PLoS ONE: Promoter funzionale -308G > una variante in Tumor Necrosis Factor alfa gene è associata al rischio e la progressione del cancro gastrico in una popolazione cinese

Astratto

Sfondo

tumor necrosis factor-α (TNF-α) svolge un ruolo cruciale nello sviluppo e nella progressione del cancro gastrico. A funzionali polimorfismo, -308 G > A (rs1800629), che si trova nel promotore di TNFA
gene, è stato suggerito di alterare la produzione di TNF-α e rischio di cancro influenza. Nel presente studio, abbiamo cercato di indagare se questo polimorfismo ha effetti sul rischio e la progressione del cancro gastrico in una popolazione cinese.

Metodi

genotipizzati il ​​ TNFA
-308 G > a polimorfismo utilizzando il metodo TaqMan in uno studio caso-controllo a due stadi per un totale di 1686 pazienti affetti da cancro gastrico e 1895 soggetti privi di tumore. La regressione logistica è stata utilizzata per valutare le associazioni genetiche con insorgenza e la progressione del cancro gastrico.

Risultati

Abbiamo trovato una significativa associazione tra i genotipi variante e aumento del rischio di cancro gastrico [ P
= 0.034, odds ratio (OR) = 1.39, 95% intervallo di confidenza (CI) = 1,01-1,67, GA /AA vs GG]. Risultati simili sono stati osservati nello studio replica di follow-up. Quando combinato i dati provenienti da due studi, abbiamo trovato un'associazione più significativo ( P
= 0,001, OR = 1.34, 95% CI = 1,13-1,59), soprattutto per i soggetti più anziani (> 65 anni). Inoltre, i pazienti portatori dei genotipi variante avevano un significativamente maggiore prevalenza di T4 stadio della malattia ( P
= 0,001, OR = 2.19, 95% CI = 1,39-3,47) e metastasi a distanza ( P
= 0,013, OR = 1.61, 95% CI = 1,10-2,35)

Conclusioni

I nostri risultati suggeriscono che il promotore funzionale -308 G >. Un polimorfismo nel TNFA
influenzare la suscettibilità e la progressione del cancro gastrico nella popolazione cinese

Visto:. Hong Y, Z Ge, Jing C, Shi J, Dong X, Zhou F, et al. (2013) Promotore funzionale -308G > una variante in Tumor Necrosis Factor alfa gene è associata al rischio e la progressione del cancro gastrico in una popolazione cinese. PLoS ONE 8 (1): e50856. doi: 10.1371 /journal.pone.0050856

Editor: Ramon Andrade de Mello, Università di Porto, Portogallo

Ricevuto: 27 maggio 2012; Accettato: 29 ottobre 2012; Pubblicato: 10 gen 2013

Copyright: © 2013 Hong et al. Questo è un articolo ad accesso libero distribuito sotto i termini della Creative Commons Attribution License, che permette l'uso senza restrizioni, la distribuzione e la riproduzione con qualsiasi mezzo, a condizione che l'autore originale e la fonte sono accreditati

Finanziamento:. Questo lavoro è stato sostenuto in parte da "le sei Talent Summit" Progetto della provincia di Jiangsu (SWYY-71-028), la National Science Foundation naturale di Jiangsu (BK2011194) e la National Science Foundation naturale della Cina (30.872.084, 30.972.444 e 81.001.274). I finanziatori avevano alcun ruolo nel disegno dello studio, la raccolta e l'analisi dei dati, la decisione di pubblicare, o preparazione del manoscritto

Competere interessi:.. Gli autori hanno dichiarato che non esistono interessi in competizione

Introduzione

cancro gastrico è la quarta più comune di cancro e la seconda causa di morte per cancro in tutto il mondo, e particolarmente diffusa in alcuni paesi, tra cui la Cina [1], [2]. Sebbene l'esatta eziologia del cancro gastrico resta da identificare, accumulando studi epidemiologici hanno dimostrato che la dieta, il fumo, l'alcool e soprattutto Helicobacter pylori
( H. Pylori
) l'infezione, sono ben noti cause del cancro gastrico [3], [4]. Tuttavia, un'alta prevalenza di questi fattori di rischio non sempre comporta un'alta incidenza di cancro gastrico, il che suggerisce che altri fattori sensibili, come le variazioni genetiche e le differenze ambientali possono inoltre contribuire alla carcinogenesi gastrica. Recentemente, prove emergenti ha suggerito che i polimorfismi genetici in geni candidati sono stati associati con la suscettibilità al cancro gastrico [5], [6], [7].

