Utilizzando l'analisi del materiale genetico e l'apprendimento automatico, I ricercatori dell'UBC hanno individuato diversi fattori chiave per garantire il successo dei trapianti di microbiota fecale (FMT), che si sono dimostrati efficaci nel trattamento delle infezioni batteriche nell'intestino, comprese malattie come C. difficile , Morbo di Crohn, Colite e persino obesità, spiega l'autore principale Negin Kazemian.
Questa terapia è ancora agli inizi, ma studi come il nostro stanno aiutando a identificare i fattori chiave del suo successo complessivo".
Negin Kazemian, Autore principale dello studio e studente laureato, Scuola di Ingegneria, Campus di Okanagan dell'Università della Columbia Britannica
Kazemian e il suo supervisore, Professore assistente Sepideh Pakpour, stanno indagando le dinamiche interne sia dei donatori che dei riceventi per definire una formula per l'efficacia della terapia.
C. difficile è una delle infezioni associate all'assistenza sanitaria più frequentemente identificate in Nord America, aggiunge. Una volta che un paziente lo ottiene, la malattia si ripresenta spesso, avere un impatto negativo significativo sui microrganismi intestinali di un paziente.
Kazemian spiega che gli ecosistemi intestinali gravemente danneggiati, come qualcuno che ha avuto C. difficile , non si rinnovano. Perciò, FMT può aiutare ripristinando i sistemi danneggiati attraverso la ricreazione dell'ecosistema originale, o la costruzione di un ecosistema completamente nuovo e alternativo.
"Nel nostro studio, abbiamo dimostrato che il successo del recupero ecologico intestinale tramite FMT dipende da diversi fattori, compreso il microbioma intestinale del donatore, la presenza di batteri specifici, nonché le strutture della comunità intestinale pre-FMT del ricevente e l'assenza di batteri e funghi specifici".
Alcuni studi precedenti hanno indicato la possibilità di donatori "super", ma queste nuove scoperte indicano che il rapporto tra donatori e riceventi è molto più complesso. Pakpour afferma che la nozione di super-donatore è eccessivamente semplificata a causa delle fluttuazioni osservate a breve termine. Il microbiota di un ricevente può essere altrettanto importante da considerare quando si prevedono i risultati del trattamento, soprattutto in condizioni di squilibrio come la colite ulcerosa.
"Prendere, Per esempio, trapianti di sangue in cui abbiamo una forte comprensione dei quattro principali gruppi sanguigni o tipi, e come interagiscono tra loro, " dice Pakpour. "Con i trapianti fecali la ricerca fino a questo punto non è stata così chiara in ciò che costituisce una buona corrispondenza o compatibilità".
Lavorando con i dati dell'ospedale dell'Università di Alberta, Kazemian e Pakpour hanno analizzato la composizione intestinale e il DNA da campioni estratti prima e dopo FMT.
Secondo Kazemian, i loro risultati indicano che non esiste un approccio "uno sgabello adatto a tutti" per garantire il successo del trapianto.
"I dati mostrano che i microrganismi unici nel corpo di ognuno rispondono in modo diverso nel tempo, e questo ha profonde implicazioni sul fatto che questi trapianti funzionino bene o meno".
I ricercatori suggeriscono che la preparazione degli ecosistemi intestinali dei donatori e dei pazienti prima del trapianto, magari usando metaboliti, potenzialmente sincronizzerebbero il loro microbiota aprendo la strada a una maggiore probabilità di successo del trapianto.