti stabilų rezultatą. Šių tyrimų duomenimis, tik lu , et al.,
Nustatė reikšmingą ryšį tarp TNFa
-308GA genotipas ir padidinta rizika skrandžio vėžio rizika (OR = 1,81, 95% PI = 1.04-3.14) , Mūsų tyrimas dar nustatyti TNFa
-308G >, A polimorfizmo kaip rizikos veiksnys skrandžio vėžiui Kinijos gyventojų, kurie gali būti svarbūs vertinant TNF alfa vaidmenį skrandžio kancerogenezėje. Kaip nurodyta galios ir mėginių imties dydžio apskaičiavimas programinę įrangą, mūsų tyrimas turėjo 96% galios aptikti arba 1,50 arba didesnis, o minimalus ARBA nuo 0,62 su poveikio dažnumo 9% prie dabartinės imties dydis (1686 atvejai ir 1895 kontrolę) , kuris rodo, kad imties dydis mūsų tyrime yra veiksminga
-308G > a. polimorfizmas buvo susijęs su padidėjusia skrandžio vėžio rizika tarp pogrupių vyresni dalykai (amžius > 65 metų), o ne jaunesnių tiriamųjų. Šis pastebėjimas yra gerai palaikoma didelio organo tyrimų, kurie sieja silpna imuninė sistema su senėjimo [26], [27]. Imuninė sistema amžiaus asmenų patiria pakeitimus, kad gali sudaryti padidėjusio polinkio į piktybinių navikų [26]. Buvo pasiūlyta, kad aukštos raiškos TNF alfa gali būti įtraukti į naviko augimui ir plinta įtakos audinių atsinaujinimą ir stromos plėtros [28], [29]. Mūsų tyrime mes taip pat nustatė, TNFa
-308G >, A polimorfizmo buvo susijęs su klinikine agresyvumo, pavyzdžiui, pažangios naviko stadijos ir tolimoje metastazių. Panaši pastaba taip pat buvo pranešta Kitame tyrime [30]. Jei patvirtinta papildomų tyrimų šis polimorfizmas gali padėti prognozuoti ligos eigą, skrandžio vėžio. Tačiau šie rezultatai turi būti interpretuojami atsargiai, nes yra galimybė, kad asociacijos su prastos prognozės yra dėl to, kad vėlai diagnozės.
infekcija statusas yra gerai žinomas priežastis skrandžio vėžiu ir buvo pasiūlyta įtakoti TNF alfa [31] išraiška. Genetiniai pokyčiai TNFa
gali sąveikauti su šį veiksnį paveikti skrandžio CANER riziką. Deja, turimos informacijos apie H trūkumas. pylori
infekciją mūsų tyrime ribotas mums toliau nagrinėti šias sąveikas. Taigi, tolesni tyrimai su daugiau išsamių duomenų apie H. pylori
infekcija yra pagrįstos
turi didelę įtaką atsiradimo ir progresavimo skrandžio Europos Sąjungos oficialiajame Kinijos gyventojų. Nors asociacijos pasirodė statistiškai reikšmingas mūsų gyventojų, šie duomenys turi būti patikslinama kitų perspektyvinius tyrimus su didesniais imties dydis vienu metu gerai suderintų kontrolės ir nešališką atitikimo vienarūšių dalyviams.