E 'stato suggerito che l'infiammazione cronica della mucosa gastrica indotta dalla H. pylori
infezione è un passo fondamentale nello sviluppo del cancro gastrico [8], [9]. In questo caso, le variazioni genetiche nei geni di citochine infiammatorie correlate possono essere potenziali fattori di suscettibilità per questa malattia. Una delle citochine importanti associati con H. pylori
infezione è il fattore di necrosi tumorale (TNF) -α, che è codificata dal TNFA
gene [10]. TNF-α è una citochina pleiotropica prodotta principalmente dai monociti e macrofagi attivati ​​e svolge un ruolo importante nella risposta infiammatoria [11]. E 'stato suggerito che oltre l'espressione di TNF-α ha mostrato una significativa gravità-dose-risposta come marcatori di rischio di lesioni pre-neoplastiche a cancro gastrico [12].

TNFA
gene è situato all'interno della regione leucociti classe antigene umano III sul cromosoma 6 (6p21) ed è altamente polimorfico. Polimorfismi nel TNFA
gene hanno dimostrato di influenzare notevolmente il suo livello di espressione [13]. Pertanto, molti studi hanno cercato di indagare se i polimorfismi nel promotore di TNFA
potrebbero essere utilizzati come fattore determinante putativo di suscettibilità per varie malattie, compreso il cancro gastrico. Tra i molti polimorfismi in TNFA
promotore, il TNFA
-308 G > Un polimorfismo sono stati selvaggiamente studiato e non c'è studio funzionale che suggerisce che l'allele -308A è associata ad un aumento della produzione di TNF-α [14]. Per quanto riguarda il cancro gastrico, sono stati condotti una serie di studi per indagare le associazioni tra il TNFA
-308 G > A polimorfismo e cancro gastrico in varie popolazioni, tuttavia, i risultati si formano questi studi rimangono inclusiva [15], [16], [17], [18], [19]. Fino ad oggi, due pubblicati meta-analisi su questo tema hanno suggerito che l'-308 G > Un polimorfismo è stato associato con cancro gastrico nelle popolazioni occidentali, ma non nelle popolazioni asiatiche [20], [21]. Qui, nel presente studio, è stato condotto uno studio caso-controllo relativo grande a due stadi che comprendeva un totale di 1686 pazienti affetti da cancro gastrico e 1895 soggetti privi di tumore per valutare ulteriormente l'influenza del TNFA
-308 G >. un polimorfismo sul rischio di cancro gastrico e la progressione in una popolazione cinese

Materiali e Metodi

Etica dichiarazione

lo studio è stato approvato dal Consiglio di Nanjing Institutional Review Medical University, Nanjing, Cina. Al reclutamento, consenso informato scritto è stato ottenuto da tutti i partecipanti coinvolti in questo studio.

Studio popolazione

Si tratta di uno studio epidemiologico molecolare corso di cancro gastrico condotta nel primo ospedale affiliato di Nanjing Medical University , Nanjing, Cina. Il disegno dello studio e dei criteri di inclusione dei soggetti sono stati precedentemente descritti altrove [22]. In breve, due studi caso-controllo ospedaliero-based indipendenti sono stati inclusi in questo studio. Nel complesso, l'insieme di test comprendeva 750 casi gastrici e 835 controlli di età e sesso reclutati al secondo ospedale affiliato di Nanjing Medical University, Nanjing e Cancer Hospital di Nantong, Nantong, Cina da marzo 2006 a gennaio 2010, e la set di validazione incluso 936 casi e 1.060 controlli arruolati da Ospedale Yixing popolare, Yixing, Cina dal gennaio 1999 al dicembre 2006. Tutti i soggetti erano di etnia cinese Han provenienti da diverse famiglie e non aveva alcun legame di sangue. Tutti i pazienti sono stati di recente diagnosi di istopatologicamente confermato, incidente cancro gastrico e sono stati reclutati consecutivamente senza restrizioni di età e sesso. sezioni istologiche di tutti i casi sono stati esaminati da due patologi indipendentemente. Quei pazienti che hanno avuto il cancro precedente, metastatizzato cancro di origine altra o sconosciuto, o la radioterapia o chemioterapia precedente sono stati esclusi. I controlli sono stati reclutati da soggetti sani che cercavano l'esame fisico nei servizi ambulatoriali in ospedale e sono stati corrispondente frequenza abbinato ai casi per età (± 5 anni) e il sesso. I controlli privi di tumore sono stati geneticamente non correlati ai casi e non ha avuto storia individuale di cancro. Ogni paziente ha donato 5 ml di sangue venoso dopo aver fornito un consenso informato scritto. Il tasso di risposta per i soggetti di casi e di controllo era sia superiore all'85%.

estrazione del DNA e genotipizzazione

Il DNA genomico intero è stato isolato e purificato dai leucociti del sangue periferico di proteinasi K digestione e fenolo /estrazione con cloroformio. Il TNFA
-308 G > Un polimorfismo è stata genotipizzarono utilizzando il metodo TaqMan MGB-(Applied Biosystems, Foster City, CA, USA), che utilizza due sonde TaqMan MGB allele-specifici e un paio di primer PCR per rilevare l'obiettivo SNP specifica. La sequenza dei primer e sonde sono disponibili su richiesta. La miscela di reazione di 10 ml conteneva 20 ng DNA genomico, 3,5 ml di 2 × TaqMan genotipizzazione Master Mix, 0,25 ml di primer e sonde mix e 6,25 ml di acqua bidistillata. L'amplificazione è stata eseguita nelle seguenti condizioni: 50 ° C per 2 min, 95 ° C per 10 minuti seguiti da 45 cicli di 95 ° C per 15 sec e 60 ° C per 1 min. Seguendo le istruzioni del produttore, amplificazioni sono state condotte in 384 pozzetti ABI 7900HT reale Time PCR (Applied Biosystems, Foster City, CA, USA) e la discriminazione allelica sono stati eseguiti utilizzando il software SDS 2.4 (Applied Biosystems, Foster City, CA, STATI UNITI D'AMERICA). I tassi di genotipizzazione di questi SNP erano tutte sopra il 98%. Per garantire la precisione di genotipizzazione, due controllo negativo sperimentale (acqua) e due controlli sperimentali positivi con genotipo noto sono state incluse in ogni piastra di reazione. Inoltre, circa il 5% dei campioni sono stati selezionati in modo casuale per ripetere genotipizzazione di conferma; ei risultati sono stati concordi al 100%

L'analisi statistica

Prima di ulteriori analisi, le frequenze alleliche di TNFA
-308G >. Un polimorfismo nei controlli di set di test, validazione set e combinati insieme sono stati valutati contro partenza da Hardy-Weinberg (HWE) con una bontà di adattamento χ2 test. Le differenze nelle distribuzioni di età, il sesso e le frequenze dei genotipi della TNFA
-308G > Un polimorfismo tra i casi ei controlli sono stati valutati con il test χ2 di Pearson. Le associazioni tra il -308G > A genotipi e il rischio di cancro gastrico, nonché le caratteristiche cliniche dei pazienti sono stati misurati calcolando odds ratio (OR) e gli intervalli di confidenza al 95% (IC) da analisi di regressione logistica incondizionata con l'aggiustamento per l'età e il sesso. Tutte le analisi statistiche sono state effettuate con il software SAS 9.1.3 (SAS Institute, Cary, NC, USA) e due sul lato Valore P
inferiore a 0,05 è stato considerato statisticamente significativo.

Risultati

caratteristiche dello studio di popolazione

le distribuzioni di frequenza delle caratteristiche demografiche e le caratteristiche cliniche dei due gruppi di gruppo di studio sono riportati nella tabella 1. i casi e controlli sono stati abbinati per età e il sesso ( P
= 0,383 e 0,424 nel set di test e P
= 0,164 e 0,061 nel set di validazione, rispettivamente). Anche se più soggetti anziani (> 65 anni) e soggetti di sesso femminile sono stati presentati nel set di prova che nel set di validazione, alcuna differenza significativa per età e sesso tra i casi e controlli è stata osservata quando abbiamo combinato le due popolazioni (Tabella 1). Nel set di prova, ci sono stati 295 cardia cancro gastrico (CGC), i pazienti e 455 da cancro gastrico pazienti non Cardia (NCGC); 406 pazienti con diagnosi di tipo diffuso di cancro gastrico e 299 come tipo intestinale. Clinical stadio TNM viene classificato in base alla profondità di invasione, metastasi linfonodali e metastasi a distanza. La percentuale di TNM fase dei pazienti nel test impostato da I a IV sono stati 26,8%, 22,0%, 35,5% e 15,7%, rispettivamente. Dei 936 pazienti nel set di validazione, 358 erano CGC e 578 erano NCGC; 539 pazienti con diagnosi di tipo diffuso di cancro gastrico e 397 come tipo intestinale. Circa il 27,7%, 19,8%, 42,2% e il 10,3% dei pazienti sono stati trovati ad avere TNM stadio I, II, III e IV malattie, rispettivamente.

associazione tra la TNFA
-308 G > a polimorfismo e cancro gastrico rischio

i risultati di genotipizzazione del TNFA
-308 G > Un polimorfismo tra i pazienti e controlli nel set di due studio sono presentati nella Tabella 2. la frequenze genotipiche osservate nei controlli di test set, set di validazione e l'insieme combinato erano conformate alla HWE ( P
= 0.481, 0.448 e 0.946, rispettivamente). Abbiamo poi utilizzato prova χ2 di Pearson e analisi di regressione logistica per valutare l'associazione tra il TNFA
-308 G > A polimorfismo e rischio di cancro gastrico. Nel set di test, abbiamo scoperto che c'erano più genotipi variante (GA /AA) nel gruppo dei casi rispetto a quella del gruppo di controllo ( P
= 0.034). Rispetto ai soggetti con genotipo GG, abbiamo trovato quei soggetti con genotipi GA /AA ha avuto un aumento del rischio di cancro gastrico (OR aggiustato = 1.39, 95% CI = 1,01-1,67). Associazioni simili sono stati osservati nello studio di replica (GA vs GG: OR = 1.29, 95% CI = 1,02-1,65 e GA /AA vs GG: OR = 1.31, 95% CI = 1,03-1,65). Quando abbiamo combinato i dati dai due studi, un'associazione più significativa è stata osservata (GA vs GG: OR = 1.33, 95% CI = 1,12-1,59 e GA /AA vs GG: OR = 1.34, 95CI% = 1,13-1,59 )

Per valutare se il TNFA
-308 G >. Un polimorfismo gioca un ruolo diverso in sottogruppi di età, sesso, sede del tumore e tipi istologici, abbiamo poi effettuato un'analisi stratificata in base a queste variabili . Come indicato nella tabella 3, l'analisi stratificata ha mostrato che l'aumento del rischio associato al TNFA
-308GG /genotipi GA è stato più evidente tra i soggetti più anziani (> 65 anni) ( P
< 0,001, OR = 1.70, 95% CI = 1,28-2,25). Inoltre, nessuna differenza significativa è stata osservata nella stratificazione del sesso, sede del tumore e tipi istologici

associazione tra la TNFA
-308 G >. Un polimorfismo e le caratteristiche cliniche dei pazienti con cancro gastrico

I polimorfismi di geni candidati sono stati suggeriti per influenzare la progressione del cancro. Abbiamo poi valutato se il TNFA
-308 G > Un polimorfismo ha effetti sulle caratteristiche cliniche dei pazienti, tra cui stadio TNM, metastasi a distanza, metastasi linfonodali e la profondità di infiltrazione tumorale. Come mostrato nella Tabella 4, abbiamo trovato che i pazienti portatori dei genotipi variante avevano un significativamente maggiore prevalenza di T4 fase di profondità invaso ( P
= 0,001, OR = 2.19, 95% CI = 1,39-3,47) e metastasi a distanza ( P
= 0,013, OR = 1.61, 95% CI = 1,10-2,35), con l'indicazione del polimorfismo può essere associato con la progressione del cancro gastrico.

Discussione

i principali risultati del nostro studio sono le associazioni significative tra il TNFA
-308 G > A polimorfismo e il rischio di cancro gastrico e la progressione. TNF-α è un importante mediatore immunitaria in risposta infiammatoria ed è stato suggerito come un promotore tumorale endogena nella carcinogenesi umana [23], [24], [25]. Nel cancro gastrico, Senthilkumar et al.
Dimostrato che il TNF-α mRNA e le espressioni di proteine ​​è risultata significativamente aumentata nei pazienti con adenocarcinoma gastrico, utilizzando RT-PCR, Western blotting ed immunoistochimica [12]. L'influenza del -308G > polimorfismo al livello di espressione di TNFA
precedentemente esaminato. . Karen et al
ha dimostrato che la -308G > Un polimorfismo potrebbero influenzare l'affinità del fattore di legame e il risultato in un fattore vincolante per l'allele -308A ma non l'allele -308G, che poi porta ad un aumento dell'espressione di TNFA
[14]. Considerando che il TNF-α è up-regolato in cancro gastrico, è possibile che le persone che trasportano l'allele -308A (es. GA /AA), che è associato con aumento del livello di TNF-α, hanno un aumentato rischio di cancro gastrico. Pertanto, è biologicamente plausibile che il TNFA
-308G >. Un conferisce la suscettibilità individuale a cancro gastrico

Ad oggi, sono stati condotti diversi studi epidemiologici molecolari per valutare l'associazione tra i tag TNFA
-308G > A polimorfismo e rischio di cancro gastrico. Tuttavia, i risultati di questi studi rimangono inconcludenti. Ci sono due meta-analisi pubblicata sulle associazioni tra il TNFA
-308G > A e il rischio di cancro gastrico che hanno identificato questo polimorfismo come fattore di rischio per il cancro gastrico nelle popolazioni caucasiche, ma non nelle popolazioni asiatiche [20] , [21]. Quando esaminato i due meta-analisi, abbiamo trovato solo 3 studi con un totale di 513 casi e 714 controlli e 5 studi con un totale di 833 casi e 1375 controlli in popolazioni cinesi sono stati inclusi nella meta-analisi di Zhang et al.
[20] e Gorouhi et al.
[21], rispettivamente (Tabella 5). Il numero di studi e la dimensione del campione di questi studi possono essere troppo limitati per generare un risultato stabile. Di questi studi, solo Lu et al.
Trovato una significativa associazione tra TNFA
-308GA genotipo e aumento del rischio di rischio di cancro gastrico (OR = 1.81, 95% CI = 1,04-3,14) . Il nostro studio ha inoltre identificare il TNFA
-308G > Un polimorfismo come fattore di rischio per il cancro gastrico della popolazione cinese, che può essere di valore nel valutare il ruolo di α TNF nella carcinogenesi gastrica. Come indicato dal potere e del campione software Dimensione di calcolo, il nostro studio ha avuto una potenza 96% per rilevare un OR di 1,50 o superiore e un minimo o di 0,62 con una frequenza di esposizione del 9% alla dimensione effettiva del campione (1686 casi e 1895 controlli) , il che suggerisce che la dimensione del campione del nostro studio è efficiente

In aggiunta, abbiamo scoperto che il TNFA
-308G >. Un polimorfismo è stato associato ad un aumento del rischio di cancro gastrico tra i sottogruppi di anziani soggetti (età > 65 anni) piuttosto che soggetti più giovani. Questa osservazione è ben supportato da un grande corpo di studi, che collegano il sistema immunitario debole con l'invecchiamento [26], [27]. Il sistema immunitario degli individui di età compresa tra subisce alterazioni che possono spiegare una maggiore suscettibilità alle neoplasie [26]. E 'stato proposto che l'alta espressione di α TNF potrebbe essere coinvolto nella crescita tumorale e la diffusione attraverso influenzare il rimodellamento dei tessuti e lo sviluppo stromale [28], [29]. Nel nostro studio, abbiamo anche trovato il TNFA
-308G > Un polimorfismo è stato associato con l'aggressività clinica come stadio tumorale avanzato e metastasi a distanza. osservazione simile è stata riportata anche in altro studio [30]. Se confermata da ulteriori studi, questo polimorfismo potrebbe aiutare a prevedere con precisione il decorso clinico del cancro gastrico. Tuttavia, questi risultati devono essere interpretati con cautela perché non vi è la possibilità che le associazioni con prognosi infausta sono dovuti a una fase avanzata al momento della diagnosi.

Quando si interpretano i nostri risultati, alcune altre limitazioni dovrebbero essere interessati. In primo luogo, poiché il nostro studio era disegno base ospedaliera, la possibilità di selezione polarizzazione dei soggetti che sono stati associati con un particolare genotipo possa esistere. Tuttavia, le distribuzioni genotipiche nei nostri controlli erano simili alle distribuzioni riportati in altri studi cinesi e conformi alla HWE. Pertanto, il bias di selezione in termini di distribuzioni genotipiche non sarebbe notevole. In secondo luogo, H. pylori
stato di infezione è una causa nota di cancro gastrico ed è stato suggerito di influenzare l'espressione di TNF-α [31]. variazioni genetiche in TNFA
possono interagire con questo fattore di rischio influenzano Caner gastrica. Purtroppo, la mancanza di informazioni disponibili sul H. pylori
stato di infezione nel nostro studio ci limita ad esplorare ulteriormente queste interazioni. Così, ulteriori studi con dati più dettagliati su H. pylori
infezione sono garantiti

In conclusione, i nostri risultati suggeriscono l'-308G >. Un polimorfismo nel promotore di TNFA
ha una notevole influenza sulla comparsa e la progressione della gastrica nel popolazione cinese. Anche se le associazioni sembravano essere statisticamente significativa nella nostra popolazione, questi risultati dovrebbero essere verificati in modo indipendente da altri studi prospettici con grande dimensione del campione simultaneo dei controlli ben assortita e partecipanti omogenei imparziali corrispondenza.

